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Heatmap: Cluster_170 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.16 -0.09 -0.91 -5.64 -1.43 0.47 0.3 0.46 0.44 0.24 0.18 0.28 -0.63 0.65 -0.02 -0.12 -0.04 -0.13 0.41 -0.2 -0.01 -0.09
0.29 -0.53 -1.86 -5.03 -1.51 0.21 0.35 0.35 0.24 0.42 0.33 0.12 -0.16 -0.25 -0.13 0.1 -0.26 -0.26 -0.24 -0.39 -0.05 1.53
0.0 0.48 -1.58 -5.45 -2.73 -0.0 0.55 0.98 1.06 0.7 0.88 0.79 -0.01 -0.8 -0.39 -1.91 -0.18 -0.31 -0.06 0.09 0.04 -4.57
0.9 -1.01 -3.83 -6.93 -2.04 0.31 1.03 -0.11 1.93 0.77 0.68 1.42 0.24 -1.83 -1.63 -2.14 -1.6 -2.32 -1.11 -0.5 -0.4 -0.29
0.17 -0.13 -3.4 -7.47 -1.3 0.2 0.41 0.72 -0.09 0.5 0.52 -0.38 -1.74 -0.42 0.21 -0.09 0.22 0.33 0.34 -0.08 0.17 0.9
0.27 -1.13 -3.64 -7.07 -1.82 0.1 0.31 0.92 0.43 0.91 0.7 0.39 -0.93 0.11 -0.63 -0.85 -0.61 -0.89 -1.09 -0.05 -0.13 1.7
0.05 0.15 -0.38 -6.23 -1.71 0.33 0.26 0.7 0.19 0.65 0.55 0.21 0.08 -0.09 -0.28 -0.32 -0.32 -0.25 0.13 -0.21 0.32 -0.2
0.58 0.25 -1.26 -6.46 -0.4 -0.14 0.31 -0.03 0.23 -0.16 -0.24 0.24 -2.04 0.4 0.16 -0.08 0.17 0.21 0.64 -0.04 -0.11 0.62
0.16 0.08 -4.27 -4.08 -1.87 0.65 0.44 1.0 -0.03 0.55 0.91 0.23 -1.51 0.1 -0.03 0.43 0.02 -0.05 -0.86 -0.0 0.03 -0.49
1.18 0.62 -2.79 -5.47 -0.41 -0.29 0.4 0.11 0.12 0.07 0.07 0.1 -2.33 0.86 -0.27 -0.36 -0.21 -0.26 0.65 -0.18 -0.38 0.35
-0.32 -0.51 -2.66 -6.5 -1.1 0.34 0.62 0.36 0.71 0.89 0.78 1.06 -0.56 -0.84 -0.02 -0.24 0.19 0.09 -0.85 -0.17 -0.16 -0.2
0.31 0.35 -1.97 -4.7 -1.83 0.54 0.88 0.21 0.68 1.42 0.93 0.79 -1.59 -0.41 -0.58 -0.41 -0.49 -0.36 -0.08 -1.2 -0.77 -0.82
-0.11 0.07 -2.11 -5.89 -1.59 0.48 0.63 0.53 0.17 0.39 -0.04 0.4 -0.43 0.01 0.25 0.33 0.5 0.47 -0.08 -0.76 -0.25 -0.07
0.65 -0.33 -8.24 -7.35 -7.15 0.26 0.46 -0.02 1.27 0.4 0.1 0.82 0.13 -0.09 -0.21 -0.19 -0.26 -0.41 -1.37 0.76 0.76 -1.56
-0.51 -0.93 -2.41 -4.59 -0.65 0.4 0.84 0.23 0.79 0.64 0.49 0.9 -0.51 -0.33 -0.09 -0.06 -0.1 -0.15 -0.14 -0.63 -0.6 0.7
0.27 -1.53 -5.7 -9.78 -1.15 -0.3 0.86 0.36 1.32 1.06 0.74 1.0 -1.42 -0.66 -0.51 -0.32 -0.55 -0.68 0.17 -1.05 -0.97 0.92
-0.1 -0.36 -0.68 -6.53 -0.38 0.4 0.65 0.54 0.09 0.56 0.69 0.04 -1.41 0.12 -0.43 -0.3 -0.24 -0.45 -0.02 -0.58 -0.62 1.3
0.4 0.64 -1.09 -5.97 -0.63 0.06 -0.23 0.63 -0.1 0.28 0.07 0.21 -1.91 -0.52 -0.53 -0.71 -0.6 -0.58 -0.97 1.55 1.22 -0.23
0.92 -1.74 -7.68 -5.92 -3.32 -0.35 0.6 0.81 1.45 1.26 1.12 1.49 -2.18 -0.82 -2.36 -2.72 -1.8 -2.11 -2.44 -1.71 -1.83 1.63
0.67 0.18 -1.3 -3.79 -4.66 0.27 0.26 0.82 0.33 0.64 0.65 0.4 -2.51 -0.8 -0.58 -0.41 -0.26 -0.19 -1.2 1.08 0.83 -0.56
-0.59 0.13 -2.64 -5.32 -2.56 0.25 -0.1 0.35 -0.57 0.04 -0.39 -0.04 -2.1 0.41 -0.41 -0.61 -0.31 -0.49 -0.28 1.79 1.77 -0.17
0.2 -0.14 -0.07 -4.73 -0.47 -0.04 0.21 0.13 -0.0 0.05 -0.09 0.05 -1.22 0.69 0.31 0.2 0.35 0.22 0.18 -0.4 -0.51 0.62
0.2 0.32 0.76 -6.71 -2.2 0.35 0.09 0.58 -0.43 -0.13 -0.3 -0.32 -1.88 -0.05 0.22 0.27 0.37 0.43 1.28 -0.58 -0.6 -0.77
0.31 -0.31 - -2.13 -5.7 0.67 0.8 1.2 -0.24 0.86 0.7 0.7 -2.42 -0.06 -0.6 0.09 -0.27 -0.18 -1.2 -0.74 0.34 0.35
0.03 -0.29 -2.61 -8.63 -3.8 0.08 0.46 0.49 -0.19 0.72 0.66 0.43 -1.4 0.4 0.18 0.1 0.42 0.3 0.3 0.09 -0.24 0.01
0.13 0.34 -1.96 -8.43 -2.92 0.08 0.06 0.64 0.29 0.74 0.69 0.19 -0.83 -1.52 -0.22 -0.08 -0.14 -0.15 0.54 0.56 0.28 0.34
0.09 -1.3 -2.2 -3.67 -6.88 0.18 0.68 0.78 1.29 0.47 0.55 1.19 0.07 0.75 -4.08 -2.29 -0.8 -1.95 0.76 0.18 0.18 -1.32
-0.2 0.74 -1.18 -4.73 -0.82 0.21 -0.35 0.46 0.35 -0.11 -0.22 0.37 -0.98 0.48 -0.45 -0.52 -0.49 -0.54 0.42 0.89 0.86 -0.0
-0.15 0.39 -7.03 -5.24 -2.24 0.12 0.79 0.1 1.14 0.75 0.74 1.04 0.25 -0.43 -0.34 -0.51 -0.53 -0.41 -0.58 0.18 0.06 -1.54
0.7 0.1 -2.74 -4.72 -0.56 -0.1 0.01 0.24 0.85 0.17 -0.08 0.79 -0.79 0.56 0.06 -0.16 0.12 -0.04 0.37 -0.48 -0.55 -0.06
-0.13 0.19 -0.83 -3.48 -6.02 0.2 -0.08 0.59 0.53 0.88 0.88 0.73 -0.84 -0.0 -0.46 -0.49 -0.72 -0.52 0.12 0.38 0.22 0.07
0.24 1.1 -1.16 -5.39 -7.58 -0.08 -0.23 0.45 -1.01 0.47 -0.08 -0.55 -0.82 -0.21 0.41 0.38 0.32 0.3 0.69 0.56 0.49 -1.04
0.67 -0.88 -9.15 -6.97 -13.81 0.13 -0.33 0.14 0.68 -0.27 -0.01 0.66 -2.32 -0.5 -0.06 -0.04 -0.02 -0.1 -0.99 1.76 1.34 -0.54
-0.05 -0.18 -2.12 -6.49 -0.93 0.11 0.26 0.6 0.18 0.43 0.57 0.18 -0.82 -0.19 -0.02 -0.15 0.02 0.1 0.38 0.42 0.44 0.12
0.28 0.96 -6.77 -3.97 -8.37 0.32 -0.81 0.14 0.39 -0.28 -0.29 0.22 -2.16 -0.03 -0.43 -0.12 -0.8 -0.41 -3.5 1.87 1.76 -1.33
0.3 -0.88 -3.03 -4.57 -1.13 0.4 0.94 0.44 -0.61 0.2 0.18 -0.46 0.4 0.5 -0.17 -0.32 -0.03 -0.3 -0.3 -0.47 -0.09 1.41
0.78 -3.72 -9.49 -9.12 -9.73 -0.49 0.34 1.03 0.45 0.23 -0.07 0.32 -1.28 1.25 -3.8 -3.09 -4.89 -5.16 -5.22 1.97 1.45 0.78
0.21 -0.37 -6.21 -6.17 -3.07 0.67 0.76 0.61 0.28 0.21 0.31 -0.02 0.6 -0.17 0.45 0.25 0.52 0.25 -0.08 -0.32 0.04 -2.77
0.16 -0.01 -3.0 -2.63 -1.59 0.33 0.15 0.0 0.41 0.46 0.76 0.67 -1.82 -0.07 0.29 0.17 0.38 -0.02 0.6 -0.33 -0.27 -0.14
-0.03 -0.22 -2.6 -2.94 -0.58 -0.14 0.72 0.39 0.27 0.6 0.68 0.73 -0.98 -0.02 -0.59 -0.27 -0.57 -0.3 -0.39 0.64 0.56 0.12
0.96 -1.57 -8.39 -4.75 -10.42 0.47 0.83 0.25 -0.38 0.35 0.25 -0.92 1.08 0.17 0.02 0.19 0.35 0.37 -2.07 -0.59 0.42 0.44
0.22 -0.62 - -9.13 - 0.6 0.17 -0.52 1.78 -0.27 1.32 1.64 -3.32 -1.02 0.33 0.4 0.51 0.73 -2.12 -4.4 -4.8 -1.3
0.96 0.78 0.45 -2.65 -5.68 0.4 -0.73 0.46 -0.53 0.24 0.11 0.48 -3.17 0.19 -0.81 -0.73 -0.54 -0.85 -2.09 1.27 1.05 -0.39
-0.05 0.52 0.11 -3.21 -0.9 0.21 0.43 0.13 0.37 0.55 0.64 -0.13 0.78 -0.58 -0.3 -0.4 -0.41 -0.63 -0.71 0.12 0.28 -0.38
0.36 -0.19 -2.77 -6.0 -3.84 0.38 0.55 0.47 0.24 0.72 0.44 0.29 -0.63 -0.69 0.16 -0.06 0.46 0.38 -0.42 -0.85 -0.41 0.98
1.1 0.99 -5.47 -5.47 -11.37 0.47 -0.69 0.81 -0.58 0.45 0.18 -0.92 -1.75 0.18 -0.44 -0.24 -0.31 -0.32 -0.45 1.09 1.07 -0.35
0.98 -1.72 -7.75 -7.87 -12.15 0.32 0.3 0.02 0.73 0.39 0.23 0.9 -1.3 0.59 0.13 -0.33 0.26 -0.25 -0.89 -0.12 -0.36 1.09
0.05 0.84 -5.44 -1.14 -3.88 0.17 -0.06 0.3 0.9 -0.12 0.22 0.43 -2.4 0.77 -0.82 -0.52 -0.8 -0.86 -0.32 1.32 0.79 -0.5
0.75 0.15 -0.61 -2.08 -5.86 0.31 0.24 -0.02 0.54 0.32 -0.1 0.48 -0.42 -0.78 0.03 -0.07 -0.37 0.02 0.38 0.27 0.25 0.12
0.38 -0.23 -6.52 -8.08 -5.4 0.42 0.61 0.72 0.31 0.31 0.19 0.47 -1.11 0.1 0.02 0.24 0.17 -0.1 -0.46 0.18 0.22 0.55
0.46 -0.33 - -3.72 -3.08 0.43 0.19 0.5 0.3 0.05 0.28 0.92 -0.34 -0.55 -0.31 0.03 0.56 0.23 -0.33 0.06 0.37 0.35
-0.7 0.47 0.25 -1.08 -2.06 0.09 -0.01 0.62 -0.6 0.11 -1.88 -0.44 -1.82 1.21 -0.32 -1.24 -0.8 -1.29 -0.04 1.25 1.34 0.12
-0.44 0.39 -2.85 -5.87 -3.02 0.32 0.54 0.45 0.54 1.03 1.29 0.57 -0.28 -0.5 -0.01 -0.17 -0.17 -0.16 -0.55 -0.13 -0.07 -1.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.