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Heatmap: Cluster_179 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.18 0.66 0.64 -5.5 -0.0 0.32 0.19 0.19 0.11 0.23 0.09 0.05 -0.7 -0.36 -0.44 -0.48 -0.22 -0.39 0.12 -0.0 0.08 0.28
0.23 0.8 0.6 -4.66 0.07 0.22 0.31 0.06 0.09 0.01 0.03 0.12 -0.97 -0.46 -0.31 -0.31 -0.1 -0.2 0.23 -0.16 -0.22 0.35
0.04 0.83 1.13 -5.09 0.29 0.34 -0.46 0.36 -0.06 -0.01 0.13 -0.24 -1.54 -0.51 -0.11 -0.2 -0.23 -0.25 0.44 -0.26 -0.22 -0.0
-0.26 0.28 1.02 -2.64 0.25 0.19 -0.24 -0.05 0.06 -0.22 -0.19 0.17 -1.13 -0.06 -0.01 -0.22 0.02 -0.08 0.63 -0.06 -0.07 0.03
0.37 0.6 0.46 -3.0 0.48 0.48 0.09 0.01 -0.52 -0.19 -0.22 -0.27 -1.52 -0.16 0.17 0.2 -0.04 -0.03 0.41 -0.19 -0.13 -0.01
0.22 0.76 1.19 -3.37 0.22 0.32 -0.15 -0.05 0.02 -0.3 -0.23 0.14 -0.45 -0.54 -0.34 -0.47 -0.43 -0.47 0.05 0.18 0.04 0.15
-0.15 0.73 1.14 -3.57 0.04 0.54 0.03 -0.01 0.2 0.01 -0.1 0.07 -0.5 -0.26 -0.59 -0.4 -0.55 -0.34 0.11 0.1 -0.15 0.05
0.38 0.77 0.74 -3.56 0.3 0.55 0.09 -0.08 -0.25 -0.09 -0.25 -0.08 -0.8 -0.53 0.01 0.12 -0.02 0.01 0.26 -0.12 -0.2 -0.69
0.28 0.98 1.13 -3.5 0.32 0.52 -0.29 -0.03 -0.09 -0.38 -0.11 -0.03 -1.02 -0.06 -0.35 -0.26 -0.28 -0.21 0.37 -0.16 -0.19 -0.69
0.45 0.59 0.45 -4.25 0.18 0.43 0.18 0.21 -0.08 -0.04 -0.07 -0.06 -1.24 -0.19 -0.02 -0.16 -0.18 -0.19 0.43 -0.15 -0.17 0.06
0.2 0.7 0.98 -3.27 0.31 0.5 -0.15 -0.02 -0.23 -0.07 -0.07 0.05 -0.91 -0.72 -0.19 -0.23 -0.41 -0.32 0.44 -0.1 0.16 -0.0
0.52 0.72 0.7 -5.49 -0.09 0.45 0.52 -0.2 0.05 -0.44 -0.34 -0.11 -1.49 -0.38 -0.11 -0.19 -0.0 -0.05 0.36 -0.2 -0.16 0.31
0.6 0.66 -0.11 -5.69 -0.18 0.43 0.29 0.45 0.04 0.61 0.94 -0.23 -1.26 -0.44 -0.36 -0.23 -0.24 -0.33 -1.57 0.24 0.15 -0.41
0.4 0.64 0.8 -4.47 -0.09 0.42 0.17 0.23 0.3 0.23 0.13 0.51 -0.67 0.04 -0.41 -0.51 -0.39 -0.51 -0.72 -0.79 -0.79 0.57
-0.34 0.75 1.63 -1.75 0.44 0.42 -0.64 -0.28 0.24 -0.12 -0.39 0.07 -0.99 0.47 -0.73 -0.79 -0.75 -0.41 -0.28 0.05 -0.43 0.07
0.88 0.9 0.77 -4.73 0.09 0.2 0.54 -0.35 -0.35 -0.75 -0.47 -0.51 -1.78 0.02 0.01 0.04 0.07 0.04 0.4 -0.72 -0.57 0.37
0.32 0.3 0.75 -4.6 0.02 0.29 0.25 -0.18 0.4 -0.21 -0.16 0.43 -1.12 0.1 -0.48 -0.73 -0.4 -0.3 -0.15 0.43 0.16 0.36
0.24 0.69 1.53 -3.2 0.58 0.75 -0.05 -0.58 0.16 -0.75 -0.82 0.01 -1.1 -0.38 -0.19 -0.13 -0.33 -0.33 0.04 -0.66 -0.2 -0.04
0.79 0.91 0.83 -4.48 0.33 0.27 0.53 -0.39 -0.41 -0.71 -0.59 -0.56 -1.04 -0.49 -0.03 0.06 0.14 0.01 0.37 -0.43 -0.37 0.1
0.71 0.25 0.04 -4.28 0.31 0.48 0.24 -0.15 0.01 -0.25 -0.21 -0.03 -1.06 -0.4 -0.25 -0.22 -0.15 -0.22 0.15 0.19 0.32 0.58
0.6 0.65 0.14 -4.14 0.15 0.44 0.26 0.09 -0.09 -0.04 -0.03 0.12 -1.13 -0.16 -0.01 -0.01 -0.02 -0.1 0.33 -0.4 -0.28 -0.06
0.54 0.72 0.31 -4.64 -0.25 0.4 0.12 -0.11 0.22 -0.19 -0.16 0.25 -1.01 -0.35 -0.19 -0.15 -0.08 -0.26 0.25 0.02 -0.07 0.4
0.17 0.58 1.11 -4.14 0.25 0.28 0.24 -0.13 0.08 -0.23 -0.35 -0.15 -1.13 0.12 -0.18 -0.13 -0.18 -0.27 0.24 -0.41 -0.27 0.34
-0.01 0.32 0.87 -5.76 0.17 0.26 0.29 -0.27 0.27 -0.41 -0.33 0.25 -1.25 0.26 -0.09 -0.07 -0.02 -0.07 0.31 -0.33 -0.25 0.33
0.27 0.78 0.41 -6.06 0.24 0.33 -0.11 0.12 -0.1 -0.02 -0.24 -0.06 -1.29 -0.42 -0.02 -0.14 -0.11 -0.18 0.25 -0.07 0.34 0.37
0.63 0.84 0.56 -5.2 -0.18 0.28 0.47 0.0 0.2 -0.33 -0.23 -0.04 -0.9 0.08 -0.2 -0.32 -0.18 -0.18 0.06 -0.41 -0.22 0.29
0.06 0.56 0.52 -4.88 0.54 0.69 -0.12 -0.24 0.17 -0.38 -0.39 0.15 -1.04 -0.38 -0.05 0.04 -0.2 -0.05 0.62 0.12 0.01 -0.52
0.31 1.26 1.43 -3.6 0.13 0.48 -0.31 -0.41 -0.63 -0.28 -0.4 -0.11 -1.48 0.23 -0.21 -0.37 -0.45 -0.36 0.06 -0.04 0.06 -0.65
0.07 0.64 0.71 -3.75 0.19 0.31 -0.02 -0.09 0.23 -0.22 -0.29 0.32 -0.5 -0.26 -0.33 -0.34 -0.32 -0.3 0.28 -0.07 0.12 0.37
-0.01 0.86 1.04 -5.64 0.05 0.15 -0.0 0.32 0.17 -0.01 0.11 0.18 -0.86 -0.7 -0.67 -0.56 -0.6 -0.57 -0.16 0.22 0.41 0.26
0.51 0.64 0.51 -5.75 -0.21 0.41 0.14 0.34 0.31 0.07 0.19 0.31 -0.95 -0.25 -0.24 -0.47 -0.24 -0.33 -0.04 -0.36 -0.31 0.29
0.33 0.7 1.08 -3.59 0.2 0.46 0.31 -0.07 0.11 -0.01 0.05 0.15 -1.0 -0.5 -0.44 -0.54 -0.31 -0.28 0.09 -0.48 -0.32 0.19
0.23 0.95 0.68 -4.33 -0.32 0.36 0.12 0.04 0.4 -0.23 -0.04 0.17 -0.53 0.06 -0.27 -0.45 -0.43 -0.36 -0.04 -0.14 -0.06 0.18
-0.5 0.56 1.16 -3.71 0.26 0.61 -0.05 0.25 0.27 0.47 0.38 0.24 -0.88 -0.66 -0.42 -0.43 -0.52 -0.56 0.13 -0.6 -0.43 -0.0
-0.44 0.56 1.05 -5.19 0.01 0.4 0.06 0.06 0.2 0.17 0.08 0.29 -1.02 -0.24 -0.34 -0.4 -0.25 -0.29 0.27 -0.19 -0.09 0.19
0.56 0.87 0.67 -4.22 -0.04 0.2 0.4 -0.03 -0.35 -0.24 -0.09 -0.12 -1.12 -0.15 -0.17 -0.21 -0.13 -0.16 0.1 -0.16 -0.15 0.43
0.28 0.92 1.12 -4.18 -0.12 0.43 -0.28 0.2 -0.14 -0.44 -0.33 0.02 -0.84 -0.65 -0.05 -0.25 -0.2 -0.17 0.35 0.06 0.12 -0.32
0.23 0.61 0.82 -4.28 0.36 0.54 0.04 -0.19 -0.08 -0.64 -0.62 -0.14 -0.65 -0.47 -0.29 -0.22 -0.18 -0.18 0.94 0.17 -0.18 -0.04
0.39 0.89 0.51 -3.8 -0.01 0.44 0.14 0.03 0.31 -0.23 -0.0 0.14 -0.39 -0.57 -0.39 -0.49 -0.32 -0.2 0.33 -0.2 -0.21 0.14
0.47 0.14 -0.24 -4.28 0.25 0.41 0.27 0.42 0.01 0.21 0.29 0.01 -1.41 -0.11 -0.05 0.06 0.01 -0.08 0.04 -0.26 -0.08 0.11
0.57 0.6 0.01 -6.0 0.28 0.51 0.37 0.23 -0.05 -0.03 0.18 -0.02 -1.05 -0.8 -0.16 -0.18 -0.08 -0.19 0.12 -0.09 -0.14 0.28
0.55 0.06 0.3 -5.09 0.2 0.26 0.42 -0.04 0.29 -0.11 -0.25 0.19 -1.09 0.18 -0.19 -0.22 -0.29 -0.28 -0.17 0.04 0.03 0.63
0.5 0.81 1.03 -3.06 0.41 0.29 0.12 0.06 -0.14 -0.79 -0.41 0.06 -1.15 -0.42 -0.33 -0.02 -0.23 -0.36 0.47 0.06 -0.41 -0.13
0.42 0.71 0.54 -4.14 0.15 0.3 0.34 -0.06 0.26 -0.02 -0.16 0.57 -0.74 -0.12 -0.31 -0.28 -0.24 -0.3 -0.12 -0.2 -0.11 -0.23
0.51 0.73 0.81 -4.39 0.07 0.29 0.14 0.34 0.1 -0.15 0.12 -0.16 -0.71 -0.15 -0.4 -0.36 -0.31 -0.32 0.18 -0.32 -0.33 0.17
0.37 0.8 1.01 -3.4 0.3 0.3 -0.29 0.04 -0.41 0.1 0.12 -0.0 -0.66 -0.45 -0.32 -0.23 -0.12 -0.36 -0.04 0.05 0.22 -0.44

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.