Heatmap: Cluster_39 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.08 0.35 0.51 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.08 0.22 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
76.19 1.94 0.0 0.54 188.0 44.92 180.59 110.33 134.36 243.99 163.13 393.92 5.31 84.95 13.54 7.68 23.84 19.36 265.9 243.76 199.92 152.38
4.16 0.99 6.28 1.48 0.07 1.63 6.14 0.99 0.38 0.16 0.16 0.0 0.59 0.36 0.63 1.0 1.09 1.09 0.28 0.3 0.34 0.39
0.75 0.74 0.11 0.48 0.16 0.03 0.17 0.0 0.0 0.0 0.12 0.19 0.09 0.09 0.06 0.07 0.07 0.12 0.15 0.08 0.0 0.72
0.08 0.0 0.0 0.15 0.02 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.06 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0
49.88 0.0 0.0 0.73 13.89 1.55 5.63 4.62 0.0 4.8 4.7 0.0 0.0 11.53 18.79 0.0 35.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
38.58 0.0 0.0 1.23 9.35 3.6 16.05 3.68 0.0 4.89 4.91 0.0 0.0 6.68 19.93 0.0 20.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.41 0.3 0.0 0.24 0.08 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.42 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.86 0.0 0.0 1.67 1.26 0.66 2.9 0.94 0.6 0.79 1.67 3.16 0.07 9.93 0.0 0.09 0.0 0.0 4.19 7.75 6.87 4.5
2.21 0.34 0.0 0.78 1.74 0.71 26.74 2.11 0.26 1.22 1.79 0.25 0.36 25.0 0.26 0.17 0.42 0.16 17.69 2.89 1.81 16.17
24.11 27.36 25.13 0.59 11.63 6.42 19.83 15.8 21.12 12.18 12.58 32.99 7.72 41.8 3.14 2.18 3.8 3.69 3.65 3.92 3.29 12.45
4.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 3.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.11 0.05 0.77 0.0 0.04 0.09 0.06 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.06 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.07 0.0 1.83 0.0 0.48 9.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 0.0 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.2 0.0 0.91 0.54 0.87 16.19 0.0 0.0 0.13 0.14 0.0 0.02 0.13 0.13 0.16 0.03 0.09 0.07 0.07 0.0 0.2
31.44 36.34 16.07 2.2 1.44 10.31 27.17 10.08 35.72 17.17 9.9 51.79 13.11 30.54 10.08 8.09 11.34 9.75 12.04 17.05 11.64 45.58
0.0 0.27 0.4 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.16 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.72 5.08 2.62 0.67 0.47 1.0 0.41 2.11 0.0 3.3 2.83 0.97 0.7 0.89 0.38 0.44 0.0 0.31 0.37 2.19 3.58 5.0
0.85 0.31 0.04 0.2 0.02 0.69 0.97 1.02 2.19 0.99 0.96 2.17 1.08 2.31 0.64 0.52 0.39 0.48 2.55 1.57 2.0 1.07
0.64 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.46 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.48 0.0 0.0 0.64 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5
38.1 0.0 0.0 0.56 0.0 0.27 1.1 0.34 0.65 0.0 0.0 0.0 0.43 7.0 0.0 0.2 0.22 0.0 0.0 0.26 0.0 0.68
39.17 0.18 0.0 0.5 3.94 5.06 42.52 0.7 3.13 0.21 0.54 1.31 3.65 13.1 0.13 0.58 0.77 0.64 0.38 1.76 0.87 3.04
20.79 0.0 0.0 0.47 0.79 3.18 8.58 0.04 0.22 0.1 0.36 0.0 1.26 13.98 0.23 0.05 0.48 0.14 0.0 0.31 0.26 0.67
4.65 0.09 0.28 0.85 0.66 0.44 2.72 0.7 0.05 0.33 0.4 0.04 0.14 1.99 1.95 0.03 2.01 0.06 0.28 0.04 0.2 0.12
0.49 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.39 0.08 0.0 0.4 0.0 0.01 0.08 0.08 0.0 0.06 0.47 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.16
3.04 3.24 0.07 1.76 0.0 0.26 0.03 1.64 0.0 1.19 0.67 0.0 0.14 0.93 0.57 0.44 0.61 0.23 0.0 0.61 0.98 1.82
0.42 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.78 0.59 0.0 0.24 67.94 17.59 52.59 42.1 40.42 79.06 27.61 96.42 0.17 10.86 0.07 0.7 0.07 0.14 117.43 45.58 41.03 45.47
0.14 0.0 0.0 2.24 0.66 3.22 72.26 1.47 1.07 1.2 1.69 1.37 0.31 42.46 0.0 0.1 0.35 0.0 10.48 1.65 0.31 23.26
0.43 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.41 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.6 0.0 0.0 0.82 0.11 3.14 63.35 0.0 0.0 0.0 0.0 3.12 0.0 19.27 2.45 0.97 1.91 6.85 0.0 0.0 0.0 5.05
48.05 4.18 42.49 3.9 1.43 93.89 1109.58 61.57 1.72 45.23 38.09 18.22 5.69 447.46 2.74 2.32 2.91 2.14 495.28 15.52 9.14 752.33
0.02 0.35 0.41 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
34.3 0.15 0.01 0.8 0.0 0.29 2.08 0.0 0.35 0.06 0.02 0.28 0.0 2.47 0.0 0.02 0.03 0.03 0.23 0.0 0.0 0.0
16.17 0.09 0.01 0.8 0.0 1.83 25.71 0.08 0.35 0.06 0.04 0.28 0.05 1.65 0.0 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03
0.14 0.05 0.0 0.31 0.04 0.01 0.06 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
6.93 2.68 0.0 0.84 1.48 3.61 6.73 0.0 15.93 0.0 0.0 10.97 2.94 4.24 0.0 0.0 0.64 0.83 8.92 8.0 7.34 7.74
0.05 0.0 0.16 0.56 0.05 0.85 1.61 0.09 0.0 0.08 0.0 0.17 0.27 0.03 0.11 0.12 0.17 0.12 0.0 0.07 0.31 0.37
2.94 0.0 0.0 1.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.67 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
19.42 1.97 1.39 0.59 0.02 4.2 15.96 13.85 13.43 7.38 20.44 4.53 0.9 16.76 0.72 1.5 1.38 0.65 0.5 1.03 0.59 34.56
19.61 0.0 0.62 2.19 0.0 0.26 0.0 1.14 0.0 1.01 0.68 0.0 0.27 1.39 5.55 6.48 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.57
859.08 168.46 72.12 11.98 100.59 165.14 202.19 187.72 156.76 216.51 224.06 142.14 153.69 246.51 128.02 124.67 130.89 105.24 128.3 147.88 131.13 258.69
0.3 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
22.97 4.56 4.3 0.23 0.06 1.59 1.29 17.47 1.93 10.26 16.13 3.02 0.58 3.72 0.66 0.29 0.39 0.6 0.53 0.66 0.64 3.64
0.64 0.03 0.08 0.55 0.02 0.49 5.3 0.92 0.97 3.09 1.68 5.34 0.04 7.81 0.0 0.03 0.03 0.03 11.57 4.24 3.98 7.19
0.53 0.0 1.62 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.98 1.05 0.28 0.92 0.53 0.46 0.61 0.93 0.6 0.53 0.25 0.0 0.99 1.57 0.38 0.23 0.62 0.72 0.44 0.46 0.53 0.31
0.12 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)