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Heatmap: Cluster_336 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.0 -0.25 -0.68 -0.09 0.9 0.38 0.4 -0.29 -0.76 -0.73 -0.43 -0.35 -0.54 -0.49 -0.41 -0.59 -0.65 0.62 1.3 0.13
0.09 -0.05 -0.27 -0.13 0.47 0.64 -0.12 -0.11 -0.63 -0.64 0.07 -0.73 -0.77 -1.04 0.16 -0.45 -0.57 0.7 0.99 0.37
0.09 0.01 -0.2 0.17 0.51 0.23 -0.72 0.03 -0.48 -0.59 0.48 -0.63 -0.92 -1.09 0.46 -0.27 -0.78 0.16 1.24 0.04
0.34 -0.27 0.26 -0.01 0.66 -0.14 -0.38 -0.43 -0.54 -0.48 0.25 -0.93 -0.48 -0.67 0.34 -0.88 -0.5 -0.2 1.49 0.07
-0.44 1.08 -0.24 -0.09 0.73 0.43 0.22 -0.62 -0.58 -0.75 -0.03 -0.85 -1.82 -1.75 0.12 -0.3 -0.58 0.28 1.35 -0.3
0.23 0.21 -0.34 0.24 0.62 0.23 0.36 -0.13 -0.56 -0.61 -0.13 -0.59 0.37 0.01 -0.09 -0.63 -0.84 0.12 0.64 -0.31
0.48 0.38 -0.16 0.25 0.45 0.21 -0.55 0.02 -0.43 -0.59 -0.77 -0.63 -0.17 -0.18 -0.86 -0.32 -0.82 0.45 1.06 0.29
0.11 0.23 -0.09 0.04 0.78 -0.1 -0.08 -0.12 -0.48 -0.64 0.43 -0.35 -1.13 -1.23 0.37 -0.74 -0.81 0.3 0.8 0.55
0.2 0.69 0.01 -0.21 0.43 0.04 0.18 -0.21 -0.28 -0.35 0.26 -0.36 -0.65 -0.85 0.24 -0.69 -0.73 0.23 0.71 0.01
-0.31 0.13 -0.76 0.36 0.45 0.48 0.1 -0.08 -0.65 -0.77 0.02 -0.68 -0.4 -0.54 -0.03 -1.25 -0.98 0.22 1.77 -0.63
0.4 -0.1 0.05 0.29 0.22 -0.11 -0.12 0.05 -0.37 -0.6 0.08 -0.67 -0.38 -0.43 0.07 -0.95 -0.84 0.26 1.05 0.51
1.12 0.67 -0.15 0.93 1.92 -3.7 0.47 -2.0 -2.39 -2.41 -0.54 -1.56 -2.58 -2.57 -0.73 -2.25 -2.06 -1.32 1.82 0.26
0.27 0.21 -0.14 0.56 0.58 0.22 0.08 -0.08 -0.61 -0.74 0.08 -0.78 -0.75 -0.92 0.2 -0.7 -0.81 0.49 0.88 -0.01
0.64 0.31 0.21 0.41 0.96 0.79 0.94 -0.68 -2.21 -2.12 -0.11 -0.33 -2.23 -2.34 -0.0 -2.01 -1.78 0.07 1.2 0.05
-0.89 -0.06 -1.3 0.34 1.22 1.07 1.05 -0.23 -1.36 -1.3 -0.39 -0.52 -2.92 -2.82 -0.28 -2.23 -1.27 0.55 1.57 0.1
0.05 0.28 -0.33 0.1 0.31 0.18 0.55 -0.09 -0.57 -0.57 -0.35 -0.41 0.11 -0.09 -0.28 -0.43 -0.3 0.62 0.08 0.31
-0.59 0.61 -0.36 -0.33 0.22 -0.35 -0.22 -0.3 -0.63 -0.61 -0.05 -0.86 -0.04 -0.17 0.05 -0.94 -1.17 0.37 1.66 0.57
0.61 0.01 -0.23 0.14 0.45 0.12 0.14 -0.17 -0.76 -0.5 0.21 -0.36 -1.0 -1.35 0.18 -0.38 -0.34 0.14 1.13 -0.08
0.22 0.33 0.99 -0.04 0.73 -0.44 0.71 -0.25 -0.99 -0.97 -1.46 -1.27 -0.96 -1.15 -1.09 -0.67 -0.78 0.05 1.66 0.16
-0.05 0.31 -0.12 0.46 0.52 -0.13 0.33 -0.1 -0.24 -0.32 -0.75 -0.86 -0.53 -0.18 -0.64 -0.16 -1.22 0.53 0.86 0.45
-0.24 0.66 -0.2 0.59 0.59 0.15 -1.17 0.15 -1.1 -1.16 -0.44 -0.74 0.3 -0.31 -0.48 -1.31 -1.37 0.44 1.45 0.22
-0.15 -0.35 -0.55 0.06 0.3 0.75 0.04 0.02 -0.56 -0.48 -0.3 -0.39 -0.39 -0.48 -0.02 -0.62 -0.35 0.54 0.94 0.47
0.95 0.7 0.82 1.19 1.77 -2.37 -0.0 -1.28 -1.33 -2.87 0.01 -1.84 -1.76 -1.59 -0.4 -0.44 -1.98 -0.15 0.94 -1.43
0.72 0.42 0.14 0.78 1.27 0.61 -0.21 -0.06 -1.1 -1.05 -0.7 -0.66 -1.36 -1.37 -0.59 -1.22 -1.63 0.38 0.99 -0.42
0.18 0.33 0.06 0.41 0.52 0.31 0.09 -0.12 -0.8 -0.87 -0.45 -0.66 -0.02 -0.01 -0.28 -1.08 -0.92 0.4 0.83 0.27
-0.31 -0.49 -1.55 -0.12 1.38 -0.21 0.78 -0.66 -1.04 -0.98 -1.46 -1.1 -1.41 -0.96 -1.27 -0.6 -0.93 0.93 1.83 0.72
-0.11 0.54 -0.29 0.59 0.89 0.24 0.36 -0.14 -0.51 -0.78 -0.63 -0.05 -0.31 -0.26 -0.9 -1.38 -1.0 0.75 0.69 -0.29
0.22 0.45 -0.02 -0.15 0.24 -0.03 -0.02 -0.19 -0.34 -0.48 0.4 -0.7 -0.39 -0.62 0.44 -0.46 -0.58 -0.02 0.88 0.14
-0.01 -0.84 0.5 0.35 0.6 -0.29 -0.35 -0.37 -0.43 -0.24 0.53 -0.83 -1.08 -1.02 0.54 -1.0 0.2 -0.53 0.92 0.7
0.19 -0.82 -0.36 0.11 0.22 0.09 -0.08 -0.24 -0.7 -0.82 0.35 -0.74 -0.6 -0.6 0.46 -0.65 -0.59 0.96 0.88 0.65
0.46 0.22 0.24 0.24 0.21 -0.53 0.22 -0.51 -0.41 -0.36 -0.0 -1.01 -0.92 -0.9 -0.14 -0.16 -0.81 0.08 1.32 0.44
-0.2 0.36 -0.28 -0.08 0.76 0.22 -0.15 -0.16 -0.65 -0.35 -0.29 -0.37 -0.22 -0.3 -0.05 -1.29 -0.8 0.8 0.4 0.8
0.31 0.28 -0.14 0.3 0.4 -2.45 0.97 -0.58 -1.01 -0.66 0.74 -0.61 -0.58 -0.58 0.4 -0.95 -1.51 -0.17 1.21 0.12
0.03 0.03 -0.69 -0.3 0.22 0.56 0.03 -0.29 -0.67 -0.59 0.25 -0.72 -0.41 -0.93 0.3 -0.37 -0.7 0.49 1.25 0.35
0.2 0.32 0.48 0.03 0.39 -0.16 0.17 -0.03 -0.31 -0.34 0.07 -0.48 -0.48 -0.76 -0.01 -0.65 -0.5 -0.18 0.57 0.61
-0.16 0.42 -0.45 0.37 1.05 0.06 -0.35 -0.21 -0.82 -0.79 -1.06 -1.16 -0.5 -0.43 -0.77 -1.38 -0.4 1.57 1.09 -0.65
-0.36 -1.32 -1.05 0.13 0.96 0.27 0.1 -0.24 -0.61 -0.65 0.11 -0.7 -0.43 -0.38 0.1 -0.5 -0.36 0.39 1.23 0.55
-0.07 -0.98 -0.38 0.15 0.3 -0.2 0.3 -0.12 -0.34 -0.34 0.39 -0.71 -0.88 -1.16 0.39 -0.49 -0.22 0.23 1.25 0.56
-0.93 -0.24 0.54 0.59 0.75 -0.22 0.05 -0.99 -1.23 -0.88 -0.11 -0.83 -2.1 -2.24 -0.01 -1.04 -0.02 0.04 2.12 -0.28
-0.3 0.71 -0.44 0.13 0.78 0.21 0.78 -0.16 -0.9 -0.8 -0.26 -1.43 -0.31 -0.65 -0.13 -1.08 -1.47 1.1 1.0 -0.78
-0.17 -0.89 -0.55 1.09 1.25 1.32 -1.27 -0.7 -4.21 -3.94 -3.79 -1.84 -3.33 -2.54 -2.85 -1.34 -0.98 1.92 1.64 0.22
0.28 -0.25 -0.24 0.82 0.92 -0.57 -0.58 -0.11 -0.8 -0.94 -0.41 -0.9 -0.61 -0.57 -0.29 -0.77 -0.55 1.07 1.31 -0.32
0.17 -0.01 -0.42 0.23 0.77 -0.04 0.17 -0.25 -0.62 -0.59 -0.01 -0.78 -0.71 -0.95 0.12 -0.89 -0.74 0.68 1.07 0.44
-0.41 -0.03 -0.45 0.41 1.17 -0.27 -0.41 -0.23 -0.57 -0.64 -0.07 -1.14 -0.58 -0.58 0.13 -0.55 -0.41 0.48 1.32 0.07
-0.28 0.9 -0.34 -0.07 1.24 0.26 0.43 -0.25 -0.88 -0.78 -0.64 -1.18 -0.48 -0.46 -0.59 -1.35 -1.61 0.54 1.26 -0.09
0.02 0.39 -0.09 -0.13 0.65 -0.18 -0.07 -0.05 -0.46 -0.65 0.06 -0.46 -0.36 -0.5 0.04 -0.52 -0.77 0.49 0.97 0.21
0.28 0.56 0.36 0.61 0.84 -0.24 -0.41 -0.35 -0.6 -0.41 -0.29 -0.63 -0.73 -0.62 -0.23 -0.82 -0.84 0.22 1.1 -0.12
1.03 -0.1 0.13 0.49 0.57 -1.01 -1.42 -0.08 -0.53 -0.92 0.24 -1.04 -0.05 -0.08 0.1 -0.96 -1.54 -0.42 1.59 -0.45
0.21 0.38 -0.25 0.05 0.95 0.37 0.36 -0.3 -1.41 -1.32 -1.01 -0.64 0.28 0.21 -1.08 -1.43 -1.18 0.5 0.92 0.55
-0.48 0.29 -0.58 0.07 0.27 0.07 -0.67 -0.1 -0.54 -0.67 -0.0 -0.93 -0.09 -0.38 -0.02 -0.69 -0.71 0.48 1.46 0.69
0.17 0.56 0.21 0.1 0.42 0.09 -0.05 0.01 -0.3 -0.4 -0.23 -0.1 -1.17 -1.35 -0.03 -0.93 -1.15 0.28 1.12 0.33
0.35 -0.4 -0.3 -0.18 0.5 0.41 0.11 0.32 -0.18 -0.36 -0.36 -0.35 -1.29 -1.37 -0.38 -0.34 -0.29 0.51 1.28 -0.07
0.65 -1.47 -0.03 0.91 0.88 0.74 0.36 -0.42 -2.05 -2.25 -1.38 -0.48 -1.49 -1.12 -1.57 -0.92 0.21 1.05 0.58 0.79
0.06 0.43 -0.02 0.14 0.94 0.35 0.33 -0.22 -0.68 -0.66 -0.48 -0.63 -0.18 -0.14 -0.38 -1.1 -1.3 0.69 0.62 0.02
-0.34 1.21 0.21 -0.19 1.35 -1.0 0.24 -2.79 -3.28 -2.61 -4.43 -1.73 -4.96 -5.08 -3.54 -3.38 -4.85 0.63 2.69 0.69
-0.18 -0.05 -0.66 -0.02 0.47 -0.13 -0.08 -0.29 -0.48 -0.5 0.16 -0.83 -0.64 -0.83 0.28 0.07 0.07 0.57 0.16 1.17
0.8 0.06 0.49 0.57 0.7 -0.19 -0.82 -0.17 -0.91 -0.9 -0.01 -0.98 -0.63 -0.82 -0.06 -0.86 -0.63 0.32 1.3 -0.45
-0.56 -0.31 -0.81 0.03 0.69 0.52 0.0 0.01 -0.74 -0.84 0.22 -1.24 -0.11 -0.56 0.17 -0.63 -0.7 -0.11 1.67 0.03
0.19 -0.62 -0.29 0.19 0.27 0.27 -0.04 -0.33 -0.81 -0.7 0.69 -0.94 -0.85 -0.97 0.76 -0.71 -0.33 0.74 0.45 0.63
-0.92 0.29 -0.31 0.54 0.23 0.54 0.47 -0.23 -1.25 -0.88 0.39 -1.3 -1.74 -1.97 0.43 -1.16 -1.26 0.53 1.7 0.02
0.25 0.3 -0.16 0.53 0.93 -0.02 0.32 -0.05 -0.56 -0.61 -0.34 -0.48 -0.23 -0.31 -0.31 -1.19 -1.27 0.36 1.09 -0.82
0.09 0.34 0.04 0.04 0.63 0.7 0.57 -0.26 -0.73 -0.59 -0.51 -0.47 -0.72 -0.63 -0.41 -1.01 -0.28 0.17 1.05 -0.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.