1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_87 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.09 0.08 0.07 0.09 0.06 0.08 0.05 0.07 0.06 0.09 0.06 0.13 0.15 0.05 0.01 0.11 0.11 0.17 0.09 1.0 0.57 0.64 0.1 0.12 0.31 0.15 0.07 0.1 0.13 0.13 0.12 0.15
0.13 0.09 0.08 0.11 0.09 0.13 0.12 0.15 0.12 0.17 0.13 0.15 0.17 0.15 0.09 0.19 0.07 0.1 0.18 1.0 0.35 0.72 0.11 0.13 0.11 0.1 0.09 0.05 0.12 0.12 0.2 0.21
0.05 0.04 0.04 0.04 0.07 0.08 0.09 0.09 0.07 0.09 0.07 0.05 0.12 0.06 0.12 0.1 0.09 0.2 0.08 1.0 0.23 0.64 0.1 0.11 0.09 0.14 0.16 0.1 0.08 0.07 0.1 0.15
0.25 0.28 0.29 0.3 0.29 0.31 0.31 0.32 0.35 0.33 0.34 0.28 0.39 0.27 0.68 0.43 0.47 0.48 0.51 1.0 0.61 0.66 0.42 0.48 0.51 0.34 0.19 0.24 0.4 0.41 0.27 0.23
0.18 0.22 0.19 0.18 0.18 0.2 0.17 0.2 0.23 0.17 0.2 0.19 0.09 0.1 0.18 0.12 0.16 0.14 0.11 1.0 0.15 0.96 0.13 0.12 0.07 0.19 0.21 0.32 0.12 0.11 0.16 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.15 0.53 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.32 0.38 0.37 0.32 0.4 0.53 0.36 0.46 0.35 0.4 0.38 0.29 0.5 0.37 0.56 0.5 0.26 0.12 0.49 1.0 0.58 0.88 0.33 0.35 0.25 0.46 0.36 0.4 0.26 0.31 0.16 0.12
0.11 0.12 0.13 0.16 0.21 0.2 0.13 0.09 0.11 0.11 0.11 0.09 0.03 0.02 0.34 0.06 0.21 0.18 0.07 1.0 0.13 0.48 0.33 0.35 0.17 0.07 0.12 0.14 0.1 0.13 0.08 0.06
0.06 0.05 0.07 0.06 0.1 0.08 0.09 0.07 0.11 0.06 0.07 0.05 0.17 0.08 0.59 0.22 0.09 0.07 0.15 1.0 0.06 0.56 0.06 0.02 0.02 0.02 0.02 0.05 0.06 0.06 0.09 0.07
0.09 0.05 0.04 0.05 0.08 0.07 0.04 0.06 0.07 0.06 0.04 0.07 0.25 0.05 0.04 0.19 0.09 0.16 0.13 1.0 0.2 0.52 0.13 0.15 0.22 0.09 0.04 0.05 0.08 0.1 0.09 0.09
0.11 0.08 0.01 0.0 0.0 0.31 0.05 0.03 0.0 0.17 0.12 0.05 0.62 0.08 0.0 0.23 0.01 0.0 0.04 1.0 0.01 0.48 0.08 0.15 0.0 0.01 0.06 0.0 0.02 0.03 0.0 0.01
0.08 0.12 0.14 0.13 0.19 0.27 0.28 0.27 0.19 0.16 0.11 0.1 0.1 0.05 0.53 0.12 0.11 0.1 0.18 1.0 0.19 0.5 0.1 0.12 0.39 0.18 0.48 0.5 0.09 0.12 0.06 0.07
0.1 0.13 0.1 0.11 0.11 0.13 0.12 0.12 0.13 0.13 0.12 0.12 0.22 0.16 0.3 0.24 0.09 0.07 0.13 1.0 0.18 0.64 0.1 0.11 0.26 0.49 0.32 0.34 0.08 0.08 0.08 0.08
0.13 0.15 0.13 0.17 0.16 0.18 0.17 0.18 0.18 0.14 0.17 0.14 0.18 0.29 0.34 0.2 0.12 0.11 0.16 1.0 0.3 0.71 0.16 0.18 0.31 0.1 0.16 0.16 0.14 0.15 0.1 0.1
0.26 0.3 0.31 0.33 0.31 0.3 0.37 0.35 0.32 0.3 0.3 0.28 0.06 0.1 0.25 0.13 0.36 0.41 0.31 1.0 0.22 0.64 0.22 0.19 0.66 0.34 0.46 0.4 0.32 0.31 0.26 0.26
0.14 0.14 0.14 0.11 0.08 0.16 0.11 0.12 0.17 0.19 0.13 0.13 0.13 0.18 0.21 0.19 0.07 0.12 0.18 1.0 0.17 0.37 0.12 0.15 0.37 0.13 0.19 0.2 0.09 0.11 0.1 0.13
0.01 0.01 0.0 0.07 0.05 0.02 0.05 0.02 0.0 0.01 0.03 0.08 0.01 0.01 0.09 0.0 0.0 0.05 0.27 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.02 0.01 0.03 0.01
0.34 0.41 0.43 0.38 0.51 0.53 0.44 0.48 0.41 0.42 0.39 0.33 0.51 0.43 0.64 0.54 0.35 0.28 0.54 1.0 0.22 0.72 0.43 0.45 0.72 0.42 0.35 0.37 0.32 0.38 0.23 0.26
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.03 0.0 0.02 0.18 0.09 0.26 0.41 0.14 0.11 0.25 1.0 0.78 0.75 0.13 0.18 0.68 0.07 0.08 0.14 0.11 0.19 0.0 0.02
0.02 0.09 0.2 0.09 0.05 0.03 0.06 0.06 0.04 0.04 0.06 0.03 0.15 0.05 0.11 0.15 0.18 0.09 0.21 1.0 0.11 0.38 0.18 0.21 0.1 0.05 0.14 0.02 0.2 0.34 0.17 0.04
0.06 0.06 0.11 0.05 0.1 0.17 0.12 0.12 0.16 0.07 0.16 0.07 0.54 0.19 0.23 0.46 0.2 0.11 0.46 1.0 0.57 0.64 0.28 0.32 0.35 0.1 0.3 0.18 0.29 0.26 0.2 0.22
0.04 0.04 0.08 0.06 0.03 0.05 0.06 0.07 0.09 0.07 0.11 0.07 0.18 0.06 0.12 0.18 0.11 0.16 0.18 1.0 0.12 0.6 0.16 0.19 0.34 0.12 0.1 0.09 0.1 0.13 0.08 0.14
0.04 0.03 0.04 0.04 0.04 0.04 0.06 0.05 0.07 0.02 0.05 0.05 0.25 0.12 0.32 0.14 0.04 0.01 0.1 1.0 0.16 0.33 0.01 0.02 0.25 0.01 0.03 0.06 0.03 0.04 0.03 0.04
0.06 0.07 0.06 0.09 0.09 0.08 0.09 0.07 0.05 0.03 0.08 0.05 0.03 0.08 0.37 0.03 0.09 0.0 0.15 1.0 0.06 0.26 0.08 0.07 0.33 0.19 0.31 0.17 0.1 0.11 0.04 0.03
0.06 0.19 0.06 0.03 0.34 0.0 0.0 0.0 0.1 0.37 0.03 0.23 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.39 0.88 0.0 0.0 0.31 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.12 0.11 0.11 0.11 0.1 0.1 0.1 0.09 0.08 0.08 0.09 0.18 0.15 0.29 0.15 0.13 0.14 0.15 1.0 0.44 0.31 0.14 0.14 0.54 0.07 0.13 0.13 0.13 0.14 0.13 0.12
0.12 0.13 0.11 0.12 0.14 0.15 0.14 0.11 0.1 0.07 0.08 0.08 0.2 0.14 0.4 0.24 0.17 0.16 0.22 0.89 0.23 1.0 0.17 0.18 0.1 0.36 0.56 0.57 0.12 0.12 0.07 0.07
0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.04 0.01 0.05 0.04 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.07 0.08 0.03 1.0 0.28 0.18 0.07 0.04 0.03 0.01 0.03 0.05 0.1 0.1 0.11 0.08
0.11 0.1 0.13 0.08 0.13 0.12 0.12 0.11 0.08 0.08 0.06 0.06 0.05 0.05 0.16 0.05 0.07 0.01 0.08 1.0 0.27 0.27 0.08 0.08 0.63 0.07 0.11 0.05 0.05 0.04 0.09 0.11
0.06 0.05 0.05 0.06 0.08 0.1 0.07 0.07 0.06 0.07 0.06 0.06 0.13 0.11 0.2 0.12 0.09 0.1 0.17 1.0 0.44 0.86 0.11 0.12 0.41 0.13 0.19 0.2 0.09 0.09 0.12 0.12
0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.03 0.02 0.04 0.02 0.01 0.14 0.07 0.06 0.04 0.03 0.02 0.07 1.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.01
0.22 0.18 0.19 0.18 0.23 0.25 0.29 0.24 0.22 0.2 0.19 0.16 0.17 0.26 0.64 0.17 0.2 0.02 0.27 1.0 0.47 0.61 0.2 0.21 0.3 0.27 0.34 0.3 0.2 0.21 0.2 0.23
0.03 0.05 0.04 0.04 0.06 0.03 0.05 0.03 0.01 0.01 0.04 0.03 0.06 0.03 0.09 0.04 0.03 0.05 0.08 1.0 0.25 0.74 0.04 0.04 0.61 0.08 0.07 0.05 0.02 0.05 0.01 0.02
0.06 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.07 0.1 0.19 0.08 0.04 0.03 0.0 0.02 0.33 0.02 0.03 0.1 0.05 1.0 0.07 0.53 0.13 0.07 0.14 0.36 0.15 0.38 0.07 0.18 0.12 0.05
0.04 0.12 0.09 0.13 0.07 0.2 0.29 0.06 0.0 0.12 0.05 0.05 0.01 0.19 0.47 0.04 0.05 0.03 0.02 1.0 0.0 0.0 0.01 0.12 0.18 0.04 0.0 0.29 0.05 0.08 0.16 0.04
0.04 0.03 0.03 0.07 0.06 0.07 0.05 0.01 0.04 0.08 0.06 0.04 0.01 0.0 0.2 0.02 0.04 0.05 0.05 1.0 0.02 0.46 0.01 0.02 0.06 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01 0.05 0.06
0.09 0.08 0.05 0.07 0.03 0.12 0.08 0.07 0.06 0.09 0.07 0.09 0.14 0.12 0.21 0.17 0.09 0.04 0.09 1.0 0.7 0.48 0.12 0.11 0.28 0.15 0.15 0.11 0.06 0.08 0.08 0.05
0.23 0.25 0.24 0.34 0.49 0.51 0.7 0.5 0.51 0.53 0.53 0.3 0.71 0.33 0.25 0.49 0.3 0.51 0.26 1.0 0.23 0.53 0.38 0.56 0.14 0.23 0.14 0.13 0.27 0.31 0.31 0.33
0.09 0.11 0.11 0.08 0.28 0.16 0.19 0.11 0.1 0.07 0.06 0.05 0.05 0.06 0.55 0.07 0.07 0.07 0.07 1.0 0.1 0.0 0.05 0.05 0.02 0.03 0.13 0.14 0.05 0.08 0.02 0.02
0.01 0.02 0.0 0.04 0.01 0.07 0.05 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.07 0.04 0.22 0.05 0.04 0.0 0.29 1.0 0.18 0.19 0.13 0.1 0.37 0.14 0.12 0.22 0.06 0.06 0.02 0.02
0.31 0.3 0.37 0.35 0.33 0.38 0.37 0.44 0.4 0.42 0.45 0.4 0.22 0.21 0.27 0.24 0.26 0.32 0.2 1.0 0.28 0.64 0.26 0.29 0.11 0.34 0.34 0.31 0.25 0.28 0.23 0.27
0.21 0.2 0.21 0.21 0.27 0.27 0.16 0.19 0.2 0.19 0.16 0.15 0.14 0.18 0.56 0.18 0.19 0.12 0.39 1.0 0.32 0.79 0.2 0.14 0.33 0.49 0.29 0.28 0.17 0.19 0.16 0.18
0.15 0.14 0.13 0.12 0.14 0.2 0.18 0.2 0.15 0.15 0.12 0.12 0.13 0.09 0.31 0.11 0.08 0.0 0.17 1.0 0.03 0.1 0.08 0.09 0.26 0.12 0.27 0.32 0.06 0.08 0.1 0.07
0.04 0.04 0.12 0.01 0.18 0.08 0.18 0.18 0.09 0.07 0.02 0.06 0.03 0.04 0.01 0.07 0.16 0.3 0.16 1.0 0.05 0.9 0.14 0.15 0.52 0.2 0.33 0.21 0.22 0.3 0.07 0.1
0.05 0.08 0.07 0.09 0.1 0.1 0.13 0.11 0.12 0.09 0.12 0.08 0.03 0.05 0.46 0.06 0.07 0.08 0.1 1.0 0.43 0.45 0.03 0.03 0.24 0.06 0.13 0.13 0.04 0.07 0.1 0.1
0.17 0.19 0.2 0.2 0.22 0.29 0.27 0.17 0.2 0.15 0.18 0.15 0.17 0.09 0.61 0.2 0.19 0.21 0.19 1.0 0.08 0.92 0.09 0.1 0.24 0.19 0.33 0.31 0.16 0.18 0.1 0.12
0.07 0.14 0.07 0.12 0.14 0.19 0.18 0.21 0.15 0.26 0.17 0.09 0.36 0.11 0.25 0.34 0.14 0.19 0.2 0.82 0.67 1.0 0.26 0.28 0.41 0.27 0.22 0.27 0.18 0.2 0.08 0.12
0.13 0.14 0.19 0.14 0.07 0.14 0.16 0.16 0.12 0.12 0.14 0.12 0.22 0.27 0.27 0.24 0.15 0.3 0.15 1.0 0.25 0.58 0.17 0.17 0.19 0.32 0.37 0.3 0.14 0.17 0.19 0.22
0.12 0.11 0.15 0.15 0.19 0.21 0.22 0.21 0.2 0.18 0.15 0.12 0.36 0.14 0.41 0.39 0.25 0.2 0.35 1.0 0.37 0.92 0.27 0.3 0.8 0.35 0.39 0.43 0.3 0.3 0.19 0.22
0.28 0.26 0.25 0.26 0.26 0.29 0.27 0.24 0.21 0.23 0.23 0.2 0.3 0.22 0.21 0.34 0.21 0.33 0.29 1.0 0.15 0.74 0.24 0.24 0.1 0.17 0.27 0.28 0.23 0.22 0.17 0.17
0.05 0.06 0.02 0.09 0.09 0.07 0.06 0.03 0.07 0.08 0.04 0.05 0.25 0.03 0.08 0.31 0.28 0.3 0.68 1.0 0.65 0.4 0.23 0.26 0.61 0.02 0.04 0.0 0.26 0.31 0.33 0.32
0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.13 0.04 0.3 0.02 0.07 0.47 0.27 0.8 0.06 1.0 0.4 0.17 0.4 0.26 0.12 0.0 0.03 0.0 0.17 0.34 0.38 0.39
0.03 0.04 0.03 0.04 0.03 0.05 0.06 0.03 0.07 0.02 0.02 0.04 0.06 0.02 0.07 0.06 0.05 0.08 0.04 1.0 0.1 0.66 0.06 0.05 0.09 0.03 0.03 0.04 0.04 0.05 0.02 0.02
0.11 0.07 0.07 0.1 0.09 0.11 0.09 0.1 0.11 0.12 0.1 0.12 0.21 0.12 0.18 0.21 0.12 0.17 0.21 1.0 0.35 0.85 0.13 0.15 0.16 0.13 0.1 0.08 0.17 0.16 0.13 0.17
0.27 0.25 0.26 0.31 0.38 0.36 0.27 0.23 0.27 0.29 0.29 0.28 0.46 0.14 0.21 0.52 0.25 0.12 0.32 0.83 0.41 1.0 0.23 0.24 0.12 0.23 0.13 0.12 0.21 0.19 0.13 0.14
0.13 0.14 0.13 0.16 0.13 0.18 0.18 0.14 0.15 0.15 0.13 0.14 0.32 0.17 0.28 0.31 0.28 0.39 0.25 1.0 0.2 0.33 0.28 0.32 0.51 0.17 0.24 0.3 0.24 0.22 0.21 0.25
0.01 0.01 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.12 0.04 0.19 0.15 0.11 0.17 0.1 1.0 0.39 0.57 0.09 0.09 0.3 0.02 0.03 0.07 0.1 0.11 0.07 0.07
0.09 0.15 0.18 0.16 0.16 0.28 0.1 0.18 0.06 0.09 0.11 0.08 0.07 0.08 0.06 0.09 0.08 0.22 0.1 1.0 0.05 0.0 0.09 0.13 0.05 0.06 0.19 0.24 0.06 0.11 0.03 0.07
0.21 0.25 0.25 0.35 0.44 0.33 0.36 0.28 0.31 0.29 0.27 0.25 0.54 0.3 0.31 0.42 0.25 0.2 0.28 1.0 0.5 0.86 0.36 0.37 0.07 0.17 0.12 0.1 0.2 0.21 0.2 0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)