1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_213 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.47 0.49 0.45 0.44 0.45 0.51 0.46 0.49 0.55 0.57 0.51 0.44 0.51 0.4 0.35 0.59 0.37 0.26 0.69 0.38 0.37 0.11 0.53 0.62 0.63 1.0 0.55 0.65 0.47 0.47 0.31 0.36
0.74 0.84 0.78 0.75 0.72 0.74 0.8 0.74 0.71 0.78 0.8 0.71 0.69 0.8 0.81 0.85 0.56 0.48 0.67 0.46 0.35 0.22 0.72 0.72 0.93 0.76 0.88 1.0 0.56 0.57 0.75 0.85
0.29 0.35 0.41 0.77 0.99 1.0 0.76 0.73 0.56 0.5 0.41 0.31 0.54 0.6 0.8 0.68 0.5 0.25 0.77 0.08 0.31 0.16 0.52 0.39 0.82 0.82 0.94 0.85 0.45 0.43 0.3 0.4
0.74 0.78 0.75 0.8 0.75 0.82 0.7 0.7 0.66 0.66 0.64 0.68 0.6 0.65 0.77 0.6 0.58 0.88 0.63 0.42 0.79 0.3 0.55 0.54 1.0 0.78 0.97 0.93 0.58 0.53 0.67 0.77
0.62 0.7 0.78 0.78 0.79 0.85 0.56 0.62 0.6 0.56 0.5 0.51 0.82 0.5 0.62 0.83 0.53 0.43 0.79 0.44 0.12 0.03 0.64 0.64 1.0 0.99 0.76 0.84 0.42 0.43 0.3 0.38
0.02 0.12 0.22 0.42 0.59 0.58 0.38 0.15 0.05 0.02 0.01 0.01 0.11 0.09 0.16 0.23 0.28 0.11 0.21 0.08 0.12 0.04 0.32 0.25 0.78 0.33 0.84 1.0 0.04 0.05 0.02 0.05
0.53 0.69 0.77 0.73 0.83 0.75 0.61 0.62 0.63 0.62 0.56 0.49 0.57 0.88 0.95 0.64 0.64 0.62 0.56 0.53 0.18 0.3 1.0 0.92 0.46 0.68 0.81 0.94 0.5 0.53 0.28 0.3
0.59 0.5 0.88 0.93 0.82 1.0 0.89 0.3 0.25 0.16 0.28 0.2 0.73 0.3 0.49 0.58 0.43 0.42 0.2 0.05 0.14 0.19 0.57 0.67 0.56 0.1 0.21 0.2 0.14 0.17 0.1 0.09
0.36 0.52 0.59 0.72 0.75 0.82 0.63 0.62 0.49 0.47 0.4 0.38 0.3 0.45 0.89 0.34 0.44 0.35 0.37 0.26 0.55 0.26 0.43 0.41 1.0 0.37 0.68 0.7 0.28 0.31 0.19 0.17
0.31 0.38 0.42 0.45 0.44 0.47 0.4 0.38 0.41 0.33 0.33 0.31 0.41 0.58 0.55 0.43 0.32 0.28 0.46 0.35 0.26 0.17 0.69 1.0 0.55 0.26 0.3 0.36 0.32 0.35 0.16 0.17
0.17 0.21 0.26 0.54 0.88 0.88 0.62 0.41 0.28 0.25 0.22 0.17 0.58 0.54 0.61 0.52 0.35 0.18 0.46 0.13 0.43 0.02 0.48 0.43 1.0 0.49 0.47 0.52 0.18 0.19 0.13 0.2
0.41 0.47 0.5 0.46 0.45 0.53 0.42 0.36 0.4 0.39 0.38 0.32 0.75 0.42 0.42 0.6 0.2 0.17 0.19 0.78 0.35 0.4 0.44 0.42 1.0 0.29 0.38 0.44 0.17 0.22 0.13 0.12
0.34 0.47 0.6 0.76 0.91 0.98 1.0 0.94 0.61 0.54 0.36 0.38 0.44 0.69 0.93 0.5 0.55 0.42 0.55 0.03 0.09 0.02 0.78 0.74 0.21 0.73 0.83 0.76 0.43 0.46 0.47 0.58
0.31 0.36 0.37 0.36 0.42 0.41 0.39 0.34 0.33 0.3 0.3 0.27 0.53 1.0 0.63 0.67 0.35 0.42 0.51 0.21 0.21 0.17 0.61 0.65 0.34 0.44 0.63 0.6 0.3 0.34 0.35 0.39
0.15 0.34 0.44 0.69 0.58 0.66 0.82 0.44 0.59 0.37 0.29 0.18 0.07 0.67 0.02 0.2 0.18 0.12 0.21 0.04 0.49 0.0 0.04 0.08 0.88 0.12 1.0 0.83 0.16 0.25 0.35 0.58
0.17 0.28 0.35 0.34 0.34 0.4 0.41 0.21 0.13 0.13 0.12 0.11 0.51 1.0 0.36 0.41 0.2 0.35 0.39 0.05 0.22 0.03 0.51 0.55 0.18 0.27 0.6 0.61 0.14 0.14 0.09 0.11
0.54 0.67 0.74 0.74 0.76 0.92 0.75 0.7 0.63 0.54 0.47 0.45 0.61 0.66 0.51 0.77 0.53 0.44 0.59 0.17 0.23 0.06 0.76 0.81 1.0 0.42 0.67 0.63 0.39 0.42 0.52 0.7
0.14 0.16 0.28 0.52 0.68 0.63 0.72 0.7 0.57 0.4 0.3 0.21 0.56 0.44 0.8 0.34 0.41 0.19 0.29 0.04 0.09 0.06 0.44 0.42 0.22 1.0 0.53 0.61 0.38 0.41 0.25 0.29
0.23 0.52 0.72 1.0 0.91 0.74 0.62 0.38 0.31 0.21 0.17 0.15 0.44 1.0 0.27 0.39 0.21 0.16 0.46 0.06 0.16 0.03 0.28 0.24 0.63 0.34 0.47 0.4 0.15 0.17 0.28 0.33
0.3 0.41 0.4 0.53 0.85 1.0 0.7 0.59 0.45 0.33 0.31 0.26 0.41 0.55 0.54 0.51 0.56 0.34 0.58 0.14 0.23 0.29 0.5 0.46 0.68 0.54 0.91 0.97 0.4 0.42 0.17 0.17
0.58 0.62 0.64 0.66 0.69 0.65 0.64 0.74 0.74 0.74 0.71 0.68 0.73 0.67 0.59 0.68 0.41 0.32 0.62 0.44 0.26 0.06 0.59 0.63 0.86 1.0 0.65 0.68 0.47 0.48 0.55 0.58
0.47 0.62 0.92 0.75 0.75 0.96 0.74 0.66 0.72 0.46 0.5 0.51 0.33 0.45 0.66 0.5 0.24 0.06 0.45 0.28 0.07 0.12 0.34 0.39 0.82 0.66 0.95 1.0 0.26 0.32 0.11 0.12
0.37 0.45 0.41 0.56 0.63 0.66 0.63 0.56 0.49 0.52 0.34 0.36 0.67 0.6 0.38 0.76 0.25 0.27 0.33 0.43 0.04 0.12 0.39 0.52 1.0 0.53 0.41 0.56 0.19 0.21 0.1 0.09
0.92 0.98 0.77 0.79 0.82 0.77 0.6 0.62 0.71 0.73 0.78 0.71 0.88 0.85 0.9 0.99 0.78 0.76 0.82 0.54 0.41 0.28 0.61 0.6 0.69 0.95 1.0 0.98 0.55 0.63 0.51 0.51
0.14 0.26 0.43 0.59 0.77 0.77 0.51 0.31 0.22 0.18 0.15 0.1 0.47 0.67 0.64 0.64 0.47 0.35 0.4 0.3 0.15 0.04 0.56 0.49 0.22 0.28 0.78 1.0 0.27 0.36 0.08 0.11
0.25 0.37 0.55 0.79 0.91 0.87 0.9 0.74 0.56 0.45 0.35 0.29 0.5 0.74 0.71 0.42 0.57 0.3 0.42 0.18 0.27 0.13 0.64 0.63 1.0 0.48 0.78 0.76 0.38 0.41 0.25 0.35
0.22 0.34 0.41 0.47 0.62 0.7 0.56 0.48 0.32 0.27 0.24 0.19 0.37 0.48 0.17 0.5 0.3 0.35 0.55 0.2 0.42 0.07 0.52 0.47 1.0 0.31 0.57 0.56 0.24 0.26 0.3 0.37
0.58 0.63 0.62 0.56 0.62 0.58 0.5 0.57 0.51 0.53 0.55 0.47 0.83 0.76 0.39 0.9 0.39 0.37 0.76 0.53 0.31 0.41 0.58 0.66 0.52 1.0 0.73 0.67 0.41 0.43 0.42 0.45
0.49 0.82 0.67 0.61 0.64 0.69 0.66 0.6 0.59 0.6 0.58 0.52 0.84 0.63 0.42 0.83 0.44 0.19 0.83 0.43 0.28 0.12 0.71 0.78 0.62 1.0 0.7 0.76 0.57 0.75 0.48 0.41
0.26 0.53 0.4 0.6 0.6 0.69 0.55 0.48 0.4 0.32 0.35 0.3 0.62 0.36 0.43 0.71 0.33 0.2 0.29 0.06 0.2 0.06 0.64 0.8 1.0 0.42 0.63 0.59 0.2 0.21 0.18 0.12
0.3 0.33 0.37 0.39 0.31 0.4 0.31 0.36 0.35 0.35 0.34 0.34 0.38 0.19 0.84 0.38 0.28 0.24 0.36 0.19 0.32 0.16 0.54 1.0 0.46 0.4 0.34 0.45 0.35 0.35 0.23 0.24
0.5 0.5 0.49 0.71 1.0 0.7 0.65 0.59 0.62 0.47 0.36 0.33 0.37 0.41 0.77 0.55 0.32 0.28 0.59 0.26 0.49 0.13 0.35 0.31 0.68 0.61 0.63 0.79 0.25 0.28 0.18 0.17
0.25 0.4 0.4 0.46 0.58 0.62 0.42 0.28 0.2 0.22 0.16 0.17 0.18 1.0 0.03 0.58 0.55 0.35 0.37 0.1 0.15 0.0 0.23 0.12 0.44 0.65 0.8 0.68 0.33 0.27 0.21 0.08
0.03 0.1 0.21 0.36 0.8 0.76 1.0 0.27 0.17 0.06 0.05 0.02 0.28 0.5 0.07 0.22 0.02 0.04 0.03 0.07 0.0 0.0 0.09 0.2 0.26 0.01 0.07 0.13 0.02 0.07 0.02 0.05
0.42 0.51 0.74 0.83 0.99 1.0 0.97 0.94 0.79 0.72 0.68 0.46 0.55 0.69 0.97 0.61 0.59 0.37 0.64 0.13 0.53 0.24 0.8 0.87 0.64 0.74 0.99 0.9 0.45 0.5 0.4 0.41
0.32 0.6 0.42 0.34 0.32 0.4 0.45 0.28 0.23 0.26 0.26 0.29 1.0 0.87 0.21 0.72 0.14 0.16 0.16 0.58 0.29 0.63 0.18 0.23 0.96 0.22 0.51 0.23 0.18 0.13 0.32 0.18
0.13 0.27 0.47 0.52 0.5 0.44 0.42 0.22 0.22 0.21 0.2 0.14 0.29 0.41 0.57 0.26 0.28 0.09 0.3 0.0 0.36 0.01 0.51 1.0 0.66 0.49 0.4 0.57 0.13 0.16 0.1 0.13
0.49 0.52 0.53 0.6 0.64 0.57 0.59 0.51 0.52 0.52 0.47 0.46 0.56 0.48 0.56 0.62 0.34 0.25 0.53 0.38 0.18 0.51 0.4 0.4 1.0 0.57 0.56 0.56 0.39 0.42 0.3 0.28
0.33 0.43 0.35 0.62 0.53 0.76 0.65 0.61 0.59 0.44 0.42 0.35 0.42 0.55 0.66 0.47 0.38 0.12 0.53 0.19 0.24 0.11 0.54 0.49 0.72 0.58 1.0 0.97 0.27 0.32 0.29 0.39
0.1 0.2 0.3 0.43 0.48 0.53 0.52 0.33 0.29 0.22 0.17 0.14 0.34 1.0 0.17 0.26 0.44 0.09 0.09 0.07 0.25 0.01 0.42 0.42 0.21 0.35 0.57 0.65 0.24 0.24 0.21 0.26
0.19 0.29 0.37 0.55 0.4 0.47 0.62 0.54 0.38 0.32 0.29 0.16 0.15 1.0 0.64 0.17 0.27 0.39 0.06 0.02 0.07 0.0 0.65 0.7 0.06 0.38 0.52 0.6 0.16 0.15 0.14 0.09
0.22 0.44 0.24 0.27 0.31 0.36 0.18 0.16 0.25 0.27 0.18 0.32 0.35 0.39 0.18 0.5 0.13 0.0 0.25 0.06 0.0 0.0 0.29 0.4 1.0 0.39 0.26 0.19 0.18 0.11 0.1 0.06
0.16 0.25 0.25 0.33 0.7 0.86 0.68 0.61 0.3 0.16 0.17 0.16 0.29 0.26 0.23 0.2 0.67 0.27 0.52 0.48 0.4 0.25 0.7 0.43 0.66 0.42 0.78 1.0 0.41 0.38 0.17 0.11
0.01 0.02 0.08 0.39 0.53 1.0 0.3 0.23 0.09 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.16 0.25 0.04 0.06 0.12 0.0 0.01 0.02 0.08 0.02
0.26 0.34 0.39 0.48 0.59 0.63 0.49 0.48 0.26 0.22 0.18 0.17 0.29 0.24 0.45 0.3 0.32 0.25 0.35 0.15 0.15 0.1 0.37 0.36 0.78 0.47 1.0 0.92 0.2 0.22 0.27 0.32
0.47 0.66 0.75 0.9 1.0 0.83 0.68 0.43 0.42 0.37 0.3 0.25 0.36 0.56 0.53 0.49 0.52 0.15 0.56 0.33 0.22 0.1 0.35 0.33 0.77 0.52 0.6 0.59 0.29 0.34 0.44 0.4
0.21 0.32 0.53 0.71 0.98 0.91 0.83 0.55 0.4 0.3 0.25 0.18 0.83 1.0 0.31 0.64 0.37 0.31 0.67 0.14 0.23 0.05 0.62 0.62 0.49 0.61 0.64 0.65 0.26 0.3 0.12 0.18
0.21 0.28 0.4 0.53 0.78 0.75 1.0 0.58 0.57 0.36 0.33 0.21 0.46 0.61 0.61 0.18 0.18 0.08 0.46 0.02 0.01 0.01 0.16 0.36 0.09 0.33 0.56 0.76 0.18 0.29 0.08 0.09
0.07 0.19 0.26 0.38 0.55 0.69 0.7 0.45 0.21 0.13 0.08 0.07 0.2 0.5 0.21 0.39 0.23 0.18 0.27 0.04 0.25 0.03 0.3 0.22 0.53 0.26 0.9 1.0 0.16 0.18 0.1 0.1
0.47 0.62 0.65 0.96 0.93 1.0 0.86 0.74 0.71 0.65 0.54 0.58 0.32 0.57 0.82 0.4 0.43 0.4 0.61 0.09 0.12 0.05 0.53 0.56 0.96 0.55 0.86 0.81 0.28 0.3 0.3 0.29
0.51 0.68 0.75 0.9 1.0 0.77 0.81 0.45 0.41 0.42 0.31 0.34 0.33 0.55 0.47 0.42 0.34 0.25 0.5 0.17 0.49 0.05 0.31 0.27 0.49 0.64 0.62 0.59 0.25 0.28 0.39 0.39
0.33 0.34 0.41 0.55 0.7 0.76 0.61 0.67 0.58 0.48 0.34 0.34 0.53 0.45 0.24 0.71 0.5 0.35 0.71 0.13 0.14 0.05 0.65 0.67 1.0 0.55 0.59 0.65 0.5 0.52 0.25 0.31
0.24 0.41 0.32 0.46 0.8 0.77 0.41 0.33 0.19 0.26 0.15 0.12 0.29 0.11 0.11 0.41 0.5 0.42 0.65 0.28 0.35 0.06 0.72 0.63 1.0 0.31 0.72 0.91 0.24 0.22 0.19 0.18
0.15 0.27 0.32 0.41 0.52 0.54 0.25 0.2 0.15 0.15 0.12 0.11 0.33 0.24 0.29 0.39 0.34 0.11 0.57 0.06 0.33 0.12 0.38 0.36 1.0 0.29 0.38 0.47 0.15 0.16 0.1 0.14
0.29 0.28 0.34 0.39 0.53 0.45 0.32 0.44 0.25 0.26 0.26 0.2 0.53 0.29 0.24 0.53 0.27 0.24 0.45 0.24 0.09 0.12 0.37 0.45 1.0 0.32 0.31 0.36 0.31 0.28 0.27 0.29
0.62 0.75 0.76 0.73 0.8 0.86 0.79 0.73 0.62 0.63 0.53 0.51 0.66 0.89 0.48 0.68 0.53 0.56 0.58 0.14 0.78 0.02 0.5 0.53 1.0 0.66 0.94 0.92 0.46 0.43 0.76 0.7
0.41 0.67 0.64 0.91 0.74 0.77 0.65 0.7 0.68 0.7 0.55 0.45 0.59 0.57 0.89 0.53 0.6 0.32 0.34 0.21 0.06 0.04 0.71 0.66 0.8 1.0 0.82 0.7 0.34 0.37 0.22 0.3
0.28 0.33 0.37 0.41 0.5 0.49 0.5 0.53 0.51 0.35 0.36 0.28 0.45 0.7 1.0 0.53 0.43 0.31 0.62 0.21 0.54 0.28 0.45 0.49 0.41 0.53 0.6 0.72 0.4 0.45 0.26 0.22
0.11 0.2 0.25 0.43 0.49 0.61 0.5 0.51 0.21 0.19 0.16 0.13 0.39 0.57 1.0 0.45 0.26 0.16 0.32 0.1 0.48 0.25 0.58 0.77 0.82 0.18 0.58 0.71 0.29 0.34 0.1 0.07
0.19 0.25 0.26 0.39 0.64 0.83 0.53 0.33 0.26 0.18 0.19 0.16 0.43 0.85 0.43 0.58 0.36 0.39 0.47 0.05 0.37 0.05 0.7 0.7 0.65 0.21 0.93 1.0 0.22 0.27 0.14 0.15
0.31 0.36 0.49 0.55 0.77 1.0 0.75 0.7 0.56 0.49 0.47 0.36 0.48 0.42 0.53 0.56 0.47 0.31 0.42 0.03 0.43 0.2 0.54 0.56 0.63 0.54 0.96 0.98 0.34 0.38 0.37 0.38
0.25 0.36 0.47 0.69 0.73 0.62 0.44 0.33 0.32 0.26 0.18 0.21 0.24 0.47 0.23 0.39 0.1 0.03 0.21 0.0 0.27 0.0 0.1 0.06 1.0 0.28 0.53 0.63 0.1 0.08 0.04 0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)