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Heatmap: Cluster_99 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.25 -0.86 -1.12 -0.96 -0.12 -0.33 -0.87 0.59 0.26 0.52 0.8 0.69 0.59 1.22 1.04 0.74 -1.29 -2.78 -0.18 -6.27 -2.6 - -1.51 -1.1 -2.87 1.23 1.13 1.17 -0.59 -0.41 -0.55 -1.0
0.08 0.02 -0.35 0.24 0.21 0.27 0.21 -0.04 0.14 0.09 0.04 -0.05 0.2 1.63 0.14 0.57 -0.88 -1.57 0.19 -0.37 -0.93 0.15 -0.57 -0.26 0.46 0.36 -0.46 -0.05 -0.38 -0.65 -1.5 -1.26
-0.32 0.17 0.41 0.43 0.33 0.47 0.4 0.4 0.31 0.27 0.19 -0.05 -0.15 0.8 1.03 -0.34 -0.16 -0.52 -0.4 -1.75 -2.34 -1.16 0.16 0.09 -0.23 -0.67 0.01 0.26 -0.32 -0.26 -0.64 -0.59
0.09 -0.31 -0.98 -0.6 -0.37 -0.49 -0.2 0.04 0.31 -0.23 0.5 0.07 1.46 1.5 0.86 0.85 -1.76 -2.0 0.19 1.47 - -5.16 -0.95 -0.36 - 0.78 0.3 -0.07 -2.08 -1.61 -1.04 0.12
-0.23 -0.15 -0.31 0.07 -0.05 -0.03 -0.02 0.04 0.04 0.02 0.01 -0.2 0.42 0.52 0.73 0.49 -0.31 -0.32 0.22 -0.0 -1.57 -0.13 0.06 0.21 0.15 -0.04 -0.13 0.07 -0.4 -0.17 -0.26 -0.11
-0.15 0.29 0.16 0.44 0.37 0.37 0.14 0.01 0.25 -0.03 0.12 -0.16 0.1 0.73 1.05 0.18 0.02 -0.56 0.33 -2.06 -1.49 -2.18 0.14 0.04 0.44 -0.3 0.14 -0.0 -0.41 -0.29 -1.19 -1.2
-0.08 0.2 0.42 0.49 0.33 0.39 0.09 0.48 0.39 0.1 0.13 -0.16 0.53 0.42 0.85 0.44 -0.48 -0.7 -0.3 -3.55 -0.68 -0.44 0.03 -0.11 -0.02 0.23 0.1 0.02 -0.72 -0.59 -1.62 -1.23
0.04 -0.31 -0.25 -0.21 -0.19 0.04 0.02 0.36 -0.06 0.55 0.15 0.14 0.18 1.31 1.49 0.33 -1.26 -3.12 -0.61 -0.2 -1.91 -1.17 -0.55 -0.7 -0.76 0.9 1.03 0.81 -1.38 -1.52 -1.11 -1.19
-0.17 0.17 0.29 0.45 0.44 0.57 0.28 0.27 0.13 0.16 -0.09 -0.25 -0.19 0.69 0.71 -0.05 -0.26 -0.23 0.22 -2.27 -2.13 -3.02 0.01 0.03 -0.58 0.12 0.12 0.02 -0.22 -0.16 -0.09 0.09
-0.08 0.13 0.2 0.11 0.2 0.14 0.06 0.21 0.18 0.28 0.19 -0.07 0.34 0.66 0.78 0.3 -0.41 -0.74 0.11 -1.12 -0.44 -0.15 0.05 0.09 -0.06 -0.04 -0.35 -0.27 -0.42 -0.34 -0.67 -0.48
-0.39 0.08 0.11 0.16 0.25 0.14 -0.2 -0.3 -0.58 -0.45 -0.61 -0.88 0.87 0.87 1.42 1.0 0.12 -0.14 0.08 -2.31 -1.66 0.33 0.34 0.37 -1.24 -0.15 -0.32 -0.2 -0.49 -0.28 -0.98 -0.58
-0.17 -0.26 -0.27 -0.14 -0.06 -0.06 -0.04 0.05 -0.01 0.04 0.02 -0.12 0.08 0.96 1.31 0.11 -0.74 -1.05 -0.15 0.43 -0.77 -0.22 -0.6 -0.39 0.78 0.36 0.26 0.26 -0.73 -0.59 -0.66 -0.76
-0.07 0.42 0.48 0.6 0.54 0.63 0.4 0.1 0.24 -0.02 0.02 -0.05 0.02 0.28 1.18 0.03 -0.07 -0.68 -0.57 -2.81 -0.19 -2.42 0.14 0.23 -0.14 -0.63 -0.15 0.15 -0.58 -0.33 -1.12 -0.93
-0.23 0.27 0.44 0.41 0.47 0.64 0.44 0.26 0.21 0.03 -0.06 -0.27 -0.19 0.68 0.93 0.14 -0.08 -0.43 -0.22 -2.29 -1.09 -5.88 -0.22 0.08 0.29 -0.72 0.15 0.43 -0.57 -0.34 -0.58 -0.44
0.2 0.27 0.22 0.23 0.28 0.18 0.08 0.24 0.29 0.27 0.2 0.16 0.22 0.36 0.54 0.31 0.09 -0.56 0.36 -1.04 -1.53 -2.09 0.12 0.1 -0.37 0.04 -0.17 -0.1 -0.07 0.01 -0.97 -0.92
-0.09 -0.07 0.01 0.09 0.05 0.03 0.01 0.08 0.13 0.12 0.02 -0.11 0.15 0.8 0.72 0.17 -0.38 -0.63 0.08 -0.28 -1.33 -0.67 0.15 0.39 0.11 0.23 0.0 0.06 -0.44 -0.38 -0.37 -0.21
-0.06 0.07 0.21 0.1 0.27 0.36 0.16 0.39 0.11 -0.02 0.23 -0.16 0.02 0.37 0.66 0.41 -0.38 -0.38 -0.12 -1.02 -0.79 -1.19 -0.02 -0.13 0.31 -0.12 0.27 0.56 -0.37 -0.27 -0.73 -0.8
0.03 -0.11 -0.23 -0.19 -0.2 -0.22 -0.33 -0.02 -0.2 -0.19 -0.09 -0.32 0.28 0.89 0.99 0.34 -0.63 -0.75 0.09 -0.06 0.01 -0.76 -0.05 0.17 -0.02 0.55 0.54 0.36 -0.63 -0.59 -0.43 -0.29
0.44 0.39 0.3 0.53 0.2 0.35 0.12 0.62 0.74 0.94 0.89 0.77 -1.3 1.05 1.2 -1.25 -1.74 -3.43 -1.13 -5.17 -2.08 -2.91 -1.82 -1.72 -0.85 1.35 0.64 0.68 -1.63 -1.63 -1.85 -2.0
-0.21 -0.37 -0.87 -0.12 -0.12 -0.46 -0.28 0.01 -0.1 0.04 0.01 -0.03 0.94 1.53 1.25 0.75 -0.88 -0.63 0.0 1.02 -1.0 -1.77 -0.74 -0.63 0.09 0.39 -0.3 -0.42 -0.71 -0.76 -0.81 -0.67
-0.47 -0.25 -0.35 -0.21 -0.09 -0.13 -0.07 -0.24 -0.54 -0.77 -0.54 -0.61 -0.03 1.23 1.53 -0.05 -0.47 -0.34 -0.2 0.67 -0.23 -0.08 -0.45 -0.32 -0.43 0.51 0.69 0.43 -0.81 -0.71 -0.27 -0.17
-0.18 -0.34 -0.18 -0.16 0.21 -0.01 0.02 -0.4 -0.29 -0.68 -0.62 -0.79 -0.01 0.92 1.35 0.35 -0.46 -0.09 0.44 0.13 -0.73 -1.65 -0.08 0.14 -0.32 -0.16 0.73 0.55 -0.25 -0.13 -0.56 -0.15
0.15 -0.02 -0.11 -0.04 0.07 0.11 -0.27 -0.02 -0.18 -0.22 -0.2 -0.36 0.59 1.03 1.17 0.75 -0.64 -0.93 0.1 -1.5 -1.68 0.16 -0.08 -0.04 -0.42 0.35 0.3 0.28 -0.51 -0.4 -0.64 -0.55
0.53 0.47 0.25 0.78 0.84 0.69 -0.05 0.72 0.5 0.06 0.61 0.21 -0.52 1.71 1.32 -0.81 -2.16 -5.79 -1.16 -2.22 -4.1 -3.17 -1.91 -2.31 -1.22 0.89 0.96 0.84 -3.05 -2.36 -2.73 -3.9
0.33 0.37 0.09 0.34 0.56 0.47 0.45 0.6 0.85 0.39 0.69 0.49 -0.03 1.02 0.86 -0.19 -1.82 -2.09 -1.33 -2.33 -2.17 -2.13 -0.43 -0.39 -0.85 1.07 0.4 0.47 -1.69 -1.5 -2.14 -2.23
-0.49 -0.31 -0.02 -0.17 0.08 0.0 0.27 -0.74 -0.22 -0.22 -0.3 -0.24 -0.45 1.28 1.33 -0.22 -1.88 -3.16 0.74 1.26 -0.85 0.52 -1.95 -1.54 0.92 0.83 0.42 1.09 -2.48 -1.61 -4.14 -3.53
0.17 -0.02 -0.05 0.28 0.28 0.07 0.16 0.08 0.36 0.26 0.22 0.31 -0.42 0.69 0.73 -0.48 -0.48 -0.99 -1.13 -0.08 -1.3 -0.23 -0.4 -0.42 0.41 0.1 0.76 0.76 -0.67 -0.42 -0.88 -0.86
0.49 0.39 0.08 0.28 0.11 0.14 0.21 0.43 0.47 0.5 0.52 0.55 -0.59 0.35 0.36 -0.14 -0.57 -1.24 0.03 -0.84 -1.06 -0.53 -0.68 -0.75 -0.2 0.49 0.44 0.43 -0.62 -0.65 -0.78 -0.78
-1.0 -1.44 -1.0 -0.92 -2.16 -1.01 -0.94 -0.88 -0.58 -1.27 -1.06 -1.36 -0.57 2.63 3.02 0.7 -1.8 -0.88 -1.17 1.46 -1.72 0.78 -2.07 -1.72 -1.67 -2.82 -0.5 -0.1 -2.17 -1.34 -2.11 -2.06
-0.48 0.04 -0.12 -0.24 -0.05 -0.19 -0.58 -0.72 -0.39 -0.54 -0.48 -0.81 1.33 1.27 1.87 1.5 -0.36 -1.18 0.53 -0.57 -3.43 -0.41 0.18 0.49 -0.48 -0.4 -0.58 -0.68 -1.0 -0.61 -2.14 -1.5
0.18 0.05 0.61 0.2 -0.32 0.44 0.19 0.29 0.41 0.25 0.65 0.29 0.48 1.07 0.61 0.31 -1.46 -3.93 -0.52 -0.33 -0.63 -1.12 -0.93 -0.53 0.27 0.1 0.33 0.35 -1.7 -1.16 -0.83 -0.53
-1.84 -1.54 -1.71 -0.33 0.21 -0.86 -1.69 -0.56 -0.88 -0.79 -1.29 -1.45 1.02 2.02 2.89 1.15 -2.74 - 0.14 1.76 -1.0 -1.92 -2.49 -1.46 -1.17 -0.42 0.04 0.4 -3.25 -2.73 -2.84 -3.49
-1.35 -0.7 -2.73 -0.38 -0.01 -0.8 -1.21 -1.09 -0.67 -1.15 -1.21 -0.97 1.35 1.38 2.56 1.92 -2.4 -3.84 1.65 0.95 -2.49 -1.15 -2.03 -1.04 -0.61 -0.29 -0.18 -0.26 -2.39 -1.36 -2.85 -2.99
0.09 0.2 -0.0 0.07 0.02 0.35 0.04 0.27 0.26 0.26 0.15 0.02 0.7 1.54 0.47 0.71 -0.96 -3.18 -0.19 -2.03 -2.82 0.26 -0.43 -0.5 -0.18 0.15 0.21 -0.32 -0.65 -0.54 -0.21 -1.08
0.02 0.14 -0.46 -0.02 -0.34 0.08 -0.07 -0.16 0.33 0.02 -0.16 -0.04 -0.64 0.95 1.66 -0.41 -1.61 -1.42 -0.85 1.29 0.32 -0.22 -1.14 -0.95 1.09 0.6 0.17 0.03 -1.38 -1.01 -2.43 -2.13
-0.03 -0.06 -0.07 0.03 0.15 0.12 0.22 0.34 0.06 0.16 0.21 -0.05 0.22 0.5 0.53 0.45 -0.68 -1.56 -0.18 0.63 -2.43 -0.66 -0.58 -0.47 -0.13 0.69 0.74 0.72 -0.64 -0.53 -1.01 -0.97
-1.32 -1.78 -1.79 -1.1 -1.59 -1.69 -2.49 -1.62 -2.2 -2.37 -1.37 -2.85 -0.16 3.2 1.94 0.68 -0.87 -0.37 -0.36 1.7 - -0.62 0.4 0.59 -0.88 -0.68 -1.14 -0.38 -0.84 -0.91 -1.17 -2.12
0.3 0.36 0.26 0.51 0.65 0.47 0.41 0.46 0.47 0.41 0.33 0.29 0.01 1.02 0.72 -0.21 -1.57 -4.46 -0.43 -1.03 -2.64 -2.62 -1.04 -0.75 0.11 0.89 0.74 0.72 -1.61 -1.6 -1.8 -1.96
0.1 0.31 0.43 0.58 0.33 0.58 0.39 0.36 0.65 0.54 0.76 0.3 -0.7 1.0 0.71 -0.8 -2.49 -4.51 -0.99 -3.25 -3.04 -1.83 -1.7 -1.46 -0.85 1.68 1.28 1.0 -2.39 -2.45 -2.68 -2.89
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0.58 0.64 -1.37 0.46 -0.96 -0.32 0.61 0.42 1.33 0.8 0.93 1.03 -0.33 1.01 1.23 0.1 -1.52 -5.71 -0.66 -4.04 - -4.28 -1.44 -0.7 - 0.97 0.77 0.57 -1.33 -1.06 -2.23 -1.99
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0.03 -0.07 0.4 0.72 0.25 0.18 0.06 -0.36 0.19 -0.42 -0.34 -0.08 0.06 2.05 1.34 0.48 -1.42 -0.83 -0.66 0.62 -3.91 - -0.54 -0.58 -1.7 0.6 0.32 0.36 -1.14 -1.41 -2.08 -2.07
0.53 0.21 -0.15 0.19 0.1 0.25 -0.22 0.28 0.49 0.53 0.65 0.73 0.86 1.18 1.13 0.87 -2.02 -5.14 -1.39 -2.87 -1.38 -3.19 -0.95 -0.95 -0.67 0.91 0.37 0.32 -1.69 -1.51 -1.39 -1.18
0.11 0.14 0.1 -0.02 0.38 0.08 -0.32 -0.09 -0.29 0.04 0.21 0.05 0.03 0.81 0.83 0.22 -0.8 -1.3 0.35 0.14 -1.55 -0.96 -0.62 -0.47 0.19 0.58 0.7 0.75 -1.05 -0.86 -0.78 -0.38
-0.07 0.34 0.38 0.36 0.25 0.31 0.19 0.24 0.21 0.3 0.19 0.09 0.18 0.61 0.68 0.47 -0.14 -0.52 -0.13 -1.54 -1.13 -1.78 0.24 0.19 0.11 -0.14 -0.47 -0.37 -0.35 -0.2 -0.85 -0.8
0.3 0.17 0.25 0.26 0.0 0.24 0.22 0.38 0.24 0.29 0.23 0.19 0.15 0.11 0.43 0.44 -0.35 -0.95 0.41 -1.35 -2.26 -2.69 -0.16 -0.12 0.06 0.3 0.15 -0.0 -0.09 -0.12 -0.39 -0.29
0.11 0.2 0.12 0.33 0.16 0.1 0.16 0.21 0.12 0.04 0.11 -0.14 -0.05 1.2 0.64 0.32 -0.72 -0.86 -0.53 -0.53 -0.75 -0.11 -0.51 -0.55 0.22 0.28 0.5 0.44 -0.93 -0.78 -0.95 -0.78
0.04 0.45 0.38 0.33 0.03 0.28 0.3 0.11 0.13 0.31 0.17 -0.0 0.14 0.3 0.58 0.08 -0.49 -2.87 -0.07 -2.03 -0.7 0.02 -0.22 -0.27 0.08 0.21 0.64 0.51 -0.83 -0.69 -0.64 -0.39
0.03 -0.02 -0.05 0.05 0.17 0.04 -0.09 0.07 0.11 -0.05 0.07 -0.12 0.23 0.62 0.53 0.3 -0.84 -1.0 0.03 0.56 -0.72 -0.62 -0.18 -0.17 -0.68 0.79 0.78 0.69 -0.77 -0.73 -1.03 -0.98
0.2 0.3 0.08 0.17 0.36 0.3 0.14 0.57 0.25 0.14 0.21 0.07 -0.11 0.23 0.33 0.07 -0.55 -2.18 -0.14 -0.64 -1.57 -1.01 -0.29 -0.14 0.02 0.53 0.65 0.46 -0.51 -0.41 -0.37 -0.33
-0.08 -0.12 -0.1 0.03 -0.06 0.03 0.04 0.08 0.12 0.05 0.13 -0.11 0.09 0.46 0.65 0.37 -0.52 -0.85 -0.06 0.48 -0.37 0.49 -0.15 -0.1 -0.46 0.45 0.28 0.27 -0.61 -0.55 -0.77 -0.7
-0.12 0.47 0.85 0.76 0.13 1.12 0.65 0.93 0.68 0.5 0.21 0.02 -1.34 1.62 0.99 -1.31 -2.68 -3.05 -2.46 -0.79 -1.46 0.09 -2.94 -2.7 1.03 0.01 0.21 0.29 -4.38 -2.94 -6.4 -3.87
-0.58 -0.35 -0.63 -0.07 0.0 -0.27 -0.37 -0.36 -0.51 -0.6 -0.48 -0.79 1.3 1.13 1.65 1.07 -0.28 -1.26 -0.11 -2.31 -0.13 -0.6 0.59 0.79 -0.92 -0.57 -0.13 0.16 -0.45 -0.04 -1.23 -1.08
-0.07 -0.32 -0.3 -0.06 0.18 0.22 -0.07 0.06 0.04 0.06 -0.06 -0.25 -0.42 1.07 1.02 -0.47 -0.36 -0.22 0.65 -0.32 -0.83 -1.66 -0.26 -0.17 0.55 0.12 0.33 0.35 -0.61 -0.4 -0.28 -0.38
0.14 0.02 0.18 0.15 0.49 0.45 -0.21 0.09 0.11 -0.03 -0.03 -0.21 0.02 0.54 0.8 0.2 -0.62 -0.93 -0.04 -0.64 -0.75 -0.53 -0.22 -0.18 0.47 0.33 0.43 0.55 -0.75 -0.59 -0.74 -0.86
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0.11 -0.05 -0.19 0.03 0.08 -0.14 -0.36 -0.5 -0.21 -0.19 -0.06 -0.29 0.84 1.29 1.35 0.99 -0.72 -0.77 0.27 -0.73 -3.03 0.2 -0.1 0.02 -2.17 -0.01 0.12 0.1 -0.7 -0.49 -0.74 -0.32
0.09 -0.32 -0.16 -0.13 -0.09 -0.06 -0.32 -0.14 0.31 0.57 0.55 0.29 0.84 1.16 1.23 0.77 -1.14 -1.26 -0.65 -2.12 -1.13 0.1 -0.82 -0.56 -0.67 0.55 0.04 0.01 -0.68 -0.45 -0.81 -0.58
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-0.53 -0.03 0.13 0.33 0.36 0.47 0.39 0.15 0.04 0.04 -0.05 -0.35 0.08 1.06 1.32 0.22 -0.3 -0.84 -0.41 -1.2 -2.58 -2.98 0.27 0.14 -0.44 0.08 0.47 0.61 -0.58 -0.48 -1.02 -0.9
-0.44 -0.37 -0.33 -0.38 -0.34 -0.11 -0.02 -0.14 -0.32 -0.23 -0.35 -0.52 0.14 0.87 1.65 0.26 -0.69 -1.1 0.19 1.2 -0.08 -0.45 -0.84 -0.58 0.22 -0.24 0.5 0.5 -0.86 -0.71 -0.31 -0.57

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.