Heatmap: Cluster_140 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.48 0.23 0.17 1.05 0.05 0.06 0.02 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.75 0.8 0.9 0.32 0.0 0.1 0.22 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.02 0.05 0.03 0.03 0.09 0.08 0.0 0.03 0.0 0.05
14.69 10.39 18.42 2.19 6.24 13.1 10.41 11.24 6.36 16.31 15.37 5.25 2.7 19.21 6.39 4.11 8.64 5.89 3.13 2.62 2.41 23.3
72.82 5.26 0.03 0.86 0.27 34.01 114.81 6.11 10.38 4.62 5.43 7.45 7.0 7.1 13.83 9.96 17.82 19.03 7.3 3.63 5.29 89.07
9.33 3.67 0.08 0.11 0.01 0.09 6.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 1.33 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.29 0.08 0.0 0.45 0.01 0.03 0.01 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35
55.58 29.22 49.76 11.12 20.71 13.33 16.04 8.77 2.81 5.09 6.41 5.41 0.63 5.36 13.68 15.04 12.2 30.1 6.22 5.5 7.46 8.77
168.32 0.25 0.69 136.51 2.93 182.52 0.11 10.16 0.74 13.8 8.87 0.0 0.35 927.71 1.93 5.27 2.74 0.74 14.69 1.43 0.65 96.59
11.88 2.18 0.0 12.43 0.0 1.58 2.47 0.64 0.92 0.96 1.4 0.3 0.0 2.42 0.19 0.45 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 2.39
1.62 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
16.14 12.33 18.38 0.77 3.99 8.0 0.96 5.26 2.39 5.06 2.85 10.08 3.0 9.6 8.89 5.8 1.13 4.11 1.71 10.66 6.57 0.0
22.87 0.52 8.74 24.72 0.33 8.24 0.07 4.51 0.0 2.5 3.67 0.0 0.18 68.46 0.51 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 23.38
10.06 3.65 0.77 1.69 0.55 3.8 1.06 3.95 7.67 3.85 3.83 8.18 1.96 0.34 4.2 0.16 3.63 3.66 1.23 1.56 3.1 0.61
1.39 0.36 0.78 0.69 0.07 0.11 0.03 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.22 0.1 0.11 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
2.01 2.13 0.29 1.15 0.01 0.31 1.29 0.05 0.05 0.11 0.32 0.14 0.12 2.09 0.09 0.1 0.14 0.11 0.07 0.07 0.11 0.42
1.7 0.04 0.0 1.12 0.0 0.06 1.48 0.81 0.0 0.21 0.43 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83
1.49 0.0 0.0 0.94 0.0 0.04 1.37 0.04 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77
1.82 0.0 0.0 4.86 0.06 0.36 0.08 0.55 0.0 0.92 0.68 0.0 0.0 4.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.13
0.05 0.0 0.0 0.15 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.57 0.58 0.0 0.41 0.06 0.3 0.24 0.44 0.0 0.39 0.0 1.63 0.0 1.15 0.0 0.74 0.28 0.28 0.0 0.68 0.75 1.32
5.88 2.26 0.09 12.02 0.05 1.42 5.0 0.92 0.8 0.81 1.43 1.0 3.5 1.57 0.3 0.18 0.28 0.3 0.23 1.42 1.41 0.41
8.26 0.0 0.0 1.45 0.09 1.75 5.43 0.0 0.0 0.28 0.74 0.0 1.18 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 1.06 13.14
0.92 0.0 0.0 0.81 0.07 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.4 1.93 2.91 1.53 0.0 0.17 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.67 0.4 0.32 0.03 0.51 0.79 0.38 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.13 0.19 0.24 0.37 0.3 0.41 0.22 0.12 0.39 0.0
14.21 0.0 1.05 37.02 1.76 5.84 0.0 8.44 0.0 14.1 22.89 0.0 0.0 18.42 1.15 0.53 1.83 0.61 4.07 0.71 0.0 2.87
2.66 1.49 0.82 0.1 0.03 1.66 1.95 2.29 0.88 2.41 1.82 1.7 0.81 1.05 0.0 0.52 0.26 0.3 0.65 1.74 0.78 1.37
8.24 0.22 0.0 6.66 0.74 7.34 0.0 2.26 0.0 1.61 4.86 0.0 0.0 23.33 0.24 0.85 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 2.64
34.94 3.51 1.64 0.33 0.05 0.12 2.09 15.03 0.0 5.6 18.09 0.03 0.02 94.95 0.02 0.01 0.04 0.01 0.05 0.01 0.0 18.69
13.0 12.78 7.05 1.44 12.46 12.63 8.86 11.48 14.73 11.39 12.1 15.08 6.99 7.76 0.92 0.9 6.63 7.35 10.77 8.47 8.78 4.86
0.34 0.0 0.0 0.31 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
30.01 18.64 21.16 5.09 13.55 22.07 7.5 15.07 22.15 12.71 14.51 25.98 16.3 20.29 10.16 10.8 12.48 12.46 18.52 13.76 17.0 6.42
69.21 20.53 11.81 1.81 10.3 35.94 56.01 26.95 48.39 24.36 17.7 37.88 23.84 46.1 24.93 26.88 20.18 20.56 28.36 32.02 32.37 38.74
1.2 0.0 0.0 2.09 0.18 1.01 0.02 1.11 0.0 0.64 0.63 0.0 0.0 3.22 0.05 0.16 0.05 0.05 0.25 0.06 0.0 0.09
0.48 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
31.95 6.64 24.95 0.65 11.8 11.49 3.33 7.0 27.14 6.28 0.0 39.2 16.41 1.62 7.31 4.0 8.26 13.19 5.01 8.06 12.01 7.05
0.04 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
28.59 15.88 16.29 1.04 10.69 20.18 10.02 9.17 8.87 7.38 7.76 7.47 4.71 4.44 9.28 11.03 10.49 9.44 8.53 4.61 4.83 15.39
0.9 0.0 0.0 16.18 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.89 0.81 0.0 5.55 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 2.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0
172.5 0.0 0.0 51.55 0.0 35.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 66.26 85.32 60.01 88.42 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.24 0.17 0.12 0.01 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.0
26.91 0.0 0.0 6.56 0.22 11.76 0.0 1.75 0.0 2.19 3.57 0.0 0.0 34.34 1.11 1.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.68
0.78 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.56 0.58 0.04 0.47 0.01 2.8 4.0 0.52 1.44 0.29 0.76 0.76 0.13 0.49 1.5 1.42 1.83 1.46 0.48 0.08 0.13 0.45
3.76 0.0 0.0 14.48 0.0 1.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.17 0.0 0.0 2.3 0.0 0.31 0.0 2.54 0.0 1.27 2.9 0.0 0.0 3.8 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.4 0.0 0.0
320.75 451.18 392.34 1.36 132.89 268.49 257.92 191.15 294.21 144.42 131.08 295.88 76.93 278.2 176.37 170.9 165.39 187.07 203.42 266.01 234.29 126.12
538.23 826.52 795.25 6.17 338.58 638.19 602.14 464.6 738.0 384.41 370.02 720.39 127.63 345.82 677.25 630.6 674.57 646.52 537.73 698.49 669.12 427.06
142.8 1.0 0.0 84.23 2.76 176.25 0.33 16.53 1.2 20.93 18.43 1.16 0.54 551.69 1.38 6.99 3.23 2.59 11.08 3.47 3.19 115.77
5.18 0.0 0.0 4.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
30.12 0.0 0.92 30.58 0.95 10.52 0.0 1.0 0.0 4.25 4.9 0.0 0.0 59.48 0.0 0.0 0.0 0.65 4.36 0.76 0.0 13.31
0.84 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.61 0.0 0.0 0.36 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.18 0.24 0.31 0.15 0.28 0.15 0.26 0.0 0.23 0.0 0.49 0.11 0.48 0.16 0.0 0.15 0.48 0.0 0.61 0.0 0.79
0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 0.24 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
1.46 0.08 0.05 0.22 0.39 0.65 0.49 0.17 0.22 0.19 0.14 0.21 0.05 0.14 0.0 0.0 0.07 0.07 0.08 0.09 0.0 1.5
2.24 1.03 0.0 1.01 0.36 0.82 1.26 2.8 0.0 0.88 1.23 0.48 0.23 1.26 0.15 0.15 0.15 0.17 0.73 0.76 0.0 2.32
1.28 3.74 2.12 0.19 0.0 0.52 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.34 0.0 0.0 2.02 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.49 0.0 0.0
0.93 0.3 0.04 2.43 0.03 0.03 0.07 0.07 0.0 0.14 0.05 0.02 0.02 0.11 0.05 0.04 0.01 0.02 0.05 0.1 0.08 0.04
0.18 0.0 0.63 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.7 0.0 0.0 2.67 0.25 0.4 4.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.0 0.4 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.78 0.0 0.0 1.27 0.07 0.14 0.1 0.0 1.24 0.0 0.58 0.0 0.0 0.07 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.32
0.5 0.0 0.0 0.61 0.11 0.11 0.7 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.78
0.6 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.19 0.16 0.14 0.02 0.06 0.22 0.0 0.15 0.03 0.11 0.0 0.01 0.06 0.07 0.02 0.07 0.03 0.0 0.11 0.05 0.04
629.33 196.84 121.87 12.84 256.73 184.36 479.76 312.54 401.24 264.99 309.91 346.35 125.31 216.47 103.16 105.43 133.12 113.77 149.74 143.41 131.04 296.96
18.1 0.0 0.0 16.06 0.0 7.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.59 0.3 1.16 0.89 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.42 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.0 0.0 1.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
375.77 0.0 0.0 338.61 0.66 24.13 0.3 15.57 0.0 10.35 25.34 0.0 0.0 221.85 4.27 5.3 3.83 5.57 0.0 0.0 0.0 0.0
21.59 0.24 0.25 44.01 0.33 24.95 0.09 3.36 0.09 2.06 3.41 0.18 0.09 109.58 0.7 0.97 0.5 0.64 3.71 0.25 0.65 20.44
28.71 0.11 0.16 36.54 0.22 31.94 0.0 1.04 0.0 0.72 0.84 0.0 0.07 57.67 0.47 0.43 0.1 0.44 3.25 0.27 0.0 14.46

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)