1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_301 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
1.03 2.11 0.18 0.47 0.0 0.37 0.76 1.25 2.07 0.07 1.66 0.55 2.11 2.95 0.57 1.01 2.26 3.76 20.22 2.26 0.05 0.04 0.04 0.07 4.55 2.46 1.66 0.0 0.03 0.15 0.07 0.01 0.03 0.0 0.16 0.03 0.07 0.03 0.03 0.03 0.05 0.02 0.03 2.12 29.04 34.46 8.81 1.47 1.17
1.06 3.44 1.62 6.19 3.39 0.53 1.95 3.27 0.13 0.14 0.2 2.27 4.3 3.89 3.48 1.56 0.05 0.92 1.84 6.04 0.14 0.12 0.15 0.13 36.17 0.15 0.1 0.15 0.07 0.09 0.14 0.09 0.07 0.04 0.0 0.03 0.03 0.1 0.13 0.05 0.15 0.01 0.11 8.94 34.22 43.81 2.99 0.17 0.02
0.18 1.65 0.22 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.86 1.86 3.8 0.95 0.1 0.0
0.03 0.18 0.01 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.26 0.06 0.02 0.24 0.31 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.01 7.91 1.95 27.48 0.04 0.0 0.0
0.02 0.3 0.41 0.01 0.0 0.02 0.03 0.05 0.02 0.09 0.3 2.08 0.45 0.56 3.18 6.08 0.06 0.67 2.77 4.98 0.02 0.06 0.07 0.02 0.14 0.08 0.13 0.06 0.04 0.03 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.1 0.05 0.34 0.06 10.36 2.3 19.32 1.49 0.05 0.03
0.01 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.32 0.0 0.0 0.01 0.05 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 1.35 1.2 7.07 0.14 0.03 0.04
0.02 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.05 0.12 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.25 1.15 0.57 0.54 0.0
0.01 0.16 0.01 0.03 0.06 0.48 0.03 0.03 0.05 0.01 0.05 0.71 0.23 0.18 0.0 0.0 0.12 0.08 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.01 0.27 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.45 7.47 78.55 0.18 0.62 0.32
0.32 8.57 21.05 0.0 0.0 0.16 4.37 3.34 0.55 0.05 3.93 0.55 8.68 12.6 2.06 3.1 0.64 2.94 0.0 0.24 0.19 0.03 0.06 0.05 0.27 0.1 0.0 0.0 0.0 0.39 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.05 0.01 0.25 0.09 11.88 81.09 107.33 4.95 0.0 0.44
0.28 18.73 0.02 0.0 0.0 0.46 1.0 1.5 4.41 0.27 2.82 6.98 4.19 22.05 5.96 11.09 0.19 7.44 0.98 10.34 0.25 1.78 0.34 0.78 1.04 0.3 0.71 0.28 0.23 0.44 0.5 0.22 0.2 0.37 0.25 0.16 0.27 0.4 0.51 1.24 0.35 2.18 1.47 2.59 125.28 228.26 7.32 0.28 0.03
10.61 8.37 11.92 0.39 0.15 0.1 2.46 2.57 5.56 0.77 1.77 11.54 7.01 7.62 0.88 0.44 8.2 3.4 18.6 1.7 0.53 0.69 0.66 0.63 0.6 0.5 0.92 0.79 0.56 0.37 0.47 0.59 0.4 0.43 0.22 0.5 0.32 0.48 0.26 0.36 0.28 0.43 0.43 5.74 13.83 45.51 11.03 11.36 12.62
11.17 3.04 1.52 0.85 0.06 0.12 3.13 4.25 2.61 0.87 1.37 1.95 0.99 0.66 0.68 0.46 1.55 1.5 2.99 1.32 0.42 0.48 0.48 0.54 0.1 1.69 1.34 0.33 0.29 0.46 0.31 0.72 0.34 0.21 0.31 0.53 0.45 0.46 0.34 0.24 0.39 0.35 0.45 1.68 2.59 10.62 1.7 1.86 1.93
4.27 1.75 0.73 0.06 0.03 0.01 1.84 1.87 1.69 0.52 0.65 1.22 1.82 0.94 0.6 0.63 3.79 0.97 2.97 1.63 0.3 0.49 0.15 0.44 1.33 1.58 1.39 0.31 0.19 0.45 0.33 0.67 0.33 0.16 0.31 0.27 0.31 0.38 0.31 0.13 0.34 0.2 0.35 1.6 1.84 38.4 1.0 1.08 1.52
0.01 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.08 0.04 0.33 0.22 2.93 0.02 0.0 0.0
0.01 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.2 1.1 14.23 0.0 0.0 0.0
0.19 0.5 0.11 0.04 0.0 0.01 0.85 0.92 0.22 0.59 0.24 0.18 0.19 0.24 0.0 0.0 0.76 0.14 0.05 0.06 0.06 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.03 0.03 0.11 0.13 0.05 0.06 0.06 0.09 0.05 0.03 0.07 0.11 0.15 0.25 1.48 3.47 6.19 0.52 0.56 0.21
0.48 0.19 0.13 0.17 0.17 0.03 0.06 0.1 0.64 0.06 0.07 0.26 0.02 0.39 0.19 0.19 0.09 0.23 0.17 0.31 0.01 0.12 0.11 0.13 0.03 0.58 0.31 0.01 0.02 0.0 0.01 0.06 0.03 0.02 0.0 0.02 0.03 0.03 0.0 0.0 0.04 0.01 0.02 0.35 0.28 2.35 0.02 0.01 0.02
1.09 1.25 0.7 0.5 0.61 1.15 3.75 4.63 0.74 0.72 1.05 0.64 2.36 1.62 0.07 0.13 2.61 0.83 0.18 1.25 0.35 0.09 0.15 0.1 0.3 0.33 0.3 0.35 0.23 0.29 0.23 0.81 0.33 0.13 0.23 0.38 0.31 0.26 0.24 0.28 0.52 0.64 0.75 3.03 2.59 7.25 0.78 0.47 0.35
0.05 0.33 0.0 0.03 0.28 0.53 0.01 0.0 0.04 0.02 0.11 0.0 0.15 0.25 0.0 0.0 0.08 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.67 0.0 0.0 0.0
0.04 0.64 1.1 0.34 0.03 0.0 13.86 6.15 0.35 0.73 0.17 0.61 2.94 2.48 0.91 2.78 0.08 0.76 0.0 7.79 0.06 0.32 0.26 0.04 0.74 3.2 9.96 0.0 0.0 0.0 0.11 0.03 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.02 0.24 0.07 0.36 10.46 55.16 0.0 0.0 0.0
0.07 0.75 0.08 0.66 0.0 0.0 19.97 23.07 0.05 4.43 2.58 0.27 1.16 16.84 8.14 19.28 2.22 4.62 9.78 9.49 0.0 0.11 0.01 0.31 3.08 5.08 5.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.13 0.03 77.37 85.31 582.9 38.37 0.92 0.39
0.85 2.0 0.75 0.0 0.0 0.04 0.48 0.57 1.49 0.18 0.41 0.08 1.26 1.17 0.0 0.0 0.85 1.52 0.88 2.15 0.02 0.02 0.05 0.05 0.0 0.37 0.0 0.13 0.18 0.0 0.05 0.13 0.0 0.09 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.03 1.56 1.31 9.27 0.92 0.73 0.7
0.0 0.06 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.32 0.56 0.0 0.0 0.0
0.09 0.37 0.01 0.0 0.0 0.0 0.85 0.52 0.11 0.01 0.08 0.09 0.47 1.09 0.0 0.0 0.01 0.59 0.0 0.05 0.02 0.03 0.02 0.03 0.46 0.0 0.03 0.04 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.05 0.05 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.78 1.31 7.88 1.55 0.04 0.04
2.21 1.06 0.26 0.02 0.05 0.05 0.03 0.01 0.81 0.02 0.1 0.29 0.25 1.15 0.25 0.22 0.12 0.41 0.55 0.16 0.02 0.08 0.02 0.13 0.19 0.29 0.28 0.01 0.03 0.03 0.03 0.06 0.03 0.03 0.04 0.05 0.03 0.02 0.06 0.01 0.04 0.02 0.03 1.23 0.71 3.13 0.05 0.06 0.08
3.66 2.3 0.49 0.0 0.16 0.0 0.06 0.12 5.0 0.03 0.25 0.47 0.43 0.37 0.48 0.73 0.08 0.48 1.69 0.29 0.02 0.04 0.01 0.12 0.07 0.79 0.74 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.05 0.04 0.02 0.02 0.0 0.04 0.0 0.01 0.1 0.1 0.05 3.45 1.64 9.68 0.38 0.0 0.0
2.63 2.65 0.91 0.0 0.1 0.0 0.02 0.04 3.52 0.04 0.56 0.71 0.24 0.22 0.45 0.37 0.2 0.88 3.57 0.27 0.02 0.04 0.0 0.17 0.0 1.0 1.1 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.05 0.1 0.06 3.32 2.14 13.45 0.36 0.0 0.0
0.01 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.02 0.18 0.09 0.12 0.24 0.22 0.02 0.12 4.71 0.13 0.04 0.01 0.16 0.03 0.02 0.05 0.04 0.07 0.01 0.02 0.03 0.06 0.0 0.02 0.05 0.04 0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 0.08 0.07 0.2 2.32 8.99 0.0 0.0 0.0
0.04 1.45 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 1.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.75 1.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.11 2.25 10.22 0.0 0.0 0.0
0.01 0.42 0.0 0.17 0.03 3.58 0.01 0.03 0.0 0.0 0.17 1.79 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.04 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 1.84 1.25 16.53 0.03 0.0 0.0
0.0 0.16 4.03 0.0 0.0 0.08 0.07 0.07 0.0 0.0 0.08 0.39 0.03 0.36 0.0 0.0 0.23 0.08 0.23 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 6.19 8.66 16.63 0.9 0.05 0.0
0.23 0.45 0.03 0.01 0.0 0.08 0.46 0.44 0.54 0.02 0.16 0.17 0.02 0.6 0.0 0.16 0.43 0.57 0.52 0.12 0.04 0.01 0.05 0.02 0.0 0.12 0.06 0.04 0.0 0.08 0.12 0.01 0.04 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 5.51 3.25 18.45 1.24 0.19 0.04
1.35 2.21 1.15 0.17 0.32 0.36 2.57 2.82 1.15 0.4 0.71 1.92 4.29 4.37 0.27 0.32 2.24 1.39 0.64 2.13 1.59 0.5 1.4 0.78 1.16 0.75 0.7 1.53 1.45 1.38 1.11 1.12 1.43 0.59 1.43 1.8 1.59 1.28 1.45 0.76 1.23 1.26 1.79 5.95 3.14 12.06 0.83 0.34 0.78
0.41 0.97 1.47 0.09 0.07 0.77 0.77 0.68 0.18 0.42 0.43 0.2 0.18 0.15 0.0 0.0 1.54 0.11 0.0 0.09 0.03 0.0 0.03 0.03 0.02 0.0 0.0 0.04 0.02 0.02 0.0 0.12 0.01 0.01 0.05 0.06 0.02 0.04 0.04 0.01 0.03 0.02 0.06 0.89 0.95 4.43 0.07 0.11 0.07
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.03 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 2.01 10.23 0.0 0.0 0.0
0.08 0.24 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.01 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.42 1.94 0.0 0.0 0.0
0.01 0.4 0.01 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 31.84 0.01 0.15 14.74 18.29 0.0 1.69 1.36 6.44 0.0 0.02 0.0 0.02 1.04 0.59 1.74 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.17 0.15 0.18 0.06 120.25 261.16 0.0 0.0 0.0
0.05 0.62 0.01 0.0 0.0 0.02 6.24 4.82 0.41 0.22 0.91 0.13 4.17 8.08 0.29 0.29 0.45 8.73 0.32 0.39 0.1 0.16 0.09 0.14 1.07 0.14 0.06 0.35 0.02 0.1 0.08 0.08 0.1 0.0 0.07 0.09 0.05 0.07 0.1 0.0 0.0 0.01 0.01 8.52 5.72 43.03 16.86 0.5 0.15
0.0 0.16 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.16 0.13 0.05 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 1.13 3.07 0.0 0.0 0.0
0.01 0.37 0.48 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.21 1.54 33.48 0.04 0.0 0.0
0.16 0.73 0.01 0.04 0.01 0.0 0.35 0.3 2.67 0.04 1.24 0.14 0.02 0.38 0.0 0.1 0.1 0.09 5.14 0.26 0.02 0.01 0.03 0.01 0.11 0.01 0.01 0.08 0.01 0.04 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 0.02 0.05 0.04 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 2.31 3.4 38.95 3.31 4.64 1.48
0.03 0.23 0.01 0.0 0.0 0.0 0.19 0.1 0.02 0.06 0.29 0.11 0.01 0.1 0.0 0.0 0.17 0.03 11.85 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 17.85 4.01 43.2 9.96 9.0 2.68
0.01 0.2 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.06 0.01 0.0 0.04 0.0 0.04 0.38 0.03 0.29 0.21 0.0 0.0 0.0 0.01 0.14 0.13 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 1.52 10.62 0.0 0.0 0.0
0.03 0.15 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.03 0.06 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.02 1.99 6.54 19.61 0.35 0.25 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)