1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_253 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
15.87 16.83 10.68 21.9 22.97 27.66 6.55 18.03 19.48 16.15 26.04 13.72 7.01 6.23 23.64 25.63 20.08 27.9 46.32 20.1
0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.0 0.0 0.02 0.05
0.01 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.12 0.0
0.11 0.16 0.0 0.21 0.04 0.09 0.05 0.1 0.06 0.06 0.0 0.0 0.09 0.11 0.07 0.34 0.06 0.0 0.19 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.19 0.0 0.35 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.17 0.0
0.38 0.0 0.24 1.11 0.26 0.32 0.17 0.38 0.36 0.38 0.87 0.0 0.74 0.6 0.8 0.75 0.17 0.21 0.5 0.56
0.57 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.21 0.34 0.16 0.0 0.21 0.0 0.32 0.33 0.84 0.05 0.67 0.15 0.33 0.5
0.02 0.17 0.12 0.0 0.08 0.0 0.03 0.11 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.04 0.05 0.05 0.07 0.33 0.1
0.07 0.0 0.05 0.84 0.0 0.0 0.03 0.1 0.01 0.1 0.04 0.0 0.03 0.02 0.08 0.3 0.06 0.0 0.29 0.0
0.01 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.31 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.15 0.25 0.43 0.0 0.0 0.0 0.28 0.06 0.0
0.0 0.43 0.0 0.63 0.0 0.0 0.15 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.25 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.1 0.07 0.28 0.05 0.0 0.0 0.09 0.03 0.08 0.02 0.0 0.08 0.08 0.06 0.21 0.08 0.16 0.19 0.04
0.03 0.0 0.12 0.19 0.0 0.0 0.07 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.02 0.0
0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.03 0.04 0.03 0.08 0.0 0.04 0.06 0.07 0.03 0.01 0.0 0.02 0.0
0.05 0.16 0.09 0.7 0.0 0.0 0.08 0.06 0.02 0.0 0.02 0.0 0.03 0.03 0.01 0.32 0.36 0.0 0.17 0.03
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.17 0.12 2.02 0.05 0.0 0.05 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.16 0.07 0.0 0.09 0.0
0.02 0.07 0.0 0.22 0.09 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.12 0.0 0.17 0.0
0.32 0.89 0.06 2.08 0.27 0.04 0.26 0.36 0.07 0.3 0.03 0.03 0.14 0.02 0.11 0.69 0.8 0.06 1.79 0.03
0.25 0.4 0.06 1.35 0.03 0.0 0.14 0.22 0.08 0.1 0.03 0.0 0.1 0.02 0.08 0.09 0.17 0.1 1.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02
0.0 0.0 0.04 0.17 0.0 0.0 0.05 0.04 0.05 0.0 0.07 0.0 0.07 0.06 0.0 0.14 0.06 0.0 0.03 0.0
0.06 0.18 0.11 0.82 0.0 0.0 0.22 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.11 0.13 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0
0.03 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.16 0.11 0.0 0.08 0.0
0.18 0.13 0.0 1.13 1.15 1.91 0.44 0.97 0.23 0.43 1.0 0.96 0.69 0.63 0.98 0.28 0.97 3.55 0.2 1.41
0.1 0.13 0.03 0.58 0.05 0.0 0.03 0.08 0.06 0.07 0.04 0.0 0.16 0.11 0.09 0.29 0.21 0.0 0.15 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.0 0.0 0.37 0.06 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.14 0.04 0.02 0.37 0.02 0.06 0.01 0.09 0.03 0.09 0.0 0.0 0.09 0.05 0.03 0.08 0.04 0.0 0.15 0.03
0.2 0.0 0.0 0.28 0.02 0.0 0.0 0.09 0.06 0.06 0.0 0.01 0.14 0.06 0.13 0.23 0.05 0.03 0.19 0.12
0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0
0.42 0.21 0.03 1.13 0.24 0.06 0.07 0.25 0.19 0.2 0.05 0.01 0.32 0.28 0.1 1.01 0.23 0.23 0.3 0.26
0.25 0.05 0.1 0.34 0.1 0.08 0.08 0.16 0.1 0.05 0.17 0.01 0.23 0.13 0.15 0.76 0.09 0.06 0.21 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.01 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.09 0.0 0.13 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.32 0.36 0.0 0.0 0.04 0.02 0.18 0.12 0.21 0.5 0.07 0.01 0.0 0.57 0.14 0.06 0.05 0.09 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.14 0.12 0.02 0.1 0.11 0.02 0.02 0.06 0.05 0.01 0.03 0.0 0.09 0.12 0.02 0.11 0.07 0.03 0.13 0.06
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.03 0.11 0.0 0.06 0.04 0.04 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.07 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.01 0.0 0.0 0.83 7.94 2.13 0.02 0.55 0.34 0.35 0.05 0.05 0.01 0.12 0.08 0.24 0.48 5.14 0.47 0.49
0.19 0.54 0.14 5.97 16.66 3.5 0.05 4.32 4.9 4.71 1.1 1.47 0.52 1.97 0.4 1.33 1.97 7.92 1.58 0.71
0.05 0.78 0.2 1.99 0.05 0.0 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.22 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.07 0.02 0.0 0.15 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.56 0.69 0.15 0.0 0.07 0.01 0.04 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.27 0.35 1.31 1.83 0.23
0.01 0.15 0.0 0.26 0.6 0.03 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.04 0.03
0.01 0.0 0.0 1.06 6.0 1.56 0.0 0.64 0.25 0.36 0.04 0.02 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 2.46 1.35 0.29
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.05 0.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.02 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
10.72 9.5 5.54 10.67 13.77 15.36 5.66 11.17 8.81 7.37 14.45 7.62 7.88 6.82 15.37 10.97 9.91 18.63 17.89 11.47
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.5 0.6 0.14 1.09 0.32 0.14 0.2 0.42 0.19 0.11 0.19 0.02 0.53 0.28 0.24 1.53 0.82 0.08 0.56 0.27
0.02 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.04 0.09 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.0 0.05 0.31 0.05 0.18 0.05 0.11 0.2 0.32 0.09 0.06 0.11 0.05 0.08 0.29 0.0 0.04 0.2 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
14.43 0.76 1.2 463.82 722.78 620.21 0.73 92.93 40.24 34.05 7.87 47.31 21.43 24.85 13.73 143.02 298.46 608.6 6.04 58.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.03 0.16 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 77.34 0.0 0.0 104.23 186.96 1.42 22.97 14.37 7.86 4.38 7.89 38.56 33.17 16.63 10.29 8.23 16.7 3.22 59.43
0.57 0.65 0.07 0.84 0.0 0.0 0.18 0.17 0.09 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.31 0.0 0.11 0.78 0.0
0.86 0.21 0.19 2.16 14.79 14.79 4.35 5.24 4.73 7.28 1.62 2.97 4.82 4.58 1.48 3.85 6.01 10.65 1.88 5.61
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.66 0.0 0.0 1.62 0.0 0.0 0.23 0.15 0.16 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.66 13.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.66 0.0 0.0 0.0 0.0
0.45 0.51 0.19 2.24 0.15 0.11 0.36 0.48 0.25 0.24 0.18 0.07 0.41 0.32 0.65 1.82 1.27 0.21 0.83 0.63
0.01 0.01 0.01 0.05 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.02 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.08 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.05 0.18 0.0 0.04 0.0 0.16 0.15 0.0 0.0 0.14 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.07 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.0 0.08 0.0 0.0 0.04 0.05 0.03 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.08 0.1
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 1.32 0.05 0.05 0.03 0.38 0.01 0.03 0.09 0.02 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.08 0.04 0.0
0.0 0.18 0.0 0.0 0.21 0.1 0.0 0.02 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.14 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.09 0.0 0.0 0.22 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.07 0.12 0.0 0.0 0.06 0.22 0.0 0.09 0.04 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)