Heatmap: Cluster_123 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.42 0.35 0.19 0.12 0.02 0.95 1.0 0.4 0.38 0.33 0.42 0.33 0.36 0.36 0.48 0.43 0.5 0.43 0.34 0.23 0.29 0.42
0.04 0.0 0.18 0.03 0.01 1.0 0.81 0.0 0.0 0.05 0.02 0.06 0.59 0.02 0.23 0.13 0.24 0.1 0.09 0.38 0.36 0.03
0.42 0.41 0.13 0.02 0.38 1.0 0.75 0.33 0.44 0.32 0.35 0.37 0.7 0.38 0.97 0.97 0.93 0.88 0.49 0.53 0.64 0.14
0.64 0.64 0.62 0.02 0.52 1.0 0.75 0.52 0.56 0.51 0.53 0.54 0.48 0.28 0.64 0.68 0.62 0.55 0.47 0.43 0.44 0.43
0.92 0.31 0.03 0.01 0.1 1.0 0.96 0.18 0.83 0.31 0.3 0.57 0.71 0.18 0.62 0.43 0.7 0.62 0.41 0.39 0.51 0.07
0.63 0.57 1.0 0.02 0.44 0.98 0.89 0.5 0.85 0.45 0.49 0.86 0.46 0.48 0.71 0.73 0.81 0.85 0.48 0.46 0.56 0.67
0.71 0.72 0.14 0.03 0.5 1.0 0.96 0.54 0.76 0.63 0.66 0.71 0.43 0.74 0.8 0.79 0.83 0.82 0.85 0.57 0.62 0.73
0.59 0.96 0.12 0.02 0.06 1.0 0.7 0.09 0.29 0.2 0.22 0.23 0.2 0.28 0.67 0.39 0.52 0.61 0.8 0.14 0.15 0.48
0.5 0.08 0.01 0.0 0.0 1.0 0.84 0.39 0.15 0.25 0.31 0.27 0.56 0.36 0.12 0.2 0.12 0.1 0.0 0.24 0.49 0.93
0.72 0.1 0.12 0.13 0.01 1.0 0.78 0.38 0.8 0.41 0.47 0.7 0.6 0.49 0.58 0.48 0.76 0.65 0.87 0.2 0.26 0.66
0.36 0.37 0.06 0.01 0.62 1.0 0.55 0.36 0.47 0.37 0.48 0.4 0.44 0.49 0.73 0.71 0.76 0.72 0.51 0.67 0.65 0.48
0.51 0.46 0.52 0.02 0.9 0.75 0.69 0.61 0.87 0.66 0.58 0.8 0.41 0.55 1.0 0.99 0.93 0.83 0.81 0.39 0.46 0.8
0.37 0.3 0.11 0.03 0.43 1.0 0.73 0.38 0.42 0.37 0.38 0.38 0.79 0.24 0.5 0.51 0.46 0.47 0.48 0.55 0.57 0.58
0.06 0.0 0.0 0.01 0.1 0.85 1.0 0.23 0.18 0.17 0.23 0.14 0.41 0.2 0.46 0.38 0.54 0.45 0.31 0.2 0.22 0.3
0.36 0.28 0.08 0.02 0.57 1.0 0.77 0.27 0.82 0.31 0.34 0.89 0.66 0.25 0.64 0.6 0.57 0.6 0.52 0.55 0.68 0.44
0.39 0.32 0.13 0.02 0.68 1.0 0.68 0.24 0.48 0.36 0.37 0.42 0.29 0.2 0.69 0.66 0.66 0.63 0.75 0.4 0.43 0.18
0.69 0.47 0.63 0.02 0.2 1.0 0.96 0.55 0.53 0.5 0.38 0.5 0.5 0.67 0.82 0.66 0.91 0.86 0.58 0.56 0.74 0.61
0.53 0.46 0.5 0.02 0.47 0.89 0.96 0.41 0.59 0.33 0.41 0.5 0.67 0.84 0.98 0.93 1.0 0.9 0.79 0.62 0.71 0.8
0.58 0.59 0.1 0.01 0.52 0.79 0.91 0.47 0.76 0.47 0.53 0.77 0.37 0.6 0.58 0.53 0.62 0.57 0.78 0.56 0.54 1.0
0.49 0.2 0.01 0.0 0.19 1.0 0.69 0.53 0.52 0.86 0.54 0.48 0.39 0.47 0.7 0.65 0.66 0.66 0.56 0.71 0.73 0.77
0.78 0.6 0.04 0.02 0.0 0.99 1.0 0.49 0.45 0.54 0.47 0.57 0.57 0.52 0.67 0.74 0.73 0.76 0.54 0.38 0.45 0.42
0.89 0.52 0.14 0.02 0.74 0.99 0.54 0.51 0.59 0.42 0.48 0.51 0.25 0.57 0.92 0.94 1.0 0.99 0.83 0.45 0.45 0.42
0.66 0.17 0.0 0.06 0.0 1.0 0.78 0.08 0.57 0.06 0.12 0.18 0.22 0.22 0.39 0.42 0.22 0.16 0.01 0.1 0.17 0.05
0.85 0.79 0.55 0.03 0.5 1.0 0.5 0.43 0.49 0.51 0.37 0.58 0.53 0.43 0.84 0.76 0.79 0.73 0.45 0.5 0.55 0.59
0.4 0.45 0.23 0.01 0.64 0.95 0.64 0.47 0.57 0.44 0.38 0.53 0.3 0.45 0.95 0.91 1.0 0.9 0.69 0.48 0.51 0.41
0.35 0.37 0.51 0.03 0.7 1.0 0.59 0.28 0.37 0.19 0.22 0.31 0.54 0.43 0.83 0.74 0.83 0.78 0.54 0.34 0.44 0.39
0.44 0.32 0.06 0.01 0.59 0.97 0.51 0.44 0.61 0.46 0.46 0.57 0.54 0.38 0.8 0.76 1.0 0.91 0.52 0.55 0.61 0.32
0.67 0.51 0.13 0.01 0.84 0.95 0.61 0.65 0.76 0.67 0.7 0.67 0.32 0.53 0.9 1.0 0.89 0.83 0.39 0.6 0.62 0.69
0.64 0.53 0.08 0.01 0.76 0.94 0.61 0.49 0.62 0.64 0.52 0.61 0.33 0.2 0.89 0.97 0.87 1.0 0.94 0.44 0.53 0.45
0.48 0.43 0.02 0.01 0.24 0.92 0.63 0.71 0.9 0.45 0.57 1.0 0.28 0.75 0.59 0.51 0.65 0.6 0.91 0.73 0.77 0.54
0.53 0.24 0.02 0.29 0.3 0.73 1.0 0.18 0.3 0.11 0.16 0.14 0.32 0.64 0.09 0.27 0.27 0.25 0.22 0.21 0.17 0.13
0.39 0.41 0.02 0.02 0.0 1.0 0.6 0.49 0.39 0.48 0.45 0.5 0.41 0.48 0.75 0.74 0.76 0.67 0.51 0.38 0.43 0.39
0.77 0.7 0.48 0.02 0.64 1.0 0.81 0.79 0.68 0.77 0.7 0.64 0.4 0.83 0.9 0.78 0.89 0.83 0.78 0.75 0.7 0.88
0.44 0.44 0.55 0.03 0.79 1.0 0.54 0.6 0.58 0.61 0.56 0.6 0.37 0.48 0.72 0.6 0.67 0.55 0.6 0.58 0.65 0.56
0.62 0.52 0.52 0.08 0.05 1.0 0.72 0.41 0.42 0.43 0.34 0.52 0.4 0.63 0.62 0.41 0.67 0.52 0.54 0.26 0.32 0.49
0.41 0.62 0.87 0.08 0.12 1.0 0.94 0.44 0.59 0.31 0.41 0.49 0.63 0.75 0.59 0.65 0.65 0.66 0.43 0.55 0.61 0.75
0.43 0.4 0.2 0.03 0.1 1.0 0.93 0.63 0.64 0.64 0.58 0.52 0.6 0.36 0.79 0.78 0.75 0.71 0.52 0.46 0.49 0.47
0.68 0.65 0.46 0.01 0.33 1.0 1.0 0.4 0.57 0.31 0.4 0.5 0.69 0.52 0.89 0.82 0.92 0.85 0.68 0.51 0.65 0.46
0.57 0.41 0.16 0.02 0.54 0.99 0.68 0.34 0.93 0.39 0.43 1.0 1.0 0.56 0.58 0.66 0.54 0.57 0.52 0.84 0.81 0.26
0.78 0.63 0.32 0.02 0.85 0.9 0.58 0.59 0.58 0.46 0.44 0.49 0.27 0.57 0.87 0.79 0.89 0.85 1.0 0.6 0.65 0.66
0.24 0.11 0.17 0.23 0.17 0.6 1.0 0.08 0.0 0.07 0.3 0.0 0.18 0.68 0.12 0.15 0.1 0.11 0.12 0.06 0.14 0.08
0.29 0.29 0.22 0.02 0.7 1.0 0.47 0.21 0.41 0.23 0.24 0.4 0.42 0.26 0.59 0.66 0.57 0.67 0.58 0.53 0.57 0.25
0.02 0.02 0.1 0.01 0.03 1.0 0.89 0.14 0.37 0.27 0.36 0.56 0.57 0.06 0.33 0.22 0.12 0.22 0.0 0.2 0.38 0.05
0.69 0.46 0.1 0.02 0.79 0.86 0.61 0.43 0.55 0.45 0.43 0.41 0.37 0.34 1.0 0.97 0.95 0.88 0.46 0.51 0.58 0.36
0.6 0.54 0.28 0.01 0.53 0.95 0.6 0.75 0.84 0.5 0.5 0.59 0.35 0.98 1.0 0.88 0.98 0.93 0.65 0.84 0.88 0.65
0.67 0.54 0.39 0.08 0.9 0.88 0.62 0.59 0.58 0.61 0.53 0.48 0.57 0.54 0.88 0.89 1.0 0.84 0.68 0.56 0.64 0.79
0.7 0.59 0.11 0.01 0.74 1.0 0.62 0.42 0.67 0.43 0.42 0.64 0.4 0.34 0.91 0.9 0.96 0.94 0.66 0.57 0.64 0.44
0.39 0.42 0.45 0.01 0.17 1.0 0.65 0.21 0.4 0.34 0.29 0.35 0.72 0.29 0.76 0.65 0.67 0.63 0.19 0.54 0.74 0.18
0.72 0.63 0.33 0.01 0.18 0.93 0.94 0.42 0.83 0.32 0.32 0.64 1.0 0.14 0.4 0.35 0.34 0.41 0.49 0.6 0.81 0.17
0.83 0.59 0.22 0.03 0.42 0.98 1.0 0.54 0.64 0.54 0.74 0.61 0.44 0.58 0.82 0.75 0.68 0.68 0.63 0.39 0.49 0.63
0.62 0.6 0.26 0.02 0.55 1.0 0.59 0.5 0.68 0.47 0.47 0.6 0.4 0.48 0.84 0.81 0.87 0.85 0.65 0.51 0.53 0.49
0.02 0.02 0.02 0.37 0.09 1.0 0.98 0.02 0.37 0.0 0.03 0.27 0.21 0.1 0.48 0.44 0.33 0.52 0.59 0.15 0.17 0.22
0.85 0.77 0.06 0.03 0.54 0.86 1.0 0.54 0.83 0.63 0.55 0.74 0.39 0.57 0.87 0.97 0.9 0.84 0.86 0.51 0.53 0.48
0.38 0.25 0.03 0.01 0.7 1.0 0.61 0.34 0.4 0.28 0.31 0.34 0.4 0.37 0.92 0.83 0.97 0.88 0.41 0.56 0.53 0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)