Heatmap: Cluster_112 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo106585	0.22	0.37	0.12	0.18	0.29	0.44	0.58	0.35	0.32	0.47	0.22	0.21	0.12	0.1	0.34	0.1	0.28	0.19	0.27	0.35	0.0	0.0	0.31	0.2	0.36	0.18	1.0	0.66	0.57	0.43	0.32	0.24
Smo110343	0.18	0.22	0.23	0.55	0.79	0.77	0.35	0.28	0.34	0.19	0.23	0.17	0.17	0.13	0.14	1.0	0.81	0.29	0.51	0.57	0.09	0.03	0.51	0.38	0.21	0.67	0.29	0.5	0.39	0.42	0.31	0.09
Smo111428	0.96	0.8	0.72	0.85	0.89	0.88	0.87	0.88	0.84	0.98	0.91	0.95	0.59	0.59	0.81	0.69	0.58	0.35	0.91	0.43	0.0	0.19	0.63	0.65	0.39	0.91	1.0	0.91	0.65	0.65	0.63	0.81
Smo115473	0.42	0.48	0.49	0.59	0.61	0.59	0.7	0.62	0.71	0.62	0.53	0.49	0.57	0.42	1.0	0.57	0.47	0.43	0.62	0.32	0.0	0.12	0.56	0.53	0.03	0.65	0.7	0.66	0.57	0.54	0.49	0.48
Smo121390	0.35	0.14	0.22	0.22	0.53	0.53	0.77	0.74	0.81	0.61	0.8	0.48	0.16	0.07	0.55	0.13	0.58	0.29	0.58	0.94	0.88	0.22	0.5	0.36	0.64	0.6	0.65	0.26	0.85	1.0	0.63	0.63
Smo122531	0.63	0.6	0.57	0.62	0.57	0.64	0.59	0.6	0.65	0.62	0.62	0.59	0.58	0.77	1.0	0.66	0.48	0.42	0.47	0.65	0.2	0.12	0.51	0.53	0.16	0.35	0.33	0.4	0.47	0.52	0.38	0.37
Smo126951	0.53	0.38	0.29	0.38	0.44	0.57	0.76	0.61	0.66	0.65	0.44	0.48	0.17	0.11	0.32	0.26	0.51	0.45	0.77	0.73	0.05	0.01	0.45	0.38	0.04	0.16	0.25	0.24	0.85	0.84	1.0	0.78
Smo128850	0.4	0.51	0.55	0.51	0.55	0.55	0.77	0.63	0.56	0.61	0.38	0.27	0.43	0.29	1.0	0.4	0.21	0.08	0.61	0.75	0.17	0.29	0.24	0.25	0.25	0.54	0.52	0.5	0.29	0.29	0.49	0.49
Smo137481	0.79	0.43	0.23	0.29	0.35	0.58	0.62	0.77	0.66	0.71	0.57	0.73	0.11	0.09	0.29	0.17	0.37	0.45	0.34	0.62	0.19	0.53	0.28	0.23	0.1	0.35	0.69	0.84	0.69	0.72	1.0	0.68
Smo17109	0.42	0.26	0.24	0.31	0.28	0.29	0.17	0.19	0.19	0.35	0.18	0.35	0.07	0.18	0.05	0.29	0.24	0.39	1.0	0.69	0.0	0.0	0.33	0.45	0.27	0.42	0.33	0.36	0.25	0.36	0.52	0.66
Smo175493	0.83	0.84	0.8	0.81	0.79	0.81	0.71	0.75	0.84	0.82	0.77	0.81	0.67	0.81	0.83	1.0	0.51	0.35	0.85	0.52	0.36	0.53	0.58	0.65	0.35	0.58	0.64	0.69	0.6	0.67	0.48	0.49
Smo182522	0.69	0.61	0.66	0.72	0.7	0.71	0.7	0.83	0.81	0.8	0.74	0.75	0.87	0.45	0.73	0.82	0.45	0.24	0.79	0.56	0.09	0.11	0.55	0.59	0.23	1.0	0.73	0.78	0.5	0.51	0.51	0.51
Smo231593	0.13	0.18	0.11	0.2	0.12	0.26	0.27	0.25	0.25	0.19	0.14	0.13	0.01	0.01	0.04	0.07	0.36	0.16	0.65	0.49	0.03	0.21	0.14	0.08	0.22	0.39	0.7	1.0	0.47	0.52	0.11	0.06
Smo232939	0.57	0.77	0.87	0.83	1.0	0.84	0.8	0.75	0.94	0.72	0.72	0.59	0.57	0.76	0.95	0.73	0.52	0.32	0.38	0.79	0.13	0.29	1.0	0.96	0.34	0.41	0.43	0.58	0.4	0.53	0.31	0.33
Smo233590	0.52	0.81	0.96	1.0	0.86	0.81	0.77	0.77	0.59	0.67	0.72	0.54	0.26	0.1	0.2	0.09	0.63	0.37	0.59	0.4	0.13	0.25	0.67	0.58	0.1	0.58	0.69	0.78	0.53	0.53	0.3	0.23
Smo27471	0.29	0.26	0.34	0.27	0.37	0.29	0.31	0.27	0.32	0.4	0.41	0.31	0.89	0.13	0.33	0.6	0.22	0.69	0.17	0.37	0.02	0.12	1.0	0.72	0.02	0.32	0.14	0.12	0.26	0.27	0.28	0.28
Smo39115	0.47	0.47	0.35	0.45	0.53	0.51	0.45	0.46	0.58	0.57	0.42	0.5	1.0	0.52	0.13	0.74	0.53	0.71	0.62	0.68	0.03	0.0	0.74	0.73	0.14	0.73	0.56	0.63	0.71	0.62	0.42	0.53
Smo39198	0.45	0.39	0.47	0.47	0.39	0.4	0.35	0.4	0.59	0.39	0.38	0.43	0.59	0.55	0.4	0.84	0.52	0.71	0.66	0.56	0.13	0.3	0.93	1.0	0.15	0.29	0.17	0.19	0.58	0.56	0.53	0.56
Smo403121	0.54	0.5	0.48	0.48	0.45	0.46	0.48	0.42	0.41	0.5	0.48	0.45	1.0	0.11	0.29	0.52	0.4	0.25	0.5	0.91	0.21	0.15	0.61	0.59	0.38	0.84	0.66	0.76	0.44	0.44	0.37	0.31
Smo403340	0.45	0.38	0.45	0.53	0.64	0.47	0.53	0.62	0.39	0.43	0.36	0.35	0.34	0.29	0.34	0.62	0.34	0.17	1.0	0.6	0.03	0.01	0.67	0.66	0.35	0.51	0.58	0.55	0.56	0.56	0.46	0.4
Smo404656	0.3	0.29	0.18	0.15	0.19	0.35	0.5	0.58	0.59	0.37	0.39	0.42	0.16	0.08	0.23	0.23	0.58	1.0	0.48	0.92	0.79	0.02	0.59	0.51	0.82	0.45	0.84	0.73	0.72	0.88	0.77	0.75
Smo405193	0.57	0.44	0.35	0.57	0.5	0.56	0.5	0.7	0.78	0.63	0.61	0.59	0.89	0.72	0.74	0.7	0.58	0.76	0.65	0.43	0.14	0.09	0.59	0.71	0.15	0.36	0.4	0.39	0.76	0.71	0.99	1.0
Smo405651	0.6	0.63	0.69	0.79	1.0	0.81	0.65	0.75	0.79	0.7	0.67	0.58	0.73	0.58	1.0	0.88	0.6	0.35	0.94	0.8	0.09	0.05	0.72	0.73	0.13	0.95	0.81	0.91	0.67	0.64	0.44	0.5
Smo412438	0.36	0.41	0.42	0.42	0.55	0.43	0.48	0.48	0.51	0.5	0.62	0.52	0.57	0.5	1.0	0.5	0.32	0.42	0.58	0.27	0.15	0.0	0.45	0.61	0.23	0.8	0.69	0.65	0.35	0.41	0.24	0.45
Smo414649	0.48	0.48	0.43	0.57	0.56	0.57	0.61	0.68	0.63	0.64	0.59	0.61	0.57	0.43	0.68	0.66	0.33	0.2	0.55	0.24	0.19	0.3	0.45	0.53	0.49	1.0	0.58	0.59	0.43	0.42	0.32	0.31
Smo417941	0.1	0.23	0.11	0.24	0.07	0.09	0.25	0.27	0.11	0.15	0.1	0.12	0.04	0.07	0.02	0.03	0.41	0.9	0.11	1.0	0.69	0.0	0.19	0.04	0.54	0.05	0.18	0.21	0.34	0.32	0.57	0.3
Smo418321	0.43	0.74	0.32	0.46	0.28	0.13	0.27	0.59	0.66	0.92	0.57	0.38	0.42	0.76	0.66	0.25	0.16	0.17	0.27	1.0	0.4	0.1	0.11	0.12	0.33	0.31	0.65	0.38	0.08	0.08	0.1	0.08
Smo418423	0.93	0.74	0.79	0.79	0.87	0.72	0.64	0.83	0.87	0.99	0.96	0.84	0.8	0.98	0.57	0.81	0.59	0.5	0.87	1.0	0.37	0.51	0.74	0.81	0.25	0.95	0.64	0.62	0.51	0.6	0.57	0.71
Smo426565	0.78	0.72	0.84	0.8	0.86	0.95	0.99	0.95	0.76	0.84	0.93	0.71	0.63	0.7	1.0	0.81	0.61	0.57	0.9	0.64	0.14	0.85	0.79	0.8	0.37	0.96	0.91	0.78	0.71	0.72	0.58	0.61
Smo427043	0.5	0.62	0.57	0.64	0.78	0.83	0.75	0.77	0.82	0.5	0.56	0.49	0.72	0.78	0.98	0.85	0.52	0.49	0.94	1.0	0.34	0.0	0.69	0.7	0.16	0.56	0.7	0.68	0.58	0.57	0.52	0.6
Smo430576	0.89	0.75	0.77	0.78	0.6	0.63	0.64	0.91	0.79	1.0	1.0	0.97	0.03	0.04	0.47	0.07	0.68	0.68	0.28	0.67	0.16	0.79	0.21	0.14	0.45	0.78	0.59	0.86	0.6	0.65	0.65	0.73
Smo431757	0.51	0.67	0.3	0.52	0.42	0.72	0.95	0.91	0.99	0.82	0.66	0.67	0.3	0.35	0.63	0.3	1.0	0.68	0.47	0.93	0.06	0.33	0.75	0.67	0.19	0.43	0.61	0.45	0.84	0.76	0.85	0.77
Smo437980	0.69	0.62	0.6	0.61	0.59	0.71	0.77	0.82	0.73	0.69	0.74	0.63	0.52	0.36	0.43	0.49	0.37	0.14	0.45	0.28	0.13	0.08	0.4	0.47	0.22	0.78	1.0	0.79	0.35	0.32	0.97	0.49
Smo438686	0.55	0.54	0.64	0.64	0.58	0.61	0.58	0.61	0.58	0.68	0.55	0.51	0.47	0.32	0.34	0.48	0.44	0.36	0.43	0.35	0.11	0.06	0.51	0.54	0.49	0.82	1.0	0.81	0.38	0.39	0.52	0.54
Smo442125	0.74	0.76	0.97	0.76	1.0	0.82	0.73	0.76	0.78	0.74	0.88	0.77	0.76	0.89	0.91	0.84	0.58	0.4	0.77	0.71	0.14	0.36	0.91	0.79	0.43	0.93	0.57	0.59	0.57	0.58	0.45	0.48
Smo443322	0.69	0.66	0.63	0.77	0.65	0.78	0.59	0.64	0.53	0.67	0.67	0.66	0.72	0.5	1.0	0.85	0.33	0.33	0.55	0.68	0.09	0.02	0.42	0.49	0.39	0.37	0.54	0.44	0.37	0.34	0.39	0.4
Smo62636	0.25	0.2	0.25	0.24	0.16	0.45	0.83	0.72	0.53	0.63	0.29	0.38	0.17	0.13	0.5	0.26	0.42	0.38	0.52	0.58	0.15	0.16	0.32	0.31	0.3	0.43	1.0	0.92	0.56	0.72	0.72	0.55
Smo63609	0.66	0.72	0.8	0.84	0.92	0.82	0.67	0.52	0.67	0.63	0.73	0.62	1.0	0.72	0.95	0.83	0.59	0.55	0.93	0.63	0.21	0.25	0.52	0.71	0.17	0.32	0.24	0.25	0.38	0.45	0.28	0.3
Smo640	0.24	0.33	0.26	0.39	0.5	0.46	0.41	0.5	0.53	0.43	0.45	0.28	0.43	0.22	1.0	0.46	0.27	0.29	0.58	0.21	0.01	0.05	0.36	0.43	0.18	0.58	0.62	0.65	0.31	0.42	0.25	0.31
Smo66964	0.54	0.48	0.59	0.68	0.72	0.77	0.62	0.71	0.62	0.66	0.56	0.49	0.5	0.54	0.29	0.67	0.7	0.59	0.9	0.51	0.04	0.01	0.79	0.58	0.41	0.65	0.97	1.0	0.78	0.79	0.48	0.53
Smo75495	0.67	0.77	0.81	0.81	0.91	0.89	0.89	0.92	0.91	0.8	0.74	0.67	0.44	0.65	0.55	0.63	0.79	0.55	0.8	0.72	0.28	0.12	0.78	0.66	0.39	0.57	0.97	1.0	0.71	0.73	0.4	0.37
Smo80187	0.35	0.42	0.34	0.37	0.58	0.45	0.62	0.45	0.48	0.39	0.57	0.36	0.05	0.1	0.03	0.23	0.23	0.26	1.0	0.49	0.0	0.02	0.89	0.91	0.99	0.32	0.49	0.52	0.43	0.31	0.22	0.2
Smo81794	0.5	0.64	0.58	0.78	0.89	0.92	0.73	0.64	0.73	0.68	0.67	0.54	0.47	0.64	1.0	0.92	0.47	0.31	0.55	0.41	0.04	0.02	0.81	0.58	0.07	0.45	0.37	0.43	0.41	0.45	0.39	0.4
Smo82465	0.56	0.7	0.45	0.7	0.97	0.96	0.74	0.89	1.0	0.86	0.71	0.67	0.67	0.79	0.83	0.81	0.73	0.54	0.58	0.75	0.54	0.34	0.9	0.76	0.64	0.35	0.63	0.69	0.62	0.67	0.42	0.38
Smo84427	0.16	0.1	0.49	0.35	0.2	0.29	0.22	0.19	0.08	0.11	0.09	0.13	0.33	0.13	0.01	0.3	0.58	0.14	0.52	1.0	0.0	0.0	0.68	0.32	0.25	0.52	0.48	0.28	0.49	0.28	0.75	0.31
Smo87193	0.48	0.34	0.45	0.33	0.29	0.32	0.35	0.48	0.5	0.45	0.64	0.82	0.34	0.21	0.26	0.31	0.39	0.56	0.44	0.57	0.56	0.19	0.38	0.36	0.99	0.79	1.0	0.91	0.6	0.63	0.63	0.62
Smo89456	0.85	0.96	0.82	0.94	0.82	0.88	0.87	0.84	0.85	0.87	0.8	0.8	0.87	0.67	1.0	0.95	0.62	0.4	0.96	0.71	0.22	0.24	0.72	0.8	0.37	0.78	0.91	0.86	0.64	0.66	0.69	0.61
Smo90398	0.93	0.99	0.75	0.86	0.7	0.56	0.82	0.5	0.81	0.9	0.74	0.8	0.04	0.03	0.22	0.04	0.81	0.47	0.73	1.0	0.2	0.04	0.26	0.15	0.64	0.52	0.32	0.36	0.75	0.72	0.95	0.96
Smo92207	0.76	0.79	0.68	0.81	0.93	1.0	0.75	0.7	0.75	0.82	0.67	0.67	0.82	0.63	0.82	0.89	0.65	0.4	0.78	0.38	0.15	0.25	0.74	0.7	0.42	0.46	0.57	0.64	0.62	0.62	0.55	0.54
Smo97896	0.54	0.5	0.45	0.44	0.46	0.52	0.48	0.48	0.53	0.56	0.56	0.5	1.0	0.74	0.69	0.84	0.42	0.79	0.61	0.62	0.12	0.19	0.79	0.81	0.24	0.64	0.41	0.36	0.47	0.46	0.52	0.64

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)