1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_224 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
10.11 48.08 15.86 7.77 10.7 24.11 9.29 33.49 24.86 27.29 33.07 12.21 21.51 14.55 32.7 15.98 13.81 12.15 12.45 47.98
0.53 0.65 0.54 0.09 0.26 12.23 0.01 3.48 0.6 0.48 3.08 1.7 0.65 0.7 1.63 0.14 0.67 0.42 0.6 1.25
0.77 0.06 0.08 0.63 0.02 0.0 0.47 0.25 0.0 0.01 0.1 0.2 0.19 0.08 0.12 0.04 0.07 0.14 0.14 0.1
0.44 0.89 0.62 0.37 0.35 0.2 0.0 2.58 1.25 1.37 2.13 0.46 5.64 3.39 2.07 0.07 0.11 0.15 0.01 0.31
0.52 0.18 0.13 0.16 0.08 2.11 0.02 4.94 2.64 3.04 0.82 1.69 2.1 2.07 0.43 2.77 3.97 0.04 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.82 0.08 0.14 0.21 0.07 0.7 1.2 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.34 0.12 0.17 0.04 2.2 0.25 3.86 1.86 1.83 2.24 0.85 3.75 3.11 2.18 1.56 1.03 0.26 0.0 3.32
0.29 0.47 0.46 0.0 0.27 2.27 0.57 6.22 1.71 2.19 3.17 2.15 5.95 3.76 2.41 1.99 2.84 0.7 0.0 4.11
3.45 2.21 7.44 2.43 2.35 23.26 0.31 8.37 0.37 0.26 0.6 2.86 2.23 1.54 0.31 0.01 0.25 0.07 0.3 1.21
4.88 0.37 1.79 3.42 3.43 73.07 3.19 52.36 9.61 9.12 12.28 10.47 10.4 10.1 9.16 6.85 9.02 3.48 2.15 29.92
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.2 5.49 2.2 2.56 2.51 3.67 4.11 3.91 1.36 0.0 0.0 0.0 0.02 3.95
0.43 0.69 0.31 0.0 2.16 18.59 16.7 20.55 0.14 0.06 3.72 16.17 6.47 4.24 2.51 0.0 0.22 4.52 1.54 15.01
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.03 0.04 0.07 0.18 3.9 0.11 6.95 0.18 0.26 0.56 0.9 1.49 0.57 0.36 0.03 0.17 0.08 0.12 0.75
123.16 9.1 7.28 0.23 0.72 1.93 47.94 50.63 2.05 3.02 6.79 10.42 32.96 13.61 1.8 0.05 0.15 2.99 1.29 50.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.66 3.3 1.21 0.38 1.53 132.98 99.41 52.51 9.54 13.41 3.82 11.11 2.58 3.73 1.66 0.43 0.28 0.43 0.0 6.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.0 0.05 0.13 0.0 0.0 0.0 5.77 1.03 1.51 0.0 2.55 8.83 7.44 0.35 0.05 0.0 0.02 0.0 4.17
1.76 1.76 0.5 1.88 2.0 26.62 0.12 22.38 5.25 5.22 3.5 8.52 20.18 14.76 2.19 1.21 2.82 8.59 5.71 13.51
7.51 9.62 2.08 0.27 0.61 13.33 10.15 61.53 2.85 2.96 4.82 15.82 30.67 31.96 2.97 0.04 2.05 0.39 0.02 6.52
10.0 0.0 4.65 4.38 3.03 12.74 28.58 65.45 2.02 1.65 2.98 11.23 20.02 25.79 0.0 0.0 0.09 0.0 0.08 36.87
0.02 0.03 0.04 0.0 0.04 0.65 0.01 2.0 1.04 1.55 1.74 0.82 3.23 2.49 1.76 0.42 0.33 0.08 0.0 1.62
2.71 3.15 0.57 0.65 0.35 7.95 0.78 1.65 0.03 0.0 0.09 0.1 0.3 0.19 0.02 0.0 0.01 0.2 0.02 0.73
0.02 0.0 0.09 0.14 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.71 1.86 2.4 1.71 2.5 16.44 2.63 34.38 8.76 11.24 11.76 14.36 8.32 6.98 8.15 1.21 1.79 8.68 19.17 18.49
10.52 39.48 8.45 10.12 6.7 25.89 1.39 96.51 61.33 55.27 54.59 73.46 74.35 41.39 47.72 67.68 42.39 3.04 0.09 8.85
0.37 0.02 0.0 0.0 2.27 11.26 0.01 13.7 0.06 0.3 0.17 0.0 0.03 0.19 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 5.59
0.32 0.04 0.0 0.03 2.64 14.58 0.02 10.87 0.05 0.28 0.16 0.0 0.07 0.19 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 2.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14
0.82 0.42 0.24 0.0 0.08 0.4 0.0 1.01 0.17 0.23 0.07 0.68 0.09 0.22 0.01 0.04 0.2 0.31 0.78 1.3
0.98 0.0 0.0 0.56 0.95 23.42 0.6 75.54 0.12 0.3 1.47 7.28 2.35 5.71 0.37 0.0 0.0 0.08 0.1 1.4
2.2 4.11 2.64 1.53 1.24 2.33 0.27 7.78 5.38 6.27 7.45 3.86 12.29 10.1 6.67 1.48 3.5 6.68 0.62 12.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.28 0.07 0.02 0.36 0.23 11.58 1.53 22.43 0.31 0.32 1.5 3.53 1.94 2.57 0.91 0.05 0.01 0.16 0.71 14.73
0.19 0.12 0.0 0.0 0.0 0.76 1.88 0.76 0.12 0.04 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.07 0.06 1.93 18.85 9.35 0.27 0.41 4.13 0.77 3.32 1.06 1.84 0.0 0.07 0.07 0.04 0.04
14.93 8.45 18.43 12.68 22.34 37.98 11.17 16.78 3.93 5.3 1.28 14.04 3.1 6.12 0.82 0.74 5.32 5.13 1.0 51.72
0.29 0.47 0.46 0.0 0.27 2.27 0.57 6.22 1.71 2.19 3.17 2.15 5.95 3.76 2.41 1.99 2.84 0.7 0.0 4.11
0.27 0.34 0.12 0.17 0.04 2.2 0.25 3.86 1.86 1.83 2.24 0.85 3.75 3.11 2.18 1.56 1.03 0.26 0.0 3.32
0.53 0.65 0.54 0.09 0.26 12.23 0.01 3.48 0.6 0.48 3.08 1.7 0.65 0.7 1.63 0.14 0.67 0.42 0.6 1.25
0.26 0.0 0.0 0.09 0.03 0.99 0.21 3.45 0.79 1.11 4.17 2.99 0.85 0.36 2.78 0.11 1.11 0.54 0.01 3.44
7.05 0.42 0.38 0.0 0.27 26.22 0.6 10.21 0.11 0.14 0.02 0.45 0.13 0.35 0.0 0.06 0.0 2.9 0.46 17.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.03
1.92 0.49 2.22 2.07 2.0 5.85 1.59 10.93 0.42 0.34 0.82 0.86 1.48 2.65 0.5 0.31 0.08 0.42 0.23 36.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.63 0.02 0.05 0.04 0.1 0.14 0.29 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.41
1.64 0.61 0.79 3.99 3.56 9.38 0.08 25.28 2.31 1.82 13.38 18.1 22.53 25.25 16.22 0.17 0.25 2.1 0.24 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.58 0.0 3.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.02 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.17 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25
2.36 0.19 0.62 0.67 0.38 4.02 0.01 2.0 0.22 0.33 0.13 0.17 0.22 0.19 0.01 0.0 0.11 0.41 0.2 2.08
0.46 0.16 0.16 0.16 0.46 2.29 0.57 6.16 2.2 2.11 3.11 2.05 7.4 5.03 1.91 0.21 0.32 0.33 0.16 2.87
1.22 0.29 0.8 4.09 4.71 15.44 0.04 20.4 2.14 2.79 3.48 8.74 11.63 16.79 2.29 2.83 6.24 0.02 0.0 0.69
3.23 2.05 1.04 1.93 5.09 45.54 5.0 31.77 10.22 11.53 9.53 16.84 14.78 10.81 8.78 2.16 3.37 16.08 1.96 7.68
1.7 0.78 0.1 0.08 0.33 8.36 1.49 20.61 0.98 0.94 1.54 3.69 11.58 8.35 0.6 0.0 0.0 0.4 0.59 6.98
3.75 1.85 4.0 4.74 12.51 30.96 4.83 21.59 5.26 8.5 32.37 14.41 6.91 8.22 17.04 3.54 9.03 12.18 0.26 48.96
0.2 0.13 0.09 0.0 0.0 0.4 0.1 2.36 0.08 0.16 0.5 0.23 0.9 0.58 0.26 0.0 0.02 0.0 0.0 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.21 1.26 2.55 1.72 0.98 2.23 0.89 7.96 7.34 6.61 4.76 2.7 6.79 6.4 2.98 5.7 2.2 0.85 0.4 2.14
2.93 0.39 1.02 0.14 2.29 38.33 0.11 19.38 0.18 0.52 0.46 1.92 2.0 1.29 1.03 0.0 0.05 0.04 0.01 12.06
2.93 0.39 1.02 0.14 2.29 38.33 0.11 19.38 0.18 0.52 0.46 1.92 2.0 1.29 1.03 0.0 0.05 0.04 0.01 12.06
2.41 1.69 1.38 1.73 3.02 13.53 2.3 47.76 6.8 5.56 8.26 20.02 15.74 18.14 7.0 1.53 2.85 4.31 20.8 5.25
0.21 0.32 0.27 0.0 3.59 3.46 0.01 1.0 0.0 0.06 0.13 0.28 0.17 0.13 0.05 0.0 0.03 0.02 0.0 0.07
0.19 0.43 0.19 0.32 0.1 2.03 1.58 6.83 4.64 3.28 4.56 4.84 8.53 6.43 4.01 1.51 1.91 0.16 0.15 9.08
0.01 0.0 0.0 0.06 0.05 4.04 0.0 3.82 1.19 1.29 2.59 1.02 2.15 1.52 2.81 0.08 0.41 0.03 0.01 2.44
0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 1.0 0.0 0.72 0.16 0.29 0.17 0.22 0.19 0.19 0.28 0.0 0.11 0.0 0.01 0.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.11 0.0 2.15 0.94 0.83 0.06 2.47 0.02 0.0 0.0 0.12 1.24 0.0 0.01 0.0
0.11 0.0 0.04 0.32 0.0 0.37 0.0 4.83 2.81 3.19 0.02 6.35 0.02 0.09 0.04 0.23 1.43 0.0 0.0 0.0
0.08 0.13 0.08 0.0 0.12 0.27 0.04 3.9 2.31 1.66 0.01 4.25 0.08 0.1 0.0 0.0 1.53 0.0 0.03 0.06
0.09 0.0 0.0 0.0 0.01 8.45 0.0 19.6 0.23 0.67 1.16 0.78 2.5 2.12 0.52 0.0 0.0 0.05 0.02 0.91
1.03 0.0 0.04 0.0 0.38 11.88 0.17 6.96 0.02 0.0 0.0 0.58 0.13 0.31 0.27 0.0 0.4 1.1 4.47 4.11
0.23 0.0 0.0 0.0 0.13 6.81 0.3 6.71 0.0 0.07 2.85 1.49 0.51 2.42 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.7 0.0 3.56 1.31 0.36 0.0 0.5 10.1 8.72 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
0.97 1.0 2.21 0.57 0.77 0.61 0.03 2.6 2.2 2.97 1.25 0.34 0.99 0.6 0.68 0.35 0.7 0.24 0.08 0.04
1.13 1.88 4.03 3.28 2.18 2.71 0.0 1.86 0.66 0.58 0.22 0.02 0.21 0.06 0.04 0.12 1.28 1.31 0.43 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.7 4.36 2.68 1.8 2.61 5.75 3.11 4.5 2.49 3.02 5.29 4.49 2.58 2.29 4.24 4.75 2.36 4.59 3.16 6.41
1.2 1.76 2.48 1.31 1.79 23.62 1.43 9.62 1.95 2.09 6.33 4.64 7.51 6.0 3.91 0.15 1.23 0.69 1.54 1.06
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 1.52 0.1 0.14 0.2 0.28 0.05 0.03 0.1 0.01 0.0 0.02 0.02 0.33
0.9 0.0 2.43 1.59 0.8 2.73 3.2 17.09 1.11 0.98 2.14 4.98 1.52 2.28 1.59 0.0 1.14 1.84 0.71 6.16
0.79 1.4 0.64 0.22 0.8 1.39 0.87 6.32 6.35 5.07 3.14 3.73 3.35 3.23 2.7 0.38 0.35 2.52 0.58 17.01
33.99 0.83 8.37 0.0 0.35 0.67 1.59 35.23 0.04 0.0 0.54 3.25 2.1 2.46 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 2.97
0.16 0.21 0.16 0.09 0.08 0.18 0.09 0.58 0.86 0.8 0.35 0.18 1.01 0.9 0.31 0.67 0.12 0.04 0.09 0.34
0.19 0.12 0.0 0.0 0.0 0.76 1.88 0.76 0.12 0.04 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 1.37 0.64 1.04 0.27 1.75 1.84 1.41 0.05 0.1 1.38 0.0 0.0 0.43

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)