Heatmap: Cluster_181 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.16 0.19 0.24 0.26 0.33 0.36 0.53 0.52 0.45 0.42 0.29 0.26 0.26 0.13 0.38 0.23 0.3 0.25 0.29 0.04 0.18 0.06 0.28 0.27 0.15 0.57 0.96 1.0 0.33 0.36 0.18 0.19
0.43 0.46 0.45 0.48 0.49 0.47 0.46 0.51 0.45 0.45 0.44 0.39 0.35 0.29 0.32 0.41 0.28 0.24 0.47 0.19 0.05 0.07 0.32 0.32 0.23 0.86 0.94 1.0 0.34 0.34 0.28 0.29
0.15 0.12 0.17 0.18 0.2 0.25 0.19 0.28 0.27 0.15 0.17 0.13 0.21 0.35 0.1 0.26 0.12 0.18 0.21 0.0 0.02 0.05 0.1 0.12 0.1 0.71 1.0 0.94 0.15 0.11 0.1 0.2
0.25 0.34 0.3 0.42 0.47 0.48 0.43 0.47 0.31 0.42 0.3 0.28 0.37 0.15 0.25 0.34 0.18 0.12 0.45 0.0 0.0 0.0 0.26 0.29 0.05 0.81 1.0 0.72 0.25 0.23 0.2 0.24
0.26 0.23 0.23 0.32 0.41 0.41 0.3 0.45 0.28 0.36 0.27 0.26 0.14 0.11 0.02 0.15 0.06 0.04 0.15 0.02 0.08 0.02 0.14 0.14 0.12 0.84 1.0 0.77 0.06 0.06 0.09 0.13
0.42 0.44 0.43 0.55 0.58 0.62 0.64 0.62 0.55 0.49 0.4 0.36 0.42 0.43 0.59 0.46 0.43 0.4 0.59 0.04 0.29 0.07 0.42 0.43 0.38 0.71 0.97 1.0 0.4 0.41 0.29 0.29
0.42 0.44 0.39 0.5 0.61 0.58 0.51 0.61 0.49 0.48 0.42 0.38 0.32 0.25 0.49 0.39 0.35 0.21 0.53 0.0 0.0 0.0 0.36 0.34 0.07 0.88 0.88 1.0 0.44 0.46 0.23 0.23
0.33 0.35 0.32 0.36 0.44 0.42 0.48 0.52 0.43 0.42 0.39 0.36 0.23 0.35 0.4 0.29 0.21 0.2 0.43 0.04 0.04 0.23 0.25 0.26 0.12 0.67 1.0 0.94 0.27 0.29 0.38 0.42
0.3 0.27 0.28 0.33 0.42 0.42 0.44 0.47 0.44 0.4 0.38 0.3 0.26 0.3 0.29 0.33 0.39 0.36 0.36 0.19 0.22 0.07 0.38 0.34 0.31 0.62 0.86 1.0 0.4 0.41 0.29 0.28
0.26 0.31 0.29 0.35 0.39 0.41 0.4 0.41 0.34 0.31 0.29 0.26 0.18 0.2 0.17 0.2 0.21 0.15 0.23 0.03 0.18 0.01 0.21 0.2 0.31 0.51 1.0 0.87 0.2 0.21 0.22 0.23
0.36 0.44 0.46 0.59 0.65 0.67 0.55 0.57 0.45 0.4 0.32 0.3 0.33 0.34 0.5 0.34 0.29 0.1 0.34 0.14 0.09 0.05 0.3 0.27 0.23 0.85 1.0 0.97 0.23 0.24 0.19 0.17
0.37 0.42 0.39 0.46 0.49 0.49 0.55 0.51 0.45 0.43 0.41 0.37 0.38 0.24 0.43 0.44 0.27 0.19 0.41 0.13 0.08 0.14 0.3 0.29 0.27 0.75 0.93 1.0 0.29 0.31 0.24 0.22
0.31 0.27 0.32 0.41 0.44 0.41 0.39 0.41 0.35 0.35 0.27 0.28 0.29 0.25 0.34 0.36 0.31 0.17 0.39 0.01 0.26 0.03 0.25 0.25 0.25 0.63 1.0 0.93 0.3 0.31 0.22 0.22
0.27 0.33 0.4 0.41 0.45 0.43 0.28 0.37 0.32 0.3 0.32 0.31 0.39 0.25 0.45 0.3 0.14 0.14 0.13 0.0 0.0 0.0 0.23 0.25 0.1 0.77 0.99 1.0 0.13 0.13 0.12 0.16
0.37 0.43 0.43 0.43 0.48 0.46 0.47 0.49 0.41 0.41 0.37 0.35 0.36 0.28 0.41 0.41 0.32 0.21 0.47 0.0 0.0 0.0 0.33 0.33 0.08 0.8 0.92 1.0 0.34 0.35 0.24 0.24
0.37 0.37 0.43 0.44 0.44 0.43 0.47 0.53 0.52 0.5 0.51 0.42 0.49 0.39 0.39 0.41 0.42 0.39 0.38 0.14 0.16 0.14 0.36 0.32 0.18 0.65 0.92 1.0 0.42 0.42 0.41 0.53
0.26 0.28 0.37 0.35 0.35 0.33 0.46 0.53 0.4 0.49 0.53 0.42 0.69 0.16 0.1 0.22 0.25 0.34 0.25 0.0 0.01 0.0 0.36 0.41 0.58 0.61 0.94 1.0 0.29 0.25 0.17 0.17
0.56 0.43 0.49 0.37 0.55 0.51 0.46 0.58 0.53 0.52 0.65 0.54 0.37 0.34 0.28 0.34 0.24 0.14 0.29 0.07 0.02 0.0 0.3 0.28 0.18 0.73 0.96 1.0 0.34 0.31 0.39 0.39
0.42 0.35 0.41 0.43 0.46 0.47 0.47 0.48 0.45 0.44 0.44 0.37 0.54 0.53 0.56 0.41 0.26 0.22 0.38 0.15 0.03 0.03 0.33 0.33 0.24 0.86 1.0 0.9 0.25 0.25 0.26 0.26
0.35 0.39 0.32 0.36 0.39 0.42 0.47 0.38 0.33 0.32 0.32 0.27 0.29 0.17 0.47 0.31 0.19 0.24 0.34 0.03 0.02 0.08 0.21 0.21 0.13 0.64 1.0 0.95 0.2 0.2 0.18 0.16
0.15 0.1 0.05 0.11 0.28 0.24 0.29 0.35 0.24 0.22 0.22 0.14 0.05 0.04 0.03 0.06 0.04 0.11 0.12 0.0 0.0 0.0 0.1 0.1 0.12 0.48 0.93 1.0 0.11 0.07 0.08 0.06
0.42 0.47 0.52 0.57 0.66 0.64 0.57 0.55 0.46 0.42 0.41 0.35 0.38 0.31 0.44 0.44 0.35 0.19 0.5 0.14 0.09 0.09 0.39 0.35 0.26 0.68 0.93 1.0 0.36 0.38 0.28 0.29
0.47 0.49 0.43 0.46 0.44 0.35 0.43 0.47 0.45 0.42 0.39 0.48 0.12 0.15 0.2 0.21 0.14 0.09 0.27 0.01 0.01 0.0 0.15 0.14 0.08 0.65 1.0 0.95 0.19 0.2 0.27 0.23
0.47 0.47 0.5 0.56 0.63 0.52 0.51 0.6 0.61 0.55 0.53 0.45 0.35 0.26 0.36 0.38 0.21 0.14 0.26 0.01 0.02 0.04 0.33 0.37 0.03 0.76 1.0 0.87 0.22 0.25 0.21 0.27
0.3 0.28 0.31 0.36 0.38 0.39 0.42 0.45 0.44 0.4 0.34 0.3 0.35 0.28 0.59 0.27 0.19 0.15 0.26 0.11 0.05 0.1 0.23 0.26 0.11 0.75 1.0 0.89 0.2 0.22 0.26 0.27
0.4 0.44 0.47 0.51 0.47 0.48 0.53 0.64 0.5 0.46 0.58 0.45 0.25 0.39 0.52 0.29 0.36 0.33 0.31 0.06 0.12 0.12 0.36 0.32 0.1 0.72 1.0 0.94 0.31 0.31 0.35 0.36
0.26 0.27 0.22 0.3 0.37 0.31 0.3 0.42 0.38 0.32 0.31 0.29 0.17 0.15 0.13 0.2 0.17 0.02 0.15 0.08 0.03 0.25 0.21 0.22 0.18 0.93 1.0 0.73 0.18 0.16 0.19 0.19
0.44 0.51 0.52 0.5 0.54 0.5 0.47 0.43 0.43 0.44 0.43 0.38 0.43 0.44 0.55 0.52 0.34 0.27 0.5 0.34 0.17 0.08 0.41 0.42 0.33 0.77 0.95 1.0 0.33 0.38 0.38 0.4
0.26 0.28 0.28 0.33 0.36 0.37 0.43 0.53 0.36 0.36 0.33 0.29 0.38 0.22 0.07 0.3 0.23 0.25 0.36 0.0 0.05 0.0 0.34 0.4 0.39 0.44 0.98 1.0 0.25 0.26 0.2 0.17
0.5 0.49 0.49 0.51 0.46 0.5 0.47 0.52 0.53 0.5 0.46 0.42 0.28 0.18 0.64 0.3 0.31 0.2 0.42 0.0 0.05 0.09 0.25 0.19 0.04 0.87 0.76 1.0 0.4 0.36 0.29 0.27
0.48 0.46 0.47 0.51 0.55 0.54 0.51 0.44 0.38 0.37 0.36 0.34 0.28 0.31 0.36 0.31 0.35 0.27 0.42 0.04 0.08 0.08 0.31 0.27 0.19 0.52 0.98 1.0 0.28 0.31 0.28 0.3
0.41 0.5 0.47 0.45 0.4 0.43 0.38 0.36 0.39 0.37 0.45 0.32 0.26 0.12 0.42 0.26 0.28 0.32 0.29 0.02 0.0 0.07 0.29 0.35 0.21 0.58 1.0 0.92 0.25 0.22 0.29 0.29
0.32 0.41 0.37 0.35 0.47 0.34 0.43 0.38 0.35 0.36 0.37 0.28 0.28 0.25 0.29 0.38 0.24 0.13 0.34 0.0 0.01 0.01 0.28 0.31 0.14 0.74 0.9 1.0 0.26 0.28 0.13 0.15
0.28 0.33 0.34 0.31 0.39 0.45 0.45 0.48 0.37 0.4 0.32 0.3 0.24 0.19 0.16 0.28 0.15 0.18 0.4 0.12 0.04 0.01 0.17 0.18 0.21 0.62 1.0 0.75 0.18 0.18 0.24 0.41
0.33 0.3 0.33 0.35 0.35 0.36 0.36 0.41 0.4 0.38 0.39 0.33 0.21 0.28 0.34 0.19 0.22 0.19 0.21 0.04 0.07 0.06 0.22 0.26 0.11 0.52 1.0 0.87 0.2 0.23 0.34 0.42
0.4 0.43 0.4 0.54 0.58 0.55 0.56 0.6 0.58 0.51 0.5 0.44 0.47 0.27 0.37 0.47 0.31 0.18 0.41 0.14 0.03 0.07 0.37 0.37 0.23 0.75 0.98 1.0 0.34 0.35 0.24 0.24
0.21 0.31 0.31 0.39 0.5 0.52 0.43 0.35 0.25 0.23 0.21 0.18 0.16 0.27 0.14 0.28 0.35 0.19 0.39 0.04 0.05 0.04 0.39 0.35 0.07 0.61 0.89 1.0 0.31 0.31 0.17 0.16
0.47 0.52 0.52 0.52 0.67 0.65 0.53 0.55 0.45 0.42 0.38 0.34 0.27 0.3 0.52 0.37 0.31 0.29 0.39 0.14 0.08 0.03 0.3 0.3 0.07 0.52 0.9 1.0 0.26 0.28 0.27 0.26
0.37 0.35 0.36 0.42 0.51 0.51 0.5 0.54 0.45 0.42 0.41 0.31 0.4 0.2 0.49 0.41 0.3 0.35 0.44 0.02 0.12 0.08 0.4 0.45 0.23 0.8 1.0 0.89 0.36 0.37 0.31 0.29
0.3 0.32 0.34 0.45 0.55 0.53 0.49 0.52 0.36 0.34 0.31 0.3 0.27 0.28 0.41 0.33 0.27 0.16 0.34 0.17 0.09 0.07 0.37 0.34 0.26 0.67 1.0 0.99 0.24 0.27 0.25 0.28
0.4 0.36 0.34 0.46 0.44 0.47 0.45 0.51 0.46 0.43 0.45 0.38 0.35 0.25 0.43 0.36 0.32 0.19 0.45 0.19 0.11 0.09 0.36 0.4 0.44 0.87 1.0 0.9 0.32 0.35 0.34 0.32
0.65 0.53 0.49 0.46 0.53 0.5 0.55 0.62 0.65 0.63 0.7 0.66 0.39 0.42 0.29 0.49 0.43 0.29 0.69 0.11 0.1 0.04 0.53 0.47 0.25 0.89 0.91 1.0 0.5 0.5 0.4 0.44
0.4 0.42 0.42 0.41 0.39 0.44 0.42 0.43 0.39 0.38 0.37 0.35 0.33 0.32 0.48 0.35 0.25 0.14 0.37 0.1 0.19 0.06 0.3 0.29 0.28 0.74 1.0 0.99 0.25 0.25 0.28 0.29
0.3 0.35 0.34 0.39 0.44 0.4 0.34 0.35 0.32 0.31 0.29 0.26 0.4 0.54 0.38 0.39 0.22 0.23 0.33 0.02 0.11 0.13 0.3 0.28 0.24 0.82 0.96 1.0 0.22 0.22 0.22 0.24
0.56 0.56 0.55 0.57 0.61 0.58 0.57 0.54 0.51 0.56 0.51 0.51 0.45 0.46 0.73 0.47 0.33 0.26 0.46 0.45 0.21 0.23 0.34 0.36 0.43 0.9 0.99 1.0 0.33 0.34 0.42 0.45
0.46 0.47 0.47 0.61 0.68 0.6 0.59 0.67 0.6 0.52 0.49 0.46 0.39 0.44 0.53 0.43 0.26 0.24 0.41 0.11 0.06 0.12 0.34 0.35 0.3 0.9 1.0 0.81 0.27 0.32 0.41 0.52
0.38 0.36 0.36 0.35 0.36 0.42 0.4 0.44 0.43 0.38 0.33 0.32 0.33 0.41 0.38 0.33 0.24 0.25 0.34 0.19 0.22 0.15 0.32 0.32 0.22 0.6 1.0 0.97 0.23 0.26 0.33 0.37
0.46 0.42 0.43 0.43 0.44 0.43 0.4 0.51 0.48 0.43 0.45 0.38 0.23 0.23 0.24 0.3 0.36 0.21 0.4 0.01 0.01 0.01 0.32 0.31 0.22 0.84 1.0 0.95 0.35 0.33 0.36 0.48
0.38 0.35 0.36 0.42 0.49 0.43 0.47 0.52 0.5 0.46 0.45 0.41 0.26 0.2 0.17 0.32 0.36 0.33 0.68 0.01 0.08 0.02 0.36 0.34 0.14 1.0 0.93 1.0 0.47 0.46 0.44 0.46
0.23 0.29 0.33 0.39 0.41 0.44 0.38 0.45 0.38 0.32 0.29 0.24 0.29 0.26 0.25 0.47 0.29 0.15 0.57 0.0 0.01 0.0 0.27 0.26 0.06 0.81 0.93 1.0 0.32 0.33 0.28 0.31
0.22 0.28 0.32 0.34 0.38 0.41 0.31 0.3 0.23 0.21 0.2 0.17 0.2 0.2 0.34 0.23 0.22 0.18 0.3 0.05 0.06 0.02 0.23 0.22 0.14 0.59 0.93 1.0 0.17 0.18 0.19 0.2
0.45 0.37 0.37 0.39 0.41 0.4 0.38 0.48 0.52 0.48 0.49 0.42 0.32 0.25 0.19 0.29 0.38 0.25 0.46 0.02 0.02 0.01 0.32 0.29 0.08 0.89 0.87 1.0 0.44 0.47 0.19 0.2
0.31 0.32 0.34 0.42 0.46 0.48 0.48 0.53 0.47 0.39 0.36 0.33 0.28 0.24 0.36 0.3 0.3 0.16 0.33 0.11 0.06 0.11 0.29 0.31 0.61 0.73 0.96 1.0 0.29 0.31 0.26 0.24
0.34 0.37 0.41 0.46 0.43 0.45 0.39 0.4 0.35 0.35 0.38 0.32 0.3 0.28 0.34 0.34 0.28 0.18 0.34 0.09 0.04 0.16 0.29 0.31 0.24 0.79 0.94 1.0 0.28 0.29 0.24 0.25
0.44 0.5 0.52 0.54 0.56 0.53 0.51 0.54 0.38 0.44 0.41 0.35 0.29 0.33 0.39 0.41 0.45 0.32 0.57 0.13 0.16 0.05 0.5 0.41 0.31 0.73 0.87 1.0 0.39 0.41 0.34 0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)