Heatmap: Cluster_43 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.3 0.13 0.11 1.0 0.08 0.05 0.2 0.16 0.12 0.18 0.17 0.03 0.14 0.22 0.04 0.31 0.41 0.09 0.11 0.02
0.44 0.36 0.26 1.0 0.19 0.05 0.19 0.36 0.32 0.33 0.21 0.08 0.45 0.45 0.55 0.85 0.44 0.05 0.23 0.04
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.41 0.0 0.15 1.0 0.17 0.0 0.1 0.28 0.4 0.8 0.0 0.08 0.56 0.06 0.27 0.77 0.0 0.0 0.56 0.0
0.09 0.0 0.03 0.1 0.0 0.0 0.05 0.41 0.1 0.16 1.0 0.12 0.09 0.1 0.85 0.12 0.13 0.11 0.32 0.13
0.12 1.0 0.03 0.27 0.68 0.23 0.35 0.27 0.57 0.4 0.12 0.48 0.49 0.4 0.12 0.04 0.02 0.55 0.07 0.19
0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.26 0.16 0.11 0.0 0.02 0.03 0.0 0.07 1.0 0.69 0.03 0.21 0.04
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.07 0.1 0.02 0.2 0.02 0.0 0.16 0.0 0.0 0.26 0.83 0.0 1.0
0.1 0.04 0.04 0.14 0.02 0.05 0.02 0.52 0.45 0.52 0.27 0.25 1.0 0.53 0.24 0.14 0.15 0.08 0.01 0.01
0.06 0.02 0.02 0.01 0.02 0.05 0.01 0.36 0.5 0.76 0.51 0.21 1.0 0.6 0.56 0.13 0.13 0.07 0.01 0.19
0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.05 0.0 0.49 0.24 0.31 0.51 0.04 1.0 0.38 0.44 0.0 0.03 0.02 0.42 0.07
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.64 0.21 0.02 0.0 0.74 0.0 0.02 0.11 0.39 0.0 0.0 0.06 1.0 0.27
0.16 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.18 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.27 0.13 1.0 0.32 0.11 0.46 0.13 0.33 0.15 0.06 0.2 0.15 0.04 0.0 0.09 0.26 0.03 0.06 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36
0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.44 0.76 0.44 0.0 1.0 0.23 0.7 0.49 0.42 0.35 0.4 0.45 0.46 0.37 0.42 0.17 0.29 0.44 0.45 0.71
0.86 0.35 0.46 1.0 0.43 0.16 0.28 0.35 0.18 0.21 0.49 0.11 0.57 0.35 0.34 0.12 0.14 0.18 0.71 0.24
0.08 0.02 0.08 0.05 0.12 0.13 0.03 0.18 0.33 0.29 0.54 0.31 0.05 0.09 0.5 1.0 0.67 0.1 0.07 0.01
1.0 0.51 0.69 0.75 0.55 0.12 0.0 0.37 0.66 0.52 0.34 0.08 0.42 0.56 0.1 0.19 0.47 0.05 0.37 0.16
0.31 0.26 0.15 1.0 0.2 0.04 0.1 0.11 0.1 0.09 0.21 0.02 0.13 0.12 0.09 0.3 0.17 0.07 0.15 0.06
0.22 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.03 0.0 0.09 0.05 0.35 0.24 0.0 0.03 0.0 0.18 0.0 0.0
0.18 0.07 0.16 1.0 0.26 0.05 0.15 0.22 0.34 0.43 0.42 0.03 0.37 0.43 0.28 0.76 0.32 0.11 0.1 0.07
0.49 0.0 0.4 0.6 0.54 0.05 0.13 0.58 0.36 0.24 0.7 0.37 1.0 0.49 0.46 0.42 0.2 0.57 0.26 0.0
0.48 0.0 0.15 1.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.28 0.09 0.44 0.0 0.26 0.33 0.26 0.81 0.33 0.0 0.21 0.0
0.2 0.0 0.24 1.0 0.0 0.0 0.82 0.03 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.2 0.07
1.0 0.4 0.03 0.49 0.52 0.48 0.37 0.62 0.72 0.62 0.54 0.1 0.1 0.15 0.6 0.26 0.23 0.6 0.52 0.51
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.21 0.16 0.0 1.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0
0.19 0.4 0.0 0.0 0.38 0.0 0.23 0.48 0.29 0.31 0.51 0.2 1.0 0.68 0.17 0.73 0.25 0.33 0.89 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 0.77 0.19 0.0 0.37 0.0 0.33 0.5 0.54 0.58 1.0 0.54 0.27 0.06 0.31 0.0 0.0 0.5 0.25 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.02 0.07 0.02 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.19 0.4 0.33 0.3 1.0 0.05 1.0 0.44 0.47 0.0 0.0 0.0 0.19 0.31
0.47 0.31 0.23 1.0 0.18 0.04 0.13 0.32 0.27 0.21 0.23 0.04 0.56 0.4 0.18 0.33 0.26 0.07 0.16 0.08
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.33 0.29 1.0 0.05 0.02 0.08 0.38 0.1 0.16 0.22 0.18 0.6 0.5 0.36 0.14 0.38 0.17 0.09 0.0
0.01 0.21 0.01 0.59 1.0 0.19 0.69 0.32 0.74 0.7 0.17 0.78 0.61 0.27 0.02 0.0 0.0 0.77 0.04 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.17 0.41 0.99 0.21 0.21 0.32 0.32 0.21 0.24 0.17 0.01 0.31 0.16 0.22 0.38 0.27 0.14 0.19 0.09
0.02 0.0 0.01 1.0 0.07 0.0 0.26 0.11 0.14 0.1 0.02 0.06 0.16 0.12 0.04 0.12 0.09 0.03 0.02 0.06
0.08 0.19 0.15 1.0 0.14 0.01 0.08 0.23 0.28 0.3 0.38 0.03 0.34 0.35 0.17 0.83 0.36 0.08 0.14 0.04
0.06 0.43 0.0 1.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.2 0.0 0.38 0.0
0.61 0.87 0.64 0.64 0.28 0.03 0.27 0.49 0.37 0.55 0.44 0.07 0.72 0.67 0.4 1.0 0.85 0.04 0.29 0.04
0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.0 0.52 0.72 1.0 0.37 0.1 0.59 0.54 0.34 0.23 0.2 0.06 0.01 0.05
0.0 0.21 0.02 0.0 0.24 0.09 0.01 0.69 0.26 0.25 0.07 0.36 1.0 0.8 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04
0.22 0.48 0.35 1.0 0.16 0.0 0.21 0.21 0.25 0.16 0.33 0.03 0.05 0.06 0.19 0.4 0.3 0.09 0.24 0.06
0.81 0.51 0.13 1.0 0.7 0.04 0.13 0.38 0.52 0.64 0.43 0.11 0.47 0.55 0.36 0.62 0.51 0.01 0.26 0.13
0.49 0.51 0.36 1.0 0.32 0.08 0.2 0.33 0.22 0.25 0.34 0.07 0.46 0.48 0.38 0.66 0.44 0.18 0.25 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.12 0.62 0.85 0.37 0.02 1.0 0.1 0.33 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.32 0.13 0.16 1.0 0.12 0.06 0.21 0.3 0.25 0.3 0.34 0.01 0.61 0.26 0.2 0.39 0.49 0.0 0.28 0.0
0.36 0.56 0.37 0.0 0.42 0.11 0.12 0.34 0.36 0.23 1.0 0.15 0.0 0.0 0.63 0.18 0.12 0.32 0.09 0.13
0.16 0.47 0.15 0.0 0.42 0.5 0.38 0.52 0.44 0.87 0.27 0.11 0.04 0.09 1.0 0.39 0.29 0.31 0.36 0.13
0.06 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.35 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.2 0.02
0.62 0.74 0.64 0.0 0.66 0.09 0.45 0.34 0.7 0.66 0.32 0.09 0.67 0.69 0.44 0.94 1.0 0.08 0.14 0.14
0.53 0.2 0.07 1.0 0.28 0.11 0.1 0.32 0.15 0.16 0.22 0.01 0.24 0.32 0.47 0.86 0.32 0.09 0.24 0.09
0.0 0.0 0.15 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 0.17 0.0 0.24 0.08 0.0 0.0 0.32 0.05 0.17 1.0 0.02 0.29 0.2 0.82 0.33 0.11 0.0 0.13 0.0
0.2 0.0 0.27 1.0 0.0 0.0 0.88 0.07 0.03 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.24 0.05
1.0 0.5 0.25 0.88 0.41 0.19 0.14 0.37 0.31 0.86 0.11 0.01 0.18 0.3 0.24 0.21 0.35 0.1 0.34 0.04
0.0 0.37 0.16 0.54 0.53 0.0 0.3 0.21 0.43 0.0 0.64 0.0 0.96 0.06 0.28 1.0 0.18 0.43 0.05 0.0
0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.53 1.0 0.26 0.0 0.0 0.19 0.17 0.79 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.29 0.0 0.0 0.6 0.74 0.0 0.0 0.44 0.17 0.31 0.71 0.0 0.92 0.2 1.0 0.0 0.46 0.0 0.5 0.32
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.13 0.21 0.77 0.16 0.05 0.07 0.28 0.45 0.41 0.38 0.08 0.26 0.22 0.61 1.0 0.88 0.09 0.19 0.01
0.37 0.18 0.07 0.57 0.19 0.1 0.07 0.37 0.56 0.42 0.52 0.09 0.39 0.27 0.53 1.0 0.64 0.17 0.34 0.02
0.11 0.11 0.07 0.56 0.15 0.05 0.04 0.24 0.36 0.32 0.3 0.06 0.42 0.46 0.44 1.0 0.68 0.07 0.06 0.01
0.04 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.02 0.08 0.02 0.04 0.26 0.0 0.16 0.16 0.09 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.14 0.24 0.18 1.0 0.21 0.04 0.04 0.36 0.39 0.38 0.27 0.07 0.28 0.48 0.73 0.49 0.56 0.0 0.28 0.03
0.23 1.0 0.6 0.59 0.76 0.12 0.58 0.42 0.43 0.42 0.16 0.23 0.67 0.61 0.24 0.17 0.18 0.31 0.76 0.06
0.17 0.3 0.29 0.0 0.17 0.25 0.04 0.22 0.29 0.19 0.29 0.27 0.32 0.24 0.18 1.0 0.49 0.25 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.32 0.49 0.53 0.1 1.0 0.31 0.26 0.53 0.56 0.02 0.02 0.1 0.13 0.06
0.22 0.0 0.44 0.72 0.0 0.0 0.0 0.64 1.0 0.88 0.62 0.06 0.1 0.41 0.38 0.98 0.24 0.21 0.32 0.0
0.0 0.16 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04
0.68 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.16 0.3 0.7 0.16 0.55 0.0 0.0 0.21 0.25 0.0 0.0 0.0 0.37 1.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.1 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)