Heatmap: Cluster_87 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
7.35 7.61 11.75 1.67 7.94 8.36 8.23 4.44 4.96 3.35 5.13 4.9 3.54 3.74 4.25 5.3 3.71 4.01 5.64 5.25 5.46 4.25
15.79 16.67 22.17 0.71 13.08 19.22 16.26 17.54 15.33 16.38 16.26 17.73 6.98 7.94 12.3 11.72 10.57 11.29 11.42 19.81 19.11 16.52
12.49 12.64 10.6 0.48 9.25 12.37 11.11 4.6 7.04 4.51 5.09 6.07 6.67 3.69 4.51 5.06 4.25 5.47 5.06 8.34 8.7 7.1
9.43 12.47 23.94 1.1 13.54 13.65 15.27 7.6 9.59 10.11 6.22 9.44 7.23 6.44 8.31 8.27 8.31 8.02 9.85 7.54 8.82 10.25
27.12 0.72 1.21 0.62 37.51 31.72 20.42 1.46 1.54 2.78 2.16 2.19 0.24 10.56 0.12 0.15 0.0 0.0 5.81 1.97 2.23 37.28
9.03 12.31 26.58 0.52 9.89 11.64 11.61 6.92 15.56 8.34 6.57 16.65 5.58 5.95 3.29 3.6 4.52 3.6 6.79 7.24 5.63 9.68
10.15 11.55 11.59 0.99 9.16 8.46 11.12 6.67 7.63 5.43 5.78 6.4 5.29 6.41 5.6 5.38 4.96 5.38 8.63 7.37 8.74 8.85
11.4 17.9 18.0 4.53 13.37 16.66 13.76 4.81 18.29 9.37 11.48 17.13 12.38 6.83 7.08 7.76 7.97 7.69 5.35 11.0 10.09 6.9
51.64 66.85 93.26 2.32 60.29 71.85 62.9 50.24 69.18 49.11 43.41 67.77 23.31 58.5 52.21 52.26 56.14 53.28 59.67 52.89 54.66 64.43
17.69 18.4 37.64 1.02 25.76 24.2 23.1 10.08 16.81 11.22 11.1 17.87 11.85 16.07 10.91 11.4 11.64 12.66 19.73 17.43 17.46 16.63
4.34 9.21 20.37 0.33 11.71 5.5 8.23 10.45 4.4 2.84 6.22 2.82 1.87 2.51 3.16 2.16 3.96 2.97 4.06 3.43 1.3 5.91
15.73 48.23 50.61 5.61 40.03 34.38 22.46 18.23 32.03 20.77 22.77 33.14 8.38 13.44 17.78 15.8 17.28 17.95 22.08 18.83 22.31 13.68
24.71 39.68 71.85 4.82 36.39 31.78 24.63 19.18 22.53 16.87 16.36 25.5 10.69 19.52 19.95 20.81 17.89 20.69 28.04 24.19 19.17 22.01
5.88 5.51 15.83 1.58 5.26 5.02 5.36 4.62 3.54 2.84 2.64 3.5 2.04 4.18 3.11 3.67 3.61 3.41 4.53 3.44 2.97 6.93
3.5 4.52 5.74 0.41 4.57 2.91 2.41 1.81 2.3 1.3 1.37 2.33 1.47 1.6 1.91 1.86 1.65 1.88 2.95 2.38 3.64 2.12
15.43 20.27 26.3 0.6 16.81 14.2 16.26 8.94 9.68 5.8 5.77 9.24 6.23 6.4 7.94 8.18 7.87 8.13 11.36 8.29 9.16 11.25
23.85 56.24 55.49 0.54 25.6 28.42 24.02 17.04 24.0 15.55 15.34 26.62 9.08 18.23 21.59 20.04 24.3 21.86 27.01 23.87 24.21 17.58
45.75 47.01 54.57 3.06 33.94 42.45 22.22 31.65 49.98 39.32 45.08 41.25 38.08 36.1 18.58 19.78 24.75 22.72 33.2 39.08 36.01 33.41
13.47 22.59 43.69 0.96 13.25 17.98 18.22 10.2 12.95 11.97 11.42 12.37 8.81 6.64 10.43 10.41 11.06 11.08 12.44 9.43 9.21 10.92
2.77 10.0 25.27 0.4 10.64 9.07 5.46 5.49 8.02 4.49 5.32 9.17 5.22 5.42 4.43 4.96 5.47 4.68 6.16 4.1 4.21 6.17
19.39 31.12 45.31 1.56 22.51 26.48 18.67 13.7 23.4 11.84 14.77 19.53 8.11 13.01 14.52 14.74 13.32 13.8 20.44 22.16 15.59 18.09
26.69 31.25 44.52 2.55 23.24 21.28 27.07 15.28 22.41 13.05 13.56 19.75 17.24 14.43 14.63 14.41 11.9 13.97 17.66 19.85 19.83 23.25
11.31 17.98 14.74 0.5 11.63 12.92 11.93 9.21 17.0 9.74 10.46 15.19 7.32 7.25 8.39 9.16 8.56 8.81 10.29 10.05 8.66 11.54
9.37 6.92 22.28 1.37 10.75 7.37 9.47 4.58 6.65 3.52 4.25 6.89 3.86 4.64 3.22 3.09 3.25 2.82 3.85 4.52 4.49 8.45
24.56 27.1 29.77 0.52 23.89 24.66 22.13 16.52 21.3 14.86 14.32 22.26 9.71 15.36 11.55 10.19 11.68 11.66 17.38 19.38 20.36 23.96
11.96 14.49 29.62 0.95 18.82 21.23 17.21 8.48 18.41 9.29 7.7 14.44 6.41 7.04 7.44 7.97 8.53 7.13 4.43 15.62 16.17 2.92
25.43 29.97 45.22 0.89 19.72 16.84 20.34 7.17 10.3 6.01 7.27 17.1 8.5 6.78 10.46 10.49 8.62 10.64 13.63 12.08 13.2 14.77
30.59 34.05 38.88 2.4 33.8 31.21 26.26 26.4 25.86 19.41 20.49 21.63 17.31 20.63 19.55 22.41 17.39 18.61 28.16 22.33 25.32 24.13
3.02 3.23 9.26 0.48 4.59 3.56 5.07 2.1 2.97 1.58 1.9 1.78 2.91 1.2 1.71 1.95 1.81 2.06 2.78 1.93 2.58 1.85
46.58 55.32 51.87 4.0 38.12 51.71 47.49 44.83 56.24 41.1 39.92 60.76 21.6 34.43 19.65 17.82 19.76 18.22 20.84 50.76 38.22 58.63
17.2 24.37 48.84 1.31 25.91 23.52 25.3 13.39 19.92 10.49 11.31 20.87 12.58 23.99 13.06 13.61 14.44 13.07 16.22 15.45 16.36 23.63
64.65 71.06 109.81 1.9 74.66 52.13 80.98 52.34 69.94 51.12 51.83 69.97 40.25 39.28 35.91 34.38 37.38 38.35 44.23 52.72 50.42 81.31
14.32 15.14 17.61 1.17 16.34 19.73 19.09 11.21 18.09 9.22 11.7 15.96 18.51 14.87 6.23 7.34 5.79 7.25 8.74 17.36 18.34 12.04
24.1 34.69 40.71 1.64 35.07 19.33 14.29 18.78 22.33 19.91 14.56 31.23 7.43 7.2 8.74 9.95 8.95 8.56 17.41 19.05 20.88 14.24
24.43 21.83 15.79 1.45 27.9 21.19 14.1 19.53 24.81 26.18 23.42 30.11 10.54 22.87 12.75 13.02 11.96 13.38 20.17 24.34 20.47 14.89
4.21 5.47 15.61 1.31 9.86 4.81 7.09 3.42 4.53 2.94 4.11 5.12 1.41 4.07 2.63 2.75 2.2 3.05 8.38 4.34 3.51 5.53
11.92 16.09 44.6 2.62 16.01 13.88 15.08 9.85 17.3 7.13 8.05 15.78 8.22 9.69 6.44 7.17 6.69 6.9 10.09 10.09 11.22 18.36
36.12 50.12 51.85 1.2 37.92 37.79 29.35 22.94 30.27 22.98 24.99 28.61 12.22 15.49 21.19 19.6 20.19 18.38 33.92 28.13 28.52 31.18
6.89 12.66 20.7 0.23 10.21 8.08 9.26 3.6 5.26 3.04 3.36 5.85 3.31 3.42 4.37 4.72 4.37 4.49 5.3 4.42 4.75 8.03
16.08 29.22 73.14 4.26 24.73 25.28 25.86 18.95 30.08 22.3 21.46 32.67 15.26 16.46 10.62 9.61 11.31 9.78 21.72 19.0 20.1 24.63
3.14 10.47 28.57 0.78 9.84 10.63 6.73 6.58 12.5 6.15 6.86 9.62 3.42 7.46 5.37 4.28 5.85 5.81 7.89 7.29 8.06 10.85
4.82 5.47 14.23 0.97 4.08 4.02 5.55 2.25 3.75 1.53 2.48 2.97 3.11 2.2 1.74 2.26 1.9 2.05 2.87 2.85 4.1 4.59
14.73 14.57 29.06 0.58 13.64 12.48 13.26 7.89 8.96 4.93 5.68 8.94 7.04 8.88 9.1 9.11 8.46 9.14 12.64 9.82 11.47 10.67
3.48 13.51 21.33 0.9 9.09 9.05 6.38 3.97 4.96 3.19 2.89 4.28 4.89 5.35 6.07 6.62 6.04 6.72 7.63 4.85 6.5 4.03
25.34 32.95 81.87 2.16 37.14 24.47 23.85 17.66 20.79 18.67 16.53 21.32 8.21 15.21 13.65 13.39 13.97 12.83 13.72 15.52 14.86 21.37
20.78 26.24 45.11 1.01 27.88 23.54 21.35 17.54 23.69 20.83 20.48 22.6 11.41 10.18 12.58 12.66 12.13 12.79 9.34 18.41 18.72 38.73
21.25 22.75 30.38 3.95 21.39 30.4 25.6 21.72 32.67 19.29 24.23 32.43 17.59 24.73 11.67 9.99 11.83 11.22 17.26 27.55 25.29 26.05
7.86 10.35 9.75 0.82 8.22 9.73 6.66 8.8 7.55 10.05 8.07 10.98 9.68 9.48 3.82 4.09 4.2 3.88 8.79 7.55 9.57 17.39
14.68 17.49 25.63 1.59 18.74 14.96 7.5 13.75 12.13 16.79 11.5 16.62 7.38 9.32 8.14 7.31 7.93 8.15 8.05 14.37 13.47 10.67
40.8 60.32 142.48 8.39 56.73 64.66 56.79 48.87 54.67 47.29 44.88 68.03 31.92 54.86 41.63 38.78 42.99 39.7 51.04 53.48 61.2 51.55
17.17 17.11 21.85 0.56 16.46 13.61 15.42 10.98 13.26 11.39 8.98 15.04 7.21 7.7 9.28 8.49 9.5 8.69 12.8 10.64 10.77 13.55
16.28 14.84 49.29 2.07 13.47 16.81 14.18 12.54 15.41 12.91 11.03 18.04 6.97 13.74 6.94 6.38 6.65 6.02 7.44 10.18 11.76 12.96
58.8 43.92 42.14 1.13 41.58 56.95 36.06 33.23 88.67 38.32 37.5 76.13 27.42 19.56 15.52 13.59 17.41 15.03 24.21 28.13 30.66 37.47
36.02 62.36 106.7 1.92 59.0 46.51 38.32 18.99 40.31 16.77 24.39 34.84 18.3 30.92 27.3 26.39 22.47 23.87 44.7 30.03 34.04 33.91
38.0 49.38 67.14 1.92 29.34 31.66 34.75 18.79 32.87 18.91 19.46 28.21 24.11 17.94 16.98 17.72 15.2 14.76 20.67 24.44 25.93 20.11
137.7 218.67 478.1 28.75 153.35 166.38 168.12 122.76 125.6 103.25 123.29 148.07 99.44 131.66 76.0 77.4 74.31 71.91 105.57 157.11 137.86 118.7
3.68 5.98 10.98 0.59 6.26 4.2 3.28 2.27 2.54 1.33 1.96 2.78 1.67 3.02 2.49 2.73 2.25 2.88 4.48 2.35 3.04 3.79
5.04 7.67 18.22 0.87 9.59 5.83 5.89 3.96 4.59 2.19 3.84 4.78 3.45 4.15 3.97 3.83 3.57 3.61 6.31 5.05 3.95 5.48
27.71 40.09 81.23 1.85 31.45 31.45 28.73 19.39 27.92 20.03 21.84 29.51 17.63 11.27 18.41 19.15 18.19 17.8 26.79 25.63 27.98 31.05
10.9 17.16 35.71 0.73 14.31 11.42 16.48 4.78 9.5 4.65 8.1 7.88 6.78 6.45 5.48 5.3 4.51 4.86 5.18 7.91 8.83 9.81
52.74 67.19 82.49 2.73 35.94 54.48 52.81 33.3 47.68 34.44 35.86 49.72 21.46 34.28 23.13 19.84 23.56 24.78 30.81 51.71 40.28 47.89
10.25 17.95 29.79 0.79 13.37 10.86 8.85 7.62 10.07 6.23 5.83 10.01 5.08 10.69 6.15 6.42 6.25 6.91 10.83 10.71 9.02 8.89
6.47 9.26 13.64 0.66 11.07 5.09 4.3 4.59 6.99 4.32 4.19 7.88 1.97 4.73 2.22 2.19 2.14 2.46 5.63 5.29 4.73 5.32
5.13 8.51 14.66 0.57 4.7 7.12 6.54 5.97 5.44 4.23 5.93 5.36 1.86 5.52 3.28 3.42 3.32 3.66 5.28 3.84 3.69 8.04
13.58 19.53 21.81 0.99 16.88 14.97 12.04 10.06 12.46 10.39 8.12 14.51 9.3 8.82 9.18 8.5 8.91 7.56 10.92 17.14 17.18 8.95
6.22 6.99 9.56 0.58 6.48 5.15 4.63 5.86 3.68 3.38 3.9 4.36 3.52 2.41 3.12 2.54 3.34 3.14 4.91 4.42 4.89 4.34
14.5 14.13 23.78 2.62 18.87 12.98 12.9 10.02 9.69 8.55 10.25 11.48 6.31 3.66 10.38 8.05 13.12 9.39 8.53 7.87 6.27 12.01
108.59 99.27 121.52 1.97 109.52 97.53 86.09 50.13 73.36 51.22 68.79 73.74 31.69 81.72 66.97 71.34 64.61 64.79 49.22 64.2 56.98 64.68
7.76 8.5 22.68 1.08 10.6 10.73 8.2 8.66 11.43 9.92 8.23 11.36 7.5 5.78 6.86 7.96 6.41 7.23 6.19 9.92 9.98 9.22
14.28 17.31 20.07 0.61 15.1 13.78 10.8 10.76 9.87 8.48 8.81 13.06 6.95 11.99 8.82 7.46 7.53 8.91 10.58 9.93 10.37 13.06
9.36 11.45 27.6 0.54 16.56 14.09 8.64 9.83 15.15 13.46 11.0 16.02 2.15 9.46 6.08 6.35 6.84 5.87 6.83 14.39 12.31 17.99
10.13 12.02 12.72 0.59 15.17 9.52 5.2 2.87 4.32 3.22 3.45 4.6 1.77 7.86 5.76 6.65 4.96 6.06 6.2 4.99 4.53 9.97
35.67 31.29 33.88 1.35 21.28 32.06 25.11 27.77 33.75 26.91 26.63 34.45 17.46 16.11 17.82 18.57 17.84 17.72 20.5 26.07 24.64 25.93
36.91 45.16 47.36 0.71 32.56 40.35 35.84 36.18 50.77 29.92 34.68 47.5 23.66 28.3 15.6 14.55 17.55 16.94 30.36 37.35 34.56 45.22
56.82 48.27 50.52 2.02 42.65 55.22 50.73 47.15 59.5 40.7 40.81 65.86 26.28 67.52 27.21 24.68 31.89 28.05 27.58 43.43 45.01 50.2
20.5 22.53 34.77 0.87 20.92 17.51 14.5 9.72 13.72 8.14 8.33 13.32 9.48 12.86 11.64 11.46 11.41 11.71 14.08 13.71 13.92 8.47
20.36 32.31 50.24 0.96 27.2 29.18 18.97 13.37 22.28 12.83 16.46 17.24 14.59 9.55 11.8 11.5 11.3 10.85 15.85 16.64 17.25 13.13
48.85 74.77 106.43 3.05 68.97 68.81 58.46 36.67 34.0 31.85 21.63 35.25 36.57 53.01 30.9 28.2 31.88 33.07 23.16 45.02 53.22 19.03
8.79 9.7 21.47 1.3 11.36 9.67 8.4 10.13 11.09 8.47 8.24 10.84 5.67 13.78 5.9 4.63 5.06 5.18 10.88 9.03 9.36 20.82
24.72 26.24 22.94 1.25 19.29 23.25 24.57 12.78 17.77 10.18 13.3 17.53 14.5 17.74 12.86 12.79 13.0 12.49 17.43 19.2 21.67 11.04
41.59 55.05 59.41 1.64 43.23 39.37 39.04 23.79 38.45 17.61 23.06 35.9 18.46 32.32 21.18 22.26 22.46 22.2 28.73 27.81 26.26 36.31
5.7 6.76 15.75 0.81 8.49 6.51 8.67 4.0 5.83 2.09 3.14 5.99 6.05 5.3 4.36 4.05 3.93 3.7 3.02 5.82 7.28 6.56
9.12 13.04 22.37 0.75 13.66 10.47 8.51 3.59 6.63 3.36 4.48 6.56 5.78 6.55 7.09 6.36 7.02 7.36 7.57 7.84 7.2 7.59
13.16 17.86 28.98 0.84 13.68 17.89 13.2 13.78 19.86 13.61 13.35 22.19 7.5 16.21 8.95 9.17 9.67 8.85 11.42 13.19 11.34 14.77
31.96 32.32 54.51 3.78 41.05 23.92 20.69 23.33 19.08 17.34 19.48 19.64 8.73 19.35 13.72 12.63 12.41 13.27 16.61 12.63 14.03 9.41
38.1 41.57 53.89 0.54 29.21 28.18 31.86 30.45 34.64 25.66 27.51 34.75 13.22 23.69 15.5 15.0 16.5 15.14 19.67 19.84 21.94 32.03
27.19 54.23 50.55 0.34 39.39 36.46 30.53 28.86 45.87 27.75 26.96 51.52 11.28 34.54 26.06 22.01 25.17 25.77 40.49 42.79 39.13 31.04

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)