1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_195 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.09 0.02 0.01 0.04 0.11 0.17 0.09 0.1 0.14 0.2 0.16 0.13 0.02 0.0 0.05 0.0 0.07 0.05 0.4 0.0 0.0 1.0 0.04 0.07 0.94 0.06 0.04 0.09 0.08 0.1 0.06 0.08
0.39 0.35 0.27 0.29 0.34 0.34 0.31 0.32 0.4 0.39 0.37 0.38 0.18 0.36 0.16 0.21 0.26 0.28 0.29 0.46 0.39 0.98 0.23 0.2 1.0 0.25 0.31 0.25 0.32 0.28 0.54 0.4
0.01 0.28 0.11 0.04 0.11 0.12 0.06 0.09 0.09 0.02 0.14 0.03 0.02 0.03 0.02 0.01 0.05 0.0 0.02 0.21 0.28 0.27 0.04 0.04 1.0 0.0 0.04 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02
0.2 0.22 0.19 0.26 0.16 0.28 0.22 0.26 0.2 0.23 0.18 0.21 0.31 0.24 0.31 0.39 0.32 0.29 0.44 0.28 0.65 1.0 0.32 0.34 0.73 0.25 0.25 0.26 0.34 0.32 0.17 0.18
0.38 0.33 0.31 0.39 0.32 0.43 0.43 0.38 0.35 0.34 0.36 0.35 0.3 0.24 0.55 0.36 0.38 0.32 0.57 0.28 0.51 1.0 0.35 0.39 0.67 0.54 0.51 0.43 0.35 0.34 0.33 0.44
0.04 0.07 0.26 0.02 0.21 0.16 0.12 0.0 0.12 0.08 0.03 0.12 0.0 0.06 0.13 0.0 0.0 0.25 0.0 0.56 0.46 1.0 0.0 0.0 0.84 0.28 0.15 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 0.37 0.45 0.45 0.43 0.42 0.45 0.4 0.4 0.37 0.38 0.31 0.46 0.38 0.44 0.54 0.48 0.34 0.52 0.38 0.37 1.0 0.51 0.47 0.42 0.65 0.41 0.45 0.4 0.39 0.4 0.38
0.21 0.17 0.29 0.17 0.21 0.25 0.32 0.28 0.19 0.25 0.3 0.29 0.17 0.06 0.02 0.11 0.14 0.47 0.2 0.0 0.43 0.74 0.19 0.2 1.0 0.48 0.42 0.47 0.14 0.13 0.26 0.22
0.32 0.27 0.26 0.3 0.19 0.3 0.21 0.25 0.28 0.26 0.27 0.32 0.58 0.38 0.53 0.67 0.2 0.32 0.4 0.57 0.28 0.9 0.22 0.29 1.0 0.48 0.37 0.29 0.19 0.25 0.45 0.45
0.49 0.61 0.62 0.49 0.56 0.53 0.53 0.5 0.53 0.49 0.48 0.36 0.69 0.94 0.45 0.68 0.5 0.71 0.41 0.11 0.87 0.56 0.78 0.76 1.0 0.31 0.38 0.3 0.45 0.48 0.38 0.35
0.04 0.04 0.08 0.01 0.01 0.04 0.08 0.06 0.01 0.04 0.04 0.01 0.04 0.04 0.1 0.05 0.03 0.01 1.0 0.01 0.21 1.0 0.05 0.03 0.6 0.01 0.15 0.14 0.04 0.03 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.05 0.0 0.37 0.1 0.0 0.0 0.59 0.0 0.24 0.14 1.0 0.31 0.34 0.37 0.66 0.33 0.91 0.0 0.05 0.05 0.05
0.17 0.14 0.15 0.14 0.26 0.23 0.17 0.2 0.15 0.14 0.15 0.15 0.08 0.17 0.32 0.07 0.08 0.15 0.12 0.21 0.18 0.76 0.08 0.09 1.0 0.23 0.35 0.26 0.1 0.09 0.06 0.07
0.43 0.42 0.59 0.46 0.67 0.67 0.49 0.62 0.53 0.42 0.43 0.42 0.86 0.58 1.0 0.66 0.44 0.66 0.86 0.68 0.16 0.49 0.84 0.88 0.81 0.23 0.31 0.36 0.42 0.61 0.37 0.27
0.06 0.03 0.04 0.1 0.14 0.08 0.09 0.05 0.04 0.02 0.06 0.03 0.03 0.04 0.03 0.04 0.05 0.11 0.06 0.18 0.21 1.0 0.05 0.03 0.7 0.36 0.43 0.42 0.05 0.06 0.02 0.01
0.34 0.38 0.3 0.37 0.32 0.43 0.27 0.36 0.29 0.32 0.3 0.3 0.35 0.47 0.6 0.34 0.26 0.12 0.48 0.36 0.45 0.45 0.32 0.31 1.0 0.3 0.42 0.38 0.26 0.24 0.27 0.27
0.1 0.11 0.12 0.11 0.06 0.08 0.04 0.09 0.08 0.21 0.03 0.04 0.18 0.23 0.17 0.26 0.04 0.04 1.0 0.07 0.03 0.32 0.01 0.02 0.4 0.1 0.15 0.11 0.02 0.02 0.04 0.06
0.13 0.26 0.22 0.23 0.23 0.17 0.14 0.26 0.16 0.2 0.13 0.11 0.15 0.22 0.22 0.19 0.14 0.24 0.23 0.2 0.14 1.0 0.23 0.18 0.22 0.19 0.35 0.36 0.1 0.09 0.1 0.1
0.1 0.09 0.14 0.14 0.18 0.1 0.31 0.13 0.29 0.27 0.24 0.18 0.03 0.11 0.1 0.08 0.18 0.01 0.19 0.0 0.2 1.0 0.13 0.17 0.62 0.24 0.38 0.24 0.2 0.17 0.25 0.3
0.27 0.27 0.29 0.31 0.33 0.39 0.46 0.52 0.59 0.54 0.44 0.35 0.33 0.26 0.71 0.3 0.2 0.2 0.35 0.23 0.76 0.74 0.29 0.32 1.0 0.44 0.39 0.48 0.28 0.33 0.19 0.25
0.17 0.21 0.24 0.31 0.43 0.43 0.57 0.51 0.44 0.37 0.25 0.22 0.29 0.2 0.98 0.28 0.21 0.18 0.31 0.23 1.0 0.82 0.3 0.33 0.71 0.29 0.39 0.48 0.25 0.29 0.12 0.12
0.35 0.3 0.34 0.28 0.2 0.27 0.32 0.33 0.31 0.38 0.35 0.32 0.18 0.21 0.22 0.23 0.18 0.15 0.33 0.05 0.88 0.66 0.2 0.21 1.0 0.34 0.4 0.42 0.18 0.21 0.17 0.18
0.15 0.0 0.06 0.2 0.07 0.07 0.14 0.06 0.12 0.2 0.43 0.0 0.17 0.0 0.05 0.09 0.08 0.48 0.0 0.4 0.45 1.0 0.0 0.07 0.87 0.32 0.79 0.37 0.07 0.0 0.15 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.09 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0
0.17 0.14 0.22 0.17 0.09 0.23 0.18 0.33 0.2 0.19 0.13 0.16 0.09 0.08 0.12 0.11 0.06 0.0 0.07 0.31 0.64 1.0 0.06 0.11 0.55 0.17 0.1 0.06 0.03 0.04 0.03 0.02
0.16 0.24 0.13 0.18 0.32 0.25 0.29 0.31 0.23 0.24 0.13 0.15 0.1 0.05 0.31 0.2 0.29 0.05 0.35 0.35 0.09 0.93 0.37 0.23 1.0 0.37 0.43 0.55 0.27 0.22 0.22 0.16
0.26 0.29 0.32 0.34 0.45 0.42 0.34 0.32 0.36 0.35 0.36 0.26 0.15 0.15 0.27 0.37 0.39 0.29 0.53 0.23 0.59 0.54 0.14 0.19 1.0 0.39 0.38 0.35 0.29 0.38 0.35 0.31
0.33 0.22 0.42 0.35 0.45 0.37 0.41 0.45 0.21 0.38 0.41 0.32 0.19 0.09 0.07 0.27 0.14 0.26 0.24 0.35 0.77 0.7 0.16 0.25 1.0 0.26 0.15 0.2 0.13 0.15 0.1 0.13
0.29 0.25 0.28 0.26 0.3 0.33 0.19 0.2 0.16 0.23 0.19 0.21 0.28 0.41 0.61 0.37 0.2 0.2 0.24 0.38 0.41 1.0 0.18 0.22 0.65 0.09 0.11 0.18 0.21 0.21 0.13 0.13
0.29 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.12 0.3 0.12 0.0 0.2 0.0 0.11 0.17 0.33 0.0 0.56 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.1 0.22 0.11 0.1
0.07 0.16 0.09 0.06 0.08 0.06 0.03 0.06 0.05 0.12 0.11 0.1 0.26 0.01 0.04 0.23 0.23 0.36 0.24 0.15 0.64 1.0 0.2 0.28 0.64 0.04 0.0 0.0 0.22 0.23 0.2 0.12
0.09 0.08 0.05 0.12 0.11 0.17 0.17 0.15 0.16 0.17 0.11 0.13 0.07 0.08 0.12 0.09 0.1 0.14 0.12 0.14 0.59 1.0 0.14 0.16 0.95 0.2 0.3 0.19 0.11 0.12 0.13 0.13
0.09 0.06 0.03 0.1 0.04 0.08 0.06 0.11 0.08 0.06 0.08 0.09 0.04 0.03 0.04 0.06 0.05 0.02 0.06 0.2 0.09 1.0 0.06 0.05 0.78 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 0.07 0.06
0.23 0.26 0.22 0.52 0.42 0.27 0.37 0.43 0.3 0.44 0.31 0.32 0.29 0.2 0.28 0.26 0.36 0.06 0.31 0.14 0.28 1.0 0.34 0.15 0.62 0.27 0.57 0.42 0.3 0.42 0.41 0.34
0.04 0.19 0.01 0.16 0.14 0.11 0.18 0.0 0.26 0.0 0.04 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.12 0.0 0.14 0.09 0.02 0.38 0.0 0.03 1.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.29 0.29 0.29 0.26 0.3 0.31 0.31 0.25 0.34 0.26 0.24 0.35 0.37 0.47 0.41 0.26 0.19 0.42 0.45 0.51 0.85 0.33 0.4 1.0 0.28 0.29 0.3 0.23 0.27 0.15 0.18
0.19 0.43 0.16 0.21 0.46 0.24 0.35 0.28 0.22 0.27 0.49 0.14 0.08 0.39 0.46 0.08 0.07 0.11 0.13 0.72 0.7 1.0 0.07 0.03 0.59 0.56 0.37 0.31 0.0 0.11 0.04 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.3 0.29 0.26 0.31 0.34 0.39 0.43 0.4 0.5 0.46 0.35 0.38 0.18 0.13 0.42 0.23 0.23 0.16 0.34 0.4 0.82 0.72 0.29 0.35 1.0 0.22 0.25 0.25 0.3 0.3 0.26 0.35
0.13 0.22 0.1 0.22 0.15 0.17 0.17 0.14 0.17 0.1 0.13 0.11 0.1 0.06 0.36 0.28 0.16 0.36 0.31 0.31 0.39 1.0 0.11 0.05 0.39 0.17 0.1 0.08 0.13 0.24 0.08 0.05
0.65 0.47 0.64 0.46 0.8 0.67 0.59 1.0 0.53 0.72 0.59 0.66 0.63 0.23 0.29 0.54 0.35 0.16 0.39 0.51 0.77 0.73 0.36 0.45 0.49 0.76 0.66 0.58 0.36 0.21 0.42 0.62
0.2 0.25 0.31 0.26 0.34 0.4 0.29 0.3 0.36 0.28 0.18 0.22 0.28 0.19 0.48 0.23 0.27 0.34 0.32 0.16 0.59 1.0 0.24 0.26 0.91 0.28 0.46 0.54 0.19 0.28 0.2 0.22
0.12 0.16 0.12 0.16 0.19 0.2 0.19 0.24 0.16 0.13 0.14 0.08 0.13 0.06 0.17 0.14 0.13 0.11 0.2 0.38 0.32 1.0 0.16 0.19 0.79 0.27 0.34 0.27 0.14 0.16 0.05 0.07
0.44 0.44 0.47 0.5 0.52 0.47 0.43 0.39 0.39 0.41 0.4 0.39 0.71 0.75 0.61 0.66 0.4 0.38 0.53 0.59 0.61 0.52 0.56 0.65 1.0 0.3 0.33 0.41 0.46 0.53 0.49 0.51
0.1 0.06 0.06 0.11 0.09 0.35 0.21 0.22 0.26 0.2 0.1 0.1 0.04 0.03 0.16 0.06 0.13 0.08 0.13 0.13 0.24 1.0 0.09 0.07 0.61 0.1 0.31 0.23 0.14 0.16 0.14 0.11
0.36 0.47 0.4 0.46 0.56 0.5 0.44 0.49 0.46 0.53 0.46 0.38 0.52 0.57 0.79 0.49 0.26 0.16 0.48 0.46 1.0 0.8 0.39 0.39 0.98 0.86 0.58 0.52 0.29 0.3 0.17 0.2
0.11 0.09 0.12 0.1 0.2 0.23 0.24 0.32 0.22 0.22 0.2 0.14 0.05 0.03 0.19 0.06 0.11 0.1 0.08 0.19 0.43 0.45 0.09 0.07 1.0 0.11 0.28 0.2 0.12 0.13 0.16 0.14
0.45 0.41 0.47 0.57 0.67 0.72 0.76 0.74 0.72 0.64 0.55 0.53 0.96 0.49 1.0 0.55 0.34 0.25 0.4 0.28 0.8 0.54 0.59 0.61 0.8 0.53 0.65 0.62 0.41 0.42 0.26 0.26

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)