Heatmap: Cluster_194 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.41 0.38 0.38 0.21 0.42 0.4 0.2 0.39 0.22 0.21 0.3 0.14 -0.29 -0.01 0.82 0.12 -0.55 -1.11 -0.08 -1.33 0.09 0.19 -0.38 -0.21 0.41 -0.6 -0.41 -0.58 -0.63 -0.56 -0.46 -0.55
-0.32 -0.83 -0.96 -0.47 -0.22 0.4 0.3 0.17 0.8 0.38 -0.01 0.09 0.58 -0.02 0.51 1.14 -0.53 -0.3 0.64 -0.78 -2.45 0.89 -0.07 -0.27 -1.47 -0.48 -0.88 -0.9 0.04 0.03 -0.07 0.03
0.64 0.0 0.04 0.06 0.02 -0.22 0.38 0.39 0.39 0.58 0.52 0.63 -0.51 0.61 -0.82 0.05 -0.8 -1.2 -0.24 -1.64 0.61 -1.51 -0.6 -0.27 -0.57 -0.19 -0.63 -0.66 -0.23 -0.31 0.83 0.54
0.3 0.08 0.21 -0.02 0.56 0.42 -0.15 0.12 0.23 0.32 0.18 0.13 0.06 0.23 1.12 0.25 -0.77 -0.97 0.06 -2.12 1.19 -1.2 -0.37 -0.35 -1.12 -0.05 -0.21 -0.09 -0.24 -0.05 -1.35 -1.08
-0.44 -0.37 -0.3 0.02 0.15 0.34 0.51 0.5 0.47 0.39 0.17 -0.04 -0.63 0.31 0.81 -0.31 -0.17 -0.57 -0.44 -1.04 0.14 -0.95 -0.35 -0.61 0.51 -0.75 0.44 0.51 0.11 0.29 -0.54 -0.79
0.13 0.2 0.28 0.06 -0.16 0.35 0.21 -0.23 0.09 0.27 0.36 0.24 -0.23 0.02 0.18 -0.01 -0.28 -0.68 -0.43 -1.98 0.56 0.88 0.18 0.15 0.44 -0.65 -0.47 -0.32 -0.34 -0.35 -0.45 -0.38
-0.22 -0.71 -0.05 -0.32 -0.17 0.06 0.45 0.32 0.45 0.44 0.41 0.32 0.46 -1.31 -0.59 0.49 -0.04 -0.53 0.52 -3.42 -0.89 0.35 0.39 0.55 -1.46 -0.3 -0.0 -0.17 0.15 0.05 0.21 -0.15
-0.11 -0.38 0.19 -0.1 -0.12 0.01 0.07 0.18 0.37 0.06 0.27 0.33 -0.19 -0.61 0.2 -0.14 -0.13 -0.69 0.07 -2.47 0.88 0.5 0.37 0.45 0.14 0.09 -0.47 -0.54 0.03 0.24 -0.54 -0.76
0.08 0.22 -0.17 -0.09 -0.14 -0.1 0.13 0.31 0.33 0.56 0.27 0.55 0.28 0.28 -0.42 0.41 -0.86 -1.02 0.42 -2.2 0.42 -3.84 -0.15 -0.01 0.71 0.1 -0.73 -0.91 -0.34 -0.37 0.17 0.5
0.33 0.29 0.27 0.14 0.26 0.4 0.2 0.13 0.02 0.31 0.08 0.1 -0.06 -0.19 0.25 0.07 -0.32 -0.27 0.08 -0.65 -0.14 -0.6 -0.46 -0.36 -0.35 -0.03 0.35 0.38 -0.29 -0.27 -0.35 -0.29
0.6 -0.14 -0.37 -0.73 -0.5 -0.17 0.26 1.02 0.88 0.82 1.1 0.65 0.94 -0.1 -1.64 0.76 -0.82 -1.16 0.77 -0.98 -0.83 -1.67 0.11 0.47 -1.83 -0.04 -1.43 -1.64 -0.13 -0.17 -1.28 -1.12
-0.1 -0.13 -0.08 0.13 0.2 0.12 0.09 0.14 0.2 0.39 0.42 0.24 0.22 0.35 0.37 0.12 -0.37 -0.62 -0.4 -0.05 0.54 -0.29 -0.17 0.0 0.91 -0.48 -0.49 -0.6 -0.61 -0.55 -0.69 -0.56
0.43 0.15 -0.03 -0.17 -0.13 -0.08 -0.13 0.01 0.2 0.47 0.41 0.46 0.47 0.67 -0.06 0.62 -0.71 0.06 -0.21 0.04 -0.28 -0.96 0.12 0.45 -1.14 0.26 -0.91 -1.13 -0.44 -0.5 -0.21 -0.17
-0.79 -0.41 0.26 0.5 0.43 0.44 0.55 0.61 0.58 0.59 0.44 0.12 -0.95 0.52 -0.98 -0.67 -0.38 -0.79 -0.8 -3.63 0.94 -9.64 0.72 0.36 0.13 0.32 -0.22 -0.06 -0.25 -0.34 -1.02 -0.55
0.26 0.25 0.46 0.22 0.08 -0.06 0.26 0.53 0.69 0.86 0.9 0.57 0.49 0.66 -2.34 0.24 -0.95 -0.85 -0.16 -0.72 -0.1 -2.17 -0.25 -0.2 -0.59 0.33 -1.11 -0.9 -0.21 -0.13 -0.9 -0.77
0.41 0.41 0.57 0.33 0.43 0.47 0.23 0.27 0.28 0.27 0.32 0.16 -0.02 -0.26 -0.41 -0.03 -0.69 -0.72 -0.23 -0.23 0.38 -1.32 -0.1 -0.08 -0.27 -0.2 -0.19 -0.0 -0.44 -0.32 -0.4 -0.38
-0.24 -0.36 -0.41 -0.2 0.08 -0.1 0.04 0.19 0.33 0.23 0.44 0.05 0.36 -0.42 0.08 0.47 -0.18 -0.29 0.39 -0.69 -0.59 -0.03 0.26 0.33 -0.17 0.08 -0.56 -0.71 0.21 0.22 -0.07 0.04
0.11 0.05 -0.13 -0.04 -0.11 -0.04 -0.04 0.08 0.3 0.47 0.33 0.36 0.67 0.45 -1.02 0.61 -0.49 -0.41 0.04 -1.83 -0.28 -3.97 0.26 0.43 0.38 -0.21 -0.22 -0.25 -0.16 -0.15 0.03 0.08
-0.18 -0.12 -0.06 0.1 -0.08 -0.04 0.09 0.15 0.13 0.2 0.11 -0.16 -0.65 0.39 -0.3 0.15 -0.16 -0.25 0.22 -0.6 0.83 -1.58 0.21 0.3 0.46 0.18 -0.29 0.11 0.04 0.21 -0.73 -0.46
0.79 -1.85 -1.11 -0.38 -0.88 -0.89 -0.27 0.85 -0.18 -0.04 -0.38 -1.7 1.98 0.88 -0.96 1.16 -4.85 -1.04 1.53 - -2.1 - -2.31 -1.25 -0.22 1.88 0.35 -0.87 -0.31 -0.58 0.05 -1.2
-0.22 -0.05 -0.04 0.09 0.12 0.5 0.52 0.45 0.45 0.16 0.18 -0.01 -0.7 -0.48 0.44 -0.7 0.27 -0.08 -0.12 -1.19 -0.18 -1.74 0.02 -0.14 0.45 -0.93 0.55 0.64 0.18 0.27 -0.93 -0.86
0.18 0.15 -0.16 0.26 0.01 -0.04 0.12 0.11 0.23 0.51 0.4 0.32 0.4 0.33 -0.36 -0.02 -0.57 -1.07 0.21 -2.12 0.77 -2.02 0.51 -0.37 -0.69 -0.62 -0.85 -1.0 -0.48 -0.38 0.9 0.72
0.12 0.28 0.07 0.25 0.41 0.35 0.17 0.27 0.52 0.47 0.34 0.08 -0.1 -0.25 0.29 0.03 -0.47 -0.41 -0.12 -1.29 0.38 -0.17 -0.03 -0.06 0.71 -0.0 -0.48 -0.36 -0.44 -0.53 -1.26 -1.14
0.05 0.38 0.02 0.15 0.11 0.06 0.38 0.45 0.81 0.83 0.54 0.0 -0.34 0.87 0.74 -0.14 -1.47 -1.4 0.45 -2.35 -0.13 -1.37 -0.41 -0.37 0.88 0.31 -1.44 -1.36 -0.74 -0.6 -0.58 -0.57
0.17 0.46 0.09 0.26 0.42 0.1 0.05 -0.04 0.06 0.23 0.05 0.05 0.29 0.12 0.67 0.38 -0.31 -0.96 -0.09 -0.51 0.24 -1.36 -0.04 0.24 0.4 -0.54 -0.44 -0.77 -0.28 -0.13 -0.39 -0.31
0.13 -0.26 -0.24 -0.11 -0.07 -0.52 -0.18 0.78 0.84 0.86 0.69 0.52 0.71 0.29 -0.31 1.15 -2.49 -1.27 1.15 -3.9 -2.54 -21.79 -1.49 -0.49 -2.16 1.34 0.02 -0.59 -0.66 -0.71 -0.39 -0.11
-0.22 -0.35 -0.22 -0.03 -0.02 0.0 0.26 0.43 0.42 0.31 0.31 0.24 -0.95 0.72 0.51 -0.37 -0.13 -0.54 -0.18 -0.96 0.17 -2.12 -0.09 -0.32 0.91 -0.11 0.07 0.13 -0.03 0.07 -0.19 -0.55
-0.48 -0.53 -0.47 -0.25 -0.13 0.04 0.01 0.11 0.18 0.06 -0.01 -0.26 -0.27 0.56 0.39 0.0 -0.0 -0.06 0.08 -2.12 0.45 -1.42 0.09 0.18 0.55 -0.1 0.39 0.23 0.05 0.2 -0.01 0.17
0.11 -0.03 0.03 0.07 -0.12 -0.0 0.25 0.32 0.54 0.74 0.43 0.59 -1.32 1.24 -0.33 -0.39 -0.51 -6.12 -0.46 -2.06 0.68 -6.57 -0.24 -0.41 0.89 -0.02 -0.51 -0.71 0.08 0.01 0.11 0.06
0.14 0.21 0.03 -0.19 -0.17 -0.21 -0.32 -0.11 0.03 0.61 0.71 0.51 0.31 0.47 -0.02 0.73 -0.67 0.61 0.08 -2.98 0.6 -3.71 0.0 0.17 -0.66 0.31 -0.86 -0.78 -0.44 -0.67 0.11 -0.05
-0.17 -1.43 0.12 -0.93 -0.41 0.5 0.82 0.85 1.07 0.44 0.48 0.04 -0.75 -0.82 -0.24 -0.73 -1.01 0.04 -0.74 - 2.01 -0.19 -1.6 -1.5 -0.8 -0.29 0.51 0.79 -0.64 -0.61 -0.63 -0.51
-1.75 -1.29 -2.51 -0.4 -0.61 -0.79 -0.86 -0.15 1.05 0.74 0.52 -0.25 -0.88 0.06 0.65 0.71 0.21 0.7 0.69 - -3.11 - 0.86 1.33 - -0.54 -0.51 -1.21 0.02 0.62 0.93 0.8
0.11 -0.08 0.66 0.44 -0.99 0.22 -0.12 1.06 0.84 0.44 0.86 0.7 -2.08 -0.56 -1.32 -2.07 -1.55 -0.17 0.45 - 1.87 - -0.58 -0.51 -1.45 0.01 0.45 -1.06 -1.86 -1.7 -0.36 1.01
-0.96 -0.8 -0.77 -0.36 -0.59 0.1 0.43 0.45 0.75 0.89 0.81 -0.06 0.04 -0.19 0.37 0.66 -1.3 0.28 -0.09 -2.67 0.03 -1.02 0.51 0.8 -1.07 -0.67 -1.28 -0.81 0.15 0.11 0.26 0.26
0.62 0.23 -0.19 -0.41 -0.5 -0.4 -0.39 -0.16 0.03 0.26 0.38 0.31 0.62 1.04 -1.25 0.95 -0.35 -0.64 -0.07 -4.46 0.7 -5.19 -0.05 -0.18 -0.64 0.21 -0.45 -0.58 0.15 -0.05 0.63 0.1
0.5 0.46 0.26 0.25 0.4 0.29 0.18 0.14 0.04 0.11 -0.05 0.04 -0.23 -0.65 -0.15 0.28 0.23 0.22 0.75 -1.67 -0.78 -0.12 0.22 0.23 -0.73 -0.64 -0.82 -0.73 0.2 0.27 -0.46 -0.59
0.16 -0.34 -0.33 -0.63 -0.63 -0.41 -0.26 0.05 -0.31 0.3 0.03 -0.12 0.26 1.0 -0.47 1.49 -0.31 -1.11 0.48 -3.53 0.93 -3.8 0.3 0.58 -0.54 0.05 -0.75 -0.55 0.27 0.03 0.22 -0.25
0.61 0.33 0.24 0.0 0.14 0.22 -0.19 -0.01 0.12 0.51 0.36 0.34 0.43 0.57 0.63 0.67 -0.86 -0.46 -0.15 -0.23 -0.17 -1.76 -0.33 -0.2 -0.11 0.2 -0.62 -0.61 -0.69 -0.1 -0.9 -0.98
0.39 -0.27 -0.68 0.88 0.09 0.52 0.7 0.31 -0.15 0.38 0.23 0.2 -1.99 0.83 1.54 -1.44 -1.96 0.94 -1.23 0.21 0.9 -2.16 -2.29 -1.77 1.12 -0.19 0.69 0.03 -6.58 -2.92 - -4.48
-0.33 0.11 0.54 0.08 0.02 -0.32 0.37 0.44 0.91 0.97 0.75 0.6 -0.63 0.21 -2.39 -1.05 -0.41 -0.9 -2.14 -1.12 0.01 -3.32 0.51 0.3 -0.19 -0.11 0.65 0.35 -0.07 -0.36 -0.53 -0.29
0.21 0.24 0.03 0.24 0.28 0.2 0.11 0.16 0.24 0.28 0.08 0.05 0.5 0.08 0.81 0.65 -0.55 -0.92 -0.0 0.03 -0.18 -1.04 -0.18 -0.06 -0.67 0.4 -0.11 -0.1 -0.56 -0.5 -0.98 -1.08
-0.4 -0.24 -0.19 -0.05 -0.4 -0.09 0.18 0.23 0.52 0.44 0.31 0.38 0.33 0.62 -0.25 1.17 -0.56 0.12 -0.18 -4.44 0.77 -1.9 0.22 0.3 -0.25 -0.25 -0.75 -0.79 -0.2 -0.32 -0.26 -0.13
0.61 0.86 0.68 0.09 0.64 0.46 -0.32 1.47 0.65 0.65 1.28 0.25 -0.14 -2.35 -3.49 -1.67 -0.71 - -0.91 - 0.37 - -0.65 -0.56 -0.53 1.04 0.62 0.55 -0.91 -0.83 -1.53 -1.86
0.26 0.36 0.87 0.36 0.09 0.22 0.87 0.56 0.26 0.5 0.78 0.45 -1.18 -1.16 1.07 -0.33 0.03 -0.8 0.38 -1.3 0.69 -1.26 -0.97 -0.57 -2.63 -0.69 -2.09 -1.17 -0.25 0.0 -0.23 -0.41
-0.73 -0.77 -1.11 -1.03 -0.32 -1.87 0.01 -0.36 -0.45 0.64 -0.2 0.17 0.26 1.05 0.12 0.51 -0.69 -0.27 0.53 -3.38 0.66 -2.26 -0.29 0.0 -2.04 0.7 0.42 0.03 0.11 0.1 1.16 0.77
0.39 0.19 -0.33 0.59 0.63 0.74 0.75 0.39 0.22 0.85 -0.27 0.98 -0.04 0.35 0.51 -0.14 -1.17 -0.45 -0.5 - 1.14 - -0.85 -1.08 -1.14 0.3 0.01 0.58 -1.41 -1.34 -1.87 -1.56
0.22 0.03 0.08 0.05 -0.1 -0.28 0.23 0.24 0.51 0.81 0.8 0.39 0.74 0.22 -0.8 0.29 0.07 -0.58 0.94 -2.21 -2.91 -0.41 -0.45 -0.41 -2.61 0.44 -0.5 0.09 -0.01 -0.05 -0.54 -0.77
-0.17 -0.55 -0.69 -0.53 -0.43 -1.15 -1.33 0.58 0.48 0.83 0.43 0.54 0.77 -1.2 -3.48 1.37 -2.55 -0.72 1.68 -7.23 -5.1 -2.05 -0.44 1.6 -0.21 1.57 -0.66 -2.43 -0.68 -1.2 -0.13 -0.76
0.3 0.33 0.43 0.58 0.46 0.31 0.29 0.45 0.61 0.49 0.37 0.26 -0.59 -0.1 0.37 -0.53 -0.53 1.07 -0.32 -3.71 0.67 -4.98 -0.52 -0.92 -1.16 -0.49 -0.67 -0.54 -0.74 -0.69 -0.03 0.34
-0.17 0.38 -0.37 0.25 -0.9 0.24 -0.02 0.25 0.71 0.52 -0.07 0.59 -0.76 -0.19 0.36 -0.71 -0.6 1.41 -0.72 -1.69 1.41 -4.58 -0.18 -1.05 -0.95 -0.11 0.41 -0.33 -1.41 -0.58 -0.62 0.59
0.16 0.03 -0.59 0.25 -0.0 -1.14 0.86 1.14 1.1 0.79 -2.75 0.36 - 0.5 2.23 - -4.13 2.15 -4.26 - -0.18 - -3.17 -4.32 - 0.21 0.87 1.3 -4.25 -4.25 - -
0.3 0.17 0.12 -0.08 0.57 0.23 0.34 0.1 0.23 0.33 0.11 -0.14 -0.29 -0.45 0.06 -0.27 -0.73 0.05 -0.32 -2.88 0.13 -2.34 -0.62 -0.36 -0.81 0.43 0.39 0.35 -0.64 -0.84 1.25 0.49
0.5 0.59 0.52 0.41 0.4 0.55 0.41 0.16 0.25 0.28 0.11 0.16 -0.26 -0.21 -0.77 -0.03 -0.41 -0.21 0.01 -0.58 0.65 -1.38 -0.34 -0.32 -0.72 -0.64 -0.17 -0.24 -0.23 -0.28 -0.27 -0.18
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0.16 -0.27 -0.26 -0.27 -0.44 -0.37 -0.02 0.28 0.74 0.98 0.9 0.8 0.61 0.07 -0.46 0.57 -1.04 -0.68 0.53 -2.58 0.57 -0.92 -0.93 -0.5 -0.86 0.7 -0.85 -0.85 -0.17 -0.29 -0.46 -0.08
-0.15 0.12 0.36 0.23 0.01 -0.14 0.41 0.26 0.57 0.54 0.59 0.18 -0.07 0.25 -2.08 -0.51 -0.09 -0.21 0.45 -0.19 -0.33 -1.86 0.0 -0.08 -0.28 0.74 -0.74 -0.6 0.05 0.12 -0.45 -0.35
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0.4 0.41 0.36 0.47 0.28 0.3 0.08 0.56 0.59 0.76 0.51 0.44 -1.09 -0.64 0.3 -0.82 -0.96 0.4 -0.72 -3.56 0.87 - -0.59 -1.2 -1.23 0.09 0.34 -0.03 -1.46 -1.79 0.22 0.86
0.24 -0.4 -0.41 -0.6 -0.29 -0.27 0.1 0.33 0.55 0.73 0.62 0.58 1.04 1.1 -2.94 0.63 -1.44 -0.46 -0.1 -7.5 -0.36 -5.6 -0.31 0.17 0.36 0.4 -0.25 -0.52 0.07 -0.11 0.01 -0.46
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0.11 0.01 -0.07 0.25 0.36 0.29 0.0 0.14 0.36 0.35 0.42 0.03 -0.02 0.15 0.73 0.17 -0.37 -0.41 0.01 -2.05 0.34 0.24 -0.26 -0.15 -0.23 -0.53 -0.24 -0.29 -0.3 -0.14 -0.5 -0.36
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0.48 0.37 0.2 0.11 -0.14 -0.11 0.03 0.06 0.44 0.6 0.52 0.68 -0.06 0.0 0.82 0.08 -0.53 -0.01 0.13 -0.44 1.05 -2.36 -0.56 -0.44 0.44 -1.78 -1.89 -1.87 -0.29 -0.27 -0.62 -0.36
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-0.24 0.05 0.28 0.46 0.41 0.27 0.42 0.4 0.37 0.06 0.19 -0.06 -0.88 0.1 0.58 -0.58 -0.32 -0.94 -0.37 -0.26 0.63 -0.19 -0.35 -0.35 0.93 -0.31 0.1 -0.09 -0.44 -0.44 -0.87 -1.17
-0.01 -0.14 -0.17 -0.26 -0.27 0.04 -0.06 -0.1 0.14 -0.0 0.05 -0.2 -0.47 0.6 -0.12 0.17 -0.17 -0.2 0.28 -0.78 0.84 -3.98 0.19 -0.05 -1.41 0.16 0.54 0.4 -0.07 -0.07 0.37 0.44
0.34 0.61 0.75 0.58 0.22 0.37 0.61 1.0 0.55 0.66 0.61 0.53 -2.53 -0.23 -1.0 -2.63 -2.32 0.5 -0.41 - 1.44 -4.28 -1.81 -1.4 0.1 0.75 -0.49 -1.43 -0.7 -1.21 -0.16 -0.37

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.