Heatmap: Cluster_18 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
-0.89 0.91 3.74 -0.51 -2.13 -1.8 -1.02 -1.91 -0.97 -2.12 -1.87 -1.19 -2.44 -1.51 -1.99 -1.76 -1.99 -1.98 -1.83 -1.99 -1.98 -1.13
- 0.26 4.22 1.1 -4.61 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.27 1.32 3.97 -0.87 -9.85 -2.25 -2.54 -2.33 -5.02 -2.55 -3.29 -6.07 -5.86 -3.37 -2.15 -2.33 -2.37 -2.1 -3.28 -1.63 -2.11 -1.67
-3.18 1.36 4.19 -0.15 -6.27 -6.65 -6.46 - -6.12 -6.26 -6.81 - -6.46 -5.07 -7.52 -7.85 -8.88 -7.92 - - -5.71 -6.06
-5.44 0.69 4.27 -0.09 -4.97 -6.35 -5.65 -6.37 - - - -6.48 -7.64 -6.07 -6.95 -7.18 -8.01 -7.1 - -6.8 -6.6 -7.36
-1.25 0.52 3.81 -2.23 -1.14 -1.3 -1.26 -1.94 -1.11 -1.5 -1.71 -1.38 -1.53 -2.63 -1.82 -1.82 -2.05 -1.95 -2.19 -1.57 -1.42 -1.47
-1.19 0.3 3.7 -2.07 -0.93 -0.98 -0.78 -1.68 -1.28 -1.21 -1.78 -1.32 -1.81 -2.07 -1.69 -1.39 -1.59 -1.43 -1.36 -1.32 -1.38 -0.9
-2.72 1.3 4.13 -2.39 -1.82 -2.94 -3.53 -3.98 -3.02 -4.17 -3.35 -3.07 -4.47 -3.86 -4.89 -4.27 -3.57 -4.85 -3.04 -3.75 -3.19 -3.22
-1.16 -0.14 3.73 -0.5 -3.42 -1.3 -0.7 -1.38 -1.08 -1.55 -1.67 -0.71 -0.97 -1.46 -2.07 -2.15 -1.85 -1.82 -1.88 -1.2 -1.34 -1.17
-1.81 0.92 4.19 -1.9 -3.78 -4.04 -3.32 -3.21 -3.03 -3.33 -3.34 -3.41 -3.35 -3.42 -6.4 -4.86 -5.03 -5.74 -3.62 -3.6 -5.53 -3.49
- 1.57 4.23 -2.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.68 0.69 4.08 0.4 -3.51 -2.84 -2.65 -5.46 -2.52 -2.12 -2.71 -3.58 -5.74 -2.29 - -6.31 - -4.51 - -1.41 -3.7 -2.01
-0.13 0.52 3.73 0.5 -2.14 -1.89 -1.48 -2.15 -1.65 -1.07 -1.28 -1.2 -3.74 -2.36 -3.12 -2.29 -2.6 -3.16 -2.46 -1.6 -1.82 -0.77
-3.38 0.64 3.89 -2.46 -5.9 -1.44 -2.8 -2.76 -0.87 -2.29 -2.55 -0.38 -3.11 -0.73 -1.87 -2.65 -1.5 -1.48 -1.58 -1.29 -1.84 -3.61
-1.41 1.14 3.89 0.07 -2.38 -2.48 -2.15 -3.08 -1.62 -0.6 -1.96 -1.82 -3.33 -2.66 -3.74 -3.78 -4.95 -2.97 -5.38 -2.61 -2.53 -1.24
-5.93 1.18 4.28 -2.04 -6.83 -9.34 - -6.23 - - - - - -8.94 - - - - - - - -
-3.22 1.45 4.24 -3.56 -8.91 -7.53 -5.79 -4.67 -7.17 -5.19 -5.86 - -8.34 -6.92 - - - -7.76 - -4.82 -5.35 -
0.12 -1.25 4.31 -0.98 -4.46 - - - - - - - - -3.42 - - - - - - - -
-6.13 1.59 4.23 -2.63 -11.65 -10.48 -11.24 -8.26 - -9.07 -10.16 - -11.06 -9.55 - - -9.57 - - -6.65 -5.26 -9.84
-4.75 0.98 4.29 -1.63 -10.96 -7.93 -9.01 -9.55 - -8.15 - -8.64 -8.73 -7.43 -9.99 -10.37 -10.03 - - -8.31 -8.76 -5.72
-2.63 0.96 4.19 -1.35 -4.44 -3.49 -3.46 -3.47 -3.33 -4.05 -4.02 -4.38 -6.2 -4.2 -3.94 -4.08 -3.93 -3.65 -4.18 -4.09 -3.51 -3.57
-7.35 1.29 4.19 0.28 -6.37 -8.28 -7.88 - - - - - -5.64 -5.7 - - - - - - - -4.58
-2.12 1.43 3.96 0.61 -3.13 -3.0 -3.01 -3.26 -1.98 -2.03 -1.88 -4.36 -3.48 -3.37 -3.25 -4.12 -4.9 -3.7 -2.74 -4.69 -4.48 -5.25
-1.23 1.06 3.84 0.54 -2.22 -2.33 -1.71 -1.99 -2.43 -1.83 -3.0 -2.16 -2.16 -2.71 -2.74 -2.53 -3.26 -3.01 -1.41 -2.95 -2.44 -1.57
-3.9 1.44 4.09 0.84 - - -4.3 - - - - - - - - - -1.73 - - - - -
- -0.34 4.33 0.04 -3.71 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.92 4.07 -0.19 - -4.01 - - - - - - - -3.58 - - - -2.12 - -2.83 - -
-9.39 1.75 4.15 -1.84 -5.96 -6.36 -5.56 -2.4 - -3.59 -4.41 - -7.63 -3.83 -7.1 - -7.06 -7.06 - -3.67 -5.64 -
-2.53 1.02 4.01 -1.37 -4.18 -2.56 -4.26 -2.75 -2.14 -2.63 -2.49 -1.93 -3.09 -2.48 -3.19 -2.8 -3.06 -2.78 -2.68 -0.79 -1.58 -2.6
-2.7 0.27 3.94 0.51 -0.87 -1.68 -2.79 -3.1 -3.43 -3.02 -3.29 -2.66 -4.65 -2.21 -1.96 -1.78 -2.11 -1.99 -1.21 -2.74 -2.08 -2.3
-3.76 1.28 4.14 0.66 -6.36 -5.56 -4.98 -5.43 -7.65 -6.55 -6.93 -5.12 -6.37 -5.47 -5.85 -5.82 -6.13 -6.99 -5.51 -6.67 -6.83 -5.6
- 1.27 4.14 0.07 -6.2 -3.63 -3.93 - - -2.7 -1.27 - - -4.24 - - -3.34 - - - - -
-6.41 -0.2 4.3 0.48 -9.62 -7.92 -6.85 -7.28 - -9.01 -7.59 -6.37 -7.97 -8.09 -9.31 -7.95 - -8.48 -8.34 -9.28 - -8.85
-2.88 1.1 4.11 0.54 -4.41 -5.08 -4.48 - -1.15 -2.26 - - - - - - - - - - - -2.09
-2.62 0.75 4.19 0.51 -4.02 -4.45 -4.24 - - - - - -4.92 -5.77 -3.7 -5.44 -5.46 - -4.14 - -3.88 -4.65
- - 4.35 0.34 - -5.86 - - - - - - - - - - -1.89 - - - - -
-2.34 0.31 4.34 -2.84 -7.67 -6.08 -6.38 -6.48 - - -7.33 - -8.81 -5.73 -6.42 -7.85 -7.4 -7.0 -4.39 - - -
-0.89 1.11 4.08 -0.19 -5.32 -4.66 -3.48 -3.18 -5.22 -3.23 -3.29 -5.28 -8.39 -3.32 -5.2 -5.18 -4.92 -5.24 -4.34 -3.88 -3.4 -1.0
-1.75 -0.18 4.01 0.2 -1.87 -2.15 -1.67 -4.0 -2.06 -2.37 -3.19 -1.98 -2.53 -3.25 -3.41 -3.28 -3.56 -2.85 -2.82 -2.2 -2.56 -0.54
-5.23 1.0 4.29 -2.58 -6.29 -6.2 -5.84 - - - - - - - - -3.3 -2.96 - - - - -
-4.03 1.12 4.2 0.09 -4.51 -5.73 -5.45 -5.31 -5.96 -6.07 -6.65 -6.01 - -4.91 -6.01 -5.33 -7.72 - - -6.34 - -4.32
-2.14 1.35 4.15 -0.55 -4.72 -4.87 -3.9 -4.61 -4.07 -3.65 -4.23 -4.13 -4.68 -4.22 -4.44 -6.39 -5.56 -4.48 -5.1 -5.0 -5.83 -3.02
-2.78 0.44 4.07 -0.11 -2.33 -1.91 -2.58 - -1.15 - - -2.2 -4.15 -2.63 -1.14 -3.88 - - -1.58 - - -1.5
-4.4 0.74 4.12 0.67 -8.62 -3.8 -6.51 -3.7 -2.76 -2.22 -2.17 -2.81 -3.33 -3.95 -4.82 -4.33 -4.06 -5.32 - -4.49 -3.93 -5.7
-1.73 1.53 3.98 0.59 -3.38 -2.73 -1.68 -4.17 -4.43 -4.59 -3.46 -5.07 -4.18 -3.12 -3.91 -3.87 -3.41 -3.58 -5.13 -4.46 -4.39 -3.1
-0.8 0.5 3.97 -0.38 -2.09 -2.34 -1.22 -2.39 -2.21 -3.05 -2.9 -3.08 -1.55 -2.1 -3.76 -3.04 -2.93 -2.63 -4.46 -1.92 -3.2 -1.01
-0.49 1.64 4.09 -2.62 -4.29 -3.94 -1.87 -4.26 -3.11 -5.55 -3.39 -4.27 -3.93 -3.57 -6.05 -5.68 -6.98 -7.6 - -5.37 -5.2 -
-2.73 1.03 3.98 0.65 -2.72 -3.39 -1.54 -3.13 -2.4 -2.67 -2.68 -1.65 -3.66 -3.76 -5.88 -4.21 -4.09 -4.64 -4.1 -3.86 -4.16 -1.29
-1.3 1.12 4.17 -1.19 -3.96 -4.28 -4.59 - - - -1.83 - -3.42 -4.8 -2.82 - - -1.73 - - - -
-4.72 -0.22 4.28 0.47 -3.65 -5.25 -5.4 -5.46 - - -3.77 - -5.58 -7.15 - -5.05 -6.25 - - -5.81 - -
-3.95 1.47 4.12 -0.21 -5.75 -5.05 -5.47 - - -2.25 - -1.19 - -4.79 - - -2.9 - - - - -
-5.98 1.68 4.21 -2.79 - -6.74 -6.15 - -6.41 -7.52 -7.68 - -10.27 -10.06 -6.99 -7.34 -7.0 -7.74 -8.43 -8.34 -8.17 -7.94
-1.31 0.44 3.91 -1.85 -3.13 -1.16 -1.27 -1.54 -1.49 -1.75 -1.81 -1.49 -1.75 -1.98 -2.58 -2.64 -2.55 -2.61 -2.46 -2.24 -1.29 -1.53
-0.7 1.07 4.12 -1.86 -4.14 -2.57 -1.19 -5.12 -4.17 -5.7 -4.98 -3.42 -3.46 -3.48 -3.37 -3.48 -4.33 -3.08 -5.02 -3.42 -3.76 -4.79
-2.06 1.28 4.16 0.16 - -2.9 -4.02 - - - - - - - - - - - - -3.36 - -
-2.34 0.3 3.95 -0.01 -2.1 -1.51 -1.57 -3.4 -3.36 -2.92 -3.39 -2.96 -3.99 -2.9 -1.32 -1.58 -1.36 -1.58 -0.65 -4.69 -2.54 -3.4
-3.0 0.88 4.31 -2.84 -5.07 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.68 1.05 4.19 -1.67 -4.2 -4.28 -3.94 -3.39 -4.1 -5.8 -3.6 -3.15 -3.58 -3.65 -4.45 -4.31 -4.22 -3.69 -4.32 -4.14 -3.86 -3.93
-1.44 0.63 4.17 0.68 -4.24 -5.05 - - - - - - - - - - - - - - - -1.48
-1.62 0.75 4.09 -0.94 -5.4 -2.4 -2.09 -2.95 -2.96 -3.2 -2.96 -3.21 -2.91 -3.3 -2.9 -2.51 -2.73 -2.67 -3.15 -3.36 -3.14 -2.62
-2.81 1.22 4.13 -0.57 -2.71 -3.66 -3.15 -3.5 -2.07 -4.42 -3.28 -4.19 -5.03 -3.41 -4.56 -4.38 -4.6 -5.08 -5.9 -4.11 -4.64 -3.6
- -0.18 4.32 0.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.35 1.14 4.22 -0.69 -2.44 -6.6 -5.51 - - - -3.89 - - -3.68 - - - -5.0 - - - -
-4.87 1.63 4.12 0.45 -5.74 - - - - - - - - -5.59 -3.58 - - - - - - -
-4.49 1.11 4.21 -1.04 -3.08 -4.03 -4.75 -4.16 -5.21 -5.1 -6.16 -4.26 -4.89 -3.82 -4.8 -4.15 -5.24 -4.87 -4.32 -6.52 -4.8 -3.69
-0.23 1.16 4.01 -0.77 -5.39 -2.28 -1.5 -4.17 -3.24 -2.05 -2.6 - -5.4 -2.16 -4.75 -3.41 -2.14 -1.85 - -4.58 -3.41 -3.59
- 0.72 4.23 0.21 -4.13 -4.38 -3.49 - - - - - -2.41 -3.9 - - - - - - - -
-4.15 1.37 4.13 -0.1 -2.21 -4.85 - - - - - - - - - -3.28 - - -1.32 -3.2 - -
- -1.63 4.27 1.15 - -5.79 -3.55 - - - - - - -3.21 - - - - - - - -
-2.88 0.91 4.2 -0.14 -5.9 -4.17 -3.95 -5.03 -4.67 -3.93 -4.2 -5.31 -4.99 -4.46 -4.89 -4.9 -5.52 -5.2 -5.37 -4.69 -5.11 -3.8
-4.71 0.54 4.26 0.25 -6.36 -6.25 -7.29 -7.05 -6.68 -7.28 -6.81 -7.0 -8.68 -7.11 -7.07 -6.62 -7.41 -6.93 -5.75 -7.45 -6.63 -7.04
- 1.23 4.19 -0.29 -3.62 - - - - - - - - -0.91 - - - - - - - -
-2.78 0.48 4.26 -0.59 -6.01 -4.8 - - -2.86 -3.97 - -2.92 - -4.52 - - - -2.93 - -4.24 - -
-1.64 0.48 4.16 0.3 -5.0 -3.37 -3.53 -4.48 -4.51 -4.72 -5.39 -4.57 -3.19 -3.89 -3.34 -3.36 -3.58 -3.54 -4.0 -4.27 -3.6 -4.55
-3.16 -0.54 4.37 -2.25 -1.59 -6.26 - - - - - - - - - - - - - - - -
-6.68 0.11 4.29 0.35 -9.69 -10.28 - - -8.41 - -9.1 - - -8.89 - - - - -8.85 - - -
-1.91 1.18 4.18 0.1 -4.2 -5.65 -5.88 - - -4.83 -4.99 - -5.94 -5.79 -6.36 -5.28 -5.39 -4.77 - -6.1 - -
-4.18 0.82 4.26 -1.06 -5.48 -4.35 -6.63 -5.7 -5.33 -5.16 -5.67 -4.97 -7.78 -5.87 -4.37 -4.64 -4.54 -4.23 -4.55 -4.31 -4.51 -5.86
-2.1 1.92 4.09 -2.14 -2.19 -2.71 -3.42 - - -3.19 - - - -5.73 - - - - -2.52 - - -
-3.59 1.05 4.13 -0.07 -2.94 -3.64 -2.95 -4.18 -3.97 -3.23 -3.74 -3.61 -3.69 -4.82 -4.85 -4.62 -6.15 -4.57 -5.0 -3.9 -4.15 -1.98
-4.75 0.33 4.26 0.43 -5.29 -5.01 -2.36 - - - - - - -5.9 - - - - - - - -
-4.48 1.26 4.26 -1.42 -5.72 -7.91 -7.91 - -7.28 - - - -9.45 -9.93 - - - - - - -7.46 -8.23
-6.06 1.3 4.27 -4.51 -7.01 -5.9 -5.59 - - - - - - -5.93 - - -4.87 - - -4.65 - -
-0.96 1.44 3.83 -0.14 -4.6 -1.71 -1.7 -2.2 -2.25 -2.98 -2.2 -2.14 -2.19 -2.43 -2.33 -2.17 -2.3 -2.32 -2.74 -2.15 -2.14 -2.42
-3.3 1.04 4.24 -1.16 -5.33 -4.55 -5.7 -4.85 -5.9 -6.47 -5.71 -5.14 -6.24 -4.13 -5.97 -4.55 -5.47 -5.14 -7.34 -6.07 -5.27 -4.93
-1.86 0.98 4.02 -0.75 -3.08 -2.0 -4.7 -2.68 -2.24 -2.18 -2.56 -2.71 -3.21 -1.59 -2.88 -2.54 -2.99 -3.25 -2.68 -2.83 -2.51 -2.43
-1.1 0.58 3.99 0.68 -1.56 -2.18 -3.75 -3.27 -4.5 -4.13 -3.31 -1.97 -4.43 -2.33 -2.76 -2.38 -3.19 -3.53 -2.76 -3.68 -2.86 -2.53
-1.77 0.69 3.91 0.13 -2.46 -1.96 -1.89 -2.42 -1.87 -2.76 -2.31 -2.19 -1.14 -2.09 -2.81 -3.36 -2.37 -2.86 -3.31 -1.76 -1.11 -2.6
-2.52 -0.07 4.05 -0.53 -6.31 -3.69 -3.11 -0.91 - -0.77 -1.22 - - -0.6 - - -2.98 - - - - 0.11
-2.46 0.86 4.19 0.1 -3.79 -4.04 -3.9 -5.39 -6.44 -5.03 -5.54 -5.5 -4.38 -5.24 -5.14 -5.27 -6.45 -5.79 -5.3 -4.45 -5.03 -3.22
- 0.5 4.35 - -6.33 -6.56 -7.01 - -3.82 - - - -4.93 - - - - - - - - -
-3.92 1.03 4.23 -0.21 -5.96 -5.23 -7.05 - -4.84 -7.96 - - -8.85 -6.41 -4.3 -5.62 -6.08 -5.38 -7.28 -6.59 - -
-3.78 1.09 4.24 -0.96 -5.51 -6.03 -4.69 -5.03 -5.07 -4.91 -5.76 -5.13 -8.24 -5.64 -5.98 -6.51 -6.98 -6.67 -7.51 -6.07 -4.44 -5.7
-2.54 0.38 4.18 0.75 -6.0 -4.35 -6.4 -6.15 -5.21 -6.32 -5.9 -3.68 -2.64 -3.91 -5.86 -4.4 -6.97 -5.42 - -4.52 -3.06 -
-3.15 1.11 4.18 -1.24 -2.9 -4.54 -2.46 -2.1 -3.61 -4.07 -3.64 -4.88 -5.7 -4.45 -5.38 -6.6 -5.62 -6.56 -5.85 -6.16 -5.01 -2.97
-6.01 1.63 4.18 -6.23 -6.09 -6.25 -5.91 -4.34 -4.71 -5.15 -5.06 -4.76 -5.92 -3.61 -8.05 -7.08 -6.69 -7.42 -3.02 -3.29 -3.84 -4.37
-3.97 1.18 4.24 -1.04 -3.46 -5.96 -6.03 -6.4 -7.02 -6.63 -6.97 -6.08 -5.66 -5.46 -5.93 -6.8 -7.54 -6.66 - -8.4 - -6.38
- - 4.42 -0.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.35 4.3 -1.01 -4.35 -5.88 -7.32 - - - -3.68 -3.04 - - - - - - -3.43 -4.3 - -3.93
- 0.71 4.12 0.23 -3.63 -2.45 -3.76 - - - - - -4.37 -5.85 - -2.77 - -2.28 -2.64 - -2.38 -0.56
- 0.91 4.02 0.41 -2.82 -2.09 -2.91 -1.14 - - -1.89 - -1.67 -3.85 - -2.6 - -2.8 - - - -0.56
- 0.71 4.12 0.23 -3.63 -2.45 -3.76 - - - - - -4.37 -5.85 - -2.77 - -2.28 -2.64 - -2.38 -0.56

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.