Heatmap: Cluster_204 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.1 0.52 0.23 2.3 1.89 148.06 2.87 2.2 1.3 1.13 1.83 4.33 4.3 2.53 6.12 1.24 1.27 17.86 1.56 244.6
0.14 0.0 0.0 0.0 1.5 5.88 82.77 2.01 1.75 1.75 0.37 26.02 0.09 0.35 0.65 0.0 0.0 3.95 1014.87 7205.24
1.32 0.13 0.8 1.02 0.26 0.84 0.9 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.15 0.17 7.13
4.17 0.07 0.62 0.0 0.16 0.21 8.26 0.12 0.17 1.76 0.0 0.05 0.02 0.21 0.0 0.16 0.0 1.18 1.61 51.71
0.02 0.05 0.01 0.0 0.02 0.2 0.13 0.03 0.03 0.01 0.01 0.06 0.0 0.05 0.03 0.01 0.04 0.0 0.07 6.01
0.11 0.08 0.13 0.12 0.06 1.15 3.29 0.65 0.56 0.5 1.44 0.24 1.29 0.91 1.16 0.05 0.08 0.03 0.02 21.55
5.32 1.82 0.4 3.51 1.74 0.58 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 11.92
4.9 2.68 1.62 0.18 0.83 0.72 1.8 2.18 0.31 0.37 0.28 0.83 4.2 13.09 0.16 1.94 1.25 0.87 8.5 76.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05
0.9 0.84 0.23 3.3 2.04 8.59 0.51 1.11 0.41 0.22 0.61 0.63 0.14 0.21 1.13 1.37 1.77 5.05 3.01 25.91
68.26 18.91 0.0 25.17 526.99 694.96 135.65 9.56 4.87 1.84 17.74 29.58 9.32 6.27 16.9 0.0 3.96 25.5 23.62 2272.92
94.62 154.31 6.45 57.6 338.03 1969.63 298.52 4.98 0.0 1.1 29.38 55.34 3.43 2.58 72.42 0.0 0.0 31.31 1.71 3900.32
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.18 0.03 0.05 0.0 0.01 0.08 0.1 0.0 0.0 0.06 0.11 0.26 8.78
10.24 4.39 4.21 4.79 7.94 1.4 103.38 5.15 12.42 22.27 1.67 11.04 2.44 3.12 6.53 0.77 0.47 0.86 11.14 1307.77
0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.61 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.04 8.73
0.06 0.13 0.03 0.02 0.04 0.04 0.55 0.02 0.02 0.03 0.02 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.17 0.22 0.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.16
4.2 0.0 0.03 2.99 0.69 0.69 15.46 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.23 1.19 137.65
68.95 1.55 2.77 1.59 0.96 2.32 233.2 1.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 49.28 31.55 805.45
0.39 0.0 0.0 1.06 1.48 2.05 2.56 0.65 0.29 0.24 0.23 0.74 0.8 0.37 0.2 0.84 2.02 2.01 0.08 15.05
0.35 0.24 0.65 0.23 0.6 0.49 0.56 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.06 0.0 0.3 1.14 8.57
0.31 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.0 0.12 0.03 0.0 0.0 0.03 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 15.51
2.24 0.64 1.35 0.81 1.09 0.53 0.6 1.99 0.63 0.5 0.44 0.33 2.59 0.92 0.56 0.27 0.87 1.29 0.23 190.35
0.08 0.44 0.17 0.0 0.0 0.54 0.89 0.0 0.01 0.09 0.04 0.1 0.08 0.13 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 3.99
3.37 7.73 2.67 0.88 3.66 3.37 9.49 0.93 0.32 0.0 0.1 1.34 0.43 0.96 0.94 0.35 0.81 2.34 2.81 25.16
0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.49 0.01 0.23 0.0 0.0 0.04 0.04 0.22 0.61 0.0 0.0 0.0 0.83 0.01 12.75
0.09 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.06 0.41 0.24 0.52 0.05 0.07 0.18 0.63 0.02 0.09 0.07 0.07 6.22
0.85 0.49 0.23 1.45 0.94 2.8 0.27 0.61 0.1 0.19 0.21 0.18 0.36 0.48 0.1 0.28 0.51 3.14 2.92 26.21
0.04 0.0 0.12 0.09 0.06 0.63 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.24 0.17 0.0 2.35
0.32 0.28 0.0 0.1 0.26 9.07 1.81 0.55 0.1 0.38 0.21 1.73 0.81 1.59 0.03 0.0 0.11 0.95 0.17 141.97
0.31 0.92 0.17 0.21 1.32 1.3 1.59 0.23 0.15 0.24 0.11 0.76 0.19 0.22 0.23 0.03 0.06 1.22 0.2 12.34
0.24 0.16 0.08 0.18 0.05 0.04 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.51
0.07 0.0 0.01 0.09 0.04 0.17 0.02 0.22 0.05 0.03 0.12 0.31 0.12 0.13 0.11 0.0 0.06 0.3 2.4 7.8
0.11 0.18 0.05 0.09 0.11 1.31 0.23 0.42 0.34 0.18 0.25 0.51 0.28 0.26 0.27 0.0 0.06 1.49 0.17 10.9
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.03 0.0 0.03 0.0 0.01 0.04 0.02 0.0 0.14 0.0 0.0 0.02 22.07
0.09 0.03 0.07 0.0 0.18 0.13 0.49 0.17 0.06 0.03 0.13 0.19 0.22 0.16 0.07 0.02 0.04 0.16 0.11 6.59
0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.16 0.1 0.03 0.01 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 3.28
0.03 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19
0.24 0.07 0.21 0.19 0.13 0.59 0.05 0.05 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.0 0.07 0.17 3.23
0.0 0.35 0.21 0.34 0.48 0.38 0.03 0.23 0.19 0.3 0.87 0.01 0.04 0.15 0.05 0.06 0.11 0.18 0.39 219.48
0.44 0.23 0.46 0.0 0.16 0.21 0.45 0.12 0.07 0.1 0.68 0.01 0.43 0.05 0.37 0.2 0.0 0.19 0.39 5.56
0.06 0.01 0.04 0.02 0.0 0.24 0.0 0.19 0.06 0.08 0.05 0.1 0.15 0.15 0.11 0.01 0.01 0.07 0.06 3.7
0.79 0.59 1.11 0.3 0.17 0.19 1.35 0.15 0.01 0.0 0.48 1.0 0.18 0.16 0.18 0.0 0.13 0.15 0.01 34.63
0.72 0.0 0.06 0.18 0.0 0.0 0.06 0.06 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.27 0.06 7.47
0.0 0.46 0.49 0.0 0.17 0.0 0.03 0.1 0.17 0.06 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 2.2 4.99 8.32
0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.06 0.0 0.05 0.02 0.17 0.08 0.0 0.0 0.2 3.95
0.19 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.05 0.36
12.26 0.24 0.18 0.13 0.1 2.45 0.08 1.59 0.06 0.07 0.03 0.38 0.17 0.2 0.02 0.2 0.06 0.69 0.53 193.57
2.11 0.97 4.56 17.44 9.91 11.91 1.27 6.51 0.39 0.53 0.47 4.12 0.09 0.57 0.75 1.56 4.5 79.83 27.61 209.63
8.48 4.0 16.97 19.73 14.3 46.47 3.4 12.78 0.56 0.53 0.66 8.8 0.17 0.68 1.1 6.5 17.54 133.17 29.79 472.14
8.3 15.67 0.26 1.06 1.03 1.95 4.25 1.19 1.23 0.8 0.28 0.56 0.45 0.53 0.64 2.51 0.38 7.53 13.56 96.86
4.06 0.17 1.49 1.67 1.9 1.0 0.02 1.83 0.35 0.26 0.34 0.4 0.14 0.41 0.4 0.89 0.57 10.78 9.73 63.54
0.56 2.92 0.35 0.18 0.04 3.94 0.06 0.51 0.53 1.28 0.02 0.61 0.83 2.84 0.03 1.37 2.96 1.16 0.01 16.6
0.02 0.0 0.01 0.05 0.2 0.06 0.17 0.06 0.03 0.03 0.05 0.03 0.01 0.01 0.07 0.09 0.02 0.17 0.32 3.9
0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.1 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.96
2.49 1.14 1.4 0.63 0.63 0.29 1.17 0.06 0.09 0.16 0.07 0.21 0.05 0.13 0.08 0.02 0.06 0.27 2.98 74.77
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 2.14
1.46 0.99 0.45 1.02 0.08 0.86 0.72 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 21.81
0.84 2.65 2.14 1.82 0.5 0.18 2.22 0.55 0.31 0.23 0.24 1.57 0.51 1.36 0.12 0.26 0.0 3.05 0.88 13.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 28.15
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 3.43
0.04 0.02 0.0 0.03 0.01 0.01 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 5.4
0.19 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03 0.14 0.02 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.7 67.62
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.1 0.05 0.05 0.06 0.05 0.16 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0
4.56 9.23 16.71 9.63 14.52 35.23 4.6 4.64 0.61 1.03 7.25 7.13 1.12 2.31 3.14 3.62 5.0 18.48 16.74 236.97
3.08 3.72 5.12 4.09 2.71 1.61 2.42 0.82 0.07 0.05 0.0 0.06 0.04 0.06 0.19 0.37 0.54 3.03 0.35 34.87
0.06 0.0 0.0 0.24 0.04 0.07 0.3 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.11 0.02 0.31
0.17 1.35 2.12 0.27 0.73 0.67 3.22 0.06 0.01 0.02 0.0 0.05 0.11 0.18 0.01 0.02 0.01 0.05 0.02 6.53
0.46 0.09 0.26 0.26 0.31 0.46 2.44 0.66 1.07 0.76 1.5 0.31 0.31 0.38 1.75 0.29 0.3 1.01 1.87 13.86
0.42 0.23 0.11 0.02 0.01 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 5.73
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.33 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 3.39
0.02 0.0 0.07 0.0 0.14 0.08 0.41 0.57 0.85 0.83 0.32 0.58 0.42 0.63 0.5 0.0 0.23 4.31 24.57 150.12

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)