Heatmap: Cluster_84 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.06 2.54 1.54 0.0 0.0 0.07 24.21 0.68 0.2 0.31 0.4 0.65 0.39 1.36 0.21 0.0 0.0 0.0 0.02 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.09 0.01 0.04 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04
0.09 0.0 0.08 0.0 0.13 9.65 27.23 0.02 0.03 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.02 0.05 0.09 0.14 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 8.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.24 0.11 0.0 0.34 0.0 1.77 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.15 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.15 126.89 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.73 144.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.1
0.64 0.14 0.18 0.25 0.39 0.94 6.07 0.26 0.1 0.18 0.12 0.46 0.16 0.33 0.04 0.02 0.15 0.26 0.38 2.92
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.29 0.51 0.33 0.0 0.78 38.1 0.13 0.09 0.36 0.0 0.0 0.11 0.07 0.21 0.0 0.0 0.21 0.07 0.0
0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 3.54 0.05 0.03 0.0 0.07 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.12 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.05 0.17 0.07 0.16 0.3 1.65 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 1.18 0.7 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.52 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.14 0.0 6.96 98.99 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.07
144.52 808.59 850.51 110.64 57.43 51.19 6354.38 64.57 7.96 6.76 21.75 147.38 127.63 221.0 27.97 10.99 6.85 16.2 6.9 15.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.16 8.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0
0.02 0.0 0.04 0.21 0.0 7.23 53.94 0.01 0.05 0.06 0.03 0.02 0.01 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0
0.51 65.77 0.52 0.06 0.27 0.32 117.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.24 39.84 9.72 2.45 5.61 11.03 67.13 1.04 1.45 1.07 3.72 0.82 1.41 1.13 3.16 0.59 0.5 3.43 3.46 0.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 71.03 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.84 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 16.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.18 0.17 3.5 9.95 0.01 0.02 0.03 0.06 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.2 0.04 0.0
0.28 0.32 0.07 0.23 0.25 0.2 2.17 0.05 0.02 0.08 0.02 0.03 0.01 0.01 0.05 0.0 0.06 0.08 0.2 0.15
0.06 0.0 0.04 0.13 0.0 7.17 53.95 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.18 0.06
0.03 0.0 0.06 0.17 0.0 2.2 11.13 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 18.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.6 0.18 0.4 0.6 0.29 34.13 92.97 0.46 0.32 0.29 0.37 0.89 0.51 0.51 0.21 0.28 0.45 0.19 0.95 0.35
3.04 1.56 1.29 0.91 1.04 1.01 30.85 2.97 3.54 4.3 0.66 3.21 0.71 1.02 0.76 2.49 4.72 0.13 0.44 0.69
0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.67 4.29 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 3.84 153.97 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.02 16.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 36.48 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36
0.16 0.06 0.0 0.0 0.27 1.51 13.78 0.04 0.0 0.02 0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.02 0.05
5.57 11.07 9.13 3.92 8.05 0.09 26.5 0.26 0.26 0.35 0.2 1.32 0.0 0.34 0.0 0.13 1.69 0.75 1.04 0.22
5.28 5.28 3.31 9.92 8.28 0.35 28.67 0.35 0.1 0.4 0.13 1.9 0.09 0.44 0.12 0.03 0.29 0.38 0.47 1.37
0.09 0.15 0.04 0.0 0.08 11.06 91.65 0.05 0.02 0.04 0.07 0.04 0.11 0.09 0.12 0.1 0.0 0.09 0.3 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 30.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.28 0.25 0.12 20.3 126.68 0.11 0.08 0.05 0.0 0.59 0.06 0.06 0.0 0.05 0.1 0.11 0.27 0.13
0.03 0.0 0.11 0.26 0.03 8.02 95.08 0.02 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.09
0.93 0.73 0.12 1.06 0.55 10.96 37.48 0.36 0.33 0.06 0.1 0.26 0.76 1.29 0.57 0.31 0.0 1.26 3.66 1.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 12.54 0.04 0.0 0.1 0.04 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.03 0.03
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 3.43 27.51 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 1.18 0.04
7.9 24.77 7.54 3.08 12.2 9.0 92.08 3.39 3.04 1.76 1.72 1.67 2.48 3.26 1.75 3.94 2.84 11.25 15.63 6.34
0.08 0.12 0.06 0.5 0.21 9.02 68.12 0.04 0.0 0.06 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.05
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.34 13.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.04 0.0
0.17 0.0 0.04 0.18 0.04 33.92 64.37 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.1 0.06 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 33.18 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.58 46.94 0.02 0.02 0.0 0.11 0.07 0.08 0.02 0.0 0.15 0.0 0.0 0.08 0.0
0.04 0.0 0.04 0.06 0.06 8.89 57.91 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.06 0.08 0.02 0.08 0.02
0.03 0.0 0.0 0.69 0.08 9.11 59.06 0.03 0.0 0.0 0.14 0.02 0.0 0.0 0.03 0.11 0.0 0.0 2.83 0.0
0.13 0.17 0.34 0.04 0.13 0.0 1.35 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.02 0.08 0.05
26.59 3431.13 11.18 3.78 9.38 1.57 3772.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.15 0.0 0.0 0.0 0.25 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.19 0.28 0.35 0.0 0.01 0.2 38.8 0.01 0.0 0.02 0.01 0.12 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.18 1.86 4.97
0.18 0.0 0.08 0.93 0.0 2.42 12.49 0.03 0.02 0.0 0.2 0.0 0.0 0.03 0.06 0.12 0.0 0.0 0.16 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.75 1.03 0.17 1.29 0.5 12.39 150.67 0.12 0.0 0.15 0.13 0.0 0.0 0.19 0.0 0.11 0.0 0.0 3.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.29 0.33 0.26 0.13 1.42 3.56 0.11 0.02 0.08 0.0 0.31 0.13 0.02 0.0 0.0 0.36 0.06 0.16 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.56 0.42 0.1 0.3 0.0 0.0 1.91 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.08 0.26 4.46 0.63 1.77 4.23 124.93 0.13 0.01 0.0 0.0 0.02 0.11 0.06 0.0 0.08 0.28 6.26 9.36 14.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 9.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.1 0.3 0.0 1.89 6.6 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.39 0.08
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 3.35 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.05
40.93 108.62 52.79 43.74 37.48 34.14 695.24 24.85 0.19 3.94 0.36 1.56 2.84 19.81 1.67 0.14 0.06 48.25 0.17 0.42
0.1 0.43 0.38 0.0 0.0 0.11 127.45 0.04 0.03 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 3.51 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04
0.0 0.0 0.0 0.17 0.01 0.0 1.49 0.13 0.03 0.12 0.0 0.0 0.3 0.15 0.15 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.08 0.0 0.0 4.84 29.1 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.03
0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 1.91 89.85 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.46 0.0
0.04 0.0 0.82 0.0 0.0 1.1 14.15 0.03 0.05 0.12 0.0 0.08 0.06 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.13 0.55 0.79 0.8 0.0 1.71 13.88 0.24 0.08 0.0 0.0 0.07 0.11 0.0 0.21 0.0 0.0 0.22 0.08 0.0
0.03 0.0 0.0 0.21 0.14 2.75 16.94 0.05 0.02 0.0 0.38 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.09 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.69 12.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.24 0.42 0.4 0.17 0.18 4.24 23.3 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 23.08 96.57 0.02 0.0 0.22 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.16 0.32 0.0 0.5 0.21
0.13 0.06 0.19 0.08 0.08 0.03 11.01 0.23 0.21 0.24 0.18 0.3 0.14 0.24 0.19 1.53 0.78 0.14 0.1 0.02
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 2.18 14.33 0.01 0.01 0.0 0.06 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0
0.11 0.09 0.48 0.22 0.15 16.13 233.81 0.08 0.03 0.02 0.05 0.14 0.08 0.06 0.13 0.13 0.05 0.22 1.02 0.2
0.13 0.0 0.24 0.8 0.0 1.18 325.84 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.66 59.06 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.17 31.42 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)