Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
-1.97 - 3.26 2.49 -2.95 -1.99 - - - - - 1.69 - - - - - - - - 1.57 -
- - 3.57 3.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.28 1.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.14 3.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.9 4.03 2.02 -3.74 -4.65 -4.25 - - -1.1 - - - -4.52 -2.5 - -2.46 - - - - -
- - 4.08 2.18 - -0.88 - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.22 0.51 3.85 2.39 - -4.5 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.12 2.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.76 - 3.77 2.95 -1.78 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.13 2.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.0 - 3.49 2.14 -0.98 - - - - - - - - - - - - - 2.28 - - -
-0.47 0.29 3.45 2.69 -1.98 -2.48 -3.39 - - -1.77 - -0.58 - -3.18 -2.2 - - -1.09 - - - -1.47
- - 3.93 2.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.0 1.0 2.95 2.63 -1.74 -1.47 -1.11 - - - -1.86 0.35 - -4.25 -1.27 - - -0.66 - 1.04 - -
-1.47 -0.64 3.75 2.08 -1.53 -2.29 -2.64 -2.92 -2.36 -3.91 -3.33 -3.11 -3.96 -2.79 -1.82 -1.81 -2.56 -2.07 -1.74 -2.45 -3.43 -2.36
0.58 1.29 3.46 2.8 - -2.95 - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.35 3.79 2.38 -1.98 -3.88 -1.65 - - - - - - - - -0.66 - - - -0.18 - -
- - 2.12 3.75 -2.14 -0.7 -3.33 - - - -0.27 - - -1.65 - - - - - - - 1.06
-0.44 0.67 3.44 2.5 -2.38 -3.4 -1.84 - - - - - - - - - - - - - - 1.38
-2.6 0.92 3.94 1.93 -1.04 -2.05 - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.4 3.98 2.19 -5.06 -3.81 - - - - - - - - - - - -1.92 - - - -
- - 4.17 1.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.37 0.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.88 0.56 4.17 0.86 -2.78 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.53 0.71 3.41 2.15 -3.45 -1.61 -1.78 - - - -1.44 -0.81 -1.97 -2.08 -1.41 -0.96 -2.34 - - - - -0.69
0.64 0.24 2.64 2.81 -2.88 -2.03 -1.05 -1.75 - - -0.73 - - -2.43 -2.18 -0.22 -2.54 -0.84 -1.22 - - 0.86
-1.17 1.08 3.9 -0.07 - -3.27 -2.74 - - - - - - -2.08 - - - - - - - 1.63
1.26 - 2.94 3.35 -2.53 -2.91 - - - - - - - - 0.49 - - - - - - -
- - 3.56 3.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.52 -1.46 3.63 2.84 - -1.48 -3.97 - - -1.04 -0.49 - - - - -1.59 - - - - - -
1.12 - 4.02 1.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.18 1.38 4.11 -0.38 - - -2.29 - - - - - - -1.7 - - - - - - - -
- 0.5 4.08 1.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.49 4.33 0.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.02 2.52 - -3.29 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.88 2.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.28 - 3.31 2.76 -1.32 -3.46 - - - - 1.5 - - - -0.44 - - - - - - -
-0.96 1.52 3.37 1.57 -3.67 -1.93 -1.75 - 0.09 -0.02 - - - -2.56 -0.42 -1.31 - -1.71 - -1.22 - -0.85
0.1 - 3.0 3.68 - -3.02 - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.11 -0.04 3.19 2.6 -0.06 -2.33 -2.85 - - - - - - -1.59 -0.18 -1.31 - -1.08 - -0.9 - 0.54
0.93 -0.1 3.11 2.27 -0.8 -1.68 -1.18 -0.1 -0.14 - -1.41 - -0.74 -2.79 - -1.88 -1.59 -1.7 - - - -1.08
- - 3.04 1.63 - - - - - - - - - - - - - - 3.42 - - -
- - 4.18 1.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.79 2.84 3.35 -1.71 -4.33 -2.04 - - 0.15 - - - -2.26 - - -0.06 - - - - -
- - 3.99 2.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.42 - 3.39 3.0 -0.1 - - - - - - - 0.43 -0.95 - - - - - - - -
- -0.42 3.85 2.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.19 - 3.79 2.72 - -1.55 -2.73 - - - - - - -2.13 - - - - - - - -
-1.93 0.31 3.78 2.55 -4.06 -1.78 -1.21 - - - - - - -2.77 - - - - - - - -
-1.83 - 3.48 3.34 -1.81 - -3.12 - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.94 2.77 -1.18 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.81
-0.21 0.28 3.62 2.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.29 1.69 3.71 2.28 -3.41 - - - - -0.69 - - - - - - - - - - - -
-0.01 1.76 3.42 1.96 -2.07 -2.62 - - - - 1.05 - - -0.91 - - - - - - - -
-2.44 2.01 3.6 1.02 -1.97 -3.37 - - - - - 1.22 - - - -0.12 - - - - - -
-4.58 -3.92 4.0 2.51 -8.64 -6.19 -5.39 - - -5.44 - - -5.28 -6.72 -5.78 -6.46 -7.47 -4.91 -6.31 - - -
- - 4.13 2.11 - - - - - - - - - -2.48 - - - - - - - -
- - 3.99 2.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.19 1.03 4.23 -1.73 -1.48 -3.22 - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.64 - 3.8 2.82 -2.76 - -2.26 - - - - - - -1.58 - - - - - - - -
-1.11 1.18 3.62 1.86 -3.14 -1.38 - - - - - - - - - - - - - - 1.52 -
-2.23 -0.06 3.79 2.42 -1.09 -3.72 -4.5 - - -1.2 -0.77 - - - - - - - - - - -
- - 3.92 2.53 -2.93 -4.95 - -0.06 - - - - - - - - - - - - - -
-0.63 - 3.0 3.26 -3.79 -1.98 -3.4 - - - 1.22 - - 0.07 - - - - - - - -
-3.85 -1.41 4.1 2.05 - -6.79 -4.26 - - - - - -2.09 - - - - - - - - -
0.5 -0.55 3.69 2.04 - -2.47 -3.37 - - - - - - - -0.69 -0.8 - -0.62 - -0.44 - -
- - 3.99 2.49 -3.28 -2.77 - - - - - - - -2.19 - - - - - - - -
1.76 - 3.76 2.06 -0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.58 4.18 -0.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.55 - 2.94 2.42 -0.93 - - - - - 0.99 - - 0.19 - - - - - - - 2.31
- - 4.18 1.67 -0.77 -2.84 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.54 2.54 -0.95 -2.15 - - - - - - - - - - - - - - - 1.92
-2.81 - 4.21 -0.19 -0.96 -4.6 - - - -0.27 - - - -1.1 - -0.82 - - - - - -
- -0.0 4.08 2.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.19 1.32 3.65 2.52 - -3.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.84 -0.36 2.48 3.38 -0.91 -1.59 -3.04 0.32 - - - - - -2.36 - - - - - - - 1.35
- - 3.7 3.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.38 0.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.12 0.05 3.72 1.9 - - - - - - - - - - - - - - - 0.22 1.42 -
-0.76 - 2.0 3.83 -2.67 -0.83 -0.47 - - - - - - -1.7 0.55 - - - - - - -
- - 4.2 1.2 - - -1.02 - - - - - - -0.23 - - - - - - - -
- - 4.31 1.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.96 3.96 2.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.42 3.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.3 -0.01 4.08 0.55 -3.14 -3.13 -0.89 0.54 - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.08 2.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.41 3.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.0 0.45 4.27 -1.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.1 3.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.99 2.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.07 2.21 -1.83 - -1.47 - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.93 4.11 2.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.