Heatmap: Cluster_224 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_01046	0.21	1.0	0.33	0.16	0.22	0.5	0.19	0.7	0.52	0.57	0.69	0.25	0.45	0.3	0.68	0.33	0.29	0.25	0.26	1.0
Gb_01792	0.04	0.05	0.04	0.01	0.02	1.0	0.0	0.28	0.05	0.04	0.25	0.14	0.05	0.06	0.13	0.01	0.05	0.03	0.05	0.1
Gb_02317	1.0	0.08	0.1	0.82	0.02	0.0	0.61	0.32	0.0	0.02	0.13	0.25	0.25	0.1	0.15	0.06	0.09	0.18	0.18	0.13
Gb_02322	0.08	0.16	0.11	0.07	0.06	0.04	0.0	0.46	0.22	0.24	0.38	0.08	1.0	0.6	0.37	0.01	0.02	0.03	0.0	0.05
Gb_02432	0.11	0.04	0.03	0.03	0.02	0.43	0.0	1.0	0.53	0.61	0.17	0.34	0.43	0.42	0.09	0.56	0.8	0.01	0.0	0.02
Gb_04259	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.03	0.0	0.69	0.07	0.12	0.17	0.06	0.58	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04497	0.07	0.09	0.03	0.05	0.01	0.57	0.06	1.0	0.48	0.47	0.58	0.22	0.97	0.8	0.56	0.4	0.27	0.07	0.0	0.86
Gb_04499	0.05	0.08	0.07	0.0	0.04	0.36	0.09	1.0	0.27	0.35	0.51	0.35	0.96	0.6	0.39	0.32	0.46	0.11	0.0	0.66
Gb_04567	0.15	0.09	0.32	0.1	0.1	1.0	0.01	0.36	0.02	0.01	0.03	0.12	0.1	0.07	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.05
Gb_04838	0.07	0.01	0.02	0.05	0.05	1.0	0.04	0.72	0.13	0.12	0.17	0.14	0.14	0.14	0.13	0.09	0.12	0.05	0.03	0.41
Gb_05594	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	1.0	0.4	0.47	0.46	0.67	0.75	0.71	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.72
Gb_07847	0.02	0.03	0.01	0.0	0.11	0.9	0.81	1.0	0.01	0.0	0.18	0.79	0.31	0.21	0.12	0.0	0.01	0.22	0.08	0.73
Gb_08204	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.75	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09144	0.04	0.0	0.01	0.01	0.03	0.56	0.02	1.0	0.03	0.04	0.08	0.13	0.21	0.08	0.05	0.0	0.02	0.01	0.02	0.11
Gb_10410	1.0	0.07	0.06	0.0	0.01	0.02	0.39	0.41	0.02	0.02	0.06	0.08	0.27	0.11	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.41
Gb_10525	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_12159	0.03	0.02	0.01	0.0	0.01	1.0	0.75	0.39	0.07	0.1	0.03	0.08	0.02	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05
Gb_13025	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_13106	0.02	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.65	0.12	0.17	0.0	0.29	1.0	0.84	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.47
Gb_13107	0.07	0.07	0.02	0.07	0.08	1.0	0.0	0.84	0.2	0.2	0.13	0.32	0.76	0.55	0.08	0.05	0.11	0.32	0.21	0.51
Gb_13559	0.12	0.16	0.03	0.0	0.01	0.22	0.16	1.0	0.05	0.05	0.08	0.26	0.5	0.52	0.05	0.0	0.03	0.01	0.0	0.11
Gb_13572	0.15	0.0	0.07	0.07	0.05	0.19	0.44	1.0	0.03	0.03	0.05	0.17	0.31	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56
Gb_13898	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.2	0.0	0.62	0.32	0.48	0.54	0.26	1.0	0.77	0.55	0.13	0.1	0.03	0.0	0.5
Gb_14581	0.34	0.4	0.07	0.08	0.04	1.0	0.1	0.21	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.02	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.09
Gb_14985	0.16	0.0	0.65	1.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.31	0.5	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15093	0.11	0.05	0.07	0.05	0.07	0.48	0.08	1.0	0.25	0.33	0.34	0.42	0.24	0.2	0.24	0.04	0.05	0.25	0.56	0.54
Gb_16281	0.11	0.41	0.09	0.1	0.07	0.27	0.01	1.0	0.64	0.57	0.57	0.76	0.77	0.43	0.49	0.7	0.44	0.03	0.0	0.09
Gb_17577	0.03	0.0	0.0	0.0	0.17	0.82	0.0	1.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.41
Gb_17578	0.02	0.0	0.0	0.0	0.18	1.0	0.0	0.75	0.0	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14
Gb_18008	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_18098	0.63	0.33	0.19	0.0	0.06	0.31	0.0	0.78	0.13	0.18	0.06	0.52	0.07	0.17	0.01	0.03	0.16	0.24	0.6	1.0
Gb_18170	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.31	0.01	1.0	0.0	0.0	0.02	0.1	0.03	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
Gb_18879	0.17	0.32	0.21	0.12	0.1	0.18	0.02	0.61	0.42	0.49	0.58	0.3	0.96	0.79	0.52	0.12	0.27	0.52	0.05	1.0
Gb_19172	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_19590	0.06	0.0	0.0	0.02	0.01	0.52	0.07	1.0	0.01	0.01	0.07	0.16	0.09	0.11	0.04	0.0	0.0	0.01	0.03	0.66
Gb_20833	0.1	0.07	0.0	0.0	0.0	0.41	1.0	0.4	0.06	0.02	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21755	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	1.0	0.5	0.01	0.02	0.22	0.04	0.18	0.06	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21894	0.29	0.16	0.36	0.25	0.43	0.73	0.22	0.32	0.08	0.1	0.02	0.27	0.06	0.12	0.02	0.01	0.1	0.1	0.02	1.0
Gb_22050	0.05	0.08	0.07	0.0	0.04	0.36	0.09	1.0	0.27	0.35	0.51	0.35	0.96	0.6	0.39	0.32	0.46	0.11	0.0	0.66
Gb_22052	0.07	0.09	0.03	0.05	0.01	0.57	0.06	1.0	0.48	0.47	0.58	0.22	0.97	0.8	0.56	0.4	0.27	0.07	0.0	0.86
Gb_22146	0.04	0.05	0.04	0.01	0.02	1.0	0.0	0.28	0.05	0.04	0.25	0.14	0.05	0.06	0.13	0.01	0.05	0.03	0.05	0.1
Gb_22261	0.06	0.0	0.0	0.02	0.01	0.24	0.05	0.83	0.19	0.27	1.0	0.72	0.2	0.09	0.67	0.03	0.27	0.13	0.0	0.82
Gb_22645	0.27	0.02	0.01	0.0	0.01	1.0	0.02	0.39	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.11	0.02	0.66
Gb_22677	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.07	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.16	0.26
Gb_23109	0.05	0.01	0.06	0.06	0.06	0.16	0.04	0.3	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	1.0
Gb_23184	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23262	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23403	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.02	1.0	0.03	0.09	0.07	0.17	0.23	0.47	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.65
Gb_23691	0.06	0.02	0.03	0.16	0.14	0.37	0.0	1.0	0.09	0.07	0.53	0.72	0.89	1.0	0.64	0.01	0.01	0.08	0.01	0.02
Gb_23927	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.01	0.08
Gb_24337	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.92	0.66	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_24391	0.59	0.05	0.15	0.17	0.09	1.0	0.0	0.5	0.06	0.08	0.03	0.04	0.05	0.05	0.0	0.0	0.03	0.1	0.05	0.52
Gb_24393	0.06	0.02	0.02	0.02	0.06	0.31	0.08	0.83	0.3	0.29	0.42	0.28	1.0	0.68	0.26	0.03	0.04	0.05	0.02	0.39
Gb_24415	0.06	0.01	0.04	0.2	0.23	0.76	0.0	1.0	0.11	0.14	0.17	0.43	0.57	0.82	0.11	0.14	0.31	0.0	0.0	0.03
Gb_24592	0.07	0.05	0.02	0.04	0.11	1.0	0.11	0.7	0.22	0.25	0.21	0.37	0.32	0.24	0.19	0.05	0.07	0.35	0.04	0.17
Gb_25098	0.08	0.04	0.0	0.0	0.02	0.41	0.07	1.0	0.05	0.05	0.07	0.18	0.56	0.4	0.03	0.0	0.0	0.02	0.03	0.34
Gb_25232	0.08	0.04	0.08	0.1	0.26	0.63	0.1	0.44	0.11	0.17	0.66	0.29	0.14	0.17	0.35	0.07	0.18	0.25	0.01	1.0
Gb_25256	0.08	0.06	0.04	0.0	0.0	0.17	0.04	1.0	0.04	0.07	0.21	0.1	0.38	0.25	0.11	0.0	0.01	0.0	0.0	0.11
Gb_25262	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25297	0.28	0.16	0.32	0.22	0.12	0.28	0.11	1.0	0.92	0.83	0.6	0.34	0.85	0.8	0.37	0.72	0.28	0.11	0.05	0.27
Gb_25693	0.08	0.01	0.03	0.0	0.06	1.0	0.0	0.51	0.0	0.01	0.01	0.05	0.05	0.03	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31
Gb_25694	0.08	0.01	0.03	0.0	0.06	1.0	0.0	0.51	0.0	0.01	0.01	0.05	0.05	0.03	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31
Gb_26256	0.05	0.04	0.03	0.04	0.06	0.28	0.05	1.0	0.14	0.12	0.17	0.42	0.33	0.38	0.15	0.03	0.06	0.09	0.44	0.11
Gb_26345	0.06	0.09	0.07	0.0	1.0	0.96	0.0	0.28	0.0	0.02	0.03	0.08	0.05	0.04	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02
Gb_28794	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.22	0.17	0.75	0.51	0.36	0.5	0.53	0.94	0.71	0.44	0.17	0.21	0.02	0.02	1.0
Gb_30560	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	1.0	0.0	0.94	0.29	0.32	0.64	0.25	0.53	0.38	0.69	0.02	0.1	0.01	0.0	0.6
Gb_30561	0.0	0.02	0.0	0.04	0.0	1.0	0.0	0.71	0.16	0.29	0.17	0.22	0.19	0.19	0.28	0.0	0.11	0.0	0.01	0.44
Gb_30948	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.0	0.87	0.38	0.34	0.02	1.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.5	0.0	0.0	0.0
Gb_30950	0.02	0.0	0.01	0.05	0.0	0.06	0.0	0.76	0.44	0.5	0.0	1.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.23	0.0	0.0	0.0
Gb_30955	0.02	0.03	0.02	0.0	0.03	0.06	0.01	0.92	0.54	0.39	0.0	1.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.36	0.0	0.01	0.01
Gb_32742	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	1.0	0.01	0.03	0.06	0.04	0.13	0.11	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05
Gb_33099	0.09	0.0	0.0	0.0	0.03	1.0	0.01	0.59	0.0	0.0	0.0	0.05	0.01	0.03	0.02	0.0	0.03	0.09	0.38	0.35
Gb_33948	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.04	0.99	0.0	0.01	0.42	0.22	0.07	0.36	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01
Gb_35483	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.07	0.0	0.35	0.13	0.04	0.0	0.05	1.0	0.86	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Gb_36110	0.33	0.34	0.75	0.19	0.26	0.21	0.01	0.88	0.74	1.0	0.42	0.11	0.33	0.2	0.23	0.12	0.23	0.08	0.03	0.02
Gb_36111	0.28	0.47	1.0	0.81	0.54	0.67	0.0	0.46	0.17	0.14	0.05	0.0	0.05	0.02	0.01	0.03	0.32	0.32	0.11	0.0
Gb_36528	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37180	0.58	0.68	0.42	0.28	0.41	0.9	0.48	0.7	0.39	0.47	0.82	0.7	0.4	0.36	0.66	0.74	0.37	0.72	0.49	1.0
Gb_37774	0.05	0.07	0.1	0.06	0.08	1.0	0.06	0.41	0.08	0.09	0.27	0.2	0.32	0.25	0.17	0.01	0.05	0.03	0.07	0.04
Gb_38338	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	1.0	0.07	0.09	0.13	0.18	0.03	0.02	0.06	0.01	0.0	0.01	0.01	0.22
Gb_38726	0.05	0.0	0.14	0.09	0.05	0.16	0.19	1.0	0.07	0.06	0.13	0.29	0.09	0.13	0.09	0.0	0.07	0.11	0.04	0.36
Gb_38820	0.05	0.08	0.04	0.01	0.05	0.08	0.05	0.37	0.37	0.3	0.18	0.22	0.2	0.19	0.16	0.02	0.02	0.15	0.03	1.0
Gb_39034	0.96	0.02	0.24	0.0	0.01	0.02	0.05	1.0	0.0	0.0	0.02	0.09	0.06	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08
Gb_39753	0.16	0.21	0.16	0.09	0.08	0.18	0.09	0.57	0.85	0.8	0.35	0.18	1.0	0.89	0.31	0.66	0.12	0.04	0.09	0.34
Gb_40382	0.1	0.07	0.0	0.0	0.0	0.41	1.0	0.4	0.06	0.02	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_41426	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.74	0.35	0.56	0.15	0.95	1.0	0.77	0.03	0.06	0.75	0.0	0.0	0.24

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)