Heatmap: Cluster_235 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00002p00252090	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.32	0.22	0.04	0.09	0.43	1.0	0.36	0.41	0.51	0.54	0.18
AMTR_s00003p00263450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.353)	0.75	0.05	1.0	0.1	0.29	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.51	0.48	0.56	0.09	0.21	0.43	0.74	0.3	0.34	0.38	0.62	0.36
AMTR_s00004p00146330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.144)	0.18	0.01	0.13	0.0	0.03	0.0	0.1	0.11	0.09	0.08	0.41	0.16	0.87	0.82	0.26	0.16	1.0	0.31	0.2	0.76	0.4	0.56
AMTR_s00006p00242700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.119)	0.38	0.38	0.61	0.17	0.17	0.0	0.04	0.0	0.11	0.11	0.47	0.41	0.51	0.25	0.36	0.31	1.0	0.32	0.36	0.53	0.36	0.39
AMTR_s00006p00254180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.176)	0.21	0.06	0.87	0.01	0.29	0.01	0.01	0.0	0.02	0.02	0.43	0.42	0.28	0.09	0.27	0.43	1.0	0.18	0.36	0.33	0.42	0.27
AMTR_s00006p00260320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.221)	0.19	0.53	0.81	0.02	0.15	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.5	0.41	0.28	0.15	0.21	0.51	1.0	0.52	0.48	0.44	0.4	0.23
AMTR_s00010p00149200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.107)	0.05	0.46	0.54	0.08	0.26	0.01	0.08	0.09	0.1	0.11	0.58	0.5	0.37	0.34	0.3	0.42	1.0	0.59	0.52	0.5	0.61	0.28
AMTR_s00011p00246950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.147)	0.73	0.0	0.81	0.03	0.39	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.68	0.6	0.28	0.13	0.19	0.36	1.0	0.35	0.34	0.31	0.2	0.42
AMTR_s00011p00266440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.230)	0.07	0.08	0.42	0.06	0.11	0.0	0.07	0.12	0.14	0.11	0.51	0.38	0.5	0.25	0.41	0.49	1.0	0.56	0.42	0.46	0.63	0.54
AMTR_s00019p00198460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.228)	0.46	0.08	0.01	0.04	0.07	0.0	0.06	0.01	0.04	0.05	0.59	0.39	0.75	0.32	0.11	0.46	1.0	0.79	0.44	0.65	0.64	0.33
AMTR_s00019p00208460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.250)	0.0	0.0	0.3	0.21	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.64	0.48	0.44	0.19	0.26	0.32	1.0	0.45	0.49	0.55	0.4	0.64
AMTR_s00021p00105410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.53)	0.43	0.37	0.21	0.01	0.25	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.49	0.5	0.32	0.13	0.32	0.61	1.0	0.38	0.41	0.57	0.37	0.38
AMTR_s00021p00216340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.197)	0.44	0.03	0.51	0.01	0.07	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.64	0.36	0.5	0.18	0.26	0.06	1.0	0.6	0.44	0.65	0.45	0.32
AMTR_s00021p00234100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.233)	0.0	0.55	0.55	0.15	0.32	0.02	0.04	0.0	0.04	0.04	0.62	0.48	0.46	0.23	0.27	0.64	1.0	0.56	0.48	0.33	0.3	0.41
AMTR_s00021p00236970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.242)	0.27	0.08	0.25	0.08	0.17	0.0	0.03	0.01	0.05	0.05	0.54	0.48	0.29	0.13	0.45	0.72	1.0	0.4	0.43	0.36	0.26	0.36
AMTR_s00025p00053190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.29)	0.0	0.36	0.0	0.01	0.12	0.0	0.09	0.03	0.15	0.11	0.56	0.33	0.73	0.64	0.16	0.56	0.93	0.54	0.67	1.0	0.83	0.5
AMTR_s00025p00176430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.212)	0.17	0.06	0.13	0.07	0.22	0.19	0.1	0.0	0.11	0.09	0.61	0.57	0.43	0.2	0.29	0.46	1.0	0.31	0.45	0.39	0.17	0.44
AMTR_s00029p00146380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.171)	0.0	0.4	0.51	0.0	0.14	0.0	0.01	0.04	0.02	0.01	0.51	0.41	0.47	0.24	0.33	0.62	1.0	0.46	0.42	0.39	0.48	0.41
AMTR_s00030p00241220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.211)	0.64	0.37	0.6	0.03	0.37	0.01	0.03	0.0	0.03	0.03	0.53	0.34	0.32	0.14	0.49	0.36	1.0	0.28	0.4	0.54	0.25	0.31
AMTR_s00031p00165100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00031.70)	0.22	0.25	0.21	0.03	0.14	0.0	0.05	0.01	0.1	0.07	0.57	0.57	0.52	0.23	0.32	0.41	1.0	0.32	0.38	0.64	0.18	0.52
AMTR_s00034p00215870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00034.87)	0.22	0.25	0.93	0.3	0.37	0.03	0.02	0.0	0.03	0.03	0.56	0.59	0.56	0.31	0.35	0.29	1.0	0.35	0.36	0.59	0.39	0.47
AMTR_s00037p00227630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.136)	0.27	0.21	0.2	0.3	0.11	0.0	0.08	0.02	0.08	0.07	0.43	0.32	0.62	0.24	0.24	0.19	1.0	0.5	0.35	0.36	0.15	0.41
AMTR_s00040p00151890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.125)	0.02	0.04	0.4	0.0	0.19	0.01	0.1	0.0	0.11	0.11	0.46	0.53	0.46	0.23	0.31	0.52	1.0	0.37	0.34	0.61	0.3	0.51
AMTR_s00041p00082900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.49)	0.42	0.23	0.46	0.24	0.26	0.26	0.11	0.27	0.17	0.17	0.58	0.52	0.4	0.25	0.33	0.3	1.0	0.44	0.41	0.47	0.33	0.37
AMTR_s00044p00228460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.250)	0.49	0.46	0.26	0.45	0.38	0.0	0.17	0.02	0.15	0.19	0.46	0.51	0.66	0.31	0.21	0.83	1.0	0.75	0.6	0.69	0.42	0.55
AMTR_s00045p00042440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.20)	0.1	0.14	0.1	0.17	0.08	0.0	0.02	0.0	0.02	0.02	0.56	0.32	0.24	0.02	0.03	0.49	1.0	0.28	0.3	0.16	0.14	0.36
AMTR_s00046p00228720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00046.170)	0.19	0.33	0.29	0.16	0.39	0.0	0.01	0.02	0.02	0.03	0.5	0.41	0.4	0.23	0.53	0.45	1.0	0.33	0.33	0.73	0.45	0.47
AMTR_s00057p00199190	0.04	0.0	0.11	0.02	0.21	0.0	0.15	0.08	0.13	0.13	0.52	0.57	0.33	0.2	0.29	0.31	1.0	0.46	0.35	0.67	0.28	0.22
AMTR_s00059p00214550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.254)	0.33	0.36	0.79	0.15	0.2	0.01	0.02	0.0	0.05	0.04	0.57	0.46	0.42	0.17	0.34	0.29	1.0	0.35	0.3	0.28	0.35	0.53
AMTR_s00061p00163460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.158)	0.0	0.0	0.06	0.16	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.43	0.19	0.05	0.14	0.18	1.0	0.35	0.32	0.41	0.31	0.22
AMTR_s00062p00159540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.149)	0.23	0.0	0.6	0.11	0.29	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.54	0.5	0.5	0.21	0.29	0.34	1.0	0.32	0.38	0.46	0.49	0.44
AMTR_s00066p00092960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.74)	0.05	0.13	0.69	0.16	0.25	0.01	0.02	0.0	0.03	0.02	0.39	0.35	0.34	0.18	0.21	0.47	1.0	0.28	0.32	0.3	0.22	0.27
AMTR_s00066p00136320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.133)	0.06	0.21	0.44	0.27	0.2	0.0	0.01	0.0	0.03	0.02	0.37	0.33	0.63	0.39	0.23	0.35	1.0	0.4	0.37	0.41	0.25	0.46
AMTR_s00068p00090790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00068.45)	0.37	0.4	0.42	0.16	0.18	0.18	0.24	0.07	0.33	0.25	0.29	0.29	0.48	0.2	0.4	0.28	1.0	0.31	0.37	0.48	0.23	0.4
AMTR_s00077p00031710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.15)	0.0	0.0	0.13	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.18	0.11	0.03	0.07	0.49	1.0	0.34	0.37	0.57	0.17	0.1
AMTR_s00078p00160770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.146)	0.0	0.0	0.24	0.1	0.14	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.72	0.52	0.46	0.09	0.06	0.67	1.0	0.51	0.54	0.45	0.11	0.44
AMTR_s00083p00043340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00083.14)	0.06	0.1	0.14	0.17	0.18	0.01	0.01	0.0	0.02	0.03	0.3	0.33	0.37	0.22	0.25	0.43	1.0	0.26	0.21	0.26	0.11	0.38
AMTR_s00092p00090110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.50)	0.2	0.11	0.15	0.08	0.19	0.0	0.01	0.01	0.02	0.02	0.46	0.33	0.36	0.17	0.3	0.43	1.0	0.23	0.3	0.59	0.15	0.46
AMTR_s00095p00019470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.6)	0.27	0.4	0.54	0.02	0.2	0.01	0.0	0.0	0.01	0.06	0.41	0.3	0.35	0.09	0.25	0.26	1.0	0.21	0.28	0.31	0.25	0.39
AMTR_s00095p00020800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.5)	0.12	0.2	0.46	0.03	0.12	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.46	0.37	0.26	0.07	0.18	0.26	1.0	0.3	0.24	0.35	0.29	0.41
AMTR_s00096p00039880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00096.17)	0.31	0.32	0.51	0.04	0.32	0.16	0.02	0.0	0.03	0.02	0.56	0.57	0.32	0.26	0.25	0.38	1.0	0.39	0.34	0.51	0.16	0.38
AMTR_s00099p00155770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.150)	0.0	0.0	0.0	0.05	0.15	0.0	0.09	0.0	0.17	0.12	0.71	0.88	0.4	0.28	0.48	0.52	1.0	0.72	0.64	0.94	0.66	0.45
AMTR_s00100p00051890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00100.11)	0.19	0.02	0.06	0.02	0.03	0.0	0.06	0.0	0.02	0.02	0.29	0.2	0.25	0.01	0.02	0.87	1.0	0.47	0.34	0.65	0.35	0.11
AMTR_s00107p00047780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00107.18)	0.02	0.2	0.76	0.16	0.16	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.49	0.47	0.44	0.21	0.21	0.5	1.0	0.34	0.31	0.45	0.44	0.37
AMTR_s00107p00082420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00107.24)	0.01	0.09	0.1	0.03	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.28	0.26	0.2	0.06	0.12	0.42	1.0	0.22	0.21	0.49	0.14	0.19
AMTR_s00109p00118420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.117)	0.28	0.38	0.38	0.02	0.26	0.0	0.01	0.04	0.04	0.04	0.39	0.35	0.48	0.24	0.37	0.38	1.0	0.25	0.28	0.55	0.27	0.58
AMTR_s00113p00140210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00113.32)	0.26	0.04	0.51	0.02	0.21	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.39	0.37	0.24	0.12	0.15	0.22	1.0	0.27	0.26	0.32	0.44	0.29
AMTR_s00130p00080480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00130.37)	0.25	0.04	0.43	0.2	0.21	0.0	0.02	0.02	0.02	0.02	0.53	0.51	0.38	0.12	0.22	0.5	1.0	0.52	0.36	0.23	0.29	0.29
AMTR_s00148p00046020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00148.24)	0.0	0.0	0.15	0.06	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.36	0.55	0.17	0.2	0.71	1.0	0.47	0.56	0.62	0.47	0.33
AMTR_s00149p00035260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00149.12)	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.47	0.29	0.65	0.56	0.2	0.07	1.0	0.59	0.24	0.79	0.5	0.14
AMTR_s00173p00012350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00173.2)	0.03	0.7	1.0	0.26	0.29	0.02	0.23	0.15	0.28	0.27	0.52	0.61	0.75	0.53	0.36	0.29	0.99	0.4	0.41	0.32	0.33	0.53

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)