Heatmap: Cluster_70 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
-0.32 1.37 4.03 -0.37 -2.69 -3.58 -4.56 -4.03 -2.91 -4.4 -3.15 -3.55 -4.46 -3.67 -4.2 -3.25 -4.32 -4.61 -3.2 -3.43 -3.94 -3.12
-1.15 1.49 4.04 -1.66 -4.46 -3.22 -2.88 -4.0 -2.47 -4.81 -3.74 -3.69 -3.24 -1.63 -3.33 -2.62 -3.19 -3.16 - -3.39 -2.81 -3.41
-4.86 0.59 4.3 -1.25 -4.68 -5.89 -5.06 -5.92 -6.56 -7.68 -4.75 -6.62 -5.6 -6.13 -5.58 -7.15 -6.2 -8.16 -6.0 -6.36 - -5.51
-3.13 1.2 4.12 -0.96 -5.1 -2.53 -2.18 -4.18 -4.81 -4.41 -3.92 -4.45 -1.84 -3.71 -3.39 -3.66 -4.4 -4.26 -3.84 -3.28 -2.41 -4.54
-1.07 1.38 3.92 -1.08 -2.01 -2.1 -2.44 -2.01 -1.86 -2.55 -2.69 -2.16 -3.68 -1.6 -3.05 -3.16 -3.15 -2.88 -3.14 -2.46 -2.66 -2.41
-4.81 0.97 4.25 -0.55 -6.16 -5.68 -6.0 - - -5.51 -7.67 -4.87 -5.05 -6.46 -6.38 -7.16 -7.16 -5.83 -5.84 -4.92 -5.57 -5.76
-1.05 1.51 3.89 -0.9 -2.01 -2.42 -0.89 -2.69 -1.66 -2.73 -2.33 -1.51 -2.62 -2.86 -3.52 -3.73 -3.99 -3.39 -3.47 -3.09 -2.67 -2.37
-1.31 1.24 4.15 -0.17 -3.28 -5.77 -4.21 -5.08 -4.53 -5.23 -4.31 -4.11 -6.1 -4.82 -7.9 -8.81 -7.11 -6.32 -6.08 -4.62 -4.71 -7.17
-5.35 1.19 4.25 -1.23 -4.48 -5.16 -6.0 -6.22 -6.48 -5.78 -5.94 -6.53 -6.38 -6.43 -7.09 -8.23 -7.05 -6.7 -5.69 -6.08 -6.65 -5.42
-1.1 1.19 3.87 -0.51 -1.3 -1.8 -2.13 -2.9 -2.47 -2.67 -3.28 -1.56 -2.66 -1.97 -2.39 -2.34 -2.36 -2.17 -2.71 -1.92 -1.61 -2.52
-1.59 1.61 4.17 -2.42 -2.36 -7.98 -5.5 -8.76 - -7.96 -9.05 -6.84 -4.75 -7.63 -9.42 - - -9.35 -8.22 -4.8 -3.96 -7.14
-3.06 1.43 4.13 -0.02 -3.28 -4.16 -5.76 -3.84 -5.7 -5.31 -4.65 -5.75 -4.93 -4.31 - -4.32 -6.29 -5.4 -3.55 -5.49 -3.55 -5.64
-1.95 1.17 4.03 -0.12 -3.81 -3.17 -2.69 -2.98 -3.32 -4.23 -3.47 -3.37 -2.53 -2.53 -3.22 -3.21 -2.95 -3.33 -4.12 -2.83 -2.57 -1.97
-3.32 1.47 4.18 -0.43 -5.62 -6.25 -5.72 -5.29 -4.93 -7.04 - - -7.06 -6.99 - -7.72 -6.44 -7.49 - -7.24 -4.52 -3.55
-2.45 0.11 4.3 -1.14 -4.52 -4.77 -4.84 -5.82 -4.88 - -3.46 -3.35 -5.16 -6.21 -5.52 -6.62 -4.79 -5.68 -5.32 -4.63 - -3.83
-1.9 1.52 4.17 -1.3 -6.19 -3.09 -4.62 -5.26 -5.33 - -5.02 - -4.65 -5.07 -4.99 -5.07 -5.92 -7.12 - -5.7 - -5.27
-2.83 1.19 3.96 -1.66 -4.41 -1.71 -1.27 -2.44 -1.8 -3.2 -2.5 -1.98 -1.25 -2.27 -3.34 -2.7 -3.02 -3.2 -3.24 -2.66 -1.94 -1.59
-1.31 1.28 3.86 -1.84 -3.11 -1.86 -1.66 -2.32 -1.59 -2.53 -2.04 -1.53 -1.81 -1.7 -2.4 -2.13 -2.76 -2.23 -2.67 -2.08 -1.71 -2.0
-2.94 -0.31 4.37 -2.63 -7.05 -7.09 -6.34 - - -7.92 - -4.41 - -6.16 -8.32 -8.42 -8.13 -8.24 -6.12 -6.03 -5.86 -4.62
-4.82 0.51 4.33 -1.16 -8.91 -8.6 -7.81 - - - - - - -8.74 - -7.49 - - - - - -7.03
-5.28 0.68 4.1 -0.64 -8.41 -2.4 -2.45 -3.43 - -3.65 -4.16 -3.53 -1.78 -3.54 -3.0 -1.72 -2.19 -1.42 -3.91 -2.01 -2.65 -
-2.85 0.59 4.28 -1.38 -3.44 -4.25 -3.62 -6.98 - -6.22 -6.73 -4.51 -4.22 -3.65 -6.58 -6.19 -5.76 -6.05 -4.9 -5.37 -6.22 -4.99
-3.37 0.87 4.26 -0.49 -5.25 -6.15 -7.08 -5.95 - -6.13 - - -7.02 -5.37 -5.65 - - -5.69 -5.45 -6.33 - -3.64
-6.49 1.68 4.22 -4.2 -8.72 -6.73 -6.52 -8.19 -6.02 -7.17 -6.85 -8.88 -6.25 -6.73 -6.81 -7.45 -6.88 -7.06 -7.68 -6.27 -7.01 -7.19
-2.75 1.45 4.15 -1.37 -3.58 -3.79 -3.8 -4.74 -5.6 -5.59 -4.88 -4.85 -5.23 -3.65 -3.58 -3.63 -4.03 -4.23 -4.04 -4.37 -4.2 -4.46
-2.96 1.46 4.17 -1.33 -3.81 -5.92 -1.9 -5.57 - -6.37 -7.46 - -4.47 -4.89 -3.56 -3.48 -7.95 - -6.63 -5.99 -6.37 -3.55
-4.78 0.97 4.23 -0.64 -4.81 -4.38 -8.66 -8.95 -8.01 -8.18 - - -10.02 -6.49 -3.39 -2.28 -3.8 -2.87 -5.64 -5.9 - -8.95
-2.36 1.56 4.11 -0.96 -4.42 -4.39 -7.09 -4.91 -3.21 -3.87 -3.22 -3.59 -3.87 -3.38 -5.18 -3.95 -5.25 -4.92 -4.97 -3.89 -4.12 -3.48
-1.1 1.22 3.91 -0.9 -1.62 -1.9 -1.72 -2.51 -2.39 -3.48 -3.61 -2.25 -2.49 -2.54 -2.38 -2.3 -2.66 -2.38 -2.23 -2.31 -2.37 -1.75
-4.63 0.45 4.3 -0.64 -3.73 -6.09 -5.73 -6.71 - - -7.05 - -5.68 -5.11 - -6.36 -6.37 -5.75 - -6.16 -5.95 -3.91
-2.99 1.4 4.15 -0.47 -3.82 -4.4 -4.77 -4.88 -5.52 -4.69 -4.98 - -5.6 -3.88 -7.15 -4.14 -4.42 -5.19 -3.37 -4.05 -4.69 -5.46
-2.57 1.85 4.0 -1.36 -2.47 -2.98 -3.62 -3.21 -3.85 -3.72 -3.52 -4.32 -4.08 -2.17 -3.11 -3.85 -3.53 -3.79 -2.94 -4.0 -4.15 -2.13
-1.99 1.24 3.88 -0.96 -2.75 -1.91 -1.35 -2.37 -1.63 -2.98 -2.05 -1.81 -1.42 -2.99 -2.45 -2.26 -2.79 -2.5 -1.86 -2.11 -1.97 -2.27
-5.21 0.75 4.26 -0.32 -4.99 -5.93 -5.48 -5.71 -6.34 -5.16 -4.81 -5.4 -5.46 -4.99 -6.42 -5.63 -5.15 -5.92 - -6.07 -6.52 -5.7
-3.0 1.01 4.24 -0.95 -5.5 -5.25 -5.58 -4.37 -4.41 -5.02 -5.68 - -4.69 -4.97 - - -5.93 - -5.85 -4.77 -3.26 -4.35
-2.16 1.82 4.07 -2.04 -4.39 -4.35 -6.79 -4.13 -2.63 -4.12 -4.08 -3.02 -4.03 -4.6 -6.66 -7.17 -4.52 -4.64 -3.47 -2.85 -2.91 -3.79
-4.27 1.81 4.15 -4.96 -3.45 -4.02 -5.57 -6.66 -7.24 -6.62 -7.07 -7.1 -6.15 -5.09 -4.03 -4.57 -4.2 -4.22 -4.23 -6.79 -7.9 -3.68
-2.33 1.57 4.1 -1.55 -7.34 -3.1 -2.38 - - -5.79 -3.79 -3.15 -3.34 -3.87 -3.96 -4.34 -2.76 -3.19 -3.53 -5.0 -3.86 -4.04
-1.78 1.73 4.01 -1.96 -3.73 -2.44 -2.47 -3.45 -3.98 -3.44 -3.59 -4.03 -4.7 -2.74 -4.25 -3.07 -3.66 -3.27 -4.78 -2.47 -2.32 -2.14
-3.77 1.85 4.1 -2.33 -2.3 -3.74 -4.29 -6.01 -5.37 -5.21 -6.84 -5.84 -5.55 -3.81 -3.74 -4.0 -4.09 -3.61 -4.23 -5.4 -6.55 -3.99
-5.39 1.39 4.22 -0.96 -7.34 -6.68 -6.26 -4.63 -6.48 -6.14 -7.17 -4.95 -7.01 -5.28 -6.01 -5.77 - -8.05 - - -5.07 -
-2.68 0.9 4.22 -0.73 -5.59 -4.86 -5.19 -4.36 -4.06 -4.58 -3.53 -4.92 -4.51 -3.4 -4.4 -4.68 -4.85 -4.72 -7.31 -4.61 -4.72 -5.23
-7.31 1.38 4.27 -4.45 - -9.94 -12.96 - -9.68 - - -9.74 - -12.34 - - - -11.48 - -9.05 - -
-0.86 1.28 3.85 -0.84 -2.02 -2.2 -1.6 -2.46 -1.87 -1.93 -2.2 -2.43 -3.49 -2.58 -2.93 -2.23 -2.7 -2.27 -5.31 -2.95 -4.05 -0.02
-0.85 1.55 4.06 -0.57 -4.25 -3.16 -3.05 -4.37 -4.41 -3.84 -3.36 -3.73 -6.15 -3.13 -3.77 -3.56 -3.9 -4.11 -6.43 -4.33 -4.59 -4.13
-2.71 1.54 4.14 -1.55 -6.85 -3.64 -2.56 -3.81 -4.97 -4.96 -6.2 -4.44 -4.45 -2.82 -4.22 -4.56 -3.98 -4.34 -6.41 -5.01 -4.51 -5.06
-1.28 1.24 3.87 -1.03 -3.45 -1.75 -1.09 -2.08 -1.21 -3.17 -2.53 -1.73 -2.06 -2.33 -4.51 -3.92 -4.47 -4.1 -4.11 -1.52 -2.43 -0.38
-4.95 1.35 4.13 -3.12 -6.91 -2.26 -3.35 - -2.09 - -4.36 -1.56 -2.92 -2.65 -4.72 -4.88 -4.68 -4.89 - -3.43 -3.26 -2.45
-7.24 0.42 4.34 -1.12 - -10.0 - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.