Heatmap: Cluster_84 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00144	0.0	0.11	0.06	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.06	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_00313	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.03	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04
Gb_00457	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_00582	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00681	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_00953	0.0	0.13	0.06	0.0	0.19	0.0	1.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.08	0.0
Gb_01220	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01999	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02111	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02170	0.1	0.02	0.03	0.04	0.06	0.15	1.0	0.04	0.02	0.03	0.02	0.08	0.03	0.05	0.01	0.0	0.02	0.04	0.06	0.48
Gb_02230	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02863	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Gb_02984	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.02	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_03142	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04229	0.1	0.03	0.11	0.05	0.1	0.18	1.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.72	0.42	0.16
Gb_04938	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_05596	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07207	0.02	0.13	0.13	0.02	0.01	0.01	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07554	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_07555	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07626	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05
Gb_07630	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0
Gb_07688	0.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08782	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08783	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09124	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09278	0.05	0.59	0.14	0.04	0.08	0.16	1.0	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01
Gb_09754	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09774	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10504	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.35	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Gb_10697	0.13	0.15	0.03	0.11	0.11	0.09	1.0	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.03	0.04	0.09	0.07
Gb_11018	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11170	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.2	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11342	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_11973	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.37	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_12197	0.1	0.05	0.04	0.03	0.03	0.03	1.0	0.1	0.11	0.14	0.02	0.1	0.02	0.03	0.02	0.08	0.15	0.0	0.01	0.02
Gb_13048	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.16	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_13684	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_13824	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14109	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_14245	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Gb_14456	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.11	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
Gb_14533	0.21	0.42	0.34	0.15	0.3	0.0	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.0	0.01	0.0	0.01	0.06	0.03	0.04	0.01
Gb_14542	0.18	0.18	0.12	0.35	0.29	0.01	1.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.07	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.05
Gb_15170	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15491	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22
Gb_15647	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16050	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16344	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16428	0.02	0.02	0.0	0.03	0.01	0.29	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.0	0.03	0.1	0.04
Gb_16654	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17159	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0
Gb_17264	0.09	0.27	0.08	0.03	0.13	0.1	1.0	0.04	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.12	0.17	0.07
Gb_20475	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.13	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21481	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21902	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22039	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22902	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22905	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23499	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23690	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.15	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0
Gb_23818	0.1	0.13	0.25	0.03	0.1	0.0	1.0	0.02	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.04	0.0	0.0	0.01	0.06	0.03
Gb_24476	0.01	0.91	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24492	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_25258	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.13
Gb_25998	0.01	0.0	0.01	0.07	0.0	0.19	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_26535	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26995	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.08	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_27172	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_27184	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.01	0.0
Gb_27617	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_27909	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28252	0.05	0.08	0.09	0.07	0.04	0.4	1.0	0.03	0.01	0.02	0.0	0.09	0.04	0.01	0.0	0.0	0.1	0.02	0.04	0.01
Gb_28281	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28845	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29876	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30267	0.3	0.22	0.05	0.16	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04
Gb_32048	0.0	0.0	0.04	0.01	0.01	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.07	0.12
Gb_32403	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32650	0.0	0.0	0.02	0.05	0.0	0.29	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.06	0.01
Gb_32781	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.02
Gb_33211	0.06	0.16	0.08	0.06	0.05	0.05	1.0	0.04	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0
Gb_33481	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0
Gb_34756	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.04	0.08	0.0	0.11	0.03	0.05	0.12	0.0	0.0	0.0	0.07	0.23
Gb_34872	0.0	0.0	0.0	0.12	0.01	0.0	1.0	0.09	0.02	0.08	0.0	0.0	0.2	0.1	0.1	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0
Gb_35451	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
Gb_36207	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_36425	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.08	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07
Gb_36982	0.01	0.04	0.06	0.06	0.0	0.12	1.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0
Gb_38021	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.16	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01
Gb_38811	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_38830	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.18	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39045	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_40109	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.0	1.0	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.14	0.07	0.01	0.01	0.0
Gb_40342	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_40470	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40498	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40932	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41038	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41716	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)