Heatmap: Cluster_30 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.03 0.23 0.12 0.29 0.27 0.36 0.38 0.54 0.13 0.04 -0.15 -0.15 -0.13 -0.41 0.43 -0.25 -0.11 -0.37 0.43 -3.32 -0.41 -4.11 0.3 0.41 0.49 -0.86 0.15 0.13 0.02 0.16 -0.41 -0.08
-0.29 -0.05 0.29 0.16 0.29 0.07 0.06 0.32 0.64 0.48 0.31 0.18 -0.45 -1.13 -0.94 -0.45 -0.61 -0.82 -0.03 -1.58 0.19 0.51 -0.13 -0.04 1.3 -0.6 -0.41 -0.65 0.19 0.05 -0.23 0.02
-0.6 -0.03 0.09 0.31 0.34 0.35 0.15 -0.05 -0.36 -0.12 -0.23 -0.56 -0.08 -1.13 -2.08 0.56 0.23 0.61 0.88 -1.94 0.29 -3.82 0.48 0.28 1.1 -0.66 -0.61 -0.68 0.29 0.27 -0.15 0.02
0.13 0.05 0.11 0.06 0.1 -0.22 -0.34 -0.08 0.02 0.32 0.2 0.3 0.55 -0.34 -0.8 0.42 0.15 -0.21 0.31 -5.73 -1.75 - 0.39 0.29 0.19 0.2 0.09 -0.05 0.33 0.49 0.25 0.08
-0.08 0.05 -0.13 0.14 0.42 0.17 0.47 0.51 0.12 0.2 -0.09 0.01 1.3 -1.55 -0.59 0.43 0.1 -0.7 0.88 -6.19 -1.49 - -0.26 -0.15 -0.6 -0.38 0.45 0.61 0.09 -0.09 -0.19 -0.13
0.11 0.25 0.25 0.54 0.51 0.78 0.34 0.17 0.26 0.32 0.25 0.23 -0.57 -0.23 -0.2 0.07 0.08 -0.84 -0.18 -2.53 -0.93 -3.54 -0.01 0.03 0.06 0.19 0.16 0.58 -0.1 0.02 -0.67 -0.66
0.24 0.08 0.04 0.04 -0.05 0.1 -0.03 0.17 0.25 0.29 0.25 0.16 0.25 -0.76 -1.46 0.73 0.03 -0.55 -0.11 -1.39 0.22 -0.14 -0.07 -0.01 0.55 0.07 -0.11 0.0 0.18 0.2 -0.64 -0.65
0.45 0.92 0.57 0.82 0.76 0.51 0.35 0.14 0.24 0.2 0.2 0.38 -0.65 0.42 -0.51 -0.26 -0.21 -1.4 0.19 -6.13 -1.7 - -0.16 -0.38 1.37 0.02 -1.04 -0.76 -0.1 -0.24 -0.85 -1.73
0.14 -0.14 -0.23 0.03 0.04 -0.05 0.03 0.13 0.39 0.3 0.28 0.26 -0.53 -0.16 -0.47 0.42 -0.09 -0.38 0.45 -2.86 -1.89 -3.34 0.49 0.61 -0.69 0.48 0.12 0.23 0.03 0.35 0.21 0.23
-0.26 -0.01 0.23 0.27 0.25 0.48 0.16 0.03 0.06 -0.12 -0.31 -0.72 -0.66 0.15 0.39 -0.17 0.3 0.31 0.84 -2.26 0.08 -1.06 0.24 0.17 0.62 -0.1 -0.07 -0.14 -0.07 0.05 -0.85 -0.82
0.26 0.06 -0.17 0.15 0.32 0.21 -0.1 0.09 0.08 0.19 0.06 0.19 0.92 -0.96 -1.64 0.82 -0.21 -0.57 0.6 - -4.67 -5.41 0.35 0.37 0.28 0.6 -0.62 -0.72 0.23 0.19 0.32 0.31
0.22 0.23 0.18 0.16 0.02 0.02 0.05 0.2 0.2 0.21 0.22 0.27 -0.01 0.31 0.46 0.5 -0.23 -0.58 0.66 -3.48 -1.89 -2.9 0.02 0.14 0.4 0.52 -0.54 -0.44 0.17 0.18 -0.47 -0.68
-0.97 0.35 0.42 0.35 0.83 0.68 0.13 -0.22 -0.61 -0.83 -1.08 -1.09 -0.19 0.5 -0.49 1.42 0.11 -1.54 0.92 -1.77 -1.13 -2.67 0.35 0.18 -0.93 0.25 0.73 0.33 0.0 -0.32 -0.51 -0.59
0.43 0.33 0.09 0.24 0.15 -0.01 0.06 0.1 0.2 0.16 0.16 0.27 -0.39 0.46 0.12 -0.24 -0.03 -0.41 -0.08 -3.64 -0.44 -2.84 -0.03 0.06 1.03 -0.16 0.29 0.09 -0.23 -0.12 -0.21 -0.4
0.02 0.02 -0.15 0.21 0.16 0.18 0.01 0.1 0.08 0.03 -0.14 -0.15 0.41 0.0 -0.77 1.1 0.19 -0.63 0.3 -2.54 -0.79 -1.8 -0.13 -0.25 0.87 0.05 0.32 0.59 0.01 -0.02 -0.58 -0.91
-0.11 -0.07 0.1 0.36 0.32 0.28 0.37 0.42 0.3 0.32 0.21 0.04 -0.27 -0.89 -0.4 0.62 -0.59 -0.9 0.61 -2.57 -0.34 -2.87 0.02 -0.29 0.11 0.64 0.26 0.5 0.0 -0.15 -0.64 -0.16
0.32 -0.64 -1.0 -0.08 0.25 -0.18 0.54 0.47 0.61 0.51 0.91 0.33 -1.07 -2.64 - -1.39 -0.41 -2.13 -0.46 - -1.49 - 0.07 -0.33 2.09 -0.42 -0.3 0.66 0.99 0.7 0.22 -0.8
-0.21 0.02 -0.04 0.07 0.24 0.11 -0.04 -0.07 0.04 -0.04 -0.03 -0.23 0.77 0.15 -1.63 0.68 -0.18 -0.74 0.37 -1.5 -1.23 -3.55 0.11 0.03 0.31 0.61 0.34 0.29 -0.13 -0.03 0.16 0.43
0.12 0.12 0.22 0.23 0.36 0.22 0.25 0.26 0.27 0.18 0.0 -0.02 0.13 -0.31 0.17 0.24 -0.22 -0.59 0.35 -1.79 -0.44 -2.62 -0.01 -0.02 0.3 0.05 0.17 0.39 0.09 0.16 -0.75 -0.59
0.17 0.02 0.3 -0.08 0.22 0.01 -0.04 -0.26 0.33 -0.07 -0.03 -0.24 0.04 -0.4 0.37 0.42 0.78 0.54 0.18 -1.92 -2.05 -2.47 0.28 0.26 -0.97 -0.41 -0.42 -0.4 0.32 0.41 0.28 0.37
-3.08 -2.03 0.25 0.71 0.24 0.59 1.21 1.49 1.72 1.23 -0.32 -0.88 -3.08 -4.63 -6.31 -3.05 -1.07 -0.94 -1.13 - - - 1.51 0.83 -1.2 0.18 0.75 0.33 0.02 -0.15 -0.58 -0.85
0.26 -0.1 -0.42 -0.2 -0.19 -0.23 -0.08 0.19 0.3 0.34 0.27 0.43 0.28 0.44 -0.35 0.23 -0.33 -0.42 0.13 -2.02 -0.69 -3.88 -0.33 -0.14 0.62 0.42 0.35 0.24 -0.04 0.07 0.04 0.25
1.01 -0.55 -1.17 -0.09 0.67 0.3 -0.28 0.49 0.67 0.47 0.27 -0.19 -4.08 -2.64 -2.73 -2.9 0.25 -0.09 -0.74 - 0.39 - -0.36 -1.02 1.33 0.27 0.77 1.16 0.68 0.44 -0.92 -0.22
-1.15 -1.03 -0.84 0.12 0.76 0.98 0.54 0.5 -0.25 -0.48 -0.74 -1.29 0.17 -1.3 -1.97 0.51 0.6 0.34 0.66 -1.73 0.61 -1.92 0.55 0.35 1.47 -1.82 -0.42 -0.29 -0.0 0.04 -0.75 -0.53
0.08 0.01 -0.27 0.22 0.47 0.2 0.1 0.12 0.16 0.22 -0.1 -0.06 0.41 -0.4 0.26 0.77 0.18 -0.31 0.41 -3.25 -2.07 -1.92 0.26 0.37 0.5 -0.5 -0.53 -0.6 0.36 0.23 -0.11 -0.21
0.36 0.21 -0.05 0.16 0.16 0.03 -0.2 0.04 0.16 0.13 0.24 0.31 0.07 0.32 0.63 0.51 -0.17 -1.48 0.4 -3.89 -1.43 -3.18 -0.24 -0.23 0.7 0.37 0.05 0.24 0.2 0.34 -0.85 -0.72
0.12 0.21 0.1 -0.05 -0.09 -0.26 -0.47 -0.4 -0.67 -0.63 -0.52 -0.34 0.71 0.8 -0.96 1.79 -0.68 -0.28 -0.19 -2.77 -3.95 -4.21 -0.8 -0.47 0.09 0.3 1.2 1.76 -0.4 -0.03 -0.9 -2.15
-0.14 -0.45 -0.29 -0.1 0.3 0.21 0.37 0.7 0.52 0.42 0.37 0.06 -0.35 -0.38 -0.84 -0.03 -0.53 -0.03 0.32 -3.65 -0.33 -2.85 -0.22 -0.39 0.62 0.66 0.41 0.49 -0.23 -0.19 -0.04 0.0
0.79 0.82 0.32 0.25 -0.8 -0.58 0.3 0.12 0.69 -0.37 0.08 -0.0 -0.29 -2.03 -2.36 0.39 0.04 0.01 0.94 - -2.3 - 0.18 0.49 -3.55 -1.1 0.34 0.33 0.96 0.9 0.01 -0.14
-1.03 -0.3 0.38 0.3 0.55 0.1 0.07 -0.1 -0.73 -1.34 -0.46 -0.99 1.25 1.14 1.22 2.19 -1.65 -1.71 -0.95 -5.92 -1.58 - -0.73 0.59 1.04 -0.03 -0.04 0.38 -1.93 -1.58 -2.68 -1.79
-0.62 -0.26 -0.59 0.34 0.0 0.04 0.11 0.87 0.8 -0.41 -0.4 -0.28 -0.86 -1.61 -0.74 -0.86 0.15 -5.48 0.53 - -2.6 - 1.16 1.06 -2.52 -0.42 1.5 0.76 0.79 0.64 -0.01 -0.42
-3.39 -1.71 -0.11 0.36 0.62 0.43 0.98 1.2 1.43 0.75 -0.21 -1.1 -3.6 -4.72 -4.99 -2.51 -0.69 -1.25 -1.24 - - -6.62 1.78 1.25 -0.1 -0.12 0.7 0.52 0.29 0.17 -0.0 -0.67
0.02 0.47 -0.09 0.17 0.06 -0.11 -0.04 0.06 0.14 0.09 0.27 -0.06 -0.12 -0.98 -0.76 0.69 -0.19 -0.4 0.53 - -1.09 - 0.04 0.14 0.26 0.65 0.09 -0.32 0.27 0.37 0.43 0.51
0.4 0.6 0.28 0.2 0.16 0.17 -0.04 -0.07 0.15 0.02 0.03 -0.06 1.28 -0.38 -3.26 0.86 -0.32 -0.43 0.45 -5.41 -2.96 - 0.39 0.25 -0.39 0.53 -0.14 -0.14 0.13 0.15 -0.31 -0.25
-0.1 0.04 0.19 0.13 0.2 0.23 0.21 0.48 0.43 0.22 0.21 0.1 -0.02 -0.12 -0.02 0.11 0.08 -1.13 0.35 -2.04 -2.31 -1.67 0.06 0.05 0.54 -0.23 0.14 0.12 0.02 0.01 0.08 0.05
-0.18 0.1 -0.04 0.19 0.26 0.24 0.26 0.26 0.17 0.28 0.18 0.05 0.07 0.03 0.42 0.44 -0.1 -0.59 0.31 -1.04 -0.1 -1.15 -0.02 -0.0 0.2 0.07 -0.25 -0.13 -0.11 -0.02 -0.58 -0.61
0.13 0.39 0.2 0.37 0.24 0.3 0.17 0.13 0.2 -0.01 -0.03 -0.02 -0.42 0.47 0.49 0.36 -0.02 -0.43 0.46 -2.5 -0.26 -1.95 0.29 0.07 0.1 -0.13 -0.32 -0.22 -0.22 -0.05 -0.31 -0.55
0.07 -0.23 0.02 0.24 0.67 0.28 -0.0 0.16 0.47 0.2 0.32 -0.18 0.8 0.14 0.68 0.91 -0.63 -3.14 0.25 -1.28 -0.39 -2.95 0.47 0.45 0.17 0.09 -0.83 -0.15 -0.4 0.06 -1.8 -1.9
-0.03 0.08 0.03 0.04 -0.21 -0.15 -0.39 -0.22 -0.04 -0.23 0.07 -0.01 0.41 0.43 0.12 0.47 0.06 0.3 0.22 -2.66 -1.34 -2.86 0.68 0.99 0.36 -0.11 -0.64 -0.8 -0.14 0.07 0.19 0.34
-0.19 0.08 0.08 0.05 0.11 0.21 0.13 0.42 0.15 0.06 0.32 -0.08 -0.1 -1.11 -0.96 0.06 0.19 -0.04 0.42 -1.23 -0.25 -0.89 0.14 0.04 1.16 -0.97 -0.55 -0.61 0.16 0.17 0.2 0.2
-0.28 -0.22 -0.24 -0.25 -0.19 -0.03 0.07 0.02 0.01 0.05 -0.25 -0.11 0.34 -0.83 -0.57 0.26 0.01 -0.18 0.69 -0.52 0.13 -2.82 0.35 0.43 0.87 -0.47 -0.72 -0.69 0.2 0.09 0.54 0.78
0.17 0.28 0.24 0.54 0.65 0.48 0.57 0.43 0.45 0.17 0.11 -0.06 -0.98 -0.78 -0.45 -0.12 -0.03 -1.35 0.15 -3.78 -1.2 -7.74 0.31 0.43 -0.81 0.22 0.52 0.64 0.19 0.15 -0.39 -0.69
-0.11 0.18 -0.16 -0.4 -0.67 -0.4 -0.1 -0.03 0.32 0.13 -0.19 -0.16 1.21 -0.53 0.1 0.79 0.81 -0.37 -0.18 -2.82 -3.01 -2.81 0.81 1.11 0.66 -1.79 -1.36 -2.17 -0.17 -0.15 0.49 0.73
0.09 -0.06 0.01 0.09 0.12 0.25 0.01 -0.08 -0.04 -0.1 -0.22 -0.1 -0.1 0.56 0.48 -0.29 -0.31 -0.45 0.03 -1.48 0.1 -2.42 -0.24 -0.01 -0.21 0.52 1.09 0.88 -0.54 -0.44 -0.55 -0.06
-0.36 -0.18 -0.08 0.16 0.44 0.57 0.07 -0.08 -0.04 -0.23 -0.25 -0.44 0.01 0.34 -2.44 1.27 -0.03 -0.2 0.69 -2.07 -0.02 -3.46 0.27 -0.14 0.27 -0.17 0.25 0.67 0.1 0.18 -0.47 -1.08
-0.1 0.18 0.26 0.52 0.48 0.38 0.37 0.47 0.17 -0.07 -0.0 -0.05 -1.21 -1.06 -0.86 -0.51 -0.01 -0.69 0.19 -1.49 -1.05 -4.77 0.43 0.41 0.28 0.05 0.7 0.7 0.19 0.19 -0.13 -0.43
-0.21 -0.39 0.34 0.35 0.66 0.61 0.68 0.96 0.26 0.45 0.06 -0.01 -1.34 -1.41 -0.59 -1.44 -0.09 - -0.19 -3.31 -2.39 -3.32 0.86 0.85 1.15 -0.62 0.71 0.08 0.16 -0.02 -0.39 -0.99
0.4 0.24 0.09 0.22 0.2 0.21 -0.17 0.16 0.3 0.07 0.15 0.09 -0.07 0.37 0.24 0.01 0.15 -0.58 0.1 -2.13 -1.12 -3.05 0.33 0.23 0.3 0.17 0.4 0.3 -0.16 -0.16 -0.64 -0.66
-1.32 -0.67 0.37 0.52 0.71 0.41 -0.58 -0.48 -0.88 -0.66 -0.78 -1.23 1.08 1.23 0.92 2.29 -1.3 -2.64 -0.51 -2.69 -1.92 - -1.11 0.03 0.61 0.25 0.42 1.02 -1.91 -1.38 -2.52 -1.42
0.07 -0.12 -0.26 -0.15 -0.12 -0.03 -0.16 0.06 0.1 0.18 -0.03 0.11 0.41 0.17 0.0 0.43 -0.08 -0.47 0.29 -2.26 -1.16 -3.06 0.17 0.24 0.57 0.06 0.17 0.11 0.04 0.12 0.25 0.47
0.3 0.32 0.07 0.47 0.16 0.4 0.21 0.47 0.25 0.21 0.34 0.29 0.07 -0.45 0.22 0.17 -0.41 -1.22 0.29 -5.0 -0.95 -5.84 0.01 0.15 0.26 0.3 0.4 0.18 -0.06 0.1 -0.72 -0.75
0.08 -0.05 -0.17 -0.03 0.07 -0.0 -0.09 -0.13 0.04 0.15 -0.18 0.08 0.15 0.29 -0.07 0.44 -0.05 -0.43 0.6 -2.41 -1.18 -3.92 0.07 0.07 0.54 0.6 0.19 0.16 0.1 0.12 0.05 0.07
1.2 0.43 -0.56 0.09 0.84 1.05 0.33 0.19 -0.0 -0.22 -0.17 -0.16 -2.09 -1.04 -2.32 -1.23 0.25 -0.18 -0.12 -3.65 -0.55 -3.15 0.49 0.03 1.06 -1.07 0.37 0.5 0.29 0.35 -0.72 -0.49
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0.37 0.21 -0.2 0.07 0.01 -0.25 -0.01 0.21 0.41 0.15 0.04 0.15 0.15 -1.07 -0.37 0.56 -0.17 -1.78 0.64 -1.9 -1.64 -3.11 0.27 0.36 -0.05 -0.23 -0.23 -0.75 0.52 0.49 0.62 0.7
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-0.14 0.05 0.13 0.11 0.25 0.37 -0.07 0.03 0.12 -0.12 0.08 -0.13 0.23 -0.23 -0.3 0.39 0.19 -0.05 0.57 -5.51 -1.09 -3.82 0.37 0.33 0.75 -0.26 0.06 -0.13 0.3 0.31 -0.35 -0.19
0.45 0.49 0.43 0.44 0.34 0.17 0.25 0.3 0.15 0.28 0.27 0.35 -2.45 0.63 -0.25 -0.55 0.24 -1.23 -0.9 -2.58 -1.19 -3.03 -0.14 -0.43 1.37 0.36 -0.05 -0.0 -0.11 0.01 -0.17 -1.07
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0.23 0.03 -0.18 0.14 0.24 0.04 -0.13 0.24 0.39 0.1 0.34 0.41 -0.31 -0.22 -0.22 0.12 -0.13 -0.67 0.42 -3.63 -2.54 -5.17 0.08 0.28 0.15 0.03 0.06 0.13 0.17 0.18 0.43 0.69
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-0.12 -0.09 -0.25 0.13 0.22 0.29 0.05 0.06 0.55 -0.38 -0.26 -0.51 -0.18 -1.96 -1.55 0.21 0.32 0.86 0.66 -0.87 -0.59 -1.09 0.14 0.18 1.32 -0.42 0.02 -0.7 0.33 0.36 -0.55 -0.56
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.