Heatmap: Cluster_43 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00529	0.3	0.13	0.11	1.0	0.08	0.05	0.2	0.16	0.12	0.18	0.17	0.03	0.14	0.22	0.04	0.31	0.41	0.09	0.11	0.02
Gb_01071	0.44	0.36	0.26	1.0	0.19	0.05	0.19	0.36	0.32	0.33	0.21	0.08	0.45	0.45	0.55	0.85	0.44	0.05	0.23	0.04
Gb_02683	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04605	0.41	0.0	0.15	1.0	0.17	0.0	0.1	0.28	0.4	0.8	0.0	0.08	0.56	0.06	0.27	0.77	0.0	0.0	0.56	0.0
Gb_05467	0.09	0.0	0.03	0.1	0.0	0.0	0.05	0.41	0.1	0.16	1.0	0.12	0.09	0.1	0.85	0.12	0.13	0.11	0.32	0.13
Gb_05825	0.12	1.0	0.03	0.27	0.68	0.23	0.35	0.27	0.57	0.4	0.12	0.48	0.49	0.4	0.12	0.04	0.02	0.55	0.07	0.19
Gb_06184	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.26	0.16	0.11	0.0	0.02	0.03	0.0	0.07	1.0	0.69	0.03	0.21	0.04
Gb_06490	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_06995	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.07	0.1	0.02	0.2	0.02	0.0	0.16	0.0	0.0	0.26	0.83	0.0	1.0
Gb_07014	0.1	0.04	0.04	0.14	0.02	0.05	0.02	0.52	0.45	0.52	0.27	0.25	1.0	0.53	0.24	0.14	0.15	0.08	0.01	0.01
Gb_07015	0.06	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.36	0.5	0.76	0.51	0.21	1.0	0.6	0.56	0.13	0.13	0.07	0.01	0.19
Gb_07643	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.05	0.0	0.49	0.24	0.31	0.51	0.04	1.0	0.38	0.44	0.0	0.03	0.02	0.42	0.07
Gb_07941	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08201	0.47	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0	0.64	0.21	0.02	0.0	0.74	0.0	0.02	0.11	0.39	0.0	0.0	0.06	1.0	0.27
Gb_08202	0.16	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.18	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0
Gb_08489	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0
Gb_08689	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09238	0.03	0.27	0.13	1.0	0.32	0.11	0.46	0.13	0.33	0.15	0.06	0.2	0.15	0.04	0.0	0.09	0.26	0.03	0.06	0.02
Gb_10160	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36
Gb_11122	0.0	0.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_11398	0.44	0.76	0.44	0.0	1.0	0.23	0.7	0.49	0.42	0.35	0.4	0.45	0.46	0.37	0.42	0.17	0.29	0.44	0.45	0.71
Gb_11640	0.86	0.35	0.46	1.0	0.43	0.16	0.28	0.35	0.18	0.21	0.49	0.11	0.57	0.35	0.34	0.12	0.14	0.18	0.71	0.24
Gb_12042	0.08	0.02	0.08	0.05	0.12	0.13	0.03	0.18	0.33	0.29	0.54	0.31	0.05	0.09	0.5	1.0	0.67	0.1	0.07	0.01
Gb_12281	1.0	0.51	0.69	0.75	0.55	0.12	0.0	0.37	0.66	0.52	0.34	0.08	0.42	0.56	0.1	0.19	0.47	0.05	0.37	0.16
Gb_12350	0.31	0.26	0.15	1.0	0.2	0.04	0.1	0.11	0.1	0.09	0.21	0.02	0.13	0.12	0.09	0.3	0.17	0.07	0.15	0.06
Gb_14452	0.22	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.02	0.07	0.03	0.0	0.09	0.05	0.35	0.24	0.0	0.03	0.0	0.18	0.0	0.0
Gb_16137	0.18	0.07	0.16	1.0	0.26	0.05	0.15	0.22	0.34	0.43	0.42	0.03	0.37	0.43	0.28	0.76	0.32	0.11	0.1	0.07
Gb_16875	0.49	0.0	0.4	0.6	0.54	0.05	0.13	0.58	0.36	0.24	0.7	0.37	1.0	0.49	0.46	0.42	0.2	0.57	0.26	0.0
Gb_18846	0.48	0.0	0.15	1.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.28	0.09	0.44	0.0	0.26	0.33	0.26	0.81	0.33	0.0	0.21	0.0
Gb_19174	0.2	0.0	0.24	1.0	0.0	0.0	0.82	0.03	0.03	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.2	0.07
Gb_19771	1.0	0.4	0.03	0.49	0.52	0.48	0.37	0.62	0.72	0.62	0.54	0.1	0.1	0.15	0.6	0.26	0.23	0.6	0.52	0.51
Gb_20137	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0
Gb_20211	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.21	0.16	0.0	1.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0
Gb_20586	0.19	0.4	0.0	0.0	0.38	0.0	0.23	0.48	0.29	0.31	0.51	0.2	1.0	0.68	0.17	0.73	0.25	0.33	0.89	0.0
Gb_20628	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	1.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21267	0.35	0.77	0.19	0.0	0.37	0.0	0.33	0.5	0.54	0.58	1.0	0.54	0.27	0.06	0.31	0.0	0.0	0.5	0.25	0.14
Gb_21752	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_21782	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.0	0.07	0.03	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.03	0.02	0.07	0.02	0.0	0.01	0.0
Gb_23310	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23622	0.18	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.19	0.4	0.33	0.3	1.0	0.05	1.0	0.44	0.47	0.0	0.0	0.0	0.19	0.31
Gb_24418	0.47	0.31	0.23	1.0	0.18	0.04	0.13	0.32	0.27	0.21	0.23	0.04	0.56	0.4	0.18	0.33	0.26	0.07	0.16	0.08
Gb_24752	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25368	0.21	0.33	0.29	1.0	0.05	0.02	0.08	0.38	0.1	0.16	0.22	0.18	0.6	0.5	0.36	0.14	0.38	0.17	0.09	0.0
Gb_26545	0.01	0.21	0.01	0.59	1.0	0.19	0.69	0.32	0.74	0.7	0.17	0.78	0.61	0.27	0.02	0.0	0.0	0.77	0.04	0.24
Gb_26609	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26817	1.0	0.17	0.41	0.99	0.21	0.21	0.32	0.32	0.21	0.24	0.17	0.01	0.31	0.16	0.22	0.38	0.27	0.14	0.19	0.09
Gb_26978	0.02	0.0	0.01	1.0	0.07	0.0	0.26	0.11	0.14	0.1	0.02	0.06	0.16	0.12	0.04	0.12	0.09	0.03	0.02	0.06
Gb_28270	0.08	0.19	0.15	1.0	0.14	0.01	0.08	0.23	0.28	0.3	0.38	0.03	0.34	0.35	0.17	0.83	0.36	0.08	0.14	0.04
Gb_28482	0.06	0.43	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.2	0.0	0.38	0.0
Gb_28623	0.61	0.87	0.64	0.64	0.28	0.03	0.27	0.49	0.37	0.55	0.44	0.07	0.72	0.67	0.4	1.0	0.85	0.04	0.29	0.04
Gb_28679	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.0	0.52	0.72	1.0	0.37	0.1	0.59	0.54	0.34	0.23	0.2	0.06	0.01	0.05
Gb_29680	0.0	0.21	0.02	0.0	0.24	0.09	0.01	0.69	0.26	0.25	0.07	0.36	1.0	0.8	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0	0.04
Gb_29822	0.22	0.48	0.35	1.0	0.16	0.0	0.21	0.21	0.25	0.16	0.33	0.03	0.05	0.06	0.19	0.4	0.3	0.09	0.24	0.06
Gb_29926	0.81	0.51	0.13	1.0	0.7	0.04	0.13	0.38	0.52	0.64	0.43	0.11	0.47	0.55	0.36	0.62	0.51	0.01	0.26	0.13
Gb_30091	0.49	0.51	0.36	1.0	0.32	0.08	0.2	0.33	0.22	0.25	0.34	0.07	0.46	0.48	0.38	0.66	0.44	0.18	0.25	0.04
Gb_30654	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.12	0.62	0.85	0.37	0.02	1.0	0.1	0.33	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_30892	0.32	0.13	0.16	1.0	0.12	0.06	0.21	0.3	0.25	0.3	0.34	0.01	0.61	0.26	0.2	0.39	0.49	0.0	0.28	0.0
Gb_31663	0.36	0.56	0.37	0.0	0.42	0.11	0.12	0.34	0.36	0.23	1.0	0.15	0.0	0.0	0.63	0.18	0.12	0.32	0.09	0.13
Gb_31838	0.16	0.47	0.15	0.0	0.42	0.5	0.38	0.52	0.44	0.87	0.27	0.11	0.04	0.09	1.0	0.39	0.29	0.31	0.36	0.13
Gb_32624	0.06	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.35	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.2	0.02
Gb_32629	0.62	0.74	0.64	0.0	0.66	0.09	0.45	0.34	0.7	0.66	0.32	0.09	0.67	0.69	0.44	0.94	1.0	0.08	0.14	0.14
Gb_32823	0.53	0.2	0.07	1.0	0.28	0.11	0.1	0.32	0.15	0.16	0.22	0.01	0.24	0.32	0.47	0.86	0.32	0.09	0.24	0.09
Gb_32862	0.0	0.0	0.15	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_33646	0.39	0.17	0.0	0.24	0.08	0.0	0.0	0.32	0.05	0.17	1.0	0.02	0.29	0.2	0.82	0.33	0.11	0.0	0.13	0.0
Gb_33814	0.2	0.0	0.27	1.0	0.0	0.0	0.88	0.07	0.03	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.24	0.05
Gb_33956	1.0	0.5	0.25	0.88	0.41	0.19	0.14	0.37	0.31	0.86	0.11	0.01	0.18	0.3	0.24	0.21	0.35	0.1	0.34	0.04
Gb_34152	0.0	0.37	0.16	0.54	0.53	0.0	0.3	0.21	0.43	0.0	0.64	0.0	0.96	0.06	0.28	1.0	0.18	0.43	0.05	0.0
Gb_34524	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.53	1.0	0.26	0.0	0.0	0.19	0.17	0.79	0.0	0.0	0.0	0.74	0.0
Gb_34658	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_35118	0.29	0.0	0.0	0.6	0.74	0.0	0.0	0.44	0.17	0.31	0.71	0.0	0.92	0.2	1.0	0.0	0.46	0.0	0.5	0.32
Gb_35520	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_35758	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_35823	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36403	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37793	0.28	0.13	0.21	0.77	0.16	0.05	0.07	0.28	0.45	0.41	0.38	0.08	0.26	0.22	0.61	1.0	0.88	0.09	0.19	0.01
Gb_37794	0.37	0.18	0.07	0.57	0.19	0.1	0.07	0.37	0.56	0.42	0.52	0.09	0.39	0.27	0.53	1.0	0.64	0.17	0.34	0.02
Gb_37799	0.11	0.11	0.07	0.56	0.15	0.05	0.04	0.24	0.36	0.32	0.3	0.06	0.42	0.46	0.44	1.0	0.68	0.07	0.06	0.01
Gb_37875	0.04	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.02	0.08	0.02	0.04	0.26	0.0	0.16	0.16	0.09	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0
Gb_38736	0.14	0.24	0.18	1.0	0.21	0.04	0.04	0.36	0.39	0.38	0.27	0.07	0.28	0.48	0.73	0.49	0.56	0.0	0.28	0.03
Gb_38931	0.23	1.0	0.6	0.59	0.76	0.12	0.58	0.42	0.43	0.42	0.16	0.23	0.67	0.61	0.24	0.17	0.18	0.31	0.76	0.06
Gb_39227	0.17	0.3	0.29	0.0	0.17	0.25	0.04	0.22	0.29	0.19	0.29	0.27	0.32	0.24	0.18	1.0	0.49	0.25	0.0	0.08
Gb_39339	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39981	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.32	0.49	0.53	0.1	1.0	0.31	0.26	0.53	0.56	0.02	0.02	0.1	0.13	0.06
Gb_40073	0.22	0.0	0.44	0.72	0.0	0.0	0.0	0.64	1.0	0.88	0.62	0.06	0.1	0.41	0.38	0.98	0.24	0.21	0.32	0.0
Gb_40534	0.0	0.16	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.04	0.0	0.0	0.0	0.1	0.04
Gb_41324	0.68	0.0	0.0	0.93	0.0	0.0	0.16	0.3	0.7	0.16	0.55	0.0	0.0	0.21	0.25	0.0	0.0	0.0	0.37	1.0
Gb_41831	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.1	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)