1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_193 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.19 0.13 0.14 0.18 0.14 0.16 0.13 0.18 0.18 0.23 0.23 0.23 0.21 0.13 0.27 0.2 0.15 0.21 0.16 0.77 0.23 1.0 0.16 0.16 0.12 0.41 0.15 0.13 0.18 0.16 0.23 0.26
0.13 0.11 0.12 0.15 0.18 0.29 0.25 0.25 0.21 0.36 0.19 0.24 0.15 0.1 0.15 0.14 0.16 0.18 0.2 0.47 0.25 1.0 0.16 0.14 0.14 0.28 0.43 0.42 0.18 0.17 0.2 0.2
0.36 0.45 0.36 0.35 0.3 0.32 0.34 0.34 0.36 0.33 0.36 0.32 0.24 0.07 0.16 0.22 0.28 0.29 0.31 0.61 0.04 1.0 0.3 0.3 0.04 0.52 0.3 0.42 0.29 0.29 0.29 0.34
0.12 0.11 0.08 0.15 0.25 0.27 0.27 0.28 0.26 0.21 0.21 0.16 0.09 0.1 0.26 0.17 0.18 0.16 0.15 0.68 0.44 1.0 0.14 0.13 0.08 0.1 0.25 0.31 0.18 0.18 0.22 0.2
0.17 0.19 0.21 0.19 0.22 0.17 0.17 0.09 0.24 0.12 0.19 0.16 0.03 0.0 0.05 0.04 0.15 0.06 0.04 1.0 0.02 0.53 0.01 0.0 0.17 0.01 0.03 0.01 0.05 0.08 0.07 0.05
0.35 0.38 0.31 0.34 0.39 0.34 0.33 0.36 0.4 0.41 0.38 0.37 0.26 0.2 0.3 0.4 0.27 0.29 0.31 0.39 0.35 1.0 0.3 0.36 0.23 0.42 0.32 0.32 0.3 0.31 0.24 0.22
0.13 0.17 0.11 0.17 0.31 0.33 0.27 0.35 0.22 0.17 0.21 0.15 0.07 0.1 0.35 0.1 0.09 0.06 0.1 0.51 0.26 1.0 0.14 0.13 0.19 0.33 0.37 0.54 0.16 0.15 0.09 0.07
0.09 0.09 0.06 0.09 0.19 0.24 0.33 0.3 0.31 0.26 0.15 0.13 0.02 0.02 0.07 0.03 0.09 0.12 0.07 0.58 0.33 1.0 0.07 0.04 0.12 0.15 0.28 0.26 0.12 0.1 0.12 0.09
0.38 0.5 0.59 0.49 0.48 0.64 0.52 0.5 0.47 0.44 0.47 0.42 0.35 0.28 0.58 0.5 0.46 0.32 0.55 0.61 0.54 1.0 0.45 0.44 0.45 0.28 0.29 0.38 0.43 0.46 0.4 0.39
0.21 0.24 0.23 0.21 0.21 0.23 0.22 0.19 0.21 0.24 0.22 0.2 0.22 0.21 0.21 0.24 0.11 0.05 0.22 0.95 0.4 1.0 0.14 0.16 0.18 0.21 0.2 0.19 0.14 0.15 0.12 0.12
0.47 0.27 0.48 0.36 0.29 0.42 0.4 0.36 0.41 0.34 0.36 0.27 0.09 0.17 0.31 0.11 0.1 0.42 0.09 0.61 0.76 1.0 0.13 0.15 0.34 0.63 0.47 0.65 0.13 0.15 0.08 0.09
0.39 0.43 0.36 0.52 0.62 0.43 0.45 0.51 0.57 0.31 0.46 0.41 0.28 0.33 0.43 0.44 0.16 0.02 0.24 0.34 0.08 1.0 0.36 0.38 0.13 0.66 0.73 0.6 0.17 0.14 0.26 0.27
0.35 0.3 0.34 0.34 0.31 0.34 0.31 0.35 0.41 0.51 0.42 0.38 0.32 0.22 0.26 0.47 0.16 0.18 0.21 0.45 0.52 1.0 0.25 0.32 0.24 0.46 0.23 0.24 0.22 0.21 0.19 0.19
0.23 0.18 0.2 0.2 0.24 0.26 0.27 0.3 0.33 0.27 0.3 0.23 0.06 0.13 0.13 0.07 0.35 0.41 0.16 0.48 0.48 1.0 0.18 0.16 0.48 0.26 0.39 0.35 0.28 0.28 0.29 0.36
0.46 0.45 0.48 0.41 0.45 0.45 0.4 0.41 0.53 0.46 0.46 0.42 0.15 0.26 0.56 0.34 0.33 0.2 1.0 0.52 0.14 0.59 0.27 0.24 0.53 0.44 0.44 0.4 0.28 0.34 0.29 0.29
0.37 0.41 0.3 0.35 0.3 0.37 0.34 0.35 0.47 0.44 0.4 0.45 0.08 0.26 0.38 0.28 0.25 0.07 0.26 0.55 0.47 1.0 0.12 0.15 0.71 0.35 0.32 0.13 0.19 0.23 0.16 0.16
0.48 0.48 0.4 0.46 0.52 0.44 0.44 0.45 0.55 0.5 0.54 0.47 0.4 0.23 0.32 0.39 0.3 0.4 0.38 0.87 0.29 1.0 0.46 0.53 0.25 0.35 0.34 0.27 0.31 0.34 0.3 0.32
0.14 0.19 0.27 0.23 0.29 0.21 0.2 0.19 0.22 0.21 0.15 0.16 0.12 0.2 0.26 0.12 0.19 0.06 0.38 0.23 0.35 1.0 0.15 0.13 0.51 0.32 0.36 0.42 0.2 0.22 0.06 0.05
0.39 0.49 0.55 0.51 0.44 0.44 0.52 0.57 0.64 0.59 0.59 0.53 0.66 0.29 0.16 0.68 0.29 0.17 0.38 1.0 0.21 0.76 0.41 0.45 0.36 0.3 0.29 0.25 0.32 0.35 0.38 0.41
0.15 0.19 0.16 0.4 0.14 0.3 0.1 0.22 0.11 0.31 0.23 0.23 0.48 0.18 0.16 0.42 0.16 0.04 0.31 1.0 0.22 0.84 0.3 0.32 0.67 0.33 0.36 0.18 0.18 0.18 0.22 0.23
0.14 0.08 0.0 0.09 0.0 0.24 0.29 0.36 0.45 0.23 0.15 0.22 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.09 0.23 0.1 0.0 0.34 0.06 0.05 0.0 0.0
0.48 0.4 0.61 0.48 0.49 0.54 0.7 0.31 0.62 0.45 0.47 0.35 0.21 0.36 0.57 0.13 0.11 0.01 0.16 0.61 0.28 1.0 0.13 0.15 0.29 0.72 0.49 0.39 0.05 0.11 0.07 0.03
0.2 0.2 0.16 0.23 0.18 0.29 0.29 0.21 0.22 0.26 0.16 0.16 0.14 0.07 0.16 0.17 0.1 0.08 0.25 0.08 0.15 1.0 0.09 0.14 0.13 0.16 0.11 0.2 0.11 0.12 0.05 0.04
0.15 0.31 0.22 0.2 0.32 0.25 0.17 0.12 0.2 0.19 0.2 0.15 0.1 0.09 0.07 0.13 0.11 0.08 0.15 0.35 0.61 1.0 0.09 0.03 0.06 0.12 0.18 0.23 0.07 0.17 0.05 0.04
0.15 0.23 0.3 0.31 0.26 0.34 0.32 0.3 0.3 0.3 0.26 0.22 0.07 0.08 0.22 0.11 0.17 0.02 0.17 0.35 0.21 1.0 0.11 0.1 0.33 0.5 0.2 0.15 0.13 0.14 0.15 0.15
0.3 0.22 0.15 0.09 0.21 0.19 0.15 0.19 0.32 0.43 0.42 0.31 0.28 0.23 0.2 0.54 0.29 0.23 0.64 0.48 0.91 0.55 0.11 0.06 0.04 0.31 0.04 0.11 0.61 0.55 1.0 0.91
0.24 0.23 0.22 0.23 0.27 0.38 0.29 0.29 0.32 0.24 0.18 0.21 0.2 0.16 0.33 0.2 0.13 0.06 0.36 0.75 0.25 1.0 0.14 0.22 0.12 0.15 0.3 0.31 0.12 0.17 0.21 0.24
0.29 0.25 0.23 0.25 0.24 0.33 0.27 0.28 0.3 0.27 0.24 0.26 0.03 0.09 0.17 0.03 0.11 0.17 0.3 0.43 0.41 1.0 0.1 0.09 0.33 0.35 0.37 0.35 0.13 0.13 0.08 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.81 0.0 1.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0
0.11 0.08 0.09 0.1 0.12 0.18 0.27 0.28 0.33 0.28 0.21 0.15 0.05 0.02 0.14 0.08 0.07 0.13 0.11 0.2 0.21 1.0 0.07 0.08 0.01 0.18 0.22 0.26 0.11 0.11 0.1 0.11
0.56 0.48 0.33 0.4 0.49 0.41 0.43 0.5 0.45 0.44 0.45 0.48 0.36 0.4 0.31 0.55 0.45 0.5 0.62 0.64 0.64 0.63 0.43 0.47 0.41 0.68 0.53 0.52 0.49 0.54 1.0 0.73
0.24 0.27 0.33 0.38 0.58 0.29 0.29 0.23 0.2 0.23 0.27 0.24 0.12 0.08 0.29 0.27 0.2 0.1 0.16 0.0 0.1 1.0 0.28 0.27 0.15 0.15 0.08 0.18 0.08 0.15 0.09 0.08
0.45 0.59 0.82 0.27 0.15 0.4 0.28 0.56 0.47 0.41 0.42 0.29 0.01 0.19 0.25 0.0 0.01 0.01 0.02 0.45 0.52 0.22 0.01 0.04 0.56 0.5 0.74 1.0 0.01 0.03 0.02 0.02
0.01 0.02 0.01 0.02 0.08 0.12 0.1 0.12 0.11 0.04 0.03 0.02 0.14 0.01 0.07 0.03 0.05 0.02 0.01 0.54 0.16 1.0 0.04 0.01 0.13 0.12 0.47 0.39 0.04 0.04 0.04 0.05
0.25 0.38 0.19 0.38 0.31 0.25 0.21 0.23 0.25 0.29 0.19 0.22 0.17 0.38 0.28 0.31 0.08 0.14 0.92 0.8 0.0 1.0 0.15 0.21 0.63 0.65 0.43 0.59 0.1 0.07 0.12 0.11
0.13 0.15 0.12 0.1 0.21 0.14 0.1 0.11 0.11 0.07 0.16 0.16 0.19 0.12 0.46 0.22 0.09 0.09 0.15 0.34 0.09 1.0 0.03 0.03 0.23 0.22 0.12 0.11 0.06 0.08 0.03 0.02
0.31 0.37 0.26 0.32 0.28 0.35 0.44 0.43 0.47 0.53 0.44 0.46 0.34 0.13 0.12 0.29 0.32 0.48 0.27 0.58 1.0 0.03 0.63 0.56 0.43 0.24 0.15 0.19 0.43 0.45 0.97 0.99
0.13 0.19 0.16 0.19 0.41 0.23 0.24 0.3 0.33 0.2 0.32 0.18 0.0 0.18 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 1.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.1 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0
0.23 0.3 0.29 0.35 0.32 0.33 0.22 0.25 0.34 0.44 0.3 0.39 0.07 0.16 0.53 0.14 0.15 0.01 0.06 1.0 0.13 0.95 0.12 0.1 0.4 0.29 0.17 0.1 0.06 0.09 0.07 0.08
0.23 0.19 0.3 0.23 0.44 0.2 0.32 0.34 0.24 0.22 0.36 0.19 0.04 0.07 0.26 0.06 0.15 0.28 0.26 1.0 0.03 0.44 0.14 0.08 0.08 0.17 0.25 0.29 0.11 0.18 0.11 0.09
0.24 0.36 0.47 0.26 0.43 0.29 0.34 0.28 0.21 0.23 0.18 0.21 0.15 0.08 0.66 0.23 0.42 0.24 0.29 1.0 0.09 0.9 0.61 0.32 0.07 0.04 0.2 0.38 0.21 0.3 0.09 0.1
0.25 0.38 0.34 0.28 0.18 0.27 0.35 0.19 0.48 0.43 0.52 0.32 0.27 0.28 0.88 0.5 0.31 0.46 0.34 0.99 0.46 1.0 0.5 0.24 0.21 0.15 0.18 0.31 0.26 0.32 0.07 0.12
0.32 0.23 0.28 0.3 0.23 0.3 0.25 0.28 0.29 0.51 0.46 0.4 0.38 0.24 0.4 0.41 0.49 0.31 0.58 0.52 0.44 0.38 0.4 0.4 0.55 0.24 0.27 0.26 0.46 0.49 0.86 1.0
0.19 0.2 0.26 0.25 0.26 0.23 0.25 0.23 0.29 0.27 0.23 0.22 0.06 0.07 0.08 0.07 0.15 0.06 0.14 0.17 0.2 1.0 0.09 0.1 0.06 0.25 0.2 0.21 0.12 0.13 0.08 0.07
0.3 0.28 0.25 0.26 0.29 0.3 0.26 0.31 0.31 0.3 0.32 0.27 0.2 0.12 0.24 0.18 0.12 0.16 0.25 0.65 0.35 1.0 0.15 0.17 0.33 0.33 0.32 0.23 0.14 0.12 0.19 0.25
0.31 0.31 0.28 0.26 0.26 0.28 0.23 0.3 0.31 0.27 0.35 0.32 0.16 0.31 0.44 0.23 0.19 0.19 0.21 0.48 0.16 1.0 0.2 0.23 0.22 0.21 0.15 0.15 0.16 0.18 0.14 0.13
0.37 0.35 0.32 0.37 0.38 0.44 0.44 0.46 0.55 0.5 0.48 0.46 0.32 0.41 0.59 0.34 0.27 0.18 0.33 0.4 0.33 1.0 0.3 0.3 0.15 0.56 0.42 0.36 0.26 0.28 0.22 0.23
0.29 0.3 0.34 0.31 0.34 0.31 0.37 0.33 0.34 0.37 0.39 0.36 0.27 0.38 0.4 0.25 0.2 0.12 0.19 0.72 0.1 1.0 0.24 0.24 0.55 0.31 0.25 0.28 0.19 0.23 0.2 0.18
0.07 0.09 0.09 0.13 0.11 0.16 0.18 0.24 0.17 0.09 0.11 0.11 0.12 0.06 0.19 0.09 0.06 0.11 0.12 0.26 0.09 1.0 0.09 0.09 0.08 0.13 0.11 0.11 0.07 0.07 0.07 0.09
0.64 0.58 0.48 0.55 0.52 0.53 0.46 0.59 0.64 0.6 0.59 0.61 0.61 0.72 0.5 0.71 0.33 0.36 0.66 0.7 0.73 1.0 0.49 0.51 0.31 0.51 0.31 0.33 0.45 0.45 0.55 0.61
0.16 0.07 0.04 0.03 0.24 0.27 0.3 0.47 0.19 0.19 0.15 0.06 0.06 0.12 0.08 0.17 0.22 0.24 0.19 0.73 0.0 1.0 0.15 0.16 0.0 0.1 0.39 0.4 0.39 0.33 0.31 0.21
0.26 0.28 0.31 0.45 0.46 0.63 0.53 0.46 0.42 0.41 0.36 0.31 0.39 0.46 0.35 0.38 0.21 0.2 0.33 0.56 0.92 1.0 0.32 0.34 0.42 0.25 0.44 0.42 0.23 0.24 0.25 0.28
0.2 0.2 0.28 0.21 0.21 0.22 0.21 0.25 0.24 0.29 0.26 0.26 0.16 0.07 0.07 0.2 0.13 0.14 0.15 0.69 0.3 1.0 0.16 0.18 0.14 0.13 0.06 0.06 0.16 0.15 0.11 0.11
0.51 0.39 0.41 0.42 0.39 0.48 0.51 0.49 0.52 0.55 0.56 0.46 0.43 0.65 1.0 0.45 0.36 0.48 0.55 0.72 0.43 0.98 0.45 0.51 0.29 0.49 0.34 0.34 0.4 0.35 0.35 0.48
0.8 0.59 0.49 0.43 0.39 0.37 0.39 0.26 0.38 0.4 0.46 0.73 0.22 0.17 0.51 0.39 0.35 0.2 0.38 0.97 0.12 1.0 0.32 0.28 0.36 0.86 0.31 0.37 0.39 0.43 0.39 0.29
0.13 0.13 0.11 0.17 0.17 0.2 0.22 0.25 0.25 0.25 0.23 0.18 0.13 0.17 0.45 0.1 0.07 0.05 0.1 0.39 0.17 1.0 0.1 0.11 0.09 0.2 0.28 0.27 0.08 0.09 0.08 0.1
0.12 0.06 0.08 0.11 0.25 0.41 0.43 0.42 0.31 0.32 0.2 0.17 0.05 0.08 0.21 0.12 0.09 0.13 0.06 0.6 0.31 1.0 0.09 0.09 0.07 0.08 0.25 0.3 0.16 0.18 0.16 0.11
0.45 0.45 0.4 0.37 0.38 0.38 0.3 0.34 0.44 0.39 0.38 0.36 0.4 0.93 0.8 0.53 0.42 0.43 0.66 0.71 0.34 1.0 0.6 0.54 0.56 0.3 0.28 0.27 0.39 0.39 0.3 0.34
0.3 0.26 0.21 0.28 0.24 0.29 0.23 0.25 0.29 0.33 0.34 0.31 0.29 0.17 0.24 0.31 0.2 0.18 0.28 0.45 0.49 1.0 0.3 0.31 0.39 0.17 0.13 0.14 0.2 0.22 0.26 0.27

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)