Heatmap: Cluster_39 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Archegoniophore (female)	Antheridiophore (male)	Antheridium (male)	Sperm	Sporeling	Thallus	Thallus (vegetative)	Thallus (MpPAP1OX-1)	Thallus (Tak1-2)	Thallus (MpPAP1OX-3)	Thallus (MpPAP1OX-2)	Thallus (Tak1-3)	mid rib (male)	Gametophyte	Gemmaling (female, hpt2040)	Gemmaling (male, hpt2040)	Gemmaling (BC3-38)	Gemmaling (Tak1)	Gemmaling	Gemma cup	gemma cup (male)	Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Mp1g02970.1	0.16	0.68	1.0	0.22	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp1g03940.1	0.5	0.31	0.91	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp1g15610.1	0.19	0.0	0.0	0.0	0.48	0.11	0.46	0.28	0.34	0.62	0.41	1.0	0.01	0.22	0.03	0.02	0.06	0.05	0.68	0.62	0.51	0.39
Mp1g26670.1	0.66	0.16	1.0	0.24	0.01	0.26	0.98	0.16	0.06	0.03	0.03	0.0	0.09	0.06	0.1	0.16	0.17	0.17	0.04	0.05	0.05	0.06
Mp1g29530.1	1.0	0.98	0.15	0.64	0.21	0.03	0.22	0.0	0.0	0.0	0.16	0.25	0.12	0.12	0.08	0.1	0.1	0.16	0.19	0.1	0.0	0.95
Mp2g02490.1	0.53	0.0	0.0	1.0	0.1	0.02	0.31	0.12	0.0	0.0	0.14	0.0	0.05	0.4	0.0	0.09	0.07	0.06	0.0	0.0	0.2	0.0
Mp2g05420.1	1.0	0.0	0.0	0.01	0.28	0.03	0.11	0.09	0.0	0.1	0.09	0.0	0.0	0.23	0.38	0.0	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp2g05440.1	1.0	0.0	0.0	0.03	0.24	0.09	0.42	0.1	0.0	0.13	0.13	0.0	0.0	0.17	0.52	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp2g05830.1	1.0	0.73	0.0	0.58	0.19	0.04	0.02	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27
Mp2g06820.1	1.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp2g06940.1	0.09	0.0	0.0	0.17	0.13	0.07	0.29	0.09	0.06	0.08	0.17	0.32	0.01	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.42	0.78	0.69	0.45
Mp2g08880.1	0.08	0.01	0.0	0.03	0.06	0.03	1.0	0.08	0.01	0.05	0.07	0.01	0.01	0.93	0.01	0.01	0.02	0.01	0.66	0.11	0.07	0.6
Mp2g11780.1	0.58	0.65	0.6	0.01	0.28	0.15	0.47	0.38	0.51	0.29	0.3	0.79	0.18	1.0	0.08	0.05	0.09	0.09	0.09	0.09	0.08	0.3
Mp2g15150.1	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp2g18860.1	0.28	0.14	0.06	1.0	0.0	0.05	0.11	0.07	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.08	0.04	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp2g19630.1	1.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp2g22420.1	0.01	0.01	0.0	0.19	0.0	0.05	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp3g08830.1	0.72	0.0	0.0	1.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp3g11600.1	0.04	0.01	0.0	0.06	0.03	0.05	1.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01
Mp3g12790.1	0.61	0.7	0.31	0.04	0.03	0.2	0.52	0.19	0.69	0.33	0.19	1.0	0.25	0.59	0.19	0.16	0.22	0.19	0.23	0.33	0.22	0.88
Mp3g23790.1	0.0	0.68	1.0	0.08	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp3g24780.1	0.28	0.0	0.0	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp4g16970.1	0.73	1.0	0.52	0.13	0.09	0.2	0.08	0.42	0.0	0.65	0.56	0.19	0.14	0.17	0.08	0.09	0.0	0.06	0.07	0.43	0.7	0.98
Mp4g17920.1	0.33	0.12	0.01	0.08	0.01	0.27	0.38	0.4	0.86	0.39	0.38	0.85	0.42	0.91	0.25	0.21	0.15	0.19	1.0	0.62	0.78	0.42
Mp4g18800.1	1.0	0.0	0.0	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp4g18820.1	1.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp4g19420.1	0.75	0.0	0.0	1.0	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78
Mp4g19880.1	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.03	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.18	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02
Mp4g19930.1	0.92	0.0	0.0	0.01	0.09	0.12	1.0	0.02	0.07	0.01	0.01	0.03	0.09	0.31	0.0	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.07
Mp4g19950.1	1.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.15	0.41	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.06	0.67	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.02	0.01	0.03
Mp5g01380.1	1.0	0.02	0.06	0.18	0.14	0.09	0.58	0.15	0.01	0.07	0.09	0.01	0.03	0.43	0.42	0.01	0.43	0.01	0.06	0.01	0.04	0.03
Mp5g05280.1	0.78	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp5g06060.1	1.0	0.06	0.0	0.29	0.0	0.01	0.05	0.05	0.0	0.05	0.34	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.11
Mp5g06840.1	0.94	1.0	0.02	0.54	0.0	0.08	0.01	0.51	0.0	0.37	0.21	0.0	0.04	0.29	0.18	0.14	0.19	0.07	0.0	0.19	0.3	0.56
Mp5g07600.1	1.0	0.0	0.0	0.89	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g03100.1	0.03	0.0	0.0	0.0	0.58	0.15	0.45	0.36	0.34	0.67	0.24	0.82	0.0	0.09	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.39	0.35	0.39
Mp6g03130.1	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.04	1.0	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.02	0.0	0.32
Mp6g04010.1	1.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g10190.1	0.68	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g11100.1	0.04	0.0	0.0	0.01	0.0	0.05	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.3	0.04	0.02	0.03	0.11	0.0	0.0	0.0	0.08
Mp6g11340.1	0.04	0.0	0.04	0.0	0.0	0.08	1.0	0.06	0.0	0.04	0.03	0.02	0.01	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.01	0.01	0.68
Mp6g12430.1	0.04	0.86	1.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g14880.1	1.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.06	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
Mp6g14890.1	0.63	0.0	0.0	0.03	0.0	0.07	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g16520.1	0.44	0.16	0.0	1.0	0.12	0.02	0.19	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0
Mp6g16810.1	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp6g17530.1	0.44	0.17	0.0	0.05	0.09	0.23	0.42	0.0	1.0	0.0	0.0	0.69	0.18	0.27	0.0	0.0	0.04	0.05	0.56	0.5	0.46	0.49
Mp6g17610.1	0.03	0.0	0.1	0.35	0.03	0.53	1.0	0.06	0.0	0.05	0.0	0.11	0.17	0.02	0.07	0.07	0.1	0.07	0.0	0.04	0.19	0.23
Mp6g21260.1	1.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp7g00350.1	1.0	0.0	0.0	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp7g00750.1	0.56	0.06	0.04	0.02	0.0	0.12	0.46	0.4	0.39	0.21	0.59	0.13	0.03	0.49	0.02	0.04	0.04	0.02	0.01	0.03	0.02	1.0
Mp7g01330.1	1.0	0.0	0.03	0.11	0.0	0.01	0.0	0.06	0.0	0.05	0.03	0.0	0.01	0.07	0.28	0.33	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.03
Mp7g04940.1	1.0	0.2	0.08	0.01	0.12	0.19	0.24	0.22	0.18	0.25	0.26	0.17	0.18	0.29	0.15	0.15	0.15	0.12	0.15	0.17	0.15	0.3
Mp7g07820.1	0.57	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.69	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp7g10940.1	1.0	0.2	0.19	0.01	0.0	0.07	0.06	0.76	0.08	0.45	0.7	0.13	0.03	0.16	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.16
Mp7g12610.1	0.06	0.0	0.01	0.05	0.0	0.04	0.46	0.08	0.08	0.27	0.14	0.46	0.0	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.37	0.34	0.62
Mp7g17530.1	0.33	0.0	1.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Mp8g05370.1	1.0	0.53	0.14	0.47	0.27	0.23	0.31	0.47	0.3	0.27	0.13	0.0	0.5	0.79	0.19	0.11	0.31	0.36	0.22	0.23	0.27	0.16
Mp8g08580.1	0.23	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)