1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_68 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
41.49 38.91 39.82 39.16 41.63 43.63 42.87 48.02 45.07 47.27 45.37 39.16 48.92 52.29 54.14 59.32 30.91 23.87 53.28 82.06 26.31 21.87 38.48 40.05 69.14 54.41 46.95 43.18 36.29 37.84 38.72 35.34
11.3 12.61 11.88 12.86 12.76 15.97 12.93 11.57 12.09 11.59 12.16 8.83 11.79 7.31 15.6 13.06 9.8 11.33 11.93 25.18 16.9 13.31 12.61 12.05 5.58 5.9 10.29 11.44 12.38 13.61 6.03 6.75
0.06 0.06 0.14 0.1 0.12 0.2 0.11 0.07 0.06 0.19 0.06 0.05 0.04 0.07 0.67 0.1 0.1 0.13 3.1 0.94 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.02 0.06 0.04 0.1 0.07 0.05 0.04
2.25 3.26 2.95 3.19 2.06 3.36 2.33 1.7 2.03 2.28 2.22 1.98 0.01 0.55 0.32 0.14 3.07 2.08 7.23 16.1 4.23 1.95 0.34 0.16 0.95 0.37 1.16 1.05 0.99 1.79 0.78 0.67
0.11 0.13 0.14 0.17 0.21 0.28 0.28 0.12 0.05 0.17 0.33 0.1 0.12 0.12 1.97 0.25 0.23 0.08 0.24 5.94 0.0 0.45 0.13 0.03 0.48 0.0 0.23 0.26 0.15 0.18 0.12 0.09
1.03 1.64 0.45 0.67 6.19 3.01 5.49 2.47 0.62 1.05 0.96 0.81 0.39 3.17 0.09 4.74 0.85 8.46 692.34 626.78 323.81 72.85 0.13 5.55 1.04 7.73 8.07 1.39 2.38 2.62 2.24 1.66
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 844.83 0.0 0.0 914.32 715.18 1048.59 745.69 5232.4 760.43 3687.95 589.03 667.09 171.82 0.0 0.0 0.0 661.18 688.2 887.03 973.17
1.83 1.36 1.53 1.78 0.91 1.47 1.14 1.38 1.36 1.68 1.06 1.45 3.42 1.41 0.21 6.66 1.04 0.38 3.22 7.71 2.69 0.0 1.23 0.56 3.58 5.5 2.08 3.21 1.54 1.26 0.77 0.51
1.03 1.53 0.86 1.4 2.72 2.46 3.73 2.19 2.31 2.85 1.67 1.76 2.33 2.5 17.32 3.62 2.75 2.43 305.69 116.11 33.41 29.19 0.34 0.94 1.25 0.5 1.62 1.83 1.13 2.1 1.52 3.28
5.67 5.84 3.96 3.01 3.62 2.72 2.66 1.64 1.93 1.83 3.68 2.63 3.19 10.94 11.66 9.38 14.38 17.82 56.57 39.53 32.89 3.62 12.93 14.24 8.1 17.85 6.4 7.85 15.19 17.22 14.36 30.62
14.91 16.15 17.5 16.98 15.25 16.37 20.25 19.4 18.97 22.18 23.94 22.1 31.71 12.81 34.28 33.66 28.03 38.71 57.9 113.34 23.82 74.8 29.53 31.34 3.23 27.45 5.8 3.95 34.01 32.69 37.61 39.32
16.43 11.97 10.75 13.19 10.24 10.44 11.06 9.82 13.53 15.11 18.74 18.19 10.21 13.18 18.91 11.77 6.61 2.35 137.34 65.32 20.16 36.05 7.88 11.79 26.25 15.09 9.0 8.28 8.39 10.11 10.83 9.17
0.29 0.54 0.36 0.71 0.14 1.12 1.13 0.74 1.11 0.95 1.19 0.8 1.45 10.98 9.0 1.29 0.75 0.94 0.96 25.7 3.26 6.72 0.61 1.2 4.57 1.16 2.68 3.11 0.81 0.86 0.29 0.3
1.52 1.32 1.86 1.54 1.46 1.63 1.8 1.24 2.17 1.76 2.48 1.5 0.12 0.54 1.81 0.34 0.75 0.58 2.88 39.63 11.76 5.83 0.05 0.02 0.93 0.42 0.51 0.74 0.46 0.43 0.29 0.23
0.19 0.34 0.35 0.88 0.59 1.24 0.54 0.39 0.37 0.13 0.26 0.57 0.6 0.46 9.06 0.73 0.91 0.38 3.37 16.37 0.0 0.46 0.06 0.25 0.0 0.55 4.3 2.38 0.25 0.29 0.55 0.4
0.34 0.44 0.66 0.7 0.92 0.53 0.47 0.57 0.78 0.46 0.46 0.51 1.6 0.32 1.5 1.68 0.49 0.21 0.74 7.36 0.31 2.22 0.24 0.28 0.6 1.63 0.63 0.61 0.29 0.43 0.24 0.29
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.89 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.56 0.24 0.11 0.3 0.11 0.07 0.3 0.06 0.13 0.14 0.31 0.37 0.98 0.07 0.18 0.37 0.13 0.08 0.72 2.05 0.22 0.0 0.04 0.04 0.36 1.07 0.46 0.85 0.02 0.09 0.02 0.02
0.15 0.3 0.31 0.35 0.15 0.0 0.27 0.26 0.12 0.34 0.08 0.09 0.07 0.19 1.66 0.12 0.1 0.0 0.47 1.18 0.0 0.68 0.17 0.06 0.14 0.27 0.34 0.58 0.16 0.1 0.13 0.16
0.19 0.27 0.11 0.13 0.24 0.25 0.25 0.09 0.22 0.38 0.26 0.2 0.16 0.23 3.16 0.23 0.2 0.2 0.74 3.1 0.12 0.0 0.05 0.09 0.38 0.23 0.2 0.0 0.16 0.15 0.13 0.11
7.68 5.65 5.71 7.44 6.9 9.01 7.89 7.0 10.35 9.21 10.69 7.33 7.52 7.55 14.8 18.69 8.0 8.16 89.62 27.15 13.7 12.7 2.27 4.02 15.62 8.59 8.23 7.15 11.35 13.67 14.25 17.93
3.17 1.78 1.08 2.56 2.08 0.91 2.04 3.12 1.78 1.79 2.21 2.77 2.26 1.18 0.74 2.78 5.27 5.63 6.12 60.88 1.78 29.49 8.12 5.87 4.03 3.79 6.97 6.64 6.43 5.26 2.99 2.39
1.5 1.67 1.25 1.7 0.89 2.53 1.57 1.78 2.21 2.15 1.48 1.49 0.71 1.56 9.45 0.85 0.97 0.8 4.85 10.65 8.66 0.53 0.57 1.58 3.47 1.24 2.51 2.53 0.94 0.9 0.88 1.18
0.14 0.12 0.05 0.06 0.17 0.27 0.18 0.18 0.02 0.08 0.31 0.08 0.32 0.24 1.63 0.07 0.05 0.03 0.07 3.08 1.41 1.93 0.02 0.04 0.13 0.11 0.07 0.0 0.12 0.26 0.12 0.08
0.4 0.32 0.37 0.17 0.82 0.42 0.29 0.35 0.69 0.6 0.4 0.57 0.05 0.01 0.39 0.13 0.2 0.46 1.57 5.46 0.51 0.99 0.09 0.17 0.05 0.23 0.09 0.11 0.1 0.15 0.15 0.25
0.53 1.22 1.79 1.33 1.55 1.47 1.65 2.08 1.2 0.99 0.93 0.76 1.28 1.73 16.66 1.84 0.62 2.26 4.5 20.07 0.0 0.0 0.73 0.44 1.01 1.71 10.47 9.55 0.38 0.85 0.7 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.27 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.6 1.01 0.6 0.59 0.43 1.16 2.01 0.75 0.54 0.32 0.07 0.86 0.77 2.55 3.83 0.57 1.11 0.04 10.9 83.5 25.11 33.71 0.04 0.08 0.87 0.08 0.09 0.0 0.46 0.44 0.23 0.11
0.01 0.07 0.21 0.04 0.19 0.04 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.04 0.03 0.17 0.06 0.0 0.98 0.33 0.0 0.0 0.06 0.06 0.14 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.19 0.06
0.29 0.19 0.31 0.39 0.22 0.22 0.38 0.22 0.46 0.4 0.32 0.42 0.02 0.02 0.22 0.11 0.17 0.57 5.43 1.3 0.09 0.16 0.29 0.64 0.94 0.3 0.12 0.08 0.15 0.22 0.27 0.27
0.09 0.25 0.38 0.44 0.28 0.28 0.28 0.33 0.27 0.3 0.09 0.25 0.0 0.03 0.36 0.01 0.96 0.0 2.44 0.84 0.25 0.23 0.7 0.64 0.0 0.62 0.74 0.73 0.62 0.61 0.22 0.24
0.03 0.04 0.01 0.1 0.16 0.22 0.04 0.15 0.13 0.08 0.03 0.07 0.01 0.04 0.17 0.03 0.19 0.04 2.57 0.92 0.15 0.04 0.35 0.23 0.17 0.64 0.85 0.71 0.11 0.19 0.15 0.05
0.25 0.15 0.17 0.37 0.63 0.36 0.15 0.21 0.52 0.21 0.12 0.35 0.12 0.15 2.93 0.75 0.38 0.21 0.53 7.23 1.92 0.66 0.15 0.05 0.0 0.24 0.44 0.0 0.0 0.21 0.11 0.05
1.05 1.75 1.71 1.66 2.25 1.16 1.28 0.08 1.74 1.55 0.89 1.54 1.85 1.1 6.75 1.16 1.78 1.82 1.86 12.01 0.0 5.39 0.97 0.8 5.65 0.2 2.92 3.32 1.36 2.11 1.36 2.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.11 0.88 0.57 1.33 0.5 0.7 0.87 0.33 0.52 1.7 0.73 5.37 2.28 2.92 2.39 0.11 0.77 43.82 45.24 37.56 5.53 0.35 1.51 0.0 0.82 0.7 1.86 0.35 1.37 0.23 0.65
0.78 0.53 0.46 0.56 1.2 1.46 1.02 1.17 1.11 1.15 0.91 0.7 1.02 0.6 2.18 2.15 0.8 0.88 9.27 4.21 1.31 1.53 0.49 0.3 1.83 1.4 1.04 1.33 0.59 0.66 0.53 0.42
1.85 0.92 1.53 1.56 2.31 4.04 5.28 4.1 4.31 3.67 1.56 1.64 1.31 1.72 5.61 2.06 2.04 1.91 6.05 7.34 2.88 3.08 2.03 1.68 1.93 2.25 2.89 4.22 2.64 1.95 3.16 3.02
0.07 0.07 0.04 0.09 0.26 0.2 0.08 0.16 0.06 0.25 0.19 0.12 1.83 0.43 0.94 0.75 0.16 0.18 15.88 5.46 0.0 0.5 0.25 0.19 0.23 0.27 0.1 0.17 0.11 0.13 0.02 0.14
0.2 0.27 0.25 0.35 0.4 0.39 0.32 0.4 0.32 0.35 0.43 0.29 0.19 0.81 2.49 0.43 0.05 0.8 0.54 1.89 0.04 0.13 0.03 0.04 0.01 0.2 0.43 0.44 0.05 0.08 0.16 0.25
6.92 6.22 6.32 6.07 7.28 7.31 6.85 8.48 7.65 8.23 7.62 7.29 9.75 8.55 10.16 8.61 3.6 2.35 9.77 19.93 1.82 4.32 5.27 6.26 8.37 16.37 14.11 11.52 4.4 4.37 4.36 7.02
24.0 30.8 31.24 44.89 38.49 46.6 48.44 42.27 45.19 31.02 29.06 23.34 56.32 56.26 65.89 58.69 38.47 32.06 52.04 78.67 47.99 44.58 46.45 50.36 34.41 25.85 33.52 36.21 41.75 48.68 16.07 15.02
0.36 0.3 0.51 0.65 0.67 1.2 0.81 0.42 0.71 0.35 0.37 0.31 0.26 0.19 1.93 0.21 0.32 0.21 0.33 3.31 2.02 0.0 0.25 0.21 0.87 0.23 1.05 1.38 0.23 0.32 0.1 0.09
0.51 0.94 0.66 0.83 1.08 1.23 0.96 0.59 0.71 0.56 0.75 0.5 1.27 1.89 3.09 2.4 0.7 1.13 13.84 8.46 0.63 1.59 1.55 2.53 0.99 0.16 1.13 0.71 1.03 1.19 2.78 2.72
1.9 1.13 0.43 1.02 1.25 1.96 3.38 2.62 1.39 4.85 1.45 1.25 1.21 2.71 5.06 0.84 1.87 1.94 0.3 36.54 0.61 4.05 0.88 0.9 1.24 0.32 1.8 3.79 2.08 0.99 2.02 2.3
1.78 1.49 1.18 1.56 2.23 1.8 2.25 2.67 2.39 2.53 2.53 2.3 1.31 2.1 7.37 2.17 1.16 1.29 11.82 14.44 0.65 0.81 0.93 1.07 2.19 4.3 7.0 6.19 1.3 1.27 1.02 1.32
0.03 0.0 0.0 0.12 0.05 0.1 0.0 0.1 0.0 0.04 0.04 0.16 0.0 0.28 1.25 0.17 0.0 0.59 8.74 8.48 0.12 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.14 0.23 0.09
13.09 11.2 9.68 15.17 12.73 16.79 17.6 6.03 11.85 7.14 14.21 8.49 11.75 11.91 50.18 10.74 19.4 17.85 15.75 190.09 53.83 64.82 9.71 10.52 34.02 10.06 11.74 18.74 12.81 13.65 4.65 4.73
6.43 8.0 10.63 8.7 8.41 10.14 9.75 6.89 5.88 5.74 6.76 6.67 7.73 5.3 10.21 10.02 10.0 9.26 8.12 179.02 47.04 56.56 9.63 9.65 47.79 5.96 7.76 5.74 8.27 8.55 14.12 14.37
0.72 0.16 0.17 0.25 0.89 0.65 0.91 0.47 0.16 0.46 0.72 0.31 0.33 0.07 2.77 0.68 0.86 0.38 8.49 2.15 1.5 0.22 0.08 0.07 1.31 0.16 0.27 0.18 0.62 0.41 0.4 0.25
0.46 0.33 0.27 0.38 0.35 0.49 0.45 0.56 0.72 0.52 0.53 0.69 1.16 1.8 1.53 1.92 0.47 0.86 0.63 3.89 0.32 0.14 0.12 0.12 0.34 1.3 1.64 1.03 0.27 0.4 0.23 0.38
4.22 3.49 3.25 3.7 3.03 4.41 3.6 3.14 3.86 4.4 3.46 3.9 4.92 3.34 13.76 4.7 3.86 3.71 4.95 111.72 27.03 21.89 3.27 3.29 6.8 1.64 2.52 2.59 3.98 3.84 4.37 5.35
1.54 0.75 0.4 0.39 1.85 0.23 0.73 1.48 0.85 1.5 1.42 1.83 3.19 2.68 6.24 4.79 0.46 0.0 27.85 6.1 0.0 0.0 0.33 0.39 0.65 1.67 0.06 0.47 0.38 0.19 0.12 0.13
26.22 24.97 21.93 29.23 17.66 36.13 31.87 39.32 22.09 32.99 41.17 23.29 167.64 103.47 137.75 165.35 75.95 151.77 398.08 241.79 176.95 81.75 80.78 100.38 60.68 89.29 42.51 30.1 71.19 64.19 54.09 49.87
0.86 1.6 0.64 1.22 1.98 1.48 1.09 1.33 1.51 1.47 1.12 1.28 0.28 0.07 2.7 0.48 0.58 0.41 2.41 10.58 3.91 5.53 0.77 0.45 0.57 0.56 0.44 0.85 0.67 0.58 0.38 0.11

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)