Heatmap: Cluster_87 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.63 0.65 1.0 0.14 0.68 0.71 0.7 0.38 0.42 0.29 0.44 0.42 0.3 0.32 0.36 0.45 0.32 0.34 0.48 0.45 0.46 0.36
0.71 0.75 1.0 0.03 0.59 0.87 0.73 0.79 0.69 0.74 0.73 0.8 0.31 0.36 0.55 0.53 0.48 0.51 0.52 0.89 0.86 0.75
0.99 1.0 0.84 0.04 0.73 0.98 0.88 0.36 0.56 0.36 0.4 0.48 0.53 0.29 0.36 0.4 0.34 0.43 0.4 0.66 0.69 0.56
0.39 0.52 1.0 0.05 0.57 0.57 0.64 0.32 0.4 0.42 0.26 0.39 0.3 0.27 0.35 0.35 0.35 0.34 0.41 0.31 0.37 0.43
0.72 0.02 0.03 0.02 1.0 0.85 0.54 0.04 0.04 0.07 0.06 0.06 0.01 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.05 0.06 0.99
0.34 0.46 1.0 0.02 0.37 0.44 0.44 0.26 0.59 0.31 0.25 0.63 0.21 0.22 0.12 0.14 0.17 0.14 0.26 0.27 0.21 0.36
0.88 1.0 1.0 0.09 0.79 0.73 0.96 0.58 0.66 0.47 0.5 0.55 0.46 0.55 0.48 0.46 0.43 0.46 0.74 0.64 0.75 0.76
0.62 0.98 0.98 0.25 0.73 0.91 0.75 0.26 1.0 0.51 0.63 0.94 0.68 0.37 0.39 0.42 0.44 0.42 0.29 0.6 0.55 0.38
0.55 0.72 1.0 0.02 0.65 0.77 0.67 0.54 0.74 0.53 0.47 0.73 0.25 0.63 0.56 0.56 0.6 0.57 0.64 0.57 0.59 0.69
0.47 0.49 1.0 0.03 0.68 0.64 0.61 0.27 0.45 0.3 0.29 0.47 0.31 0.43 0.29 0.3 0.31 0.34 0.52 0.46 0.46 0.44
0.21 0.45 1.0 0.02 0.57 0.27 0.4 0.51 0.22 0.14 0.31 0.14 0.09 0.12 0.16 0.11 0.19 0.15 0.2 0.17 0.06 0.29
0.31 0.95 1.0 0.11 0.79 0.68 0.44 0.36 0.63 0.41 0.45 0.65 0.17 0.27 0.35 0.31 0.34 0.35 0.44 0.37 0.44 0.27
0.34 0.55 1.0 0.07 0.51 0.44 0.34 0.27 0.31 0.23 0.23 0.35 0.15 0.27 0.28 0.29 0.25 0.29 0.39 0.34 0.27 0.31
0.37 0.35 1.0 0.1 0.33 0.32 0.34 0.29 0.22 0.18 0.17 0.22 0.13 0.26 0.2 0.23 0.23 0.22 0.29 0.22 0.19 0.44
0.61 0.79 1.0 0.07 0.8 0.51 0.42 0.32 0.4 0.23 0.24 0.41 0.26 0.28 0.33 0.32 0.29 0.33 0.51 0.41 0.63 0.37
0.59 0.77 1.0 0.02 0.64 0.54 0.62 0.34 0.37 0.22 0.22 0.35 0.24 0.24 0.3 0.31 0.3 0.31 0.43 0.32 0.35 0.43
0.42 1.0 0.99 0.01 0.46 0.51 0.43 0.3 0.43 0.28 0.27 0.47 0.16 0.32 0.38 0.36 0.43 0.39 0.48 0.42 0.43 0.31
0.84 0.86 1.0 0.06 0.62 0.78 0.41 0.58 0.92 0.72 0.83 0.76 0.7 0.66 0.34 0.36 0.45 0.42 0.61 0.72 0.66 0.61
0.31 0.52 1.0 0.02 0.3 0.41 0.42 0.23 0.3 0.27 0.26 0.28 0.2 0.15 0.24 0.24 0.25 0.25 0.28 0.22 0.21 0.25
0.11 0.4 1.0 0.02 0.42 0.36 0.22 0.22 0.32 0.18 0.21 0.36 0.21 0.21 0.18 0.2 0.22 0.19 0.24 0.16 0.17 0.24
0.43 0.69 1.0 0.03 0.5 0.58 0.41 0.3 0.52 0.26 0.33 0.43 0.18 0.29 0.32 0.33 0.29 0.3 0.45 0.49 0.34 0.4
0.6 0.7 1.0 0.06 0.52 0.48 0.61 0.34 0.5 0.29 0.3 0.44 0.39 0.32 0.33 0.32 0.27 0.31 0.4 0.45 0.45 0.52
0.63 1.0 0.82 0.03 0.65 0.72 0.66 0.51 0.95 0.54 0.58 0.85 0.41 0.4 0.47 0.51 0.48 0.49 0.57 0.56 0.48 0.64
0.42 0.31 1.0 0.06 0.48 0.33 0.43 0.21 0.3 0.16 0.19 0.31 0.17 0.21 0.14 0.14 0.15 0.13 0.17 0.2 0.2 0.38
0.83 0.91 1.0 0.02 0.8 0.83 0.74 0.55 0.72 0.5 0.48 0.75 0.33 0.52 0.39 0.34 0.39 0.39 0.58 0.65 0.68 0.8
0.4 0.49 1.0 0.03 0.64 0.72 0.58 0.29 0.62 0.31 0.26 0.49 0.22 0.24 0.25 0.27 0.29 0.24 0.15 0.53 0.55 0.1
0.56 0.66 1.0 0.02 0.44 0.37 0.45 0.16 0.23 0.13 0.16 0.38 0.19 0.15 0.23 0.23 0.19 0.24 0.3 0.27 0.29 0.33
0.79 0.88 1.0 0.06 0.87 0.8 0.68 0.68 0.67 0.5 0.53 0.56 0.45 0.53 0.5 0.58 0.45 0.48 0.72 0.57 0.65 0.62
0.33 0.35 1.0 0.05 0.5 0.38 0.55 0.23 0.32 0.17 0.21 0.19 0.31 0.13 0.18 0.21 0.2 0.22 0.3 0.21 0.28 0.2
0.77 0.91 0.85 0.07 0.63 0.85 0.78 0.74 0.93 0.68 0.66 1.0 0.36 0.57 0.32 0.29 0.33 0.3 0.34 0.84 0.63 0.96
0.35 0.5 1.0 0.03 0.53 0.48 0.52 0.27 0.41 0.21 0.23 0.43 0.26 0.49 0.27 0.28 0.3 0.27 0.33 0.32 0.33 0.48
0.59 0.65 1.0 0.02 0.68 0.47 0.74 0.48 0.64 0.47 0.47 0.64 0.37 0.36 0.33 0.31 0.34 0.35 0.4 0.48 0.46 0.74
0.73 0.77 0.89 0.06 0.83 1.0 0.97 0.57 0.92 0.47 0.59 0.81 0.94 0.75 0.32 0.37 0.29 0.37 0.44 0.88 0.93 0.61
0.59 0.85 1.0 0.04 0.86 0.47 0.35 0.46 0.55 0.49 0.36 0.77 0.18 0.18 0.21 0.24 0.22 0.21 0.43 0.47 0.51 0.35
0.81 0.72 0.52 0.05 0.93 0.7 0.47 0.65 0.82 0.87 0.78 1.0 0.35 0.76 0.42 0.43 0.4 0.44 0.67 0.81 0.68 0.49
0.27 0.35 1.0 0.08 0.63 0.31 0.45 0.22 0.29 0.19 0.26 0.33 0.09 0.26 0.17 0.18 0.14 0.2 0.54 0.28 0.23 0.35
0.27 0.36 1.0 0.06 0.36 0.31 0.34 0.22 0.39 0.16 0.18 0.35 0.18 0.22 0.14 0.16 0.15 0.15 0.23 0.23 0.25 0.41
0.7 0.97 1.0 0.02 0.73 0.73 0.57 0.44 0.58 0.44 0.48 0.55 0.24 0.3 0.41 0.38 0.39 0.35 0.65 0.54 0.55 0.6
0.33 0.61 1.0 0.01 0.49 0.39 0.45 0.17 0.25 0.15 0.16 0.28 0.16 0.17 0.21 0.23 0.21 0.22 0.26 0.21 0.23 0.39
0.22 0.4 1.0 0.06 0.34 0.35 0.35 0.26 0.41 0.3 0.29 0.45 0.21 0.23 0.15 0.13 0.15 0.13 0.3 0.26 0.27 0.34
0.11 0.37 1.0 0.03 0.34 0.37 0.24 0.23 0.44 0.22 0.24 0.34 0.12 0.26 0.19 0.15 0.2 0.2 0.28 0.26 0.28 0.38
0.34 0.38 1.0 0.07 0.29 0.28 0.39 0.16 0.26 0.11 0.17 0.21 0.22 0.15 0.12 0.16 0.13 0.14 0.2 0.2 0.29 0.32
0.51 0.5 1.0 0.02 0.47 0.43 0.46 0.27 0.31 0.17 0.2 0.31 0.24 0.31 0.31 0.31 0.29 0.31 0.44 0.34 0.39 0.37
0.16 0.63 1.0 0.04 0.43 0.42 0.3 0.19 0.23 0.15 0.14 0.2 0.23 0.25 0.28 0.31 0.28 0.31 0.36 0.23 0.3 0.19
0.31 0.4 1.0 0.03 0.45 0.3 0.29 0.22 0.25 0.23 0.2 0.26 0.1 0.19 0.17 0.16 0.17 0.16 0.17 0.19 0.18 0.26
0.46 0.58 1.0 0.02 0.62 0.52 0.47 0.39 0.53 0.46 0.45 0.5 0.25 0.23 0.28 0.28 0.27 0.28 0.21 0.41 0.41 0.86
0.65 0.7 0.93 0.12 0.65 0.93 0.78 0.66 1.0 0.59 0.74 0.99 0.54 0.76 0.36 0.31 0.36 0.34 0.53 0.84 0.77 0.8
0.45 0.6 0.56 0.05 0.47 0.56 0.38 0.51 0.43 0.58 0.46 0.63 0.56 0.55 0.22 0.24 0.24 0.22 0.51 0.43 0.55 1.0
0.57 0.68 1.0 0.06 0.73 0.58 0.29 0.54 0.47 0.66 0.45 0.65 0.29 0.36 0.32 0.29 0.31 0.32 0.31 0.56 0.53 0.42
0.29 0.42 1.0 0.06 0.4 0.45 0.4 0.34 0.38 0.33 0.31 0.48 0.22 0.39 0.29 0.27 0.3 0.28 0.36 0.38 0.43 0.36
0.79 0.78 1.0 0.03 0.75 0.62 0.71 0.5 0.61 0.52 0.41 0.69 0.33 0.35 0.42 0.39 0.43 0.4 0.59 0.49 0.49 0.62
0.33 0.3 1.0 0.04 0.27 0.34 0.29 0.25 0.31 0.26 0.22 0.37 0.14 0.28 0.14 0.13 0.13 0.12 0.15 0.21 0.24 0.26
0.66 0.5 0.48 0.01 0.47 0.64 0.41 0.37 1.0 0.43 0.42 0.86 0.31 0.22 0.18 0.15 0.2 0.17 0.27 0.32 0.35 0.42
0.34 0.58 1.0 0.02 0.55 0.44 0.36 0.18 0.38 0.16 0.23 0.33 0.17 0.29 0.26 0.25 0.21 0.22 0.42 0.28 0.32 0.32
0.57 0.74 1.0 0.03 0.44 0.47 0.52 0.28 0.49 0.28 0.29 0.42 0.36 0.27 0.25 0.26 0.23 0.22 0.31 0.36 0.39 0.3
0.29 0.46 1.0 0.06 0.32 0.35 0.35 0.26 0.26 0.22 0.26 0.31 0.21 0.28 0.16 0.16 0.16 0.15 0.22 0.33 0.29 0.25
0.33 0.54 1.0 0.05 0.57 0.38 0.3 0.21 0.23 0.12 0.18 0.25 0.15 0.28 0.23 0.25 0.2 0.26 0.41 0.21 0.28 0.34
0.28 0.42 1.0 0.05 0.53 0.32 0.32 0.22 0.25 0.12 0.21 0.26 0.19 0.23 0.22 0.21 0.2 0.2 0.35 0.28 0.22 0.3
0.34 0.49 1.0 0.02 0.39 0.39 0.35 0.24 0.34 0.25 0.27 0.36 0.22 0.14 0.23 0.24 0.22 0.22 0.33 0.32 0.34 0.38
0.31 0.48 1.0 0.02 0.4 0.32 0.46 0.13 0.27 0.13 0.23 0.22 0.19 0.18 0.15 0.15 0.13 0.14 0.15 0.22 0.25 0.27
0.64 0.81 1.0 0.03 0.44 0.66 0.64 0.4 0.58 0.42 0.43 0.6 0.26 0.42 0.28 0.24 0.29 0.3 0.37 0.63 0.49 0.58
0.34 0.6 1.0 0.03 0.45 0.36 0.3 0.26 0.34 0.21 0.2 0.34 0.17 0.36 0.21 0.22 0.21 0.23 0.36 0.36 0.3 0.3
0.47 0.68 1.0 0.05 0.81 0.37 0.32 0.34 0.51 0.32 0.31 0.58 0.14 0.35 0.16 0.16 0.16 0.18 0.41 0.39 0.35 0.39
0.35 0.58 1.0 0.04 0.32 0.49 0.45 0.41 0.37 0.29 0.4 0.37 0.13 0.38 0.22 0.23 0.23 0.25 0.36 0.26 0.25 0.55
0.62 0.9 1.0 0.05 0.77 0.69 0.55 0.46 0.57 0.48 0.37 0.67 0.43 0.4 0.42 0.39 0.41 0.35 0.5 0.79 0.79 0.41
0.65 0.73 1.0 0.06 0.68 0.54 0.48 0.61 0.39 0.35 0.41 0.46 0.37 0.25 0.33 0.27 0.35 0.33 0.51 0.46 0.51 0.45
0.61 0.59 1.0 0.11 0.79 0.55 0.54 0.42 0.41 0.36 0.43 0.48 0.27 0.15 0.44 0.34 0.55 0.4 0.36 0.33 0.26 0.51
0.89 0.82 1.0 0.02 0.9 0.8 0.71 0.41 0.6 0.42 0.57 0.61 0.26 0.67 0.55 0.59 0.53 0.53 0.41 0.53 0.47 0.53
0.34 0.37 1.0 0.05 0.47 0.47 0.36 0.38 0.5 0.44 0.36 0.5 0.33 0.25 0.3 0.35 0.28 0.32 0.27 0.44 0.44 0.41
0.71 0.86 1.0 0.03 0.75 0.69 0.54 0.54 0.49 0.42 0.44 0.65 0.35 0.6 0.44 0.37 0.38 0.44 0.53 0.49 0.52 0.65
0.34 0.41 1.0 0.02 0.6 0.51 0.31 0.36 0.55 0.49 0.4 0.58 0.08 0.34 0.22 0.23 0.25 0.21 0.25 0.52 0.45 0.65
0.67 0.79 0.84 0.04 1.0 0.63 0.34 0.19 0.28 0.21 0.23 0.3 0.12 0.52 0.38 0.44 0.33 0.4 0.41 0.33 0.3 0.66
1.0 0.88 0.95 0.04 0.6 0.9 0.7 0.78 0.95 0.75 0.75 0.97 0.49 0.45 0.5 0.52 0.5 0.5 0.57 0.73 0.69 0.73
0.73 0.89 0.93 0.01 0.64 0.79 0.71 0.71 1.0 0.59 0.68 0.94 0.47 0.56 0.31 0.29 0.35 0.33 0.6 0.74 0.68 0.89
0.84 0.71 0.75 0.03 0.63 0.82 0.75 0.7 0.88 0.6 0.6 0.98 0.39 1.0 0.4 0.37 0.47 0.42 0.41 0.64 0.67 0.74
0.59 0.65 1.0 0.03 0.6 0.5 0.42 0.28 0.39 0.23 0.24 0.38 0.27 0.37 0.33 0.33 0.33 0.34 0.4 0.39 0.4 0.24
0.41 0.64 1.0 0.02 0.54 0.58 0.38 0.27 0.44 0.26 0.33 0.34 0.29 0.19 0.23 0.23 0.22 0.22 0.32 0.33 0.34 0.26
0.46 0.7 1.0 0.03 0.65 0.65 0.55 0.34 0.32 0.3 0.2 0.33 0.34 0.5 0.29 0.26 0.3 0.31 0.22 0.42 0.5 0.18
0.41 0.45 1.0 0.06 0.53 0.45 0.39 0.47 0.52 0.39 0.38 0.5 0.26 0.64 0.28 0.22 0.24 0.24 0.51 0.42 0.44 0.97
0.94 1.0 0.87 0.05 0.74 0.89 0.94 0.49 0.68 0.39 0.51 0.67 0.55 0.68 0.49 0.49 0.5 0.48 0.66 0.73 0.83 0.42
0.7 0.93 1.0 0.03 0.73 0.66 0.66 0.4 0.65 0.3 0.39 0.6 0.31 0.54 0.36 0.37 0.38 0.37 0.48 0.47 0.44 0.61
0.36 0.43 1.0 0.05 0.54 0.41 0.55 0.25 0.37 0.13 0.2 0.38 0.38 0.34 0.28 0.26 0.25 0.24 0.19 0.37 0.46 0.42
0.41 0.58 1.0 0.03 0.61 0.47 0.38 0.16 0.3 0.15 0.2 0.29 0.26 0.29 0.32 0.28 0.31 0.33 0.34 0.35 0.32 0.34
0.45 0.62 1.0 0.03 0.47 0.62 0.46 0.48 0.69 0.47 0.46 0.77 0.26 0.56 0.31 0.32 0.33 0.31 0.39 0.46 0.39 0.51
0.59 0.59 1.0 0.07 0.75 0.44 0.38 0.43 0.35 0.32 0.36 0.36 0.16 0.35 0.25 0.23 0.23 0.24 0.3 0.23 0.26 0.17
0.71 0.77 1.0 0.01 0.54 0.52 0.59 0.57 0.64 0.48 0.51 0.64 0.25 0.44 0.29 0.28 0.31 0.28 0.37 0.37 0.41 0.59
0.5 1.0 0.93 0.01 0.73 0.67 0.56 0.53 0.85 0.51 0.5 0.95 0.21 0.64 0.48 0.41 0.46 0.48 0.75 0.79 0.72 0.57

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)