Heatmap: Cluster_211 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo102916	0.07	0.06	0.34	0.5	0.55	0.7	0.34	0.17	0.04	0.07	0.17	0.24	-0.58	-1.32	-1.28	-0.52	0.03	0.04	-0.46	-6.65	-1.44	-0.98	0.59	0.2	1.1	-0.03	-0.36	-0.53	0.09	0.15	0.01	0.13
Smo104906	-0.08	0.31	0.27	0.39	0.26	0.19	0.26	-0.04	-0.03	-0.1	-0.15	-0.03	-1.76	-1.46	-1.94	-0.45	0.25	-0.06	0.6	-4.63	-2.97	-7.82	-0.21	-0.44	-0.09	1.42	1.11	1.25	0.12	0.19	-0.23	-0.59
Smo110074	-0.1	0.11	0.29	0.33	0.36	0.6	-0.1	-0.07	-0.05	-0.31	-0.34	-0.47	0.14	0.23	-0.15	0.35	0.52	0.37	0.45	-4.03	-3.24	-5.17	0.86	0.68	-2.29	-0.78	-0.04	0.37	0.17	0.47	-0.09	-0.17
Smo111765	0.11	-0.65	-0.6	-0.3	-0.2	-0.28	0.08	0.31	0.58	0.24	0.45	0.13	-0.12	-0.22	0.36	0.04	-0.13	-0.49	0.32	-1.03	0.04	-1.36	0.02	0.05	-2.22	0.61	0.24	-0.32	0.26	0.31	0.25	0.5
Smo118063	-0.09	-0.06	-0.13	-0.15	0.04	-0.05	0.04	0.12	-0.05	-0.02	0.07	-0.1	-0.24	0.38	0.43	0.07	-0.36	-0.37	0.38	-1.36	-1.28	-1.59	-0.12	-0.19	0.16	0.72	0.94	0.89	-0.26	-0.3	-0.13	-0.26
Smo118982	-0.25	-0.15	-0.14	-0.03	0.0	-0.03	0.17	0.15	0.2	0.23	0.22	0.08	-0.06	-0.0	-0.22	-0.13	-0.39	-0.62	0.33	-2.53	-1.17	-2.15	0.47	0.79	0.45	0.76	0.48	0.74	-0.22	-0.13	-0.48	-0.64
Smo127964	0.04	0.1	-0.3	-0.17	0.04	-0.17	-0.64	0.36	0.14	0.59	0.23	0.33	-1.84	0.08	-0.37	0.48	-2.13	-1.21	0.78	-5.0	-6.54	-2.77	-1.44	-0.54	1.28	2.0	1.59	0.83	-1.8	-1.93	-2.01	-2.52
Smo140962	0.33	0.11	0.02	0.02	0.06	0.04	-0.09	0.03	0.06	0.13	0.06	0.01	-0.3	-0.96	-1.14	-0.21	-0.18	-0.21	0.19	-2.1	-0.82	-4.21	-0.03	0.09	0.66	0.17	0.53	0.55	-0.07	0.07	0.77	0.74
Smo143846	-0.06	-0.29	-0.5	-0.04	-0.05	-0.03	-0.14	0.08	0.22	0.12	0.22	-0.02	-0.28	-0.26	-0.14	-0.05	-0.41	-0.46	0.58	-2.8	-2.1	-2.83	0.23	0.37	-0.94	0.68	0.75	0.6	-0.17	-0.05	0.82	0.86
Smo147913	0.13	0.24	0.07	0.11	0.19	0.14	0.01	-0.18	-0.04	0.01	-0.01	-0.02	-0.22	-0.2	-1.93	0.29	-1.09	-0.91	0.93	-4.37	-2.66	-6.41	-0.54	-0.36	-1.23	1.28	0.83	0.68	-0.09	-0.31	1.09	0.67
Smo147933	0.69	0.81	0.19	0.07	-0.07	-0.41	-0.67	-0.51	-0.46	-0.32	-0.25	0.08	0.53	0.41	-1.12	0.69	-0.74	-0.33	1.02	-3.47	-2.6	-7.69	-1.26	-0.8	0.19	1.96	0.55	0.75	-0.71	-0.47	-1.49	-0.77
Smo148418	-0.15	0.08	0.16	0.26	0.33	0.32	0.2	0.05	0.02	-0.13	-0.24	-0.38	-0.14	-0.01	-0.6	0.19	0.02	-0.45	0.37	-2.53	-0.95	-3.18	0.17	0.12	-0.45	0.49	0.94	0.99	-0.07	-0.04	-0.17	-0.17
Smo149210	0.54	0.4	-0.07	-0.31	-0.27	-0.59	-0.64	-0.55	-0.25	-0.4	-0.31	-0.29	-0.31	-0.46	-1.92	0.87	-1.37	-0.14	1.54	-5.6	-1.23	-6.93	-0.66	-0.53	-1.05	1.8	0.85	0.8	-0.14	-0.16	0.23	0.41
Smo150195	-0.02	0.0	0.1	0.16	0.13	0.1	0.04	0.29	0.43	0.48	0.39	0.16	-0.43	0.05	-0.13	-0.43	-0.3	-0.77	-0.37	-1.59	-0.85	-2.25	0.38	0.27	0.74	0.95	0.02	0.23	-0.21	-0.13	-0.34	-0.57
Smo165705	-0.01	-0.33	-0.33	-0.52	-0.99	-0.89	-0.06	0.5	0.45	0.5	0.4	0.11	-1.51	-3.82	-4.61	0.5	-0.01	0.06	1.31	-1.56	-0.34	-8.18	0.15	0.09	0.43	1.57	-0.6	-0.64	0.5	0.42	0.18	-0.09
Smo172529	-0.12	-0.41	-0.18	-0.25	-0.18	-0.11	-0.4	0.13	0.1	0.1	0.22	-0.11	0.26	-0.01	-0.2	0.36	-0.24	-0.59	0.34	-1.04	0.1	-2.3	0.42	0.64	0.7	0.95	0.07	-0.05	-0.05	-0.08	-0.52	-0.46
Smo173629	-0.08	-0.39	-0.23	-0.19	0.15	0.13	0.16	0.49	0.6	0.66	0.53	0.42	-0.01	0.27	0.19	-0.03	-0.48	-0.46	0.05	-1.2	-0.19	-1.0	-0.17	0.09	-0.16	0.37	0.08	0.16	-0.04	-0.09	-0.84	-0.83
Smo179756	-0.49	-0.37	-0.08	0.06	0.06	-0.03	0.39	0.63	0.45	0.4	0.16	-0.29	-0.2	0.39	-0.13	0.23	-0.24	-0.76	0.08	-6.76	-3.33	-6.58	-0.33	-0.28	-2.42	0.7	0.88	0.93	0.06	0.16	0.54	0.44
Smo230356	0.24	0.28	0.5	0.35	0.14	0.27	0.13	0.26	0.11	0.21	0.23	0.23	-0.22	-0.57	-0.42	-0.3	-0.43	-0.74	0.48	-1.55	0.22	-2.63	-0.24	-0.27	0.42	1.0	-0.0	-0.06	0.0	-0.01	-0.72	-0.62
Smo231563	-0.16	-0.25	-0.42	-0.05	0.09	-0.29	0.04	0.76	0.67	0.61	0.71	0.35	0.25	0.22	0.3	0.37	-0.39	-0.72	0.41	-2.21	-0.23	-0.69	-0.02	0.13	-0.92	0.16	-0.19	-0.53	0.06	0.01	-0.74	-0.46
Smo234236	-0.11	-0.08	-0.02	0.02	0.17	0.01	0.11	0.43	0.43	0.38	0.19	0.11	-0.23	-0.49	-0.34	0.22	-0.03	-0.74	0.44	-1.98	-1.1	-0.84	0.19	0.24	0.38	0.57	-0.17	-0.05	0.26	0.19	-0.16	-0.36
Smo234911	0.06	0.01	0.04	0.37	0.27	0.24	0.1	-0.01	0.48	0.45	0.37	0.19	-0.43	-0.05	-0.81	0.02	-0.49	-0.64	0.44	-3.02	-0.07	-4.72	0.59	0.72	-0.98	0.85	0.26	0.54	-0.45	-0.28	-1.06	-0.45
Smo267465	0.27	0.22	0.1	0.12	0.29	0.31	-0.17	-0.01	0.06	-0.1	-0.17	-0.29	0.16	-0.44	-1.68	0.47	0.2	0.67	0.43	-5.92	-2.6	-5.29	0.95	0.94	-2.07	0.46	0.03	0.13	0.13	0.26	-0.18	-0.2
Smo270214	-0.01	-0.01	0.0	0.09	0.13	0.02	0.04	0.24	0.24	0.28	0.17	0.2	-0.26	0.45	0.11	-0.43	-0.27	-0.52	0.23	-2.08	-0.29	-2.08	0.01	0.16	-0.25	1.01	0.42	0.37	-0.2	-0.15	-0.37	-0.39
Smo270329	-0.23	-0.33	-0.2	-0.17	-0.04	-0.16	-0.14	0.2	0.41	0.49	0.52	0.37	0.25	-0.37	-0.01	0.31	-0.35	-0.73	0.06	-1.88	-0.42	-1.95	-0.03	0.31	0.71	0.77	-0.31	-0.19	0.15	0.13	-0.11	-0.13
Smo410232	-0.08	-0.28	-0.41	-0.08	0.07	-0.03	0.13	0.28	0.34	0.01	0.03	-0.0	-0.61	-0.3	-0.53	-0.21	-0.05	-0.0	0.38	-10.9	-2.58	-5.95	-0.24	-0.2	-0.6	0.93	0.93	0.85	0.2	0.18	0.7	0.64
Smo419336	0.33	0.27	0.61	0.36	0.47	0.53	0.49	0.61	0.54	0.51	0.23	0.34	-4.32	-4.08	-3.71	-3.41	-0.83	0.19	0.54	-2.82	-0.51	-2.25	0.18	0.16	0.17	0.96	0.58	-0.02	-0.48	-0.57	-0.37	0.27
Smo422623	0.04	-0.5	-0.56	-0.31	-0.21	-0.73	-0.36	-0.24	-0.09	-0.2	0.36	0.06	-0.61	-2.16	-0.92	-0.03	0.14	-0.06	0.78	-1.46	-0.16	0.4	0.34	0.35	0.11	1.26	-0.09	0.15	0.13	0.37	0.29	0.2
Smo423173	-0.27	-0.05	-0.01	-0.03	0.09	0.07	0.11	0.06	0.07	0.02	-0.2	-0.4	-0.33	-0.21	-0.16	0.48	-0.38	-0.04	0.8	-2.73	-1.69	-3.36	-0.58	-0.42	-0.42	1.21	0.6	0.75	0.17	0.31	0.08	0.27
Smo426330	0.03	-0.25	-0.45	-0.2	-0.22	-0.16	-0.25	-0.01	0.04	-0.3	0.43	0.19	0.16	-1.07	-1.31	0.47	0.27	-0.25	0.34	-3.4	-0.22	-0.39	0.69	0.65	0.3	0.69	-0.5	-0.46	0.28	0.17	0.41	0.12
Smo427724	-0.29	-0.52	-0.32	-0.12	-0.21	-0.1	0.08	0.48	0.35	0.38	0.21	0.05	-0.38	-0.94	-0.74	-0.02	-0.25	-0.58	-0.47	-2.67	-0.05	-1.41	0.23	0.33	1.04	0.54	0.59	0.61	0.0	0.03	0.27	-0.06
Smo43841	0.48	0.4	0.09	0.09	-0.04	-0.21	-0.38	0.24	-0.07	0.25	0.04	0.25	0.24	0.68	-2.8	0.27	-1.26	-2.03	0.34	-2.23	-0.45	-	-1.61	-1.87	0.4	2.22	0.83	0.8	-0.79	-0.91	-1.3	-1.36
Smo438663	-0.25	-0.07	-0.09	-0.13	0.07	0.12	0.02	0.2	0.26	0.23	0.21	-0.07	0.27	-0.11	0.02	0.26	-0.38	-0.84	0.19	-0.47	-1.03	-0.82	0.23	0.41	0.09	1.0	0.49	0.69	-0.29	-0.31	-1.33	-1.34
Smo440557	0.36	0.48	0.28	0.26	-0.39	-1.12	-1.27	-1.95	-2.2	-2.13	-2.03	-1.11	0.23	-1.77	-2.86	0.26	0.5	0.22	1.79	-3.82	-1.48	-9.12	0.2	0.76	-1.3	2.06	-0.85	-0.84	0.24	0.33	0.81	0.9
Smo441645	-0.08	0.02	0.11	0.21	0.33	0.23	0.38	0.48	0.22	0.15	0.16	0.04	-0.02	0.1	0.12	0.13	-0.25	-0.84	-0.03	-5.39	-2.65	-2.0	-0.22	-0.31	-0.17	0.79	0.88	0.98	-0.11	-0.02	-0.68	-0.78
Smo441764	0.1	-0.12	-0.3	-0.03	0.19	-0.06	-0.12	0.16	0.18	0.18	0.03	0.24	0.05	-0.28	-0.46	0.03	-0.12	-0.48	0.55	-1.42	0.5	-2.33	0.2	0.27	-0.06	0.66	0.16	-0.16	0.23	0.1	-0.14	-0.21
Smo441904	-0.58	-0.36	-0.19	0.22	0.46	0.07	0.07	0.36	-0.3	-0.44	-0.43	-0.56	0.08	-0.73	-4.42	1.04	-0.67	-1.54	0.49	-4.54	-2.79	-8.1	-0.52	-0.48	0.06	1.9	1.32	1.34	-0.06	-0.06	-0.43	-0.81
Smo442281	-0.3	-0.37	-0.1	0.11	0.44	0.48	0.26	0.38	0.04	0.09	0.06	-0.1	-0.97	-2.76	-2.86	-0.15	0.24	-0.61	0.51	-1.09	-2.07	-	0.14	-0.39	-0.07	0.72	0.72	0.99	-0.06	-0.38	0.95	0.74
Smo442676	0.45	0.47	0.42	0.25	0.39	0.5	0.04	0.07	0.18	0.12	0.23	-0.04	-0.79	-1.94	-1.65	-0.07	0.2	-0.44	-0.09	-1.98	-1.87	-2.56	0.26	0.07	-0.69	-0.34	0.34	0.33	0.53	0.37	0.51	0.65
Smo443883	0.26	-0.3	-0.54	-0.35	-0.3	0.2	-0.16	-0.01	-0.11	0.17	0.06	0.12	0.27	-0.65	-1.36	0.58	-0.55	-0.01	-0.01	-	-2.05	-5.93	-0.31	-0.46	-0.57	1.75	1.32	1.17	-0.07	-0.04	-0.42	-0.23
Smo446907	-0.02	-0.65	-0.46	-0.55	-0.3	-0.16	0.22	0.1	0.38	0.58	0.3	0.29	-0.55	-0.32	-0.37	0.18	-0.25	-0.64	0.47	-0.98	-0.05	-2.48	-0.07	0.1	-0.28	0.38	0.63	0.5	0.48	0.59	-0.18	-0.04
Smo448268	0.33	0.61	0.95	0.43	0.63	0.72	0.33	0.57	0.64	0.66	0.71	0.38	-7.1	-10.74	-10.69	-6.2	0.25	0.0	0.14	-	-4.55	-	0.33	-0.69	0.94	-0.77	-0.84	-1.5	0.37	0.17	0.78	0.2
Smo49619	0.14	-0.34	0.13	-0.28	-0.5	-0.63	0.1	0.63	0.61	0.74	0.59	0.49	-1.36	-1.24	-1.85	-0.04	-0.49	0.23	0.02	-0.42	-0.32	-3.18	0.02	0.1	0.01	1.08	-0.65	-0.49	0.47	0.46	0.16	0.07
Smo52537	0.11	-0.39	-1.09	-0.98	-0.44	-0.18	-0.02	0.42	0.09	0.52	0.21	0.16	-0.43	-2.25	-1.84	0.15	-0.01	-0.03	0.19	-	-6.98	-1.89	0.26	0.2	0.06	0.92	0.17	0.12	0.21	-0.09	1.4	1.32
Smo54463	0.16	0.19	0.28	0.12	0.11	0.27	0.19	0.36	0.02	0.04	0.15	-0.03	-0.74	-1.03	-0.94	0.19	-0.12	-0.31	0.38	-6.61	-1.95	-1.97	-0.35	-0.54	0.16	0.6	0.89	0.73	-0.03	-0.08	0.64	0.3
Smo54652	-0.1	0.09	0.21	0.19	0.21	0.4	0.26	0.26	0.37	0.47	0.43	0.27	-0.29	-0.81	-1.33	-0.08	0.34	-0.8	0.69	-1.49	-0.13	-1.45	0.34	0.27	-0.23	-0.17	-0.11	0.16	0.22	0.3	-0.78	-0.86
Smo54701	-0.13	-0.0	0.06	0.17	0.33	0.32	0.06	0.32	0.12	0.08	-0.0	-0.09	0.46	-0.61	-1.04	0.79	-0.2	-0.91	0.22	-1.64	-0.33	-2.53	-0.1	0.08	0.35	0.98	0.22	0.68	0.0	-0.06	-0.79	-1.31
Smo62955	0.06	-0.05	0.08	0.2	0.2	0.33	-0.19	-0.09	0.15	-0.0	-0.07	-0.24	-0.36	-0.09	-1.32	0.22	0.07	-0.45	0.19	-1.77	-2.52	-7.19	0.81	0.47	0.1	0.83	0.63	0.76	-0.12	0.0	-0.1	-0.17
Smo64025	0.0	0.09	0.31	0.31	0.6	0.56	0.29	0.22	-0.01	-0.14	-0.13	-0.32	0.11	0.19	-1.95	0.34	0.32	-0.44	0.26	-8.94	-3.55	-6.45	0.7	0.59	-2.17	-0.06	0.67	0.81	-0.09	-0.2	0.09	-0.13
Smo74927	-0.27	-0.42	-0.1	-0.04	0.11	-0.04	0.02	0.44	0.4	0.39	0.4	0.03	0.35	-0.36	-0.3	0.45	0.03	-0.51	0.38	-1.76	-0.46	-0.14	0.15	0.29	-0.47	0.62	-0.24	0.13	0.23	0.2	-0.8	-1.07
Smo75008	-0.11	0.03	-0.27	-0.01	0.04	-0.08	0.04	0.66	0.53	0.22	0.33	0.28	-1.04	-1.03	-0.3	-0.05	0.01	-0.86	0.51	-5.38	0.39	-1.25	0.08	-0.12	-1.96	0.98	-0.02	-0.35	0.31	0.26	0.43	0.38
Smo75049	0.14	-0.57	-0.53	-0.34	-0.46	-0.62	-0.02	0.32	0.52	0.56	0.52	0.37	0.15	-0.1	-0.53	0.15	-0.35	-2.41	0.49	-2.27	-0.16	-2.4	0.39	0.22	-0.06	1.03	-0.47	-0.36	0.51	0.45	0.11	0.19
Smo75074	0.56	0.27	-0.72	-0.9	-0.4	-0.95	-1.59	-1.47	-1.7	-1.66	-1.45	-0.6	-1.98	-0.18	-2.55	0.24	-1.55	0.26	1.82	-3.3	-1.72	-7.85	-0.78	0.07	0.4	1.19	1.28	1.23	-0.49	-0.45	1.41	1.3
Smo77428	-0.16	0.0	0.24	0.39	0.22	0.1	0.25	0.51	0.33	0.31	0.23	0.12	0.44	0.37	-0.06	0.31	-0.28	-1.08	-0.72	-4.09	-3.53	-5.29	-0.2	0.08	-0.91	0.47	0.57	0.49	-0.39	-0.18	0.5	0.36
Smo78058	-0.08	-0.51	-0.05	0.17	-0.18	-0.28	0.24	0.84	0.82	1.0	0.77	0.39	-1.01	-0.94	-2.74	-2.14	-0.41	-0.96	-1.79	-1.65	-0.2	-6.38	1.14	0.32	0.27	1.34	-0.07	0.03	0.04	-0.14	-0.4	-0.33
Smo80357	0.03	-0.29	-0.03	0.23	0.51	0.32	0.34	0.53	0.74	0.67	0.77	0.31	-1.9	-1.05	-1.47	-1.39	-0.29	0.15	0.57	-2.24	-0.25	-6.98	0.5	0.67	-0.12	0.46	0.44	0.47	-0.3	-0.36	-1.12	-1.41
Smo81531	-0.23	0.01	0.1	0.16	0.27	0.07	0.21	0.14	0.03	0.07	-0.1	-0.26	-0.12	-0.02	-0.37	0.4	0.02	-0.53	0.46	-4.01	-1.07	-1.39	0.18	0.03	0.21	0.79	0.49	0.7	0.13	0.1	-0.45	-0.64
Smo84376	-0.48	-0.66	-0.21	-0.22	-0.13	-0.51	0.06	0.28	0.46	0.53	0.37	0.1	0.74	-0.35	-2.57	0.58	-0.68	-1.44	0.56	-3.67	0.16	-6.1	-0.06	0.14	0.98	1.17	-0.39	-0.23	0.13	-0.01	-0.27	0.33
Smo88196	-0.19	0.11	0.13	0.31	0.27	0.38	0.16	-0.02	0.04	0.04	-0.13	0.02	0.01	-0.26	-0.9	0.33	-0.1	-0.3	0.35	-2.28	-1.3	-2.73	0.4	0.41	0.41	0.37	0.23	0.41	-0.12	-0.04	0.09	-0.02
Smo89183	-0.41	-0.51	-0.71	-0.53	-0.35	-0.34	-0.13	0.26	0.36	0.53	0.4	0.35	-0.49	-1.41	-0.89	-0.08	-0.53	-0.61	0.26	-2.66	0.43	-1.53	-0.35	-0.08	1.18	1.21	0.22	0.07	0.02	0.07	0.25	0.55
Smo90072	-0.09	0.05	-0.15	-0.01	-0.01	0.09	0.02	0.13	0.18	0.15	0.06	0.08	-0.16	0.25	0.41	0.19	0.1	-0.58	0.43	-2.73	-1.23	-1.38	0.21	0.24	-0.06	0.78	0.18	0.12	0.18	0.09	-0.39	-0.27
Smo90433	0.15	0.2	-0.16	0.13	-0.07	0.14	0.04	0.32	0.34	0.46	0.25	0.22	0.19	-0.24	-0.69	0.61	-0.51	-0.89	1.02	-1.74	-0.25	-2.85	-0.35	-0.18	0.27	0.94	-0.32	-0.05	0.23	0.17	-0.84	-1.63
Smo98239	-0.29	-0.34	0.02	0.05	0.48	0.22	0.11	0.33	0.16	0.13	0.05	-0.24	0.34	-0.54	-0.34	0.42	-0.41	-0.39	0.55	-	-1.05	-2.14	0.08	0.29	-0.94	1.14	0.66	0.44	0.13	0.15	-0.64	-0.32
Smo99947	-0.13	0.01	0.03	0.13	-0.25	-0.14	0.21	0.31	0.38	0.45	0.33	0.37	-0.19	-0.7	-1.61	0.14	-0.23	-0.88	0.07	-2.46	-0.15	-1.93	-0.05	-0.12	0.96	0.47	0.18	0.17	0.31	0.18	0.0	0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.