1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_49 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.44 0.54 0.48 0.56 0.49 0.5 0.37 0.39 0.34 0.38 0.35 0.33 0.43 0.31 0.89 0.56 0.41 0.29 0.99 0.49 1.0 0.33 0.32 0.25 0.77 0.42 0.8 0.83 0.31 0.39 0.21 0.21
0.12 0.13 0.14 0.14 0.11 0.1 0.16 0.12 0.16 0.1 0.15 0.14 0.11 0.02 0.52 0.21 0.36 0.12 1.0 0.15 0.7 0.01 0.12 0.11 0.07 0.51 0.47 0.54 0.37 0.29 0.37 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.42 0.36 0.0 1.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.07 0.11 0.12 0.18 0.24 0.27 0.29 0.28 0.23 0.16 0.15 0.02 0.02 0.08 0.03 0.11 0.12 1.0 0.03 0.64 0.12 0.07 0.08 0.07 0.26 0.37 0.35 0.14 0.14 0.14 0.1
0.21 0.22 0.22 0.19 0.17 0.22 0.27 0.24 0.17 0.24 0.17 0.16 0.32 0.18 0.09 0.37 0.23 0.34 1.0 0.13 0.77 0.21 0.39 0.45 0.44 0.38 0.35 0.41 0.35 0.31 0.21 0.15
0.02 0.03 0.03 0.03 0.04 0.04 0.03 0.02 0.01 0.03 0.03 0.01 0.04 0.04 0.16 0.03 0.03 0.02 1.0 0.03 0.28 0.0 0.06 0.04 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 1.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.16 1.0 0.02 0.37 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02
0.03 0.04 0.03 0.05 0.02 0.02 0.0 0.09 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.01 0.03 0.03 0.0 0.41 0.0 1.0 0.0 0.14 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.15 0.03 0.06 0.0
0.08 0.14 0.11 0.16 0.08 0.13 0.2 0.08 0.05 0.04 0.09 0.09 0.26 0.12 1.0 0.1 0.14 0.22 0.82 0.07 0.89 0.0 0.07 0.05 0.0 0.08 0.08 0.35 0.08 0.1 0.05 0.02
0.05 0.06 0.06 0.08 0.03 0.08 0.07 0.03 0.04 0.02 0.05 0.06 0.07 0.05 0.07 0.13 0.04 0.04 0.47 0.01 1.0 0.08 0.08 0.1 0.12 0.21 0.1 0.16 0.06 0.08 0.03 0.04
0.19 0.19 0.07 0.07 0.01 0.07 0.08 0.07 0.04 0.1 0.15 0.03 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.04 0.6 0.0 1.0 0.0 0.02 0.06 0.07 0.24 0.0 0.47 0.05 0.03 0.04 0.02
0.11 0.05 0.1 0.02 0.05 0.1 0.09 0.09 0.12 0.11 0.08 0.07 0.01 0.08 0.09 0.01 0.02 0.33 1.0 0.0 0.68 0.0 0.01 0.01 0.02 0.34 0.31 0.25 0.02 0.01 0.0 0.01
0.13 0.18 0.27 0.34 0.14 0.52 0.57 0.4 0.65 0.36 0.27 0.2 0.12 0.09 1.0 0.19 0.26 0.0 0.35 0.41 0.88 0.0 0.27 0.2 0.36 0.19 0.36 0.27 0.21 0.42 0.18 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.46 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.15 0.14 0.13 0.11 0.2 0.28 0.19 0.16 0.26 0.21 0.21 0.04 0.04 0.01 0.02 0.1 0.12 0.5 0.0 1.0 0.04 0.09 0.08 0.39 0.2 0.3 0.32 0.09 0.1 0.1 0.14
0.15 0.19 0.28 0.15 0.14 0.21 0.22 0.11 0.07 0.06 0.1 0.09 0.18 0.21 0.48 0.44 0.19 0.09 0.77 0.04 1.0 0.02 0.22 0.22 0.14 0.28 0.18 0.45 0.16 0.25 0.07 0.08
0.25 0.25 0.12 0.27 0.1 0.27 0.3 0.23 0.29 0.3 0.3 0.27 0.14 0.16 0.31 0.15 0.16 0.01 0.56 0.01 1.0 0.03 0.23 0.19 0.56 0.3 0.22 0.16 0.17 0.12 0.22 0.27
0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 1.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.06 0.11 0.27 0.57 0.0 1.0 0.09 0.06 0.07 0.12 0.0 0.08 0.0 0.1 0.07 0.1 0.17
0.19 0.01 0.02 0.06 0.15 0.1 0.02 0.02 0.19 0.02 0.0 0.04 0.16 0.11 0.07 0.23 0.03 0.2 0.63 0.0 1.0 0.0 0.15 0.4 0.31 0.06 0.22 0.27 0.05 0.04 0.01 0.02
0.05 0.04 0.01 0.01 0.09 0.01 0.03 0.06 0.02 0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.05 1.0 0.0 0.55 0.0 0.03 0.08 0.28 0.35 0.11 0.2 0.06 0.06 0.07 0.01
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.33 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.89 0.1 0.29 0.32 0.63 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.5 0.19 0.28 0.09 0.18
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.0 0.02 0.02 0.08 0.15 0.16 0.13 0.18 0.06 0.07 0.04 0.0 0.02 0.02 0.03 0.05 1.0 0.0 0.19 0.0 0.02 0.01 0.08 0.31 0.13 0.35 0.07 0.06 0.01 0.01
0.07 0.03 0.03 0.05 0.11 0.1 0.1 0.11 0.12 0.15 0.12 0.12 0.02 0.02 0.05 0.01 0.1 0.06 1.0 0.0 0.46 0.06 0.04 0.03 0.04 0.11 0.19 0.27 0.09 0.09 0.08 0.05
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.16 0.38 0.0 1.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.67 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.08 0.06 0.16 0.23 0.18 0.25 0.15 0.22 0.13 0.19 0.13 0.06 0.06 0.06 0.04 0.09 0.18 0.89 0.0 1.0 0.0 0.13 0.1 0.42 0.29 0.31 0.23 0.09 0.11 0.04 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.19 0.0 0.27 1.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.17 0.0
0.09 0.17 0.06 0.19 0.08 0.14 0.22 0.24 0.12 0.16 0.14 0.11 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.07 0.65 0.0 1.0 0.0 0.01 0.01 0.32 0.1 0.17 0.21 0.08 0.07 0.04 0.05
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.16 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 1.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05
0.04 0.07 0.01 0.1 0.04 0.03 0.13 0.03 0.06 0.1 0.06 0.03 0.0 0.0 0.04 0.02 0.03 0.06 1.0 0.0 0.73 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.06 0.05 0.03
0.11 0.0 0.06 0.05 0.0 0.03 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.47 1.0 0.0 0.33 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.22 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.11 0.7 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.04 0.03 0.02 0.0 0.09 0.15 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09 0.02 0.18 0.12 0.28 1.0 0.21 0.34 0.0 0.13 0.03 0.1 0.0 0.13 0.16 0.0 0.02 0.16 0.14
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.15 0.56 0.0 1.0 0.0 0.02 0.02 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.14 0.31 0.08 0.17 0.14 0.11 0.26 0.11 0.16 0.14 0.23 0.24 0.02 0.04 0.05 0.02 0.08 0.18 0.54 0.04 1.0 0.06 0.07 0.04 0.5 0.15 0.2 0.07 0.12 0.1 0.19 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0 0.49 0.0 1.0 0.0 0.05 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.06 0.04 0.04 0.07 0.05 0.07 0.07 0.07 0.09 0.09 0.04 0.11 0.15 0.01 0.05 0.02 0.02 0.86 0.0 1.0 0.0 0.03 0.08 0.28 0.12 0.05 0.07 0.09 0.12 0.05 0.08
0.13 0.1 0.09 0.13 0.13 0.1 0.12 0.13 0.13 0.11 0.13 0.14 0.29 0.1 1.0 0.25 0.04 0.02 0.52 0.36 0.51 0.02 0.07 0.09 0.03 0.09 0.14 0.14 0.06 0.06 0.27 0.21
0.1 0.04 0.03 0.07 0.23 0.12 0.12 0.1 0.05 0.16 0.15 0.04 0.31 0.01 0.22 0.82 0.21 0.38 1.0 0.07 0.87 0.13 0.16 0.2 0.0 0.29 0.18 0.22 0.33 0.38 0.16 0.17
0.03 0.05 0.03 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.07 0.22 0.08 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.02 1.0 0.0 0.3 0.0 0.11 0.08 0.0 0.01 0.02 0.03 0.05 0.03 0.05 0.08
0.01 0.0 0.01 0.02 0.03 0.03 0.03 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.1 0.02 0.03 0.23 0.03 0.13 0.5 0.01 1.0 0.19 0.0 0.04 0.03 0.05 0.03 0.04 0.07 0.08 0.05 0.12
0.18 0.16 0.2 0.2 0.21 0.24 0.29 0.25 0.25 0.24 0.2 0.18 0.14 0.05 0.14 0.7 0.19 0.43 0.6 0.13 1.0 0.26 0.31 0.45 0.55 0.42 0.39 0.42 0.35 0.28 0.17 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.24 1.0 0.0 0.22 0.0 0.04 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.09 0.26 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.24 1.0 0.0 0.22 0.0 0.04 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.09 0.26 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01
0.05 0.07 0.06 0.05 0.14 0.11 0.08 0.09 0.06 0.06 0.1 0.1 0.03 0.02 0.01 0.04 0.14 0.13 1.0 0.0 0.42 0.0 0.28 0.25 0.03 0.03 0.07 0.12 0.22 0.27 0.15 0.26

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)