Heatmap: Cluster_140 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.46 0.22 0.16 1.0 0.05 0.06 0.02 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.83 0.89 1.0 0.36 0.0 0.11 0.25 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.02 0.05 0.04 0.03 0.1 0.09 0.0 0.04 0.0 0.05
0.63 0.45 0.79 0.09 0.27 0.56 0.45 0.48 0.27 0.7 0.66 0.23 0.12 0.82 0.27 0.18 0.37 0.25 0.13 0.11 0.1 1.0
0.63 0.05 0.0 0.01 0.0 0.3 1.0 0.05 0.09 0.04 0.05 0.06 0.06 0.06 0.12 0.09 0.16 0.17 0.06 0.03 0.05 0.78
1.0 0.39 0.01 0.01 0.0 0.01 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.14 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.66 0.18 0.0 1.0 0.02 0.06 0.01 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.06 0.1 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79
1.0 0.53 0.9 0.2 0.37 0.24 0.29 0.16 0.05 0.09 0.12 0.1 0.01 0.1 0.25 0.27 0.22 0.54 0.11 0.1 0.13 0.16
0.18 0.0 0.0 0.15 0.0 0.2 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.1
0.96 0.18 0.0 1.0 0.0 0.13 0.2 0.05 0.07 0.08 0.11 0.02 0.0 0.19 0.02 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.19
1.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.88 0.67 1.0 0.04 0.22 0.44 0.05 0.29 0.13 0.28 0.16 0.55 0.16 0.52 0.48 0.32 0.06 0.22 0.09 0.58 0.36 0.0
0.33 0.01 0.13 0.36 0.0 0.12 0.0 0.07 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.34
1.0 0.36 0.08 0.17 0.06 0.38 0.11 0.39 0.76 0.38 0.38 0.81 0.19 0.03 0.42 0.02 0.36 0.36 0.12 0.15 0.31 0.06
1.0 0.26 0.56 0.49 0.05 0.08 0.02 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.16 0.07 0.08 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
0.95 1.0 0.14 0.54 0.0 0.15 0.61 0.02 0.02 0.05 0.15 0.07 0.05 0.98 0.04 0.05 0.06 0.05 0.03 0.03 0.05 0.2
1.0 0.03 0.0 0.66 0.0 0.04 0.87 0.48 0.0 0.13 0.26 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49
1.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.03 0.92 0.03 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52
0.37 0.0 0.0 1.0 0.01 0.07 0.02 0.11 0.0 0.19 0.14 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23
0.3 0.0 0.0 1.0 0.04 0.04 0.11 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.23 0.0 0.16 0.02 0.12 0.09 0.17 0.0 0.15 0.0 0.64 0.0 0.45 0.0 0.29 0.11 0.11 0.0 0.27 0.29 0.52
0.49 0.19 0.01 1.0 0.0 0.12 0.42 0.08 0.07 0.07 0.12 0.08 0.29 0.13 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.12 0.12 0.03
0.63 0.0 0.0 0.11 0.01 0.13 0.41 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 1.0
1.0 0.0 0.0 0.89 0.08 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.48 0.66 1.0 0.53 0.0 0.06 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.24 0.19 0.02 0.31 0.47 0.23 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.08 0.11 0.14 0.22 0.18 0.24 0.13 0.07 0.23 0.0
0.38 0.0 0.03 1.0 0.05 0.16 0.0 0.23 0.0 0.38 0.62 0.0 0.0 0.5 0.03 0.01 0.05 0.02 0.11 0.02 0.0 0.08
1.0 0.56 0.31 0.04 0.01 0.63 0.74 0.86 0.33 0.91 0.69 0.64 0.3 0.4 0.0 0.2 0.1 0.11 0.24 0.65 0.29 0.52
0.35 0.01 0.0 0.29 0.03 0.31 0.0 0.1 0.0 0.07 0.21 0.0 0.0 1.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.11
0.37 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.16 0.0 0.06 0.19 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2
0.86 0.85 0.47 0.1 0.83 0.84 0.59 0.76 0.98 0.76 0.8 1.0 0.46 0.51 0.06 0.06 0.44 0.49 0.71 0.56 0.58 0.32
1.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.62 0.71 0.17 0.45 0.74 0.25 0.5 0.74 0.42 0.48 0.87 0.54 0.68 0.34 0.36 0.42 0.42 0.62 0.46 0.57 0.21
1.0 0.3 0.17 0.03 0.15 0.52 0.81 0.39 0.7 0.35 0.26 0.55 0.34 0.67 0.36 0.39 0.29 0.3 0.41 0.46 0.47 0.56
0.37 0.0 0.0 0.65 0.05 0.31 0.0 0.35 0.0 0.2 0.19 0.0 0.0 1.0 0.02 0.05 0.02 0.01 0.08 0.02 0.0 0.03
0.76 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.82 0.17 0.64 0.02 0.3 0.29 0.09 0.18 0.69 0.16 0.0 1.0 0.42 0.04 0.19 0.1 0.21 0.34 0.13 0.21 0.31 0.18
0.08 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.56 0.57 0.04 0.37 0.71 0.35 0.32 0.31 0.26 0.27 0.26 0.16 0.16 0.32 0.39 0.37 0.33 0.3 0.16 0.17 0.54
0.06 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.15 0.0 1.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.49 0.35 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0
0.58 1.0 0.69 0.48 0.06 0.17 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.17 0.38 0.0
0.78 0.0 0.0 0.19 0.01 0.34 0.0 0.05 0.0 0.06 0.1 0.0 0.0 1.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.99 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.13 0.01 0.1 0.0 0.61 0.88 0.11 0.32 0.06 0.17 0.17 0.03 0.11 0.33 0.31 0.4 0.32 0.1 0.02 0.03 0.1
0.26 0.0 0.0 1.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.07 0.0 0.61 0.0 0.3 0.69 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.1 0.0 0.0
0.71 1.0 0.87 0.0 0.29 0.6 0.57 0.42 0.65 0.32 0.29 0.66 0.17 0.62 0.39 0.38 0.37 0.41 0.45 0.59 0.52 0.28
0.65 1.0 0.96 0.01 0.41 0.77 0.73 0.56 0.89 0.47 0.45 0.87 0.15 0.42 0.82 0.76 0.82 0.78 0.65 0.85 0.81 0.52
0.26 0.0 0.0 0.15 0.01 0.32 0.0 0.03 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.21
1.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.51 0.0 0.02 0.51 0.02 0.18 0.0 0.02 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.01 0.0 0.22
1.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.73 0.0 0.0 0.1 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.18 0.24 0.31 0.15 0.28 0.15 0.26 0.0 0.23 0.0 0.49 0.11 0.48 0.16 0.0 0.15 0.48 0.0 0.61 0.0 0.79
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.76 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0
0.97 0.05 0.03 0.14 0.26 0.43 0.33 0.11 0.15 0.13 0.09 0.14 0.03 0.09 0.0 0.0 0.05 0.05 0.05 0.06 0.0 1.0
0.8 0.37 0.0 0.36 0.13 0.29 0.45 1.0 0.0 0.31 0.44 0.17 0.08 0.45 0.06 0.05 0.05 0.06 0.26 0.27 0.0 0.83
0.34 1.0 0.57 0.05 0.0 0.14 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.67 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.24 0.0 0.0
0.38 0.12 0.01 1.0 0.01 0.01 0.03 0.03 0.0 0.06 0.02 0.01 0.01 0.04 0.02 0.02 0.0 0.01 0.02 0.04 0.03 0.02
0.28 0.0 1.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.47 0.04 0.07 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.0 0.0 1.0 0.07 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.62 0.0 0.0 1.0 0.05 0.11 0.08 0.0 0.98 0.0 0.45 0.0 0.0 0.06 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.25
0.65 0.0 0.0 0.78 0.14 0.14 0.89 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 1.0
1.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.64 0.53 0.46 0.05 0.2 0.74 0.0 0.51 0.09 0.35 0.0 0.04 0.19 0.23 0.05 0.23 0.08 0.0 0.38 0.17 0.12
1.0 0.31 0.19 0.02 0.41 0.29 0.76 0.5 0.64 0.42 0.49 0.55 0.2 0.34 0.16 0.17 0.21 0.18 0.24 0.23 0.21 0.47
1.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.51 0.26 1.0 0.77 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.44 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.06 0.0 0.04 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.59 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.0 0.0 0.4 0.0 0.23 0.0 0.03 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 1.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.19
0.5 0.0 0.0 0.63 0.0 0.55 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 1.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)