Heatmap: Cluster_181 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo101516	0.16	0.19	0.24	0.26	0.33	0.36	0.53	0.52	0.45	0.42	0.29	0.26	0.26	0.13	0.38	0.23	0.3	0.25	0.29	0.04	0.18	0.06	0.28	0.27	0.15	0.57	0.96	1.0	0.33	0.36	0.18	0.19
Smo102849	0.43	0.46	0.45	0.48	0.49	0.47	0.46	0.51	0.45	0.45	0.44	0.39	0.35	0.29	0.32	0.41	0.28	0.24	0.47	0.19	0.05	0.07	0.32	0.32	0.23	0.86	0.94	1.0	0.34	0.34	0.28	0.29
Smo110984	0.15	0.12	0.17	0.18	0.2	0.25	0.19	0.28	0.27	0.15	0.17	0.13	0.21	0.35	0.1	0.26	0.12	0.18	0.21	0.0	0.02	0.05	0.1	0.12	0.1	0.71	1.0	0.94	0.15	0.11	0.1	0.2
Smo117320	0.25	0.34	0.3	0.42	0.47	0.48	0.43	0.47	0.31	0.42	0.3	0.28	0.37	0.15	0.25	0.34	0.18	0.12	0.45	0.0	0.0	0.0	0.26	0.29	0.05	0.81	1.0	0.72	0.25	0.23	0.2	0.24
Smo150191	0.26	0.23	0.23	0.32	0.41	0.41	0.3	0.45	0.28	0.36	0.27	0.26	0.14	0.11	0.02	0.15	0.06	0.04	0.15	0.02	0.08	0.02	0.14	0.14	0.12	0.84	1.0	0.77	0.06	0.06	0.09	0.13
Smo151539	0.42	0.44	0.43	0.55	0.58	0.62	0.64	0.62	0.55	0.49	0.4	0.36	0.42	0.43	0.59	0.46	0.43	0.4	0.59	0.04	0.29	0.07	0.42	0.43	0.38	0.71	0.97	1.0	0.4	0.41	0.29	0.29
Smo163635	0.42	0.44	0.39	0.5	0.61	0.58	0.51	0.61	0.49	0.48	0.42	0.38	0.32	0.25	0.49	0.39	0.35	0.21	0.53	0.0	0.0	0.0	0.36	0.34	0.07	0.88	0.88	1.0	0.44	0.46	0.23	0.23
Smo166503	0.33	0.35	0.32	0.36	0.44	0.42	0.48	0.52	0.43	0.42	0.39	0.36	0.23	0.35	0.4	0.29	0.21	0.2	0.43	0.04	0.04	0.23	0.25	0.26	0.12	0.67	1.0	0.94	0.27	0.29	0.38	0.42
Smo230271	0.3	0.27	0.28	0.33	0.42	0.42	0.44	0.47	0.44	0.4	0.38	0.3	0.26	0.3	0.29	0.33	0.39	0.36	0.36	0.19	0.22	0.07	0.38	0.34	0.31	0.62	0.86	1.0	0.4	0.41	0.29	0.28
Smo271353	0.26	0.31	0.29	0.35	0.39	0.41	0.4	0.41	0.34	0.31	0.29	0.26	0.18	0.2	0.17	0.2	0.21	0.15	0.23	0.03	0.18	0.01	0.21	0.2	0.31	0.51	1.0	0.87	0.2	0.21	0.22	0.23
Smo31884	0.36	0.44	0.46	0.59	0.65	0.67	0.55	0.57	0.45	0.4	0.32	0.3	0.33	0.34	0.5	0.34	0.29	0.1	0.34	0.14	0.09	0.05	0.3	0.27	0.23	0.85	1.0	0.97	0.23	0.24	0.19	0.17
Smo402481	0.37	0.42	0.39	0.46	0.49	0.49	0.55	0.51	0.45	0.43	0.41	0.37	0.38	0.24	0.43	0.44	0.27	0.19	0.41	0.13	0.08	0.14	0.3	0.29	0.27	0.75	0.93	1.0	0.29	0.31	0.24	0.22
Smo403334	0.31	0.27	0.32	0.41	0.44	0.41	0.39	0.41	0.35	0.35	0.27	0.28	0.29	0.25	0.34	0.36	0.31	0.17	0.39	0.01	0.26	0.03	0.25	0.25	0.25	0.63	1.0	0.93	0.3	0.31	0.22	0.22
Smo403914	0.27	0.33	0.4	0.41	0.45	0.43	0.28	0.37	0.32	0.3	0.32	0.31	0.39	0.25	0.45	0.3	0.14	0.14	0.13	0.0	0.0	0.0	0.23	0.25	0.1	0.77	0.99	1.0	0.13	0.13	0.12	0.16
Smo406615	0.37	0.43	0.43	0.43	0.48	0.46	0.47	0.49	0.41	0.41	0.37	0.35	0.36	0.28	0.41	0.41	0.32	0.21	0.47	0.0	0.0	0.0	0.33	0.33	0.08	0.8	0.92	1.0	0.34	0.35	0.24	0.24
Smo406963	0.37	0.37	0.43	0.44	0.44	0.43	0.47	0.53	0.52	0.5	0.51	0.42	0.49	0.39	0.39	0.41	0.42	0.39	0.38	0.14	0.16	0.14	0.36	0.32	0.18	0.65	0.92	1.0	0.42	0.42	0.41	0.53
Smo407737	0.26	0.28	0.37	0.35	0.35	0.33	0.46	0.53	0.4	0.49	0.53	0.42	0.69	0.16	0.1	0.22	0.25	0.34	0.25	0.0	0.01	0.0	0.36	0.41	0.58	0.61	0.94	1.0	0.29	0.25	0.17	0.17
Smo407922	0.56	0.43	0.49	0.37	0.55	0.51	0.46	0.58	0.53	0.52	0.65	0.54	0.37	0.34	0.28	0.34	0.24	0.14	0.29	0.07	0.02	0.0	0.3	0.28	0.18	0.73	0.96	1.0	0.34	0.31	0.39	0.39
Smo409308	0.42	0.35	0.41	0.43	0.46	0.47	0.47	0.48	0.45	0.44	0.44	0.37	0.54	0.53	0.56	0.41	0.26	0.22	0.38	0.15	0.03	0.03	0.33	0.33	0.24	0.86	1.0	0.9	0.25	0.25	0.26	0.26
Smo409885	0.35	0.39	0.32	0.36	0.39	0.42	0.47	0.38	0.33	0.32	0.32	0.27	0.29	0.17	0.47	0.31	0.19	0.24	0.34	0.03	0.02	0.08	0.21	0.21	0.13	0.64	1.0	0.95	0.2	0.2	0.18	0.16
Smo410009	0.15	0.1	0.05	0.11	0.28	0.24	0.29	0.35	0.24	0.22	0.22	0.14	0.05	0.04	0.03	0.06	0.04	0.11	0.12	0.0	0.0	0.0	0.1	0.1	0.12	0.48	0.93	1.0	0.11	0.07	0.08	0.06
Smo410333	0.42	0.47	0.52	0.57	0.66	0.64	0.57	0.55	0.46	0.42	0.41	0.35	0.38	0.31	0.44	0.44	0.35	0.19	0.5	0.14	0.09	0.09	0.39	0.35	0.26	0.68	0.93	1.0	0.36	0.38	0.28	0.29
Smo413675	0.47	0.49	0.43	0.46	0.44	0.35	0.43	0.47	0.45	0.42	0.39	0.48	0.12	0.15	0.2	0.21	0.14	0.09	0.27	0.01	0.01	0.0	0.15	0.14	0.08	0.65	1.0	0.95	0.19	0.2	0.27	0.23
Smo414202	0.47	0.47	0.5	0.56	0.63	0.52	0.51	0.6	0.61	0.55	0.53	0.45	0.35	0.26	0.36	0.38	0.21	0.14	0.26	0.01	0.02	0.04	0.33	0.37	0.03	0.76	1.0	0.87	0.22	0.25	0.21	0.27
Smo417117	0.3	0.28	0.31	0.36	0.38	0.39	0.42	0.45	0.44	0.4	0.34	0.3	0.35	0.28	0.59	0.27	0.19	0.15	0.26	0.11	0.05	0.1	0.23	0.26	0.11	0.75	1.0	0.89	0.2	0.22	0.26	0.27
Smo421634	0.4	0.44	0.47	0.51	0.47	0.48	0.53	0.64	0.5	0.46	0.58	0.45	0.25	0.39	0.52	0.29	0.36	0.33	0.31	0.06	0.12	0.12	0.36	0.32	0.1	0.72	1.0	0.94	0.31	0.31	0.35	0.36
Smo423776	0.26	0.27	0.22	0.3	0.37	0.31	0.3	0.42	0.38	0.32	0.31	0.29	0.17	0.15	0.13	0.2	0.17	0.02	0.15	0.08	0.03	0.25	0.21	0.22	0.18	0.93	1.0	0.73	0.18	0.16	0.19	0.19
Smo426594	0.44	0.51	0.52	0.5	0.54	0.5	0.47	0.43	0.43	0.44	0.43	0.38	0.43	0.44	0.55	0.52	0.34	0.27	0.5	0.34	0.17	0.08	0.41	0.42	0.33	0.77	0.95	1.0	0.33	0.38	0.38	0.4
Smo42776	0.26	0.28	0.28	0.33	0.36	0.37	0.43	0.53	0.36	0.36	0.33	0.29	0.38	0.22	0.07	0.3	0.23	0.25	0.36	0.0	0.05	0.0	0.34	0.4	0.39	0.44	0.98	1.0	0.25	0.26	0.2	0.17
Smo429498	0.5	0.49	0.49	0.51	0.46	0.5	0.47	0.52	0.53	0.5	0.46	0.42	0.28	0.18	0.64	0.3	0.31	0.2	0.42	0.0	0.05	0.09	0.25	0.19	0.04	0.87	0.76	1.0	0.4	0.36	0.29	0.27
Smo429547	0.48	0.46	0.47	0.51	0.55	0.54	0.51	0.44	0.38	0.37	0.36	0.34	0.28	0.31	0.36	0.31	0.35	0.27	0.42	0.04	0.08	0.08	0.31	0.27	0.19	0.52	0.98	1.0	0.28	0.31	0.28	0.3
Smo430123	0.41	0.5	0.47	0.45	0.4	0.43	0.38	0.36	0.39	0.37	0.45	0.32	0.26	0.12	0.42	0.26	0.28	0.32	0.29	0.02	0.0	0.07	0.29	0.35	0.21	0.58	1.0	0.92	0.25	0.22	0.29	0.29
Smo430219	0.32	0.41	0.37	0.35	0.47	0.34	0.43	0.38	0.35	0.36	0.37	0.28	0.28	0.25	0.29	0.38	0.24	0.13	0.34	0.0	0.01	0.01	0.28	0.31	0.14	0.74	0.9	1.0	0.26	0.28	0.13	0.15
Smo437462	0.28	0.33	0.34	0.31	0.39	0.45	0.45	0.48	0.37	0.4	0.32	0.3	0.24	0.19	0.16	0.28	0.15	0.18	0.4	0.12	0.04	0.01	0.17	0.18	0.21	0.62	1.0	0.75	0.18	0.18	0.24	0.41
Smo437721	0.33	0.3	0.33	0.35	0.35	0.36	0.36	0.41	0.4	0.38	0.39	0.33	0.21	0.28	0.34	0.19	0.22	0.19	0.21	0.04	0.07	0.06	0.22	0.26	0.11	0.52	1.0	0.87	0.2	0.23	0.34	0.42
Smo437796	0.4	0.43	0.4	0.54	0.58	0.55	0.56	0.6	0.58	0.51	0.5	0.44	0.47	0.27	0.37	0.47	0.31	0.18	0.41	0.14	0.03	0.07	0.37	0.37	0.23	0.75	0.98	1.0	0.34	0.35	0.24	0.24
Smo438647	0.21	0.31	0.31	0.39	0.5	0.52	0.43	0.35	0.25	0.23	0.21	0.18	0.16	0.27	0.14	0.28	0.35	0.19	0.39	0.04	0.05	0.04	0.39	0.35	0.07	0.61	0.89	1.0	0.31	0.31	0.17	0.16
Smo438910	0.47	0.52	0.52	0.52	0.67	0.65	0.53	0.55	0.45	0.42	0.38	0.34	0.27	0.3	0.52	0.37	0.31	0.29	0.39	0.14	0.08	0.03	0.3	0.3	0.07	0.52	0.9	1.0	0.26	0.28	0.27	0.26
Smo439124	0.37	0.35	0.36	0.42	0.51	0.51	0.5	0.54	0.45	0.42	0.41	0.31	0.4	0.2	0.49	0.41	0.3	0.35	0.44	0.02	0.12	0.08	0.4	0.45	0.23	0.8	1.0	0.89	0.36	0.37	0.31	0.29
Smo439153	0.3	0.32	0.34	0.45	0.55	0.53	0.49	0.52	0.36	0.34	0.31	0.3	0.27	0.28	0.41	0.33	0.27	0.16	0.34	0.17	0.09	0.07	0.37	0.34	0.26	0.67	1.0	0.99	0.24	0.27	0.25	0.28
Smo439571	0.4	0.36	0.34	0.46	0.44	0.47	0.45	0.51	0.46	0.43	0.45	0.38	0.35	0.25	0.43	0.36	0.32	0.19	0.45	0.19	0.11	0.09	0.36	0.4	0.44	0.87	1.0	0.9	0.32	0.35	0.34	0.32
Smo440325	0.65	0.53	0.49	0.46	0.53	0.5	0.55	0.62	0.65	0.63	0.7	0.66	0.39	0.42	0.29	0.49	0.43	0.29	0.69	0.11	0.1	0.04	0.53	0.47	0.25	0.89	0.91	1.0	0.5	0.5	0.4	0.44
Smo440877	0.4	0.42	0.42	0.41	0.39	0.44	0.42	0.43	0.39	0.38	0.37	0.35	0.33	0.32	0.48	0.35	0.25	0.14	0.37	0.1	0.19	0.06	0.3	0.29	0.28	0.74	1.0	0.99	0.25	0.25	0.28	0.29
Smo442381	0.3	0.35	0.34	0.39	0.44	0.4	0.34	0.35	0.32	0.31	0.29	0.26	0.4	0.54	0.38	0.39	0.22	0.23	0.33	0.02	0.11	0.13	0.3	0.28	0.24	0.82	0.96	1.0	0.22	0.22	0.22	0.24
Smo442865	0.56	0.56	0.55	0.57	0.61	0.58	0.57	0.54	0.51	0.56	0.51	0.51	0.45	0.46	0.73	0.47	0.33	0.26	0.46	0.45	0.21	0.23	0.34	0.36	0.43	0.9	0.99	1.0	0.33	0.34	0.42	0.45
Smo443461	0.46	0.47	0.47	0.61	0.68	0.6	0.59	0.67	0.6	0.52	0.49	0.46	0.39	0.44	0.53	0.43	0.26	0.24	0.41	0.11	0.06	0.12	0.34	0.35	0.3	0.9	1.0	0.81	0.27	0.32	0.41	0.52
Smo444321	0.38	0.36	0.36	0.35	0.36	0.42	0.4	0.44	0.43	0.38	0.33	0.32	0.33	0.41	0.38	0.33	0.24	0.25	0.34	0.19	0.22	0.15	0.32	0.32	0.22	0.6	1.0	0.97	0.23	0.26	0.33	0.37
Smo444750	0.46	0.42	0.43	0.43	0.44	0.43	0.4	0.51	0.48	0.43	0.45	0.38	0.23	0.23	0.24	0.3	0.36	0.21	0.4	0.01	0.01	0.01	0.32	0.31	0.22	0.84	1.0	0.95	0.35	0.33	0.36	0.48
Smo61619	0.38	0.35	0.36	0.42	0.49	0.43	0.47	0.52	0.5	0.46	0.45	0.41	0.26	0.2	0.17	0.32	0.36	0.33	0.68	0.01	0.08	0.02	0.36	0.34	0.14	1.0	0.93	1.0	0.47	0.46	0.44	0.46
Smo76001	0.23	0.29	0.33	0.39	0.41	0.44	0.38	0.45	0.38	0.32	0.29	0.24	0.29	0.26	0.25	0.47	0.29	0.15	0.57	0.0	0.01	0.0	0.27	0.26	0.06	0.81	0.93	1.0	0.32	0.33	0.28	0.31
Smo84658	0.22	0.28	0.32	0.34	0.38	0.41	0.31	0.3	0.23	0.21	0.2	0.17	0.2	0.2	0.34	0.23	0.22	0.18	0.3	0.05	0.06	0.02	0.23	0.22	0.14	0.59	0.93	1.0	0.17	0.18	0.19	0.2
Smo92017	0.45	0.37	0.37	0.39	0.41	0.4	0.38	0.48	0.52	0.48	0.49	0.42	0.32	0.25	0.19	0.29	0.38	0.25	0.46	0.02	0.02	0.01	0.32	0.29	0.08	0.89	0.87	1.0	0.44	0.47	0.19	0.2
Smo93050	0.31	0.32	0.34	0.42	0.46	0.48	0.48	0.53	0.47	0.39	0.36	0.33	0.28	0.24	0.36	0.3	0.3	0.16	0.33	0.11	0.06	0.11	0.29	0.31	0.61	0.73	0.96	1.0	0.29	0.31	0.26	0.24
Smo96986	0.34	0.37	0.41	0.46	0.43	0.45	0.39	0.4	0.35	0.35	0.38	0.32	0.3	0.28	0.34	0.34	0.28	0.18	0.34	0.09	0.04	0.16	0.29	0.31	0.24	0.79	0.94	1.0	0.28	0.29	0.24	0.25
Smo99919	0.44	0.5	0.52	0.54	0.56	0.53	0.51	0.54	0.38	0.44	0.41	0.35	0.29	0.33	0.39	0.41	0.45	0.32	0.57	0.13	0.16	0.05	0.5	0.41	0.31	0.73	0.87	1.0	0.39	0.41	0.34	0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)