1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_55 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
2.19 1.33 1.52 1.74 4.33 2.32 3.11 2.59 1.64 1.54 2.15 1.8 8.13 1.93 5.17 8.11 2.37 0.37 5.14 0.0 0.0 0.4 3.05 4.19 1.34 3.1 4.5 5.63 3.68 2.96 1.23 0.7
0.7 0.7 0.65 1.04 2.52 0.69 1.17 0.93 1.42 0.57 0.87 0.87 0.38 0.48 0.88 0.13 0.62 0.07 0.29 0.89 0.19 0.0 0.07 0.06 0.4 0.28 0.33 0.2 0.3 0.55 0.42 0.53
0.46 0.34 0.51 1.17 1.75 0.47 0.57 0.85 1.04 0.84 0.64 0.17 0.03 0.09 0.07 0.0 0.09 0.79 0.12 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.16 0.39 0.42 0.65 0.2 0.07 0.23 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 2.01 0.0 3.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.87 2.25 4.69 0.5 13.64 9.17 11.74 7.84 10.61 2.55 3.4 2.44 1.28 0.53 4.53 0.3 1.04 4.45 1.9 2.9 0.0 4.62 0.5 0.91 13.93 1.05 3.83 9.19 3.98 2.8 2.35 3.47
1.28 1.26 0.0 2.06 4.62 0.33 1.94 0.27 1.01 1.36 2.33 0.66 1.94 0.41 1.1 1.2 1.7 2.85 18.19 0.0 1.76 0.0 4.33 1.36 0.0 0.78 2.5 0.0 2.43 2.14 1.53 1.66
0.05 0.11 0.05 0.04 1.6 0.17 0.0 0.05 0.0 0.24 0.16 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.12 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.06 0.38
0.09 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
6.4 5.21 12.08 8.84 11.82 10.13 10.47 13.46 9.26 7.73 6.03 5.27 10.79 7.08 15.78 12.06 7.61 6.72 12.64 5.22 5.71 2.16 9.49 10.57 13.53 9.74 11.51 11.34 9.06 8.49 4.91 6.44
0.03 0.07 0.22 0.07 0.18 0.14 0.03 0.03 0.0 0.05 0.06 0.03 0.55 0.04 0.05 0.01 0.01 0.07 0.12 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.09 0.0 0.03 0.27 0.03 0.08 0.0 0.0
0.15 0.4 0.13 0.16 0.82 0.13 0.21 0.21 0.06 0.11 0.04 0.18 0.34 0.14 0.09 0.03 0.04 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.08 0.43 0.1 0.18 0.01 0.07 0.02 0.0
0.03 0.0 0.0 0.02 0.5 0.02 0.04 0.04 0.04 0.17 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.06 0.06 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.03 0.13 0.11 0.06 0.04 0.0 0.0
0.08 0.03 0.25 0.08 0.48 0.09 0.12 0.01 0.04 0.07 0.06 0.1 0.06 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.06 0.04 0.03 0.05 0.08
13.03 11.57 10.37 10.11 23.95 9.39 10.11 10.81 12.75 10.86 14.81 12.11 11.88 7.39 7.73 16.88 7.89 7.34 14.22 4.85 3.73 11.05 20.13 25.47 23.22 8.17 5.87 7.89 10.6 12.36 10.91 9.36
0.01 0.14 0.17 0.13 0.59 0.0 0.05 0.06 0.03 0.08 0.2 0.01 0.11 0.05 0.0 0.04 0.17 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
0.06 0.08 0.21 0.0 0.27 0.1 0.07 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.42 0.13 0.02 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.13 0.0 0.05 0.0 0.03 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 9.93 2.4 0.01 2.3 0.0 0.0 0.23 0.0 1.59 0.17 2.74 0.25 2.78 1.03 2.92 0.0 1.07 0.0 1.98 3.12 9.14 0.31 0.84 0.65 2.04 1.77 2.23 3.67
0.6 0.98 1.43 2.87 3.32 1.74 2.92 1.31 1.3 0.68 1.21 0.5 0.09 0.09 0.62 0.11 0.21 0.0 0.15 0.48 0.0 0.15 0.15 0.25 3.4 1.08 2.68 1.48 0.45 0.56 0.25 0.1
0.05 0.0 0.0 0.06 1.06 0.24 0.05 0.07 0.52 0.16 0.06 0.12 0.24 0.06 0.16 0.18 0.13 0.29 0.34 0.0 0.0 0.0 0.17 0.19 0.0 0.14 0.23 0.36 0.09 0.26 0.28 0.09
1.52 3.99 2.06 2.3 5.52 1.24 1.78 1.06 2.11 2.1 2.01 2.75 0.0 0.03 0.0 0.28 1.58 2.0 6.28 0.0 0.0 0.0 0.98 0.69 0.63 6.97 2.8 2.58 1.88 2.22 0.9 0.79
0.47 0.21 0.18 0.73 1.24 0.19 0.35 0.66 0.51 0.48 0.52 0.37 0.0 0.11 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.06 0.03 0.27 0.71 0.04 0.0 0.11 0.11 0.06 0.03 0.13 0.08 0.0 0.09 0.0 0.19 0.19 0.39 0.0 0.0 0.0 0.4 0.15 0.4 0.29 0.09 0.17 0.13 0.14 0.24 0.13
0.01 0.0 0.01 0.03 0.25 0.04 0.05 0.0 0.02 0.03 0.0 0.02 0.04 0.06 0.33 0.07 0.02 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0
0.52 0.49 0.73 0.5 2.21 0.39 0.54 1.12 1.01 1.01 0.58 0.52 0.43 0.12 0.17 0.98 0.84 1.26 1.36 0.0 0.0 0.88 2.91 1.98 2.7 0.38 0.44 0.15 1.05 1.29 1.25 1.03
0.03 0.0 0.02 0.07 0.29 0.16 0.14 0.17 0.14 0.08 0.11 0.08 0.0 0.02 0.05 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0
0.06 0.13 0.21 0.02 0.66 0.26 0.28 0.29 0.06 0.11 0.22 0.12 0.09 0.07 0.65 0.14 0.09 0.12 0.28 0.0 0.51 0.22 0.08 0.06 0.12 0.16 0.64 0.79 0.01 0.05 0.07 0.0
1.59 1.28 0.55 0.9 3.04 1.29 1.02 0.97 1.69 1.42 2.55 2.33 0.38 0.43 0.56 0.28 1.55 0.31 0.96 0.0 0.0 0.0 0.66 0.61 0.14 2.79 1.5 1.63 1.31 1.06 1.53 0.97
0.06 0.01 0.0 0.07 0.33 0.04 0.0 0.01 0.0 0.08 0.04 0.0 0.03 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.22 0.29 0.0 0.01 0.0 0.0
0.5 0.35 0.14 0.24 0.85 0.35 0.18 0.57 0.58 0.59 1.25 0.78 0.47 0.23 0.55 0.51 0.3 0.05 0.53 0.04 0.35 0.1 0.34 0.26 0.27 1.03 0.05 0.0 0.41 0.34 0.84 1.17
0.08 0.0 0.0 0.0 4.92 0.0 0.0 0.98 0.0 0.11 0.26 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.22 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.1 0.63 0.0 0.15 0.07 0.47 0.0 0.1 0.0 0.06 0.0 0.18 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.09 0.09 0.09 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 3.5 0.7 0.0 0.8 0.06 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.02 0.81 0.0 0.0 0.0 0.23 0.07 0.0 0.0
0.9 0.89 2.27 0.82 2.94 1.16 1.95 1.59 0.29 1.72 0.69 0.36 0.52 1.72 4.05 0.6 0.36 0.07 2.9 1.34 1.11 0.0 0.74 0.96 1.13 1.5 2.11 3.02 0.33 0.58 0.37 0.45
0.06 0.03 0.06 0.06 0.25 0.09 0.06 0.19 0.07 0.14 0.11 0.25 0.02 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.47 0.06 0.0 0.0 0.03 0.06 0.12 0.05 0.03 0.46 0.05 0.08 0.04 0.04
0.84 0.53 0.23 1.02 3.1 0.67 1.1 1.75 0.26 1.82 1.33 1.17 1.38 0.61 1.03 0.81 0.07 0.0 0.84 0.0 0.0 0.22 1.7 3.16 4.55 0.33 1.16 2.13 0.85 0.36 0.64 0.41
0.09 0.19 0.02 0.05 0.71 0.03 0.04 0.06 0.07 0.04 0.05 0.17 0.02 0.07 0.01 0.14 0.2 0.26 2.89 0.0 0.41 0.0 0.19 0.03 0.09 0.66 0.47 0.88 0.12 0.17 0.1 0.1
0.01 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.13 0.02 0.04 0.0 0.05 0.24 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.16 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.05 0.16 0.01 0.23 0.15 0.09 0.1 0.0 0.02 0.14 0.0 0.0 0.04 0.04 0.03 0.03 0.12 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.07 0.0 0.04 0.01 0.0
0.1 0.05 0.49 0.16 1.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.8 0.05 0.19 0.0 0.0 0.0 0.1 0.1 0.0 0.2 0.0 0.0 0.14 0.05 0.05 0.0
0.03 0.11 0.0 0.04 0.79 0.06 0.34 0.0 0.0 0.17 0.0 0.22 0.0 0.07 0.0 0.14 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.06 0.68 0.0 0.14 0.29 0.0 0.18 0.0 0.0
0.85 0.8 0.84 1.0 2.44 0.52 0.65 0.81 0.52 1.68 0.72 1.02 5.5 0.52 0.04 1.01 0.12 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.53 0.49 0.27 1.1 1.44 1.23 0.44 0.13 0.44 0.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.36 0.0 0.37 1.54 0.49 0.28 0.0 0.75 0.25 0.34 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 1.06 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.79 0.86 0.7 0.11 0.39 0.38 0.0 0.0 0.0 0.27 0.27 0.0 0.25 0.49 0.0 0.1 0.16 0.21 0.15
0.03 0.0 0.0 0.04 0.92 0.37 0.85 0.49 0.05 0.22 0.07 0.29 0.08 0.0 0.36 0.08 0.23 0.15 0.07 0.0 0.72 1.04 0.0 0.28 0.3 0.0 0.42 1.03 0.18 0.25 0.18 0.05
0.03 0.12 0.15 0.25 0.71 0.11 0.07 0.08 0.14 0.09 0.09 0.02 0.15 0.02 0.11 0.03 0.09 0.52 2.94 0.0 0.2 0.16 0.11 0.21 0.11 0.0 0.38 0.0 0.1 0.05 0.0 0.03
0.09 0.1 0.13 0.09 0.27 0.13 0.14 0.1 0.13 0.1 0.04 0.1 0.07 0.03 0.04 0.05 0.13 0.02 0.57 0.0 0.04 0.0 0.12 0.18 0.2 0.14 0.23 0.25 0.09 0.16 0.05 0.09
0.02 0.03 0.0 0.05 0.11 0.06 0.03 0.04 0.06 0.02 0.07 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 0.11 0.03 0.67 0.01 0.0 0.05 0.06 0.08 0.0 0.02 0.13 0.0 0.06 0.04 0.01 0.02
0.37 0.22 0.45 0.51 0.72 0.73 1.22 1.46 0.44 0.8 0.82 0.32 1.47 0.68 1.43 1.84 0.54 0.13 1.34 0.0 0.73 0.0 1.23 1.62 0.25 1.18 1.43 0.92 0.62 0.65 0.34 0.2
0.15 0.03 0.62 0.47 1.72 0.42 0.17 0.18 1.27 0.91 0.18 0.35 0.08 0.25 0.02 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.26 0.07 0.0 0.16 0.0 0.0 0.07 0.04 0.04 0.03
0.57 0.87 0.59 0.74 1.96 0.81 0.36 0.71 2.22 1.13 2.04 1.69 0.87 0.96 0.76 1.0 0.67 0.47 1.31 0.05 0.1 1.18 1.14 1.01 0.9 1.84 1.38 0.57 0.9 0.92 0.59 0.49
0.36 0.48 0.52 0.19 1.26 0.13 0.55 0.52 0.5 0.65 0.77 0.26 0.39 0.32 0.5 0.32 0.11 0.1 0.78 0.0 0.2 0.0 0.07 0.0 0.84 0.64 0.41 0.55 0.09 0.03 0.04 0.09
0.01 0.0 0.02 0.01 0.65 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.07 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.1 0.02 0.02 0.04 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.14 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.05 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.24 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.47 0.08 0.12 0.22 0.0 0.02 0.14 0.07 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.02 0.0 0.08 0.02
0.37 0.27 0.2 0.09 0.95 0.43 0.09 0.12 0.09 0.16 0.36 0.39 0.77 0.76 0.39 0.94 0.89 0.79 1.25 0.0 0.0 0.0 1.17 0.91 0.0 0.11 0.14 0.73 0.43 0.61 1.14 0.95
0.88 0.67 0.13 0.79 3.69 2.58 2.06 2.23 1.82 1.73 0.82 0.95 0.17 0.08 1.21 0.42 0.46 0.11 0.16 1.0 3.75 0.23 0.46 0.31 0.44 1.5 4.07 3.93 0.69 0.63 0.9 0.67
0.54 0.34 0.37 1.48 3.14 0.84 1.21 1.09 1.23 0.4 0.26 0.69 3.4 0.59 1.82 3.23 0.7 1.44 0.17 0.0 0.0 0.29 2.89 1.63 0.41 0.41 0.45 1.38 1.07 0.81 0.53 0.34
0.03 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.05 0.06 0.03 0.05 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.55 0.08 0.21 1.1 0.05 0.26 0.0 0.21 0.18 0.0 0.0 1.11 0.26 0.0 0.22 0.05 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.31 0.15 0.0 0.52 0.12 0.46 0.09 0.0 0.05 0.0
0.12 0.0 0.0 0.11 0.55 0.0 0.63 0.12 0.0 0.0 0.12 0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 1.73 0.0 0.0 0.0 1.25 0.0 0.0 0.17 0.39 0.55 0.1 0.08 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06
0.12 0.0 0.0 0.0 1.78 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.07 0.1 0.0 0.08 0.0 1.86 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0 0.68 0.79 0.38 0.15 0.08 0.08 0.15
4.07 5.89 7.96 5.9 9.06 4.31 4.13 2.64 3.17 2.53 3.55 4.34 2.08 2.6 3.15 1.34 1.86 1.46 5.98 0.0 0.8 0.0 1.47 0.64 0.0 1.48 2.76 1.55 2.62 2.53 1.22 1.76
0.26 0.04 0.0 0.0 3.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
9.47 14.13 5.45 11.0 15.71 10.11 15.57 13.26 8.45 6.7 11.69 8.11 8.16 3.74 3.99 21.44 8.23 12.32 62.29 0.0 0.0 0.0 13.99 14.41 2.34 3.48 3.0 2.64 15.93 10.3 9.68 9.7
0.0 0.06 0.0 0.33 0.67 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.09 0.14 0.0 0.15 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 2.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
0.85 0.8 0.82 1.07 3.05 1.62 1.0 1.82 1.56 1.4 1.25 1.25 0.1 0.52 1.86 0.13 0.14 0.09 0.11 0.0 0.72 0.0 0.09 0.11 1.62 0.96 0.52 1.18 0.1 0.15 0.04 0.06

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)