Heatmap: Cluster_253 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00056	0.34	0.36	0.23	0.47	0.5	0.6	0.14	0.39	0.42	0.35	0.56	0.3	0.15	0.13	0.51	0.55	0.43	0.6	1.0	0.43
Gb_00183	0.29	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.16	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.36	0.44	0.82	0.0	0.0	0.49	1.0
Gb_00343	0.06	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.19	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.17	0.0	0.0	0.86	0.0
Gb_00472	0.31	0.47	0.0	0.62	0.11	0.27	0.16	0.31	0.19	0.18	0.0	0.0	0.25	0.33	0.19	1.0	0.19	0.0	0.56	0.04
Gb_00924	0.24	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.09	0.42	0.06	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_01092	0.0	0.54	0.0	1.0	0.0	0.0	0.07	0.21	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.26	0.0	0.49	0.0
Gb_01095	0.34	0.0	0.22	1.0	0.24	0.29	0.15	0.34	0.32	0.34	0.78	0.0	0.67	0.54	0.72	0.68	0.15	0.19	0.45	0.5
Gb_02936	0.68	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.25	0.4	0.18	0.0	0.25	0.0	0.38	0.39	1.0	0.06	0.8	0.17	0.39	0.6
Gb_03118	0.06	0.52	0.36	0.0	0.23	0.0	0.08	0.35	0.03	0.0	0.0	0.06	0.05	0.04	0.11	0.14	0.16	0.21	1.0	0.29
Gb_03226	0.09	0.0	0.05	1.0	0.0	0.0	0.03	0.12	0.02	0.12	0.05	0.0	0.04	0.02	0.1	0.35	0.08	0.0	0.34	0.0
Gb_03755	0.1	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.2	0.22	0.0
Gb_03834	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04782	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.12	0.19	0.33	0.0	0.0	0.0	0.22	0.04	0.0
Gb_04936	0.0	0.68	0.0	1.0	0.0	0.0	0.24	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.4	0.0
Gb_05404	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	1.0	0.08	0.87	0.0	0.0	0.42	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_05444	0.74	0.34	0.25	1.0	0.17	0.0	0.0	0.32	0.12	0.29	0.07	0.0	0.27	0.3	0.2	0.75	0.3	0.56	0.69	0.13
Gb_05846	0.15	0.0	0.61	0.98	0.0	0.0	0.35	0.33	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.1	0.0
Gb_05896	0.09	0.0	0.0	0.52	0.07	0.08	0.0	0.37	0.52	0.33	1.0	0.03	0.54	0.79	0.85	0.39	0.09	0.03	0.23	0.0
Gb_05921	0.07	0.22	0.13	1.0	0.0	0.0	0.11	0.09	0.03	0.0	0.02	0.0	0.04	0.04	0.02	0.46	0.52	0.0	0.25	0.05
Gb_06305	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	1.0	0.0
Gb_07035	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0
Gb_07379	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07525	0.04	0.08	0.06	1.0	0.03	0.0	0.02	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.08	0.03	0.0	0.05	0.0
Gb_08040	0.08	0.34	0.0	1.0	0.41	0.0	0.0	0.17	0.05	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.55	0.0	0.79	0.0
Gb_08212	0.15	0.43	0.03	1.0	0.13	0.02	0.13	0.17	0.03	0.14	0.01	0.01	0.07	0.01	0.05	0.33	0.39	0.03	0.86	0.01
Gb_08542	0.19	0.3	0.04	1.0	0.02	0.0	0.1	0.17	0.06	0.07	0.02	0.0	0.07	0.02	0.06	0.07	0.13	0.07	0.76	0.0
Gb_08933	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_09125	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.26
Gb_09235	0.0	0.0	0.23	1.0	0.03	0.0	0.3	0.23	0.29	0.01	0.43	0.0	0.44	0.34	0.0	0.85	0.33	0.0	0.18	0.0
Gb_09239	0.08	0.22	0.14	1.0	0.0	0.0	0.27	0.1	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.14	0.15	0.0	0.09	0.0
Gb_09514	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.34	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0	1.0	0.7
Gb_09554	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.25	0.25
Gb_09625	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.68	0.0	0.0	0.47	0.0
Gb_09681	0.09	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.07	0.18	0.0	0.03	0.0	0.0	0.11	0.04	0.0	0.55	0.37	0.0	0.28	0.0
Gb_10174	0.05	0.04	0.0	0.32	0.32	0.54	0.12	0.27	0.06	0.12	0.28	0.27	0.19	0.18	0.28	0.08	0.27	1.0	0.06	0.4
Gb_10771	0.18	0.23	0.05	1.0	0.08	0.0	0.05	0.13	0.1	0.12	0.08	0.01	0.28	0.19	0.16	0.5	0.36	0.0	0.26	0.2
Gb_12028	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_13710	0.23	0.0	0.0	1.0	0.17	0.0	0.1	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.7	0.0
Gb_14060	0.02	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.06	0.0	0.0	0.39	0.08
Gb_14219	0.37	0.11	0.05	1.0	0.05	0.16	0.03	0.25	0.09	0.25	0.0	0.0	0.24	0.12	0.09	0.21	0.1	0.0	0.4	0.09
Gb_14225	0.73	0.0	0.01	1.0	0.07	0.0	0.0	0.32	0.2	0.22	0.0	0.03	0.5	0.21	0.49	0.82	0.18	0.1	0.67	0.43
Gb_14451	0.15	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.55	0.06	0.0	0.09	0.0	0.0	0.13	0.28	0.0	0.19	0.17	0.0	0.16	0.0
Gb_14494	0.37	0.19	0.02	1.0	0.22	0.05	0.06	0.22	0.17	0.18	0.05	0.01	0.28	0.25	0.09	0.9	0.21	0.21	0.27	0.23
Gb_14589	0.33	0.06	0.13	0.45	0.13	0.11	0.1	0.21	0.13	0.07	0.23	0.01	0.3	0.17	0.2	1.0	0.12	0.07	0.28	0.21
Gb_14747	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.85	0.0
Gb_15410	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.16	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0
Gb_15923	0.14	0.0	0.89	0.0	1.0	0.0	0.15	0.3	0.1	0.15	0.0	0.08	0.12	0.11	0.97	0.0	0.0	0.65	0.59	0.0
Gb_16167	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.12	0.27	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.73	0.0
Gb_16322	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.29	0.0	0.41	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.38	0.0
Gb_17625	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.61	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_18094	0.13	0.56	0.63	0.0	0.0	0.06	0.03	0.31	0.21	0.37	0.88	0.12	0.02	0.0	1.0	0.25	0.11	0.09	0.16	0.04
Gb_18679	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.0
Gb_18681	1.0	0.81	0.12	0.71	0.75	0.14	0.15	0.39	0.37	0.07	0.18	0.0	0.6	0.86	0.16	0.79	0.51	0.21	0.91	0.44
Gb_18762	0.0	0.0	0.0	0.19	0.03	0.0	0.0	0.28	0.16	0.23	1.0	0.0	0.51	0.36	0.35	0.24	0.0	0.02	0.19	0.0
Gb_19531	0.12	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0	0.16	1.0	0.19	0.0	0.48	0.0	0.09	0.0	0.42	0.28	0.0	0.0	0.91	0.0
Gb_19718	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.12	0.2	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.5	0.0	1.0	0.0
Gb_19958	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.39	0.91	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Gb_20680	0.0	0.88	0.39	1.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0
Gb_20719	0.0	0.0	0.0	0.1	1.0	0.27	0.0	0.07	0.04	0.04	0.01	0.01	0.0	0.02	0.01	0.03	0.06	0.65	0.06	0.06
Gb_20723	0.01	0.03	0.01	0.36	1.0	0.21	0.0	0.26	0.29	0.28	0.07	0.09	0.03	0.12	0.02	0.08	0.12	0.48	0.1	0.04
Gb_20850	0.02	0.39	0.1	1.0	0.03	0.0	0.02	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.11	0.0
Gb_21041	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.7	0.6	0.36	0.24	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_21306	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0
Gb_21456	0.0	0.49	0.12	0.0	1.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0
Gb_21502	0.05	0.0	0.0	0.5	0.16	0.0	0.0	0.33	0.4	0.13	0.15	0.02	0.06	0.0	0.46	0.28	0.08	0.09	1.0	0.0
Gb_22372	0.0	0.0	0.0	0.3	0.38	0.08	0.0	0.04	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.15	0.19	0.71	1.0	0.13
Gb_22374	0.02	0.26	0.0	0.43	1.0	0.05	0.0	0.05	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.07	0.05
Gb_22647	0.0	0.0	0.0	0.18	1.0	0.26	0.0	0.11	0.04	0.06	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.41	0.23	0.05
Gb_23281	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.05	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.6	0.24
Gb_24166	0.0	0.0	0.0	1.0	0.33	0.7	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.23	0.0
Gb_24943	0.0	0.69	0.0	1.0	0.0	0.0	0.2	0.3	0.29	0.0	0.0	0.09	0.36	0.34	0.27	0.0	0.66	0.0	0.1	0.0
Gb_25432	0.0	0.0	0.0	0.0	0.86	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_25463	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_25543	0.58	0.51	0.3	0.57	0.74	0.82	0.3	0.6	0.47	0.4	0.78	0.41	0.42	0.37	0.83	0.59	0.53	1.0	0.96	0.62
Gb_26381	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0
Gb_27013	0.33	0.39	0.09	0.72	0.21	0.09	0.13	0.28	0.12	0.07	0.13	0.01	0.35	0.18	0.15	1.0	0.54	0.05	0.37	0.18
Gb_27815	0.16	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.36	0.85	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28241	0.12	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28625	0.45	0.0	0.16	0.95	0.15	0.55	0.16	0.34	0.61	1.0	0.27	0.19	0.34	0.16	0.25	0.89	0.0	0.13	0.63	0.12
Gb_28809	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28839	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	1.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0
Gb_29285	0.02	0.0	0.0	0.64	1.0	0.86	0.0	0.13	0.06	0.05	0.01	0.07	0.03	0.03	0.02	0.2	0.41	0.84	0.01	0.08
Gb_29546	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_30046	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.26	0.17	0.13	0.0	0.0	0.0	0.1	0.24	0.19	1.0	0.0	0.0	0.28	0.0
Gb_30085	0.0	0.41	0.0	0.0	0.56	1.0	0.01	0.12	0.08	0.04	0.02	0.04	0.21	0.18	0.09	0.06	0.04	0.09	0.02	0.32
Gb_31053	0.67	0.77	0.09	1.0	0.0	0.0	0.21	0.2	0.1	0.05	0.0	0.0	0.04	0.0	0.08	0.37	0.0	0.14	0.93	0.0
Gb_31357	0.06	0.01	0.01	0.15	1.0	1.0	0.29	0.35	0.32	0.49	0.11	0.2	0.33	0.31	0.1	0.26	0.41	0.72	0.13	0.38
Gb_32272	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.34	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.28	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32798	0.41	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.14	0.09	0.1	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.22
Gb_33447	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_34580	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.69	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34838	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_35707	0.0	0.0	0.13	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_35938	0.2	0.23	0.08	1.0	0.07	0.05	0.16	0.21	0.11	0.11	0.08	0.03	0.19	0.14	0.29	0.81	0.57	0.09	0.37	0.28
Gb_36104	0.26	0.14	0.12	0.95	0.14	0.0	0.0	0.35	0.43	0.09	0.0	0.0	0.08	0.13	0.18	1.0	0.44	0.1	0.3	0.0
Gb_36278	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36559	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36651	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.68	0.0
Gb_36863	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.32	0.28	1.0	0.0	0.2	0.0	0.9	0.84	0.0	0.0	0.76	0.0
Gb_37029	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.59	0.81	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_37096	1.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.24	0.32	0.18	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78	0.0	0.0	0.51	0.59
Gb_37122	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.17	0.32	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.47
Gb_37673	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.14	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0
Gb_37915	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.04	0.02	0.29	0.01	0.02	0.06	0.02	0.0	0.04	0.0	0.04	0.0	0.06	0.03	0.0
Gb_39024	0.0	0.86	0.0	0.0	1.0	0.48	0.0	0.08	0.13	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.67	0.0
Gb_39544	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_39749	0.16	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.05	0.17	0.44	0.04	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.82	0.0
Gb_39837	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.32	0.0	0.0	0.75	0.0
Gb_40506	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_40607	0.0	0.0	0.05	0.31	0.57	0.0	0.0	0.27	1.0	0.0	0.42	0.16	0.92	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.54
Gb_41384	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.21	0.35	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	1.0	0.0	0.0	0.22	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)