1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_55 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.27 0.16 0.19 0.21 0.53 0.29 0.38 0.32 0.2 0.19 0.26 0.22 1.0 0.24 0.64 1.0 0.29 0.05 0.63 0.0 0.0 0.05 0.38 0.52 0.17 0.38 0.55 0.69 0.45 0.36 0.15 0.09
0.28 0.28 0.26 0.41 1.0 0.27 0.47 0.37 0.56 0.23 0.35 0.35 0.15 0.19 0.35 0.05 0.25 0.03 0.11 0.35 0.08 0.0 0.03 0.03 0.16 0.11 0.13 0.08 0.12 0.22 0.16 0.21
0.26 0.19 0.29 0.67 1.0 0.27 0.32 0.48 0.59 0.48 0.36 0.09 0.01 0.05 0.04 0.0 0.05 0.45 0.07 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.09 0.22 0.24 0.37 0.12 0.04 0.13 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.51 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.16 0.34 0.04 0.98 0.66 0.84 0.56 0.76 0.18 0.24 0.18 0.09 0.04 0.33 0.02 0.07 0.32 0.14 0.21 0.0 0.33 0.04 0.07 1.0 0.08 0.28 0.66 0.29 0.2 0.17 0.25
0.07 0.07 0.0 0.11 0.25 0.02 0.11 0.01 0.06 0.07 0.13 0.04 0.11 0.02 0.06 0.07 0.09 0.16 1.0 0.0 0.1 0.0 0.24 0.07 0.0 0.04 0.14 0.0 0.13 0.12 0.08 0.09
0.03 0.07 0.03 0.03 1.0 0.11 0.0 0.03 0.0 0.15 0.1 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.24
0.09 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.41 0.33 0.77 0.56 0.75 0.64 0.66 0.85 0.59 0.49 0.38 0.33 0.68 0.45 1.0 0.76 0.48 0.43 0.8 0.33 0.36 0.14 0.6 0.67 0.86 0.62 0.73 0.72 0.57 0.54 0.31 0.41
0.06 0.12 0.41 0.13 0.33 0.26 0.05 0.05 0.0 0.1 0.11 0.06 1.0 0.08 0.09 0.03 0.02 0.12 0.21 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.17 0.0 0.05 0.48 0.06 0.15 0.0 0.0
0.18 0.49 0.16 0.2 1.0 0.16 0.26 0.26 0.07 0.14 0.05 0.23 0.42 0.17 0.11 0.03 0.04 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.1 0.53 0.13 0.22 0.01 0.08 0.03 0.0
0.06 0.0 0.0 0.05 1.0 0.05 0.08 0.09 0.07 0.34 0.04 0.02 0.03 0.04 0.0 0.0 0.13 0.12 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.1 0.05 0.26 0.22 0.12 0.07 0.0 0.0
0.17 0.07 0.53 0.17 1.0 0.2 0.25 0.02 0.09 0.16 0.13 0.21 0.13 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.13 0.13 0.08 0.06 0.11 0.16
0.51 0.45 0.41 0.4 0.94 0.37 0.4 0.42 0.5 0.43 0.58 0.48 0.47 0.29 0.3 0.66 0.31 0.29 0.56 0.19 0.15 0.43 0.79 1.0 0.91 0.32 0.23 0.31 0.42 0.49 0.43 0.37
0.02 0.23 0.28 0.22 1.0 0.0 0.08 0.1 0.05 0.14 0.34 0.01 0.18 0.09 0.0 0.07 0.29 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.1 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0
0.21 0.3 0.77 0.0 1.0 0.38 0.27 0.22 0.0 0.0 0.07 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.58 0.18 0.03 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.18 0.0 0.07 0.0 0.05 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.24 0.0 0.23 0.0 0.0 0.02 0.0 0.16 0.02 0.28 0.02 0.28 0.1 0.29 0.0 0.11 0.0 0.2 0.31 0.92 0.03 0.08 0.07 0.21 0.18 0.22 0.37
0.18 0.29 0.42 0.85 0.98 0.51 0.86 0.38 0.38 0.2 0.36 0.15 0.03 0.03 0.18 0.03 0.06 0.0 0.04 0.14 0.0 0.04 0.04 0.07 1.0 0.32 0.79 0.44 0.13 0.16 0.07 0.03
0.05 0.0 0.0 0.06 1.0 0.22 0.05 0.06 0.49 0.15 0.06 0.11 0.22 0.05 0.15 0.17 0.12 0.28 0.33 0.0 0.0 0.0 0.16 0.18 0.0 0.13 0.22 0.34 0.09 0.24 0.27 0.08
0.22 0.57 0.3 0.33 0.79 0.18 0.26 0.15 0.3 0.3 0.29 0.39 0.0 0.0 0.0 0.04 0.23 0.29 0.9 0.0 0.0 0.0 0.14 0.1 0.09 1.0 0.4 0.37 0.27 0.32 0.13 0.11
0.38 0.17 0.14 0.59 1.0 0.15 0.28 0.53 0.41 0.39 0.42 0.3 0.0 0.09 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.09 0.04 0.38 1.0 0.05 0.0 0.15 0.16 0.08 0.04 0.18 0.11 0.0 0.13 0.0 0.26 0.26 0.54 0.0 0.0 0.0 0.56 0.2 0.56 0.4 0.13 0.23 0.19 0.2 0.34 0.19
0.02 0.0 0.04 0.08 0.7 0.12 0.15 0.0 0.04 0.08 0.0 0.05 0.12 0.16 0.93 0.2 0.06 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.15 0.0 0.0 0.11 0.0 0.06 0.0
0.18 0.17 0.25 0.17 0.76 0.13 0.19 0.38 0.35 0.35 0.2 0.18 0.15 0.04 0.06 0.34 0.29 0.43 0.47 0.0 0.0 0.3 1.0 0.68 0.93 0.13 0.15 0.05 0.36 0.44 0.43 0.36
0.09 0.0 0.06 0.22 1.0 0.55 0.49 0.58 0.46 0.28 0.38 0.28 0.0 0.06 0.16 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.15 0.28 0.0 0.0 0.1 0.05 0.0
0.08 0.17 0.26 0.03 0.83 0.33 0.35 0.36 0.08 0.14 0.28 0.15 0.11 0.09 0.82 0.18 0.12 0.15 0.35 0.0 0.64 0.27 0.1 0.08 0.16 0.2 0.81 1.0 0.02 0.06 0.08 0.0
0.52 0.42 0.18 0.3 1.0 0.43 0.34 0.32 0.56 0.47 0.84 0.77 0.12 0.14 0.18 0.09 0.51 0.1 0.32 0.0 0.0 0.0 0.22 0.2 0.05 0.92 0.49 0.54 0.43 0.35 0.5 0.32
0.06 0.01 0.0 0.08 0.38 0.05 0.0 0.02 0.0 0.09 0.04 0.0 0.04 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.08 0.26 0.34 0.0 0.02 0.0 0.0
0.4 0.28 0.11 0.19 0.68 0.28 0.14 0.46 0.46 0.47 1.0 0.62 0.37 0.19 0.44 0.4 0.24 0.04 0.42 0.03 0.28 0.08 0.27 0.2 0.22 0.83 0.04 0.0 0.33 0.27 0.67 0.94
0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.11 0.67 0.0 0.16 0.08 0.5 0.0 0.1 0.0 0.06 0.0 0.19 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.1 0.09 0.09 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0 0.23 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.23 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0
0.22 0.22 0.56 0.2 0.73 0.29 0.48 0.39 0.07 0.42 0.17 0.09 0.13 0.42 1.0 0.15 0.09 0.02 0.72 0.33 0.27 0.0 0.18 0.24 0.28 0.37 0.52 0.75 0.08 0.14 0.09 0.11
0.13 0.06 0.13 0.14 0.54 0.2 0.13 0.4 0.14 0.31 0.23 0.54 0.05 0.0 0.0 0.05 0.15 0.0 1.0 0.13 0.0 0.0 0.07 0.14 0.25 0.11 0.06 0.99 0.11 0.16 0.08 0.09
0.18 0.12 0.05 0.22 0.68 0.15 0.24 0.38 0.06 0.4 0.29 0.26 0.3 0.13 0.23 0.18 0.02 0.0 0.18 0.0 0.0 0.05 0.37 0.69 1.0 0.07 0.25 0.47 0.19 0.08 0.14 0.09
0.03 0.06 0.01 0.02 0.25 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.06 0.01 0.02 0.0 0.05 0.07 0.09 1.0 0.0 0.14 0.0 0.07 0.01 0.03 0.23 0.16 0.3 0.04 0.06 0.03 0.03
0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.08 0.26 0.04 0.09 0.0 0.11 0.48 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.14 0.32 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.06 0.18 0.01 0.26 0.17 0.1 0.11 0.0 0.02 0.16 0.0 0.0 0.05 0.05 0.03 0.03 0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.08 0.0 0.05 0.01 0.0
0.1 0.05 0.45 0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.73 0.05 0.17 0.0 0.0 0.0 0.09 0.09 0.0 0.18 0.0 0.0 0.13 0.04 0.04 0.0
0.04 0.14 0.0 0.05 1.0 0.08 0.43 0.0 0.0 0.22 0.0 0.28 0.0 0.09 0.0 0.18 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.07 0.87 0.0 0.18 0.36 0.0 0.23 0.0 0.0
0.15 0.15 0.15 0.18 0.44 0.09 0.12 0.15 0.09 0.31 0.13 0.18 1.0 0.1 0.01 0.18 0.02 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.05 0.2 0.26 0.22 0.08 0.02 0.08 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.23 0.0 0.24 1.0 0.32 0.18 0.0 0.49 0.16 0.22 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.74 0.81 0.65 0.1 0.37 0.36 0.0 0.0 0.0 0.26 0.25 0.0 0.23 0.46 0.0 0.1 0.15 0.2 0.14
0.03 0.0 0.0 0.04 0.88 0.35 0.81 0.47 0.05 0.21 0.07 0.28 0.08 0.0 0.34 0.08 0.22 0.15 0.07 0.0 0.69 1.0 0.0 0.27 0.29 0.0 0.4 0.98 0.17 0.24 0.17 0.04
0.01 0.04 0.05 0.08 0.24 0.04 0.02 0.03 0.05 0.03 0.03 0.01 0.05 0.01 0.04 0.01 0.03 0.18 1.0 0.0 0.07 0.05 0.04 0.07 0.04 0.0 0.13 0.0 0.03 0.02 0.0 0.01
0.17 0.18 0.22 0.16 0.48 0.23 0.25 0.18 0.23 0.18 0.08 0.18 0.12 0.05 0.07 0.09 0.23 0.03 1.0 0.0 0.07 0.0 0.22 0.31 0.35 0.24 0.4 0.43 0.15 0.27 0.09 0.16
0.03 0.04 0.0 0.08 0.17 0.09 0.05 0.06 0.08 0.02 0.11 0.03 0.02 0.01 0.04 0.03 0.16 0.04 1.0 0.02 0.0 0.07 0.09 0.11 0.0 0.04 0.19 0.0 0.09 0.06 0.02 0.02
0.2 0.12 0.24 0.28 0.39 0.4 0.66 0.8 0.24 0.44 0.44 0.17 0.8 0.37 0.77 1.0 0.29 0.07 0.73 0.0 0.4 0.0 0.67 0.88 0.13 0.64 0.78 0.5 0.34 0.35 0.19 0.11
0.09 0.02 0.36 0.27 1.0 0.24 0.1 0.11 0.74 0.53 0.1 0.21 0.05 0.15 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.15 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.04 0.02 0.02 0.02
0.26 0.39 0.26 0.33 0.88 0.36 0.16 0.32 1.0 0.51 0.92 0.76 0.39 0.43 0.34 0.45 0.3 0.21 0.59 0.02 0.05 0.53 0.51 0.46 0.41 0.83 0.62 0.26 0.4 0.42 0.27 0.22
0.29 0.38 0.42 0.15 1.0 0.11 0.44 0.41 0.4 0.52 0.61 0.21 0.31 0.25 0.4 0.25 0.09 0.08 0.62 0.0 0.16 0.0 0.05 0.0 0.67 0.51 0.33 0.44 0.07 0.03 0.03 0.08
0.01 0.0 0.02 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.11 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.15 0.03 0.03 0.06 0.0
0.0 0.13 0.0 0.0 0.57 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.15 0.22 0.08 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 1.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 1.0 0.18 0.25 0.46 0.0 0.05 0.29 0.15 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.05 0.0 0.17 0.05
0.29 0.22 0.16 0.07 0.77 0.35 0.07 0.09 0.07 0.13 0.29 0.31 0.62 0.61 0.31 0.75 0.72 0.63 1.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.73 0.0 0.09 0.11 0.58 0.35 0.49 0.92 0.76
0.22 0.17 0.03 0.2 0.91 0.63 0.51 0.55 0.45 0.43 0.2 0.23 0.04 0.02 0.3 0.1 0.11 0.03 0.04 0.24 0.92 0.06 0.11 0.08 0.11 0.37 1.0 0.97 0.17 0.16 0.22 0.16
0.16 0.1 0.11 0.43 0.92 0.25 0.36 0.32 0.36 0.12 0.08 0.2 1.0 0.17 0.53 0.95 0.21 0.42 0.05 0.0 0.0 0.08 0.85 0.48 0.12 0.12 0.13 0.4 0.32 0.24 0.16 0.1
0.07 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.09 0.0 0.11 0.11 0.13 0.07 0.11 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.5 0.07 0.19 0.99 0.05 0.24 0.0 0.19 0.17 0.0 0.0 1.0 0.24 0.0 0.2 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.28 0.13 0.0 0.47 0.1 0.42 0.09 0.0 0.04 0.0
0.2 0.0 0.0 0.17 0.88 0.0 1.0 0.2 0.0 0.0 0.19 0.0 0.06 0.0 0.1 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.1 0.22 0.32 0.06 0.05 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03
0.07 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.05 0.0 0.04 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.37 0.42 0.21 0.08 0.04 0.04 0.08
0.45 0.65 0.88 0.65 1.0 0.48 0.46 0.29 0.35 0.28 0.39 0.48 0.23 0.29 0.35 0.15 0.21 0.16 0.66 0.0 0.09 0.0 0.16 0.07 0.0 0.16 0.3 0.17 0.29 0.28 0.14 0.19
0.08 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.23 0.09 0.18 0.25 0.16 0.25 0.21 0.14 0.11 0.19 0.13 0.13 0.06 0.06 0.34 0.13 0.2 1.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.23 0.04 0.06 0.05 0.04 0.26 0.17 0.16 0.16
0.0 0.08 0.0 0.49 1.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.13 0.21 0.0 0.22 0.06 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.48 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.28 0.26 0.27 0.35 1.0 0.53 0.33 0.6 0.51 0.46 0.41 0.41 0.03 0.17 0.61 0.04 0.05 0.03 0.04 0.0 0.24 0.0 0.03 0.04 0.53 0.31 0.17 0.39 0.03 0.05 0.01 0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)