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Heatmap: Cluster_218 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.62 -0.49 -0.22 -0.07 0.05 -0.1 0.23 0.47 0.56 0.45 0.17 -0.09 0.48 0.18 0.34 0.18 -0.66 -0.6 0.06 0.6 -0.12 -0.96 -0.24 0.15 0.32 0.88 -0.59 -0.61 -0.46 -0.38 -0.71 -0.48
0.17 -0.18 -0.45 0.23 0.0 -0.13 0.41 0.6 0.62 1.1 0.84 0.46 -0.86 0.87 -0.38 -0.87 -1.38 -0.21 -0.56 -2.31 0.22 -3.08 -0.92 -0.89 0.8 1.01 0.32 0.51 -1.08 -1.18 -1.0 -1.11
-0.04 0.06 -0.31 0.21 0.49 0.22 0.01 0.28 0.18 0.45 0.23 0.18 -0.32 0.04 0.91 -0.13 -0.49 -1.7 -0.2 -1.07 -0.56 0.41 -0.14 -0.07 0.74 0.28 0.29 0.14 -0.73 -0.68 -0.77 -0.88
-0.44 -0.4 -0.1 0.22 -0.13 -0.26 0.04 0.65 0.79 1.1 0.62 0.55 -0.07 0.02 -1.3 0.15 -1.59 -1.68 0.17 0.71 0.1 -1.08 -0.99 -0.43 -0.11 1.15 -0.64 -0.96 -0.67 -0.85 0.15 -0.14
-0.16 -0.33 -0.63 -0.3 -0.31 -0.29 -0.06 0.16 0.24 0.33 0.1 0.23 0.81 0.64 0.77 0.75 -0.77 -0.91 0.06 -1.16 -0.11 -0.39 0.01 0.35 0.63 0.63 -0.87 -1.11 -0.37 -0.29 -0.45 -0.38
-0.13 -0.07 -0.28 -0.14 -0.08 -0.11 -0.19 -0.13 0.14 -0.11 -0.07 -0.06 0.91 1.21 0.67 1.01 -0.57 -0.69 0.11 -0.58 -0.46 -1.01 -0.16 -0.05 0.62 0.23 -0.33 -0.22 -0.54 -0.48 -0.69 -1.03
-0.14 -0.09 -0.06 0.13 0.16 0.04 0.1 0.39 0.25 0.18 0.13 -0.01 0.62 0.63 0.71 0.71 -0.77 -1.05 -0.26 -0.92 -2.21 -1.37 -0.26 -0.0 -0.35 0.94 0.48 0.44 -0.59 -0.53 -0.91 -0.75
-0.21 -0.45 -0.26 -0.35 -0.01 -0.03 -0.3 -0.31 -0.12 -0.08 -0.0 -0.21 0.77 1.04 -0.02 0.86 -0.54 -0.14 0.12 -0.59 0.07 -0.07 -0.26 0.13 -0.21 0.74 -0.19 0.13 -0.27 -0.05 -0.44 -0.79
0.2 -0.16 -0.07 -0.04 -0.05 0.26 0.25 0.28 0.46 0.25 0.41 0.45 -0.38 -0.26 0.32 0.2 -0.59 -2.27 0.08 -0.95 -0.6 -1.73 -0.65 -0.28 0.66 1.04 0.75 0.33 -0.35 -0.08 -0.85 -1.05
-0.26 -0.29 -0.23 -0.11 -0.14 -0.22 0.06 0.22 0.26 0.37 0.34 0.21 0.6 0.59 0.78 0.48 -0.72 -1.09 -0.03 -1.15 -0.81 -0.41 -0.28 -0.01 0.18 0.65 -0.25 -0.4 -0.47 -0.52 0.21 0.03
0.15 -0.18 -0.43 -0.46 -0.67 -0.6 -0.57 -0.37 -0.06 0.23 0.24 0.44 1.33 1.03 0.31 1.09 -0.54 -0.79 0.18 -1.18 0.06 -0.74 0.31 0.44 0.34 -0.48 -1.82 -2.39 -0.12 -0.13 -0.31 0.01
-0.3 -0.16 0.02 0.04 0.02 -0.0 0.19 0.36 0.13 0.17 0.18 -0.17 0.59 0.56 0.66 0.37 -0.7 -1.4 -0.51 0.08 -0.76 -0.35 -0.47 -0.28 0.02 0.79 0.41 0.37 -0.69 -0.7 -0.45 -0.46
-0.06 -0.35 -0.26 -0.29 -0.26 -0.28 -0.3 0.12 0.57 0.74 0.71 0.59 0.29 -0.27 0.19 0.14 -1.19 -1.36 -0.27 0.4 0.93 -0.5 -0.44 -0.11 0.53 0.64 -1.08 -1.27 -0.33 -0.44 -0.29 -0.08
-0.0 -0.13 -0.28 -0.3 -0.22 -0.58 -0.46 -0.2 0.12 0.32 0.53 0.33 -0.04 -0.11 -0.65 0.17 -0.68 -0.97 -0.1 1.04 0.81 0.12 -0.35 -0.22 1.02 0.54 -0.61 -0.85 -0.49 -0.48 -0.17 0.03
-0.3 -0.44 -0.43 -0.2 -0.1 -0.25 -0.11 0.32 0.28 0.4 0.3 0.19 -0.03 0.04 0.35 0.14 -0.76 -1.01 -0.06 0.57 0.73 -0.29 -0.29 -0.1 0.32 0.91 -0.04 -0.17 -0.47 -0.4 -0.44 -0.62
-0.6 -0.54 -0.27 -0.0 0.16 0.19 0.41 0.49 0.18 0.11 -0.33 -0.44 -0.17 0.14 1.33 -0.12 -0.47 -0.46 0.19 -0.42 0.29 -0.01 -0.33 -0.22 1.08 -0.05 -0.51 -0.32 -0.28 -0.36 -0.41 -0.94
0.02 -0.29 0.11 0.28 0.23 -0.16 0.08 0.46 0.67 0.88 0.67 0.44 1.06 0.25 0.17 0.32 -1.52 -2.56 -0.87 -1.28 -0.5 -1.36 -1.87 -1.89 1.02 1.09 0.16 0.08 -0.92 -1.22 -1.2 -0.99
-0.24 -0.53 -0.41 -0.21 -0.04 -0.13 0.11 0.33 0.34 0.29 0.28 0.1 0.19 0.6 1.19 0.1 -0.52 -0.84 -0.32 -0.91 -0.97 -0.37 -0.21 0.1 0.12 0.52 0.09 -0.11 -0.58 -0.49 -0.02 0.22
0.06 -0.06 -0.16 -0.15 -0.13 -0.43 -0.27 -0.14 0.05 -0.04 -0.03 -0.14 1.12 0.92 0.5 1.06 -0.3 -0.76 -0.05 -3.57 -0.18 -0.8 -0.05 0.25 0.7 0.04 -0.2 -0.1 -0.3 -0.25 -0.5 -1.11
0.27 -0.48 -0.35 0.02 0.33 0.1 -0.03 0.33 0.18 0.24 0.22 0.36 -0.22 -0.17 0.38 -0.05 -0.81 -3.25 -0.01 -0.67 -1.28 -0.52 -0.57 -0.43 1.06 1.01 0.82 0.22 -0.79 -0.57 -0.26 0.0
-0.14 -0.37 -0.33 -0.11 -0.11 -0.07 -0.06 0.26 0.28 0.45 0.21 0.3 0.35 0.66 0.67 0.18 -0.75 -1.15 0.07 -0.11 0.07 0.14 -0.22 0.1 -0.2 0.88 -0.48 -0.67 -0.64 -0.54 -0.47 -0.31
-0.03 -0.05 -0.42 -0.32 -0.29 -0.34 -0.28 -0.08 -0.1 0.09 0.04 0.14 1.11 0.73 0.26 0.69 -0.28 -0.63 0.62 -1.04 0.16 -3.51 0.3 0.48 0.33 -0.03 -0.8 -0.88 0.2 0.29 -0.62 -0.57
-0.15 -0.53 -0.46 -0.35 -0.21 -0.41 -0.24 0.4 0.39 0.44 0.39 0.15 0.38 0.6 0.37 0.3 -1.3 -1.65 -0.41 -0.34 0.03 -1.61 -0.63 -0.3 0.94 1.33 0.4 0.2 -0.88 -0.84 -0.52 -0.15
0.71 0.73 -0.12 0.43 -0.35 1.2 0.43 0.45 -0.06 1.18 0.99 -0.31 - 0.78 1.02 -3.43 -2.21 - - - - - - -1.56 -0.2 2.19 1.8 0.28 - -3.55 - -
-0.15 -0.22 -0.1 -0.2 -0.28 -0.13 -0.09 -0.03 -0.03 0.04 0.11 -0.11 0.99 0.89 -0.52 1.09 -0.75 -0.66 0.28 -2.39 -0.19 -0.58 -0.33 -0.14 1.08 0.08 -0.15 -0.19 -0.37 -0.35 -0.07 -0.41
0.11 0.22 -0.16 -0.14 -0.23 -0.18 -0.07 -0.04 0.03 0.05 0.4 0.18 -0.33 -0.23 -0.71 -0.41 -1.51 -3.13 -0.65 0.2 1.36 -2.03 -1.14 -1.01 1.02 1.19 1.21 1.14 -1.15 -0.97 -0.98 -1.15
-0.55 -0.12 -0.29 -0.02 -0.47 0.03 0.12 0.14 0.05 0.23 0.02 -0.12 -0.41 -1.09 0.08 -0.73 -1.37 -2.66 -0.34 0.98 0.69 -0.34 -0.76 -0.69 0.67 1.64 1.11 1.0 -1.01 -0.71 -1.5 -1.46
0.16 -0.53 -0.79 -0.32 -0.07 -0.6 -0.31 0.01 0.41 0.43 0.42 0.34 -1.9 -0.34 -1.96 -1.0 -0.47 -0.37 0.01 0.48 1.14 -0.82 -0.27 -0.3 0.91 1.52 0.14 0.3 -0.27 -0.23 -0.76 -0.64
0.52 0.42 -0.06 0.13 -0.47 0.37 0.44 0.64 0.59 0.73 0.6 0.43 -2.57 0.26 0.53 -1.72 -1.08 -4.36 -1.37 -3.51 0.15 -1.65 -2.13 -2.74 1.15 1.65 1.21 0.72 -1.55 -1.53 -2.89 -2.57
-0.49 -0.37 0.37 0.4 0.87 0.24 0.99 1.03 1.21 1.18 0.82 0.74 -2.99 -1.49 -5.73 -2.09 -1.11 -0.09 -1.5 0.91 0.8 -4.77 -2.0 -2.5 -1.5 1.27 -0.5 -0.58 -0.54 -0.81 -0.9 -1.58
0.07 0.34 0.2 0.34 0.29 0.27 0.14 0.45 0.29 0.46 0.4 0.2 -0.45 -0.13 0.46 -0.44 -1.15 -2.37 -0.49 -0.6 -0.39 -0.14 -0.42 -0.12 0.84 0.28 0.57 0.33 -1.1 -0.76 -0.49 -0.57
-0.12 0.2 0.11 0.21 0.34 0.13 0.04 0.08 0.25 0.19 0.19 -0.0 0.36 0.37 0.45 0.42 -0.56 -2.23 -0.14 -0.75 -0.73 -0.42 -0.41 -0.19 -0.2 0.59 0.55 0.66 -0.55 -0.52 -0.66 -0.57
-0.26 -0.49 -0.34 -0.3 -0.09 -0.1 0.17 0.51 0.47 0.57 0.5 0.24 0.26 -0.29 0.24 0.28 -0.75 -0.91 0.08 -0.43 0.08 -1.17 -0.37 -0.07 0.38 0.95 -0.43 -0.38 -0.28 -0.22 -0.01 -0.06
-0.3 -1.21 -1.51 -1.64 -2.1 -1.93 -1.37 -0.32 0.03 0.59 1.26 1.03 -0.76 -1.46 -1.56 0.12 -0.64 0.43 0.74 -0.4 0.75 - -0.34 -0.91 0.83 1.98 -1.37 -1.73 0.18 0.45 0.23 0.62
-0.28 -0.43 -0.57 -0.47 -0.34 -0.19 -0.15 0.23 0.35 0.22 0.23 -0.07 0.07 -0.79 -1.6 0.12 -0.76 -0.99 -0.08 0.69 0.96 -0.15 -0.35 -0.15 1.25 0.42 -0.05 0.18 -0.12 -0.31 -0.09 0.02
-0.93 -0.62 0.09 0.42 -1.09 -0.49 1.21 0.93 0.94 1.28 1.07 0.77 0.47 -0.16 0.57 -1.01 -1.46 -2.44 -2.7 -1.53 -1.51 1.52 -2.0 -0.14 -1.33 1.78 -1.82 -1.16 -2.8 -2.49 -2.28 -3.4
-0.13 -0.08 -0.06 -0.12 -0.16 -0.28 0.04 0.18 0.3 0.54 0.44 0.38 0.2 -0.14 -0.13 -0.06 -0.95 -0.86 -0.04 -0.56 -0.42 -3.36 -0.46 -0.25 0.87 1.09 0.47 0.14 -0.6 -0.58 0.02 0.28
-0.33 -0.32 -0.35 -0.16 0.19 0.27 0.28 0.45 0.36 0.5 0.26 0.01 -0.04 -0.01 1.15 -0.01 -1.1 -1.2 0.2 -0.82 -0.08 0.11 -0.58 -0.19 0.95 0.29 -0.06 -0.19 -0.64 -0.52 -0.83 -0.63
-0.18 -0.24 -0.04 -0.07 -0.13 -0.05 -0.02 0.46 0.34 0.32 0.4 0.1 0.28 0.62 0.77 0.38 -0.82 -0.99 -0.24 -0.35 -0.66 0.21 -0.2 0.05 -0.69 0.71 0.08 -0.03 -0.65 -0.56 -0.57 -0.38
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0.04 -0.12 -0.4 -0.2 -0.12 -0.06 -0.43 -0.01 0.09 0.37 0.09 0.13 0.36 0.05 0.06 0.41 -0.33 -0.64 -0.18 -3.9 -0.47 -0.84 -0.33 -0.1 1.01 1.11 0.11 0.37 -0.13 -0.1 -0.15 -0.13
0.15 0.06 -0.33 -0.09 -0.37 0.04 -0.42 0.08 -0.01 0.19 -0.15 0.09 -0.68 -0.09 -0.22 -0.34 -0.84 -2.08 -0.27 0.14 0.92 -0.07 -0.61 -0.87 1.34 1.22 0.93 0.81 -0.94 -0.98 -1.02 -1.42
0.0 -0.04 -0.02 0.02 -0.13 -0.1 0.04 0.52 0.35 0.65 0.47 0.53 -0.0 0.47 0.6 -0.28 -1.67 -2.59 -1.03 -2.85 -0.66 0.55 -0.6 -0.47 1.03 1.29 0.02 -0.09 -0.55 -0.71 -0.94 -1.1
-0.3 -0.73 -0.07 -0.04 -0.05 -0.04 0.53 0.81 0.87 0.98 0.74 0.6 0.15 -1.27 -1.25 -1.07 -0.91 -0.99 -1.06 0.42 -0.44 -1.85 -0.41 -0.37 -0.27 0.92 -0.07 -0.09 -0.35 -0.41 0.22 0.52
0.05 -0.11 -0.3 -0.0 -0.07 0.07 -0.17 0.17 0.16 0.26 0.06 0.08 0.47 0.45 0.91 0.83 -0.47 -0.99 0.38 -2.11 -1.21 -0.59 -0.09 0.1 -0.29 0.73 -0.07 -0.49 -0.44 -0.41 0.02 -0.2
-0.01 -0.15 0.01 0.03 -0.06 -0.09 0.15 0.41 0.35 0.62 0.57 0.45 -0.54 -0.11 -0.07 -0.2 -0.6 -0.82 -0.43 0.87 0.73 -0.73 -0.27 -0.32 0.31 0.25 -0.45 -0.41 -0.42 -0.46 -0.32 -0.39
0.17 -0.02 -0.01 -0.12 -0.19 -0.11 -0.03 0.15 0.29 0.39 0.39 0.27 0.48 0.66 0.59 0.47 -0.68 -0.71 0.19 -0.42 -0.64 -1.48 -0.23 -0.06 0.19 0.24 -0.33 -0.42 -0.62 -0.54 -0.07 0.09
-0.31 -0.22 -0.35 -0.0 0.01 0.05 -0.11 0.09 0.29 0.21 0.17 0.11 0.44 0.1 0.73 0.65 -0.97 -1.16 -0.63 -0.83 -1.34 -0.66 -0.26 -0.06 0.68 0.94 0.22 0.13 -0.63 -0.61 0.16 0.14
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-0.0 -0.07 -0.18 0.11 0.26 0.1 0.32 0.42 0.43 0.63 0.53 0.5 -0.34 0.21 1.0 -0.14 -0.59 -1.04 -0.24 -1.05 -0.15 -0.21 -0.52 -0.39 0.1 0.44 -0.21 -0.24 -0.43 -0.41 -0.72 -0.61
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.