1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_201 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.18 0.19 0.26 0.29 0.32 0.36 0.43 0.42 0.38 0.39 0.35 0.3 0.25 0.16 0.23 0.28 0.21 0.13 0.29 0.12 0.31 0.14 0.24 0.24 0.09 1.0 0.52 0.49 0.22 0.2 0.22 0.3
0.44 0.48 0.56 0.5 0.49 0.42 0.56 0.7 0.7 0.83 0.72 0.51 0.85 0.46 0.3 0.77 0.38 0.15 0.39 0.2 0.04 0.05 0.65 0.55 0.04 1.0 0.33 0.35 0.36 0.37 0.5 0.42
0.28 0.32 0.39 0.37 0.46 0.35 0.38 0.56 0.57 0.58 0.53 0.36 0.8 0.31 0.22 0.64 0.34 0.17 0.31 0.18 0.14 0.13 0.6 0.51 0.12 1.0 0.32 0.26 0.3 0.3 0.44 0.38
0.2 0.17 0.18 0.21 0.24 0.22 0.21 0.26 0.24 0.33 0.31 0.25 0.17 0.15 0.18 0.23 0.15 0.2 0.24 0.04 0.09 0.03 0.19 0.2 0.13 1.0 0.35 0.38 0.17 0.18 0.14 0.15
0.41 0.38 0.48 0.43 0.46 0.4 0.55 0.59 0.57 0.68 0.68 0.59 0.43 0.36 0.51 0.48 0.27 0.25 0.45 0.32 0.15 0.07 0.33 0.37 0.22 1.0 0.59 0.59 0.38 0.36 0.4 0.42
0.42 0.37 0.38 0.44 0.47 0.44 0.43 0.53 0.5 0.51 0.51 0.45 0.4 0.39 0.42 0.41 0.28 0.2 0.39 0.04 0.15 0.07 0.34 0.36 0.39 1.0 0.62 0.56 0.3 0.31 0.31 0.31
0.42 0.41 0.42 0.42 0.42 0.37 0.38 0.42 0.42 0.43 0.43 0.39 0.52 0.45 0.4 0.49 0.27 0.22 0.38 0.02 0.01 0.06 0.38 0.43 0.09 1.0 0.82 0.88 0.31 0.32 0.35 0.32
0.37 0.37 0.41 0.51 0.5 0.49 0.55 0.63 0.59 0.57 0.53 0.45 0.43 0.44 0.52 0.53 0.32 0.18 0.68 0.05 0.02 0.02 0.36 0.37 0.07 1.0 0.71 0.79 0.43 0.45 0.37 0.34
0.35 0.28 0.24 0.31 0.28 0.34 0.36 0.44 0.48 0.42 0.4 0.41 0.48 0.38 0.45 0.59 0.2 0.14 0.41 0.3 0.04 0.02 0.25 0.32 0.1 1.0 0.74 0.69 0.29 0.31 0.2 0.18
0.47 0.41 0.44 0.49 0.5 0.46 0.49 0.54 0.61 0.68 0.61 0.53 0.74 0.4 0.06 0.55 0.22 0.33 0.48 0.03 0.07 0.01 0.31 0.37 0.21 1.0 0.49 0.47 0.28 0.29 0.27 0.42
0.22 0.18 0.22 0.22 0.25 0.2 0.2 0.35 0.32 0.34 0.32 0.31 0.27 0.2 0.05 0.29 0.1 0.12 0.26 0.05 0.16 0.04 0.2 0.22 0.14 1.0 0.43 0.39 0.21 0.21 0.17 0.2
0.23 0.27 0.31 0.41 0.37 0.33 0.37 0.38 0.39 0.37 0.33 0.29 0.44 0.23 0.25 0.36 0.32 0.16 0.28 0.05 0.13 0.05 0.34 0.34 0.29 1.0 0.54 0.56 0.31 0.32 0.2 0.24
0.22 0.17 0.19 0.24 0.23 0.2 0.21 0.35 0.34 0.36 0.33 0.29 0.33 0.39 0.27 0.32 0.1 0.08 0.24 0.02 0.08 0.02 0.17 0.21 0.18 1.0 0.54 0.42 0.17 0.17 0.2 0.29
0.47 0.43 0.4 0.48 0.47 0.48 0.44 0.51 0.53 0.56 0.53 0.53 0.45 0.37 0.47 0.51 0.35 0.22 0.52 0.06 0.14 0.16 0.37 0.39 0.26 1.0 0.7 0.71 0.37 0.38 0.36 0.34
0.44 0.43 0.46 0.44 0.5 0.46 0.51 0.48 0.43 0.46 0.49 0.39 0.42 0.28 0.4 0.5 0.3 0.28 0.47 0.22 0.03 0.01 0.35 0.37 0.19 1.0 0.85 0.93 0.33 0.38 0.28 0.29
0.34 0.36 0.34 0.38 0.34 0.33 0.33 0.39 0.41 0.43 0.42 0.39 0.48 0.42 0.3 0.45 0.2 0.17 0.28 0.1 0.07 0.1 0.29 0.32 0.35 1.0 0.62 0.63 0.2 0.21 0.19 0.2
0.45 0.47 0.48 0.54 0.58 0.57 0.58 0.62 0.5 0.51 0.48 0.43 0.36 0.28 0.36 0.41 0.32 0.17 0.4 0.1 0.1 0.07 0.32 0.32 0.27 0.95 0.98 1.0 0.33 0.33 0.35 0.29
0.11 0.11 0.12 0.18 0.23 0.23 0.21 0.23 0.19 0.18 0.18 0.12 0.2 0.24 0.16 0.27 0.13 0.09 0.32 0.01 0.03 0.02 0.19 0.2 0.18 1.0 0.44 0.43 0.16 0.17 0.12 0.15
0.72 0.66 0.67 0.73 0.72 0.7 0.69 0.81 0.7 0.71 0.71 0.68 0.66 0.71 0.71 0.72 0.38 0.3 0.63 0.25 0.16 0.28 0.51 0.54 0.53 1.0 0.97 0.98 0.39 0.42 0.53 0.55
0.4 0.35 0.41 0.43 0.44 0.39 0.43 0.5 0.52 0.6 0.55 0.44 0.69 0.36 0.06 0.53 0.21 0.13 0.49 0.16 0.14 0.11 0.3 0.31 0.17 1.0 0.49 0.5 0.28 0.28 0.28 0.41
0.44 0.37 0.33 0.35 0.36 0.36 0.31 0.44 0.46 0.49 0.49 0.51 0.38 0.21 0.15 0.33 0.2 0.2 0.24 0.09 0.15 0.03 0.3 0.35 0.29 1.0 0.49 0.48 0.23 0.23 0.17 0.15
0.32 0.25 0.22 0.25 0.27 0.22 0.22 0.3 0.3 0.33 0.36 0.33 0.29 0.24 0.18 0.3 0.16 0.07 0.21 0.04 0.1 0.05 0.26 0.3 0.22 1.0 0.47 0.51 0.19 0.18 0.14 0.12
0.29 0.27 0.25 0.35 0.38 0.3 0.33 0.39 0.34 0.4 0.35 0.31 0.36 0.23 0.35 0.38 0.25 0.2 0.53 0.01 0.18 0.24 0.27 0.27 0.16 1.0 0.69 0.63 0.28 0.27 0.28 0.37
0.48 0.45 0.43 0.45 0.48 0.4 0.41 0.52 0.45 0.52 0.54 0.47 0.36 0.35 0.26 0.44 0.29 0.25 0.43 0.12 0.12 0.16 0.33 0.33 0.31 1.0 0.61 0.7 0.32 0.35 0.24 0.24
0.31 0.26 0.35 0.34 0.32 0.29 0.27 0.43 0.37 0.41 0.43 0.37 0.39 0.29 0.21 0.43 0.23 0.18 0.41 0.0 0.0 0.0 0.3 0.28 0.02 1.0 0.58 0.61 0.29 0.31 0.34 0.41
0.45 0.45 0.45 0.47 0.41 0.38 0.38 0.54 0.49 0.61 0.56 0.5 0.59 0.33 0.26 0.65 0.2 0.14 0.45 0.07 0.03 0.11 0.31 0.31 0.09 1.0 0.45 0.43 0.37 0.37 0.34 0.38
0.42 0.39 0.41 0.42 0.41 0.39 0.45 0.54 0.55 0.56 0.56 0.53 0.46 0.45 0.35 0.57 0.28 0.24 0.48 0.15 0.16 0.05 0.36 0.39 0.24 1.0 0.65 0.66 0.37 0.37 0.4 0.41
0.27 0.35 0.35 0.37 0.43 0.42 0.43 0.52 0.43 0.48 0.47 0.4 0.31 0.26 0.38 0.35 0.31 0.18 0.42 0.06 0.04 0.07 0.3 0.3 0.28 1.0 0.8 0.88 0.36 0.36 0.24 0.25
0.22 0.22 0.21 0.27 0.23 0.23 0.19 0.34 0.35 0.31 0.34 0.25 0.19 0.15 0.24 0.28 0.2 0.11 0.37 0.0 0.01 0.0 0.22 0.22 0.1 1.0 0.39 0.39 0.23 0.23 0.27 0.31
0.33 0.3 0.3 0.36 0.35 0.32 0.38 0.46 0.4 0.43 0.36 0.32 0.31 0.24 0.43 0.43 0.24 0.11 0.42 0.0 0.0 0.0 0.33 0.35 0.0 1.0 0.66 0.72 0.31 0.32 0.2 0.18
0.48 0.45 0.49 0.43 0.42 0.42 0.52 0.6 0.52 0.61 0.51 0.49 0.48 0.28 0.21 0.61 0.22 0.14 0.4 0.23 0.06 0.08 0.33 0.33 0.08 1.0 0.63 0.62 0.34 0.35 0.27 0.28
0.26 0.19 0.19 0.26 0.32 0.29 0.34 0.41 0.38 0.39 0.35 0.29 0.28 0.18 0.41 0.34 0.18 0.14 0.44 0.04 0.06 0.08 0.23 0.29 0.15 1.0 0.65 0.63 0.23 0.25 0.16 0.15
0.55 0.45 0.44 0.45 0.43 0.41 0.35 0.47 0.53 0.62 0.68 0.54 0.34 0.5 0.34 0.23 0.18 0.21 0.41 0.01 0.12 0.0 0.37 0.33 0.08 1.0 0.64 0.63 0.17 0.17 0.26 0.32
0.5 0.44 0.41 0.49 0.49 0.49 0.44 0.53 0.52 0.55 0.54 0.51 0.39 0.36 0.44 0.45 0.3 0.2 0.39 0.05 0.21 0.08 0.35 0.35 0.32 1.0 0.78 0.77 0.29 0.3 0.36 0.37
0.4 0.41 0.43 0.43 0.49 0.39 0.49 0.49 0.47 0.48 0.51 0.42 0.48 0.32 0.34 0.55 0.32 0.33 0.46 0.21 0.13 0.12 0.39 0.41 0.14 1.0 0.82 0.79 0.37 0.38 0.39 0.39
0.22 0.26 0.27 0.32 0.31 0.32 0.33 0.35 0.39 0.35 0.34 0.25 0.26 0.15 0.26 0.3 0.22 0.27 0.25 0.0 0.03 0.0 0.2 0.18 0.12 1.0 0.51 0.53 0.21 0.21 0.27 0.24
0.41 0.38 0.32 0.36 0.39 0.35 0.37 0.42 0.41 0.45 0.41 0.41 0.37 0.21 0.28 0.43 0.24 0.16 0.38 0.01 0.0 0.04 0.28 0.25 0.1 1.0 0.63 0.63 0.31 0.32 0.32 0.33
0.27 0.23 0.21 0.24 0.26 0.22 0.17 0.3 0.25 0.22 0.24 0.25 0.31 0.26 0.22 0.33 0.12 0.07 0.32 0.0 0.08 0.01 0.2 0.21 0.24 1.0 0.71 0.64 0.16 0.18 0.21 0.26
0.23 0.23 0.2 0.22 0.24 0.22 0.24 0.3 0.31 0.3 0.33 0.31 0.23 0.13 0.14 0.24 0.15 0.07 0.23 0.08 0.11 0.02 0.16 0.17 0.03 1.0 0.51 0.47 0.18 0.18 0.17 0.18
0.52 0.57 0.67 0.59 0.53 0.47 0.51 0.64 0.61 0.58 0.59 0.5 0.62 0.5 0.36 0.62 0.33 0.3 0.55 0.16 0.12 0.17 0.55 0.63 0.24 1.0 0.68 0.7 0.49 0.51 0.32 0.32
0.45 0.47 0.49 0.54 0.55 0.52 0.57 0.59 0.56 0.54 0.54 0.51 0.35 0.37 0.38 0.45 0.29 0.19 0.47 0.15 0.21 0.08 0.37 0.4 0.26 1.0 0.88 0.93 0.34 0.35 0.37 0.34
0.8 0.61 0.66 0.67 0.72 0.73 0.64 0.83 0.76 0.78 0.77 0.67 0.56 0.57 0.69 0.59 0.4 0.28 0.54 0.36 0.2 0.26 0.47 0.51 0.27 0.98 0.99 1.0 0.44 0.47 0.41 0.44
0.49 0.51 0.55 0.52 0.57 0.5 0.53 0.55 0.54 0.51 0.54 0.44 0.5 0.41 0.39 0.55 0.31 0.23 0.5 0.09 0.02 0.02 0.4 0.41 0.06 0.94 0.91 1.0 0.34 0.36 0.41 0.35
0.47 0.47 0.47 0.48 0.48 0.44 0.52 0.57 0.56 0.63 0.63 0.55 0.45 0.45 0.44 0.54 0.33 0.27 0.52 0.3 0.27 0.25 0.3 0.32 0.33 1.0 0.69 0.71 0.4 0.42 0.41 0.41
0.58 0.61 0.57 0.58 0.59 0.54 0.5 0.59 0.58 0.65 0.6 0.61 0.67 0.57 0.48 0.56 0.25 0.2 0.49 0.16 0.24 0.3 0.35 0.39 0.41 1.0 0.75 0.72 0.31 0.33 0.34 0.4
0.41 0.37 0.37 0.41 0.43 0.39 0.39 0.46 0.41 0.43 0.42 0.39 0.32 0.28 0.28 0.38 0.21 0.12 0.36 0.1 0.02 0.04 0.27 0.28 0.07 1.0 0.92 0.87 0.26 0.26 0.37 0.36
0.38 0.38 0.38 0.38 0.41 0.37 0.4 0.41 0.39 0.41 0.38 0.33 0.35 0.28 0.32 0.37 0.23 0.17 0.34 0.0 0.0 0.0 0.26 0.27 0.05 1.0 0.88 0.9 0.27 0.27 0.21 0.21
0.41 0.39 0.39 0.45 0.48 0.45 0.5 0.52 0.56 0.56 0.55 0.48 0.28 0.29 0.46 0.39 0.25 0.15 0.54 0.11 0.09 0.08 0.28 0.3 0.06 1.0 0.75 0.78 0.31 0.31 0.24 0.25
0.36 0.31 0.34 0.35 0.4 0.31 0.41 0.45 0.45 0.45 0.49 0.41 0.26 0.26 0.35 0.32 0.23 0.17 0.33 0.23 0.07 0.1 0.2 0.23 0.13 1.0 0.6 0.62 0.28 0.28 0.32 0.34
0.41 0.5 0.51 0.55 0.6 0.54 0.51 0.58 0.5 0.52 0.47 0.43 0.48 0.39 0.61 0.55 0.33 0.24 0.75 0.0 0.0 0.0 0.39 0.43 0.03 0.8 0.98 1.0 0.41 0.43 0.24 0.26
0.23 0.21 0.19 0.23 0.22 0.22 0.24 0.34 0.35 0.35 0.34 0.32 0.34 0.27 0.37 0.34 0.15 0.11 0.39 0.07 0.04 0.2 0.16 0.19 0.17 1.0 0.55 0.47 0.21 0.22 0.26 0.22
0.38 0.39 0.37 0.31 0.3 0.27 0.32 0.36 0.4 0.45 0.47 0.43 0.56 0.14 0.12 0.6 0.11 0.11 0.11 0.07 0.07 0.06 0.14 0.21 0.39 1.0 0.41 0.42 0.13 0.15 0.12 0.12
0.49 0.52 0.57 0.54 0.58 0.52 0.52 0.61 0.53 0.57 0.58 0.47 0.61 0.42 0.28 0.62 0.33 0.33 0.56 0.16 0.12 0.05 0.56 0.59 0.19 1.0 0.8 0.83 0.39 0.42 0.4 0.47
0.37 0.32 0.33 0.29 0.35 0.34 0.37 0.35 0.35 0.42 0.38 0.34 0.32 0.4 0.43 0.35 0.22 0.16 0.34 0.2 0.14 0.21 0.27 0.3 0.2 1.0 0.66 0.59 0.26 0.26 0.23 0.24
0.5 0.51 0.54 0.54 0.53 0.46 0.43 0.51 0.49 0.53 0.61 0.52 0.34 0.4 0.36 0.28 0.22 0.17 0.28 0.05 0.07 0.1 0.24 0.23 0.26 1.0 0.63 0.75 0.23 0.23 0.23 0.21
0.26 0.33 0.39 0.36 0.34 0.34 0.34 0.45 0.42 0.41 0.38 0.31 0.41 0.21 0.25 0.39 0.21 0.15 0.39 0.01 0.01 0.01 0.29 0.34 0.1 1.0 0.58 0.62 0.25 0.28 0.18 0.17
0.46 0.47 0.44 0.45 0.46 0.38 0.34 0.4 0.47 0.47 0.49 0.46 0.42 0.44 0.29 0.33 0.23 0.11 0.3 0.05 0.07 0.01 0.27 0.27 0.27 1.0 0.59 0.63 0.28 0.3 0.23 0.21
0.37 0.35 0.32 0.38 0.36 0.31 0.35 0.41 0.43 0.42 0.43 0.38 0.41 0.35 0.19 0.44 0.23 0.11 0.3 0.06 0.03 0.02 0.37 0.39 0.17 1.0 0.58 0.61 0.27 0.29 0.25 0.27
0.5 0.51 0.48 0.53 0.6 0.53 0.54 0.6 0.52 0.54 0.53 0.52 0.46 0.42 0.31 0.54 0.29 0.23 0.47 0.07 0.08 0.04 0.32 0.34 0.17 1.0 0.91 1.0 0.34 0.35 0.29 0.27
0.4 0.38 0.46 0.51 0.48 0.42 0.38 0.56 0.56 0.51 0.53 0.44 0.75 0.31 0.36 0.49 0.21 0.14 0.43 0.02 0.02 0.0 0.25 0.26 0.21 1.0 0.82 0.68 0.28 0.25 0.23 0.34
0.16 0.22 0.24 0.24 0.3 0.22 0.28 0.32 0.3 0.29 0.25 0.23 0.19 0.22 0.3 0.32 0.17 0.14 0.53 0.0 0.0 0.0 0.18 0.17 0.1 1.0 0.35 0.36 0.24 0.25 0.25 0.26
0.59 0.56 0.67 0.57 0.59 0.61 0.57 0.77 0.76 0.89 0.72 0.61 0.8 0.35 0.27 0.83 0.33 0.28 0.55 0.09 0.12 0.01 0.48 0.47 0.41 1.0 0.48 0.53 0.49 0.46 0.48 0.49
0.35 0.32 0.28 0.35 0.42 0.39 0.4 0.43 0.47 0.45 0.46 0.39 0.51 0.32 0.55 0.58 0.28 0.21 0.5 0.2 0.05 0.12 0.33 0.36 0.12 1.0 0.56 0.71 0.37 0.38 0.19 0.2
0.41 0.46 0.46 0.55 0.66 0.56 0.51 0.54 0.5 0.49 0.46 0.44 0.49 0.33 0.42 0.68 0.34 0.17 0.67 0.07 0.02 0.01 0.47 0.51 0.12 1.0 0.9 0.94 0.42 0.45 0.24 0.25
0.48 0.42 0.4 0.43 0.54 0.52 0.42 0.54 0.54 0.57 0.52 0.45 0.73 0.42 0.45 0.68 0.24 0.23 0.4 0.06 0.11 0.14 0.45 0.65 0.19 1.0 0.87 0.95 0.25 0.31 0.27 0.44
0.41 0.39 0.43 0.42 0.43 0.41 0.47 0.55 0.51 0.59 0.58 0.52 0.51 0.29 0.34 0.5 0.26 0.22 0.49 0.19 0.31 0.28 0.28 0.32 0.47 1.0 0.66 0.7 0.35 0.37 0.36 0.37
0.31 0.3 0.34 0.34 0.36 0.28 0.31 0.43 0.42 0.43 0.38 0.32 0.46 0.26 0.16 0.55 0.15 0.14 0.41 0.0 0.02 0.0 0.3 0.42 0.02 1.0 0.51 0.46 0.22 0.22 0.32 0.34
0.51 0.56 0.51 0.51 0.55 0.53 0.52 0.51 0.54 0.55 0.58 0.49 0.63 0.42 0.37 0.59 0.38 0.3 0.5 0.09 0.17 0.06 0.44 0.47 0.32 0.95 0.99 1.0 0.39 0.43 0.39 0.34
0.56 0.54 0.53 0.55 0.58 0.57 0.64 0.64 0.65 0.67 0.7 0.64 0.35 0.39 0.56 0.43 0.38 0.27 0.49 0.15 0.21 0.13 0.36 0.38 0.26 1.0 0.76 0.74 0.38 0.4 0.4 0.41
0.43 0.41 0.41 0.39 0.4 0.37 0.37 0.41 0.41 0.38 0.42 0.36 0.3 0.32 0.28 0.37 0.24 0.14 0.44 0.01 0.01 0.01 0.29 0.27 0.07 1.0 0.68 0.69 0.31 0.32 0.26 0.2
0.48 0.45 0.46 0.46 0.54 0.53 0.42 0.46 0.52 0.49 0.45 0.47 0.55 0.37 0.39 0.57 0.32 0.05 0.42 0.03 0.05 0.0 0.45 0.46 0.09 0.89 0.92 1.0 0.37 0.42 0.23 0.33
0.18 0.17 0.16 0.19 0.21 0.22 0.19 0.29 0.2 0.24 0.2 0.19 0.13 0.19 0.12 0.2 0.09 0.15 0.2 0.0 0.01 0.0 0.09 0.11 0.17 1.0 0.54 0.45 0.11 0.12 0.1 0.15
0.38 0.39 0.38 0.38 0.38 0.33 0.38 0.49 0.47 0.48 0.5 0.43 0.49 0.3 0.29 0.53 0.23 0.19 0.4 0.04 0.01 0.04 0.34 0.31 0.03 1.0 0.57 0.61 0.34 0.38 0.26 0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)