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Heatmap: Cluster_28 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
0.68 0.43 0.68 -2.02 -1.45 -1.18 -1.56 -1.59 0.51 -0.81 -1.75 -1.87 -0.1 0.46 -0.92 0.25 0.48 0.01 1.32 0.72 0.52 0.52 1.07 -0.64 -0.51 -0.96 -0.83 -0.06 0.03 -0.1 -0.41 -0.49 -0.34 -0.19 -0.18 -0.45 -0.18 0.07 0.33 0.45 0.48 0.35 0.58 0.21 0.13 0.05 -0.4 -0.39
- - - 2.58 -0.97 - 1.88 - 0.38 - - - - - -2.74 1.64 - -0.57 - - - - 4.91 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.44 - - - - -
0.57 0.59 0.86 0.11 -0.92 -1.85 -1.99 -2.2 0.4 -0.62 -1.7 -1.8 -0.11 0.42 -0.21 0.26 0.26 -0.11 1.35 0.88 0.57 0.64 1.22 -1.23 -0.99 -1.55 -1.45 -0.29 -0.05 -0.1 -0.48 -0.37 -0.34 -0.1 -0.1 -0.59 -0.38 0.22 0.16 0.3 0.19 0.32 0.53 -0.06 -0.06 0.37 -0.52 -0.2
0.1 0.01 -0.2 -0.69 -1.26 -0.95 -1.88 -2.13 -0.11 -0.47 -1.78 -1.77 0.52 1.14 -0.35 -1.02 -1.17 -1.11 1.24 0.85 0.47 0.42 1.87 -1.51 -0.91 -1.85 -1.4 -0.13 -0.15 0.02 -0.36 -0.36 -0.26 -0.1 -0.04 -0.54 -0.23 0.41 0.47 0.39 0.51 0.74 0.58 0.06 0.06 0.48 -0.36 0.39
0.31 0.82 1.83 0.47 -2.16 -1.18 -1.06 -1.0 0.17 -0.75 -1.61 -1.59 -0.91 -0.89 -1.32 0.1 0.73 0.35 1.53 1.22 0.67 0.28 2.14 -1.7 -0.69 -0.88 -0.46 -0.2 -0.41 0.09 -0.53 -0.17 -0.36 -0.02 -0.69 -0.72 -0.85 -0.13 -1.07 -0.25 -1.11 -0.71 -0.31 -0.26 -0.71 -0.04 -0.19 -0.47
0.83 0.89 1.42 -0.68 0.02 -0.42 -0.67 -0.68 0.82 -1.19 -1.69 -1.68 -0.72 -1.01 -0.93 0.64 1.08 0.8 0.9 0.82 0.33 0.56 2.43 -0.43 -0.45 -0.41 -1.09 -0.18 -0.93 -0.25 -0.83 -0.88 -0.83 -0.7 -0.93 -0.91 -0.82 -0.53 -0.61 -0.61 -1.18 -0.94 -0.29 -0.33 -0.59 -0.47 -0.41 -0.26
0.09 0.24 0.74 -0.39 0.21 -1.23 -1.53 -2.11 0.19 -1.06 -2.53 -2.72 -1.08 -0.92 -1.15 0.67 1.37 0.16 0.98 0.77 0.58 0.46 2.58 -1.9 -0.64 -1.42 -1.14 0.16 -0.09 -0.06 -0.33 -1.05 -0.21 0.08 -0.44 -0.6 -0.52 -0.13 -0.45 0.17 -0.45 -0.21 0.11 -0.19 -0.35 -0.03 -0.17 -0.07
0.96 0.95 0.68 -0.15 -0.13 0.06 -0.99 -0.92 0.92 -0.66 -1.66 -1.8 -0.18 0.01 -0.64 0.69 0.53 -0.13 0.82 0.49 0.21 0.33 1.21 0.08 -0.77 -1.34 -1.33 -0.12 0.18 -0.23 -0.32 -0.47 -0.29 -0.11 -0.1 -0.34 -0.19 -0.02 -0.24 -0.01 -0.42 -0.3 0.17 -0.06 -0.16 0.02 -0.44 -0.34
-0.19 0.12 -0.16 -3.0 1.91 -0.01 -0.66 -0.85 0.32 -1.25 -1.03 -1.15 -1.8 -2.25 -1.15 -0.66 0.4 -0.65 0.31 0.05 -0.25 -0.4 3.6 -1.7 -0.61 -1.42 -0.4 0.02 -0.53 -0.26 -0.86 -0.31 -0.3 -0.34 -0.73 -0.54 -0.92 -0.64 -1.07 -0.43 -1.41 -1.82 -0.14 -0.43 -0.26 -0.6 -0.11 -0.05
-1.04 -0.06 -0.56 -2.98 0.75 -1.03 -0.7 -0.69 -0.35 -0.17 -0.55 -0.45 -0.45 -1.53 -0.2 -1.03 -0.43 -0.81 -0.41 0.01 -0.25 -0.35 3.23 1.55 -0.34 -0.63 -0.27 -0.12 -0.14 -0.03 0.07 -0.1 -0.05 -0.26 -1.01 -0.14 -0.03 -0.18 -0.88 -0.39 -0.69 -0.79 -0.32 -0.21 -0.45 -0.15 -0.17 -0.0
-0.21 -0.47 -0.99 -3.2 -0.73 -0.94 -1.84 -1.46 -0.55 -0.64 -1.54 -1.34 0.28 0.77 -0.22 -0.87 -0.81 -1.06 0.9 0.29 0.14 0.06 2.9 -2.18 -0.82 -1.75 -0.4 -0.14 -0.44 -0.28 -0.53 -0.42 -0.32 -0.33 -0.13 -0.65 -0.2 0.5 0.48 0.41 0.75 0.78 0.54 0.22 0.06 0.54 -0.64 -0.28
0.95 0.57 0.23 -1.72 -1.06 -0.63 -1.53 -1.32 0.45 -0.63 -1.74 -1.91 0.13 0.44 -0.54 -0.03 -0.02 -0.23 1.31 0.89 0.59 0.49 1.85 -0.72 -0.57 -0.89 -0.97 0.06 -0.03 -0.03 -0.32 -0.48 -0.26 -0.1 -0.0 -0.5 -0.28 0.18 -0.14 0.07 -0.23 -0.01 0.2 -0.18 -0.09 0.27 -0.34 -0.34
0.24 0.6 1.11 -1.82 -1.2 -0.18 -1.02 -1.11 0.59 -0.62 -2.38 -2.81 -0.12 -0.06 -0.74 -0.34 0.04 -0.17 1.55 0.87 0.74 0.84 1.17 -0.53 -0.52 -1.19 -1.33 0.23 -0.02 0.07 -0.13 -0.56 -0.35 -0.1 -0.07 -0.57 -0.13 0.51 0.12 0.01 -0.37 -0.2 0.13 -0.02 -0.36 0.53 -0.3 -0.16
0.52 0.23 -0.02 -1.85 -0.58 0.1 -0.78 -0.48 0.44 -0.6 -1.74 -1.72 -0.22 -0.25 -0.28 -0.68 -0.64 -0.52 1.35 0.81 0.27 0.33 2.31 -1.76 -0.84 -0.67 -1.0 0.11 0.07 0.07 -0.31 -0.42 -0.32 -0.11 0.11 -0.41 -0.08 0.22 -0.0 0.01 -0.13 -0.09 0.26 0.01 -0.13 0.25 -0.55 0.04
0.54 0.92 1.51 0.3 -0.48 -1.02 -1.23 -1.68 0.46 -0.78 -1.56 -1.41 -0.63 -0.82 -0.65 0.29 0.62 0.57 1.19 0.83 0.51 0.45 2.3 0.02 -0.55 -0.53 -1.51 -0.32 -0.38 -0.07 -0.47 -0.5 -0.5 -0.36 -0.6 -0.94 -0.6 -0.11 -0.83 -0.61 -1.35 -0.73 -0.25 -0.35 -0.48 -0.05 -0.34 -0.27
0.24 0.25 0.31 -1.69 0.71 -0.21 -0.72 -0.67 0.16 -0.36 -1.12 -1.17 -0.23 -0.46 -0.13 0.03 0.29 -0.09 1.06 0.74 0.47 0.66 1.4 -0.03 -0.25 -1.04 -0.75 -0.04 0.12 -0.13 -0.22 -0.57 -0.11 -0.26 -0.19 -0.59 -0.17 0.15 -0.4 0.14 -0.22 -0.18 0.39 0.11 -0.01 0.24 -0.34 -0.22
0.56 0.56 0.86 -1.18 0.47 -1.48 -0.85 -0.69 0.2 -0.3 -1.5 -1.57 -0.07 -0.57 -0.19 0.32 0.75 -0.01 1.09 0.82 0.67 0.48 1.15 -0.36 -0.43 -0.21 -0.8 -0.12 -0.48 -0.0 -0.21 -0.25 -0.19 -0.07 -0.29 -0.41 -0.03 0.16 -0.47 -0.1 -0.6 -0.25 0.1 0.01 -0.21 0.2 -0.31 -0.27
0.75 0.89 1.56 -0.31 -2.34 -2.35 -2.64 -2.64 0.41 -1.11 -2.87 -2.95 -0.48 0.12 -1.44 0.39 1.08 1.13 1.17 0.83 0.6 0.6 1.6 0.98 -0.65 -1.02 -1.78 0.0 -0.67 0.09 -0.61 -0.96 -0.41 -0.16 -0.6 -0.75 -0.49 -0.22 0.09 -0.2 -0.49 -0.26 0.03 -0.32 -0.29 -0.24 -0.48 -0.6
0.01 0.37 0.39 -2.29 -0.34 -1.15 -1.41 -1.42 -0.14 -0.62 -1.54 -1.48 -0.45 0.32 -0.22 -0.44 -0.5 -0.59 0.82 0.46 0.14 0.15 2.8 -0.86 -0.47 -1.56 -1.18 0.03 -0.13 -0.19 -0.37 -0.49 -0.1 -0.3 -0.1 -0.54 -0.31 0.21 0.07 -0.0 0.42 0.32 0.39 -0.02 0.13 0.24 -0.5 0.1
1.12 1.11 0.69 -1.08 -3.29 -2.27 -1.85 -1.79 1.1 -0.46 -1.13 -1.42 0.06 0.46 -0.22 0.97 0.68 0.65 1.1 0.91 0.55 0.63 1.27 -1.29 -0.93 -0.12 -0.67 -0.18 -0.04 -0.08 -0.76 -0.12 -0.22 -0.12 -0.18 -0.71 -0.76 -0.41 -0.07 -0.32 -0.72 -0.64 -0.02 -0.7 -0.19 -0.41 -0.43 -0.44
0.84 1.09 1.54 -1.7 -0.71 -0.17 -1.08 -0.97 0.86 -0.54 -1.6 -1.81 -0.67 -0.77 -0.66 0.86 0.92 0.74 1.1 0.61 0.62 0.72 1.53 -0.96 -0.82 -0.89 -1.34 -0.04 -0.56 -0.08 -0.45 -0.48 -0.24 -0.12 -0.37 -0.43 -0.76 -0.1 -0.63 -0.31 -0.9 -0.68 -0.14 -0.37 -0.47 -0.05 -0.5 -0.41
0.3 0.43 0.25 -2.39 -0.61 -0.36 -0.88 -1.03 0.54 -0.6 -1.17 -1.05 -0.21 0.17 -0.43 0.19 0.17 -0.47 0.75 0.16 -0.19 -0.04 2.22 -0.84 -0.57 -0.99 -0.58 0.36 0.35 0.05 -0.25 -0.1 -0.1 0.15 0.12 -0.31 -0.2 -0.02 0.13 -0.04 -0.14 -0.18 0.13 -0.1 0.02 -0.01 -0.13 0.13
0.17 -0.02 0.26 -2.61 0.05 0.04 -0.8 -0.84 -0.15 -0.73 -1.49 -1.33 -0.61 0.25 -0.6 -0.56 -0.47 -1.0 0.86 0.46 0.02 -0.09 2.65 -1.37 -0.81 -2.07 -1.03 -0.05 -0.11 0.04 -0.24 -0.4 -0.1 -0.12 -0.17 -0.57 -0.32 0.13 0.31 0.31 0.35 0.39 0.62 0.02 0.12 0.25 -0.22 -0.05
0.21 0.47 0.85 -1.63 -0.5 -0.47 -0.66 -0.66 -0.0 -0.75 -1.02 -1.17 -0.04 0.19 -0.8 0.45 0.39 -0.35 0.75 0.45 0.03 0.16 1.01 -1.38 -0.76 -0.96 -0.79 0.28 0.41 -0.11 -0.09 -0.05 0.04 0.28 0.3 -0.29 -0.04 -0.05 0.39 0.22 -0.1 0.03 0.34 0.18 0.24 -0.04 0.19 -0.05
-0.26 -0.04 0.17 -0.78 0.57 0.29 -0.65 -0.58 -0.14 -1.22 -2.17 -2.29 -0.73 0.08 -0.88 -0.65 -0.59 -0.35 0.76 0.71 0.04 0.17 3.38 -0.69 -0.89 -1.46 -1.34 -0.74 -0.72 -0.34 -1.07 -0.92 -0.66 -0.62 -0.75 -1.17 -0.73 -0.36 0.35 0.04 0.17 0.4 0.25 -0.18 -0.08 -0.22 -1.01 -0.33
0.16 -0.01 -0.36 -2.37 -0.3 -0.68 -1.67 -1.67 -0.13 -0.62 -0.91 -0.86 0.11 0.71 -0.45 0.01 -0.47 -0.8 0.68 0.45 0.05 0.05 2.22 -0.29 -0.82 -1.54 -0.59 -0.21 -0.24 -0.03 -0.36 0.03 -0.08 -0.14 -0.14 -0.69 -0.38 -0.06 0.56 0.51 0.68 0.68 0.56 0.15 0.3 -0.04 -0.38 0.14
0.32 0.57 0.73 -1.8 0.53 -0.82 -1.24 -1.22 0.42 -0.21 -1.56 -1.63 -0.16 -0.43 -0.01 -0.01 0.33 -0.2 1.02 0.68 0.62 0.68 1.1 -0.69 -0.41 -1.22 -1.23 0.21 0.05 -0.02 -0.06 -0.13 0.06 0.18 0.1 -0.33 -0.07 0.06 -0.24 0.08 -0.76 -0.55 0.36 0.08 0.05 0.18 0.03 -0.15
0.39 0.44 1.64 -1.49 0.25 -0.27 -0.16 -0.35 0.18 -1.12 -2.01 -1.98 -1.07 -1.37 -1.31 -1.03 0.75 0.48 0.92 0.92 0.61 0.54 3.29 -1.23 0.35 -0.39 0.61 -0.79 -1.67 -0.54 -1.47 -1.12 -1.0 -0.79 -1.41 -1.35 -1.44 -0.45 -1.37 -0.72 -1.48 -1.39 -0.64 -0.71 -0.79 -0.39 -1.0 -0.82
-0.11 0.28 -0.29 -2.85 0.7 -0.77 0.11 0.13 0.82 -3.72 -2.38 -2.2 -4.23 -5.04 -2.95 1.08 0.28 -0.62 -1.65 -2.98 -2.93 -6.16 4.51 2.76 -2.08 -0.24 -2.06 -5.16 -3.62 -1.69 -3.12 -1.93 -3.96 -4.09 -2.0 -2.7 -3.52 -2.55 -3.16 -2.29 -4.34 -4.47 -3.67 -4.13 -3.42 -3.47 -3.49 -2.46
0.75 0.54 0.33 -1.43 0.06 -0.8 -1.56 -1.23 0.45 -0.85 -2.94 -2.69 -1.28 -1.25 -0.38 -0.09 0.94 0.06 0.96 0.98 1.09 0.72 2.23 -1.49 -1.19 -1.25 -1.06 0.22 0.2 -0.08 -0.51 -1.12 -0.15 0.06 -0.15 -0.43 -0.14 -0.13 0.03 0.2 -0.65 -0.99 0.32 0.19 -0.02 -0.04 -0.5 -0.21
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-0.01 0.23 0.65 -1.32 0.71 -0.33 -0.65 -0.84 0.03 -0.79 -1.04 -1.32 -0.11 0.46 -0.89 -0.09 0.66 -0.29 1.01 0.76 0.35 0.29 1.59 -2.0 -0.45 -1.35 -0.7 -0.03 0.12 -0.15 -0.38 -0.25 -0.16 0.02 -0.23 -0.49 -0.32 -0.08 0.21 0.25 -0.04 0.03 0.36 0.15 0.02 0.01 0.03 -0.3
0.5 0.61 0.65 -1.79 0.11 0.0 -0.25 -0.26 0.57 -0.76 -0.98 -1.01 -0.45 -0.05 -0.61 0.32 0.48 -0.4 0.84 0.5 0.46 0.44 1.47 -1.06 -0.68 -1.0 -0.79 0.25 0.07 -0.15 -0.16 -0.41 -0.14 -0.07 0.07 -0.37 -0.25 -0.08 0.09 0.03 -0.14 -0.12 0.17 -0.28 -0.14 0.04 -0.27 -0.27
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- 1.11 0.94 -5.99 1.73 1.45 0.82 1.23 0.84 - -32.44 - -1.74 - -3.09 - 1.2 1.22 - -1.16 0.39 -0.28 3.49 2.31 - -2.04 - -0.01 -0.65 -1.15 -1.29 -1.45 - -1.07 - -1.43 - - -0.49 0.86 - - -1.42 - - 0.15 - -2.74
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0.98 1.27 1.31 -1.25 -0.32 -1.24 -1.93 -1.39 1.14 -0.7 -1.96 -2.11 0.07 0.72 -0.64 0.33 0.44 0.32 1.19 0.91 0.92 1.0 0.59 -1.54 -1.02 -1.07 -2.22 -0.1 -0.34 -0.5 -0.73 -0.94 -0.46 -0.32 -0.37 -0.77 -0.42 0.0 0.16 0.04 -0.26 -0.46 0.19 -0.17 -0.24 0.02 -0.68 -0.23
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2.62 2.12 0.42 0.83 -3.49 - -7.13 -4.3 1.81 -3.7 -3.76 -7.06 -3.67 -3.38 -0.58 0.71 1.03 1.3 -7.95 - -1.74 -0.02 4.13 -1.7 - -2.59 -7.13 -3.36 -2.1 -0.69 -3.87 -4.6 -3.62 -4.4 -3.72 -5.18 -5.52 -4.35 -2.49 -2.26 -1.52 -1.15 -3.56 -3.04 -2.6 -2.05 -3.9 0.06
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.