Heatmap: Cluster_111 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo101476	0.34	0.39	0.5	0.54	0.51	0.35	0.59	0.69	0.77	0.88	0.76	0.63	0.4	0.4	0.89	0.46	0.23	0.15	0.22	0.0	0.0	0.0	0.24	0.2	0.0	1.0	0.41	0.33	0.27	0.27	0.27	0.39
Smo106561	0.48	0.43	0.37	0.47	0.49	0.5	0.51	0.69	0.67	0.67	0.66	0.59	0.65	0.66	0.88	0.73	0.37	0.29	0.63	0.16	0.55	0.15	0.42	0.53	0.43	1.0	0.7	0.69	0.44	0.45	0.4	0.35
Smo109190	0.27	0.33	0.37	0.38	0.29	0.27	0.33	0.45	0.49	0.53	0.47	0.42	0.28	0.49	1.0	0.28	0.14	0.06	0.16	0.02	0.02	0.12	0.08	0.09	0.06	0.46	0.19	0.16	0.14	0.15	0.26	0.28
Smo112372	0.63	0.74	0.69	0.75	0.72	0.7	0.67	0.76	0.63	0.78	0.66	0.66	0.5	0.56	0.7	0.7	0.45	0.29	1.0	0.3	0.64	0.16	0.62	0.72	0.79	0.86	0.84	0.93	0.59	0.6	0.64	0.48
Smo120629	0.35	0.38	0.49	0.46	0.39	0.33	0.42	0.56	0.58	0.76	0.61	0.59	0.36	0.5	0.89	0.33	0.16	0.06	0.2	0.04	0.01	0.06	0.1	0.1	0.03	1.0	0.34	0.28	0.16	0.15	0.37	0.38
Smo131418	0.63	0.59	0.36	0.44	0.6	0.5	0.69	0.55	0.7	0.64	0.78	0.7	0.48	0.71	0.54	0.51	0.34	0.16	0.58	0.18	1.0	0.47	0.64	0.62	0.76	0.84	0.49	0.42	0.34	0.43	0.37	0.46
Smo142026	0.36	0.36	0.43	0.51	0.52	0.47	0.47	0.63	0.53	0.6	0.6	0.45	0.54	0.91	0.9	0.76	0.27	0.2	0.57	0.19	0.12	0.08	0.63	0.68	0.28	1.0	0.35	0.35	0.37	0.37	0.37	0.27
Smo14302	0.37	0.46	0.57	0.52	0.57	0.44	0.52	0.54	0.6	0.79	0.69	0.47	0.62	0.49	0.98	0.65	0.37	0.39	0.38	0.0	0.0	0.0	0.39	0.38	0.0	1.0	0.35	0.41	0.38	0.46	0.38	0.52
Smo143081	0.52	0.52	0.56	0.62	0.6	0.58	0.62	0.76	0.83	1.0	0.98	0.89	0.51	0.78	0.91	0.51	0.31	0.23	0.39	0.19	0.29	0.08	0.38	0.4	0.27	0.95	0.48	0.54	0.32	0.34	0.4	0.43
Smo146823	0.62	0.55	0.48	0.57	0.64	0.6	0.68	0.74	0.69	0.67	0.62	0.62	0.55	0.41	0.96	0.64	0.49	0.38	0.65	0.28	0.33	0.11	0.56	0.55	1.0	0.94	0.64	0.61	0.55	0.58	0.49	0.49
Smo158708	0.73	0.62	0.66	0.67	0.77	0.83	0.77	0.77	0.86	0.95	0.81	0.75	0.65	0.67	1.0	0.75	0.7	0.51	0.75	0.26	0.76	0.38	0.74	0.75	0.86	0.75	0.82	0.83	0.64	0.67	0.68	0.79
Smo172615	0.45	0.43	0.43	0.46	0.47	0.45	0.47	0.56	0.63	0.66	0.63	0.62	0.48	0.59	0.7	0.53	0.33	0.27	0.4	0.44	0.37	0.31	0.35	0.37	0.6	1.0	0.55	0.55	0.33	0.36	0.4	0.47
Smo173359	0.25	0.25	0.26	0.29	0.31	0.33	0.37	0.45	0.43	0.46	0.48	0.43	0.38	0.52	0.69	0.37	0.19	0.2	0.32	0.3	0.12	0.11	0.29	0.39	0.16	1.0	0.37	0.36	0.21	0.23	0.2	0.21
Smo182516	0.54	0.5	0.5	0.52	0.55	0.48	0.52	0.61	0.64	0.63	0.62	0.59	0.56	0.56	0.72	0.59	0.29	0.25	0.47	0.12	0.41	0.33	0.41	0.47	0.49	1.0	0.65	0.64	0.32	0.33	0.39	0.42
Smo187330	0.78	0.66	0.64	0.72	0.69	0.64	0.97	0.93	0.88	0.93	0.92	0.9	0.33	0.48	1.0	0.57	0.55	0.67	0.83	0.72	0.71	0.19	0.51	0.54	0.79	0.54	0.95	0.87	0.53	0.58	0.39	0.41
Smo227351	0.63	0.64	0.61	0.7	0.71	0.71	0.65	0.74	0.72	0.72	0.71	0.71	0.52	0.75	0.52	0.8	0.37	0.25	0.67	0.12	0.33	0.12	0.41	0.46	0.75	0.89	1.0	0.9	0.46	0.48	0.39	0.38
Smo227818	0.19	0.2	0.27	0.35	0.27	0.27	0.5	0.89	0.62	0.93	0.78	0.62	0.59	0.71	0.98	0.51	0.19	0.21	0.32	0.16	0.06	0.18	0.19	0.21	0.2	1.0	0.18	0.14	0.22	0.21	0.32	0.35
Smo230708	0.4	0.36	0.36	0.39	0.39	0.41	0.56	0.71	0.68	0.67	0.62	0.52	0.58	0.46	0.87	0.65	0.37	0.27	0.68	0.18	0.26	0.27	0.54	0.81	0.56	1.0	0.54	0.56	0.46	0.54	0.38	0.38
Smo231054	0.59	0.52	0.48	0.57	0.55	0.61	0.86	1.0	0.9	0.86	0.66	0.69	0.39	0.73	0.99	0.6	0.31	0.15	0.78	0.32	0.8	0.15	0.32	0.47	0.94	0.82	0.87	0.73	0.46	0.51	0.74	0.63
Smo2346	0.45	0.46	0.46	0.51	0.57	0.55	0.55	0.79	0.74	0.77	0.71	0.59	0.6	0.41	0.46	0.6	0.25	0.19	0.43	0.17	0.14	0.19	0.42	0.47	0.48	1.0	0.62	0.63	0.36	0.36	0.33	0.38
Smo266549	0.41	0.39	0.41	0.49	0.46	0.45	0.44	0.57	0.56	0.58	0.58	0.47	0.55	1.0	0.69	0.63	0.24	0.19	0.47	0.51	0.15	0.1	0.36	0.39	0.42	0.88	0.47	0.42	0.27	0.27	0.31	0.38
Smo270804	0.47	0.34	0.31	0.32	0.34	0.32	0.33	0.49	0.59	0.6	0.6	0.53	0.64	0.59	0.88	0.46	0.22	0.2	0.35	0.25	0.3	0.21	0.28	0.39	0.29	1.0	0.39	0.36	0.3	0.31	0.32	0.36
Smo271951	0.72	0.73	0.75	0.73	0.8	0.73	0.87	0.87	0.84	0.86	0.83	0.79	0.7	0.88	0.98	0.78	0.54	0.42	0.73	0.6	0.62	0.42	0.59	0.65	0.77	1.0	0.8	0.8	0.56	0.6	0.58	0.53
Smo403227	0.34	0.24	0.27	0.31	0.24	0.27	0.35	0.75	0.65	0.86	0.68	0.67	0.67	0.28	0.63	0.44	0.18	0.21	0.64	0.39	1.0	0.08	0.16	0.16	0.22	0.78	0.55	0.53	0.21	0.21	0.07	0.07
Smo404190	0.38	0.4	0.33	0.39	0.52	0.56	0.62	0.65	0.71	0.57	0.55	0.55	0.46	0.42	0.83	0.44	0.59	0.55	0.46	0.02	0.38	0.08	0.56	0.65	1.0	0.81	0.66	0.48	0.58	0.5	0.62	0.51
Smo404220	0.55	0.46	0.56	0.48	0.51	0.5	0.58	0.72	0.6	0.68	0.62	0.6	0.43	0.58	0.85	0.54	0.42	0.17	0.74	0.32	0.91	0.19	0.49	0.54	0.88	1.0	0.8	0.69	0.48	0.48	0.44	0.43
Smo404222	0.55	0.46	0.56	0.48	0.51	0.5	0.58	0.72	0.6	0.68	0.62	0.6	0.43	0.58	0.85	0.54	0.42	0.17	0.74	0.32	0.91	0.19	0.49	0.54	0.88	1.0	0.8	0.69	0.48	0.48	0.44	0.43
Smo404891	0.45	0.47	0.38	0.38	0.39	0.37	0.39	0.39	0.46	0.54	0.54	0.46	0.16	0.36	0.5	0.2	0.36	0.56	0.34	0.55	0.81	0.1	0.44	0.4	1.0	0.38	0.6	0.55	0.26	0.29	0.38	0.43
Smo405482	0.37	0.42	0.47	0.52	0.56	0.53	0.58	0.6	0.63	0.6	0.59	0.5	0.48	0.61	0.71	0.56	0.47	0.58	0.78	0.33	0.3	0.35	0.78	0.65	0.64	1.0	0.58	0.62	0.51	0.56	0.47	0.55
Smo407588	0.32	0.31	0.32	0.37	0.37	0.41	0.5	0.47	0.56	0.67	0.54	0.51	0.31	0.7	0.77	0.31	0.25	0.12	0.18	0.08	0.63	0.06	0.17	0.22	0.28	1.0	0.4	0.46	0.27	0.28	0.18	0.17
Smo411712	0.34	0.27	0.31	0.37	0.35	0.35	0.4	0.44	0.53	0.51	0.52	0.42	0.26	0.36	1.0	0.32	0.27	0.17	0.32	0.02	0.19	0.26	0.16	0.14	0.11	0.57	0.49	0.56	0.22	0.25	0.26	0.35
Smo414525	0.4	0.21	0.39	0.22	0.16	0.21	0.2	0.29	0.39	0.53	0.42	0.55	0.02	0.65	0.04	0.08	0.09	0.86	0.4	0.75	1.0	0.0	0.12	0.11	0.42	0.68	0.34	0.42	0.33	0.24	0.34	0.46
Smo419620	0.34	0.23	0.27	0.34	0.32	0.41	0.54	0.71	0.72	0.8	0.78	0.55	0.57	0.63	0.68	0.56	0.21	0.21	0.59	0.45	0.31	0.18	0.36	0.43	0.26	1.0	0.48	0.43	0.32	0.32	0.44	0.54
Smo428809	0.27	0.23	0.24	0.29	0.34	0.41	0.42	0.48	0.43	0.48	0.47	0.3	0.41	0.65	0.6	0.42	0.18	0.06	0.32	0.06	0.14	0.28	0.28	0.3	0.22	1.0	0.57	0.52	0.19	0.21	0.22	0.25
Smo437498	0.35	0.41	0.47	0.44	0.47	0.46	0.48	0.54	0.54	0.55	0.61	0.45	0.62	0.66	0.91	0.68	0.31	0.31	0.43	0.19	0.11	0.05	0.49	0.54	0.19	1.0	0.51	0.63	0.33	0.4	0.27	0.28
Smo440035	0.47	0.45	0.43	0.46	0.41	0.44	0.52	0.57	0.59	0.64	0.55	0.49	0.28	0.46	0.5	0.36	0.21	0.18	0.38	0.16	0.07	0.08	0.25	0.29	0.38	1.0	0.69	0.64	0.3	0.31	0.37	0.36
Smo444105	0.44	0.48	0.53	0.46	0.61	0.56	0.62	0.66	0.73	0.82	0.68	0.66	0.65	0.71	0.59	0.68	0.41	0.05	0.65	0.19	1.0	0.04	0.46	0.55	0.97	0.97	0.75	0.94	0.48	0.56	0.44	0.45
Smo444190	0.33	0.3	0.34	0.38	0.4	0.38	0.42	0.51	0.54	0.57	0.51	0.43	0.55	0.79	0.73	0.52	0.23	0.16	0.39	0.22	0.17	0.01	0.35	0.42	0.17	1.0	0.47	0.48	0.22	0.25	0.25	0.26
Smo444789	0.16	0.23	0.44	0.47	0.4	0.31	0.74	0.86	0.72	0.77	0.61	0.42	0.71	1.0	0.83	0.14	0.11	0.07	0.13	0.03	0.02	0.07	0.11	0.13	0.09	0.84	0.35	0.18	0.17	0.17	0.18	0.19
Smo71450	0.37	0.38	0.44	0.45	0.54	0.58	0.6	0.74	0.7	0.72	0.69	0.53	0.68	1.0	0.76	0.68	0.34	0.34	0.48	0.28	0.26	0.41	0.53	0.58	0.36	0.71	0.64	0.76	0.45	0.45	0.36	0.37
Smo73901	0.68	0.66	0.66	0.67	0.72	0.66	0.66	0.71	0.79	0.73	0.74	0.65	0.67	0.7	0.68	0.66	0.4	0.37	0.78	0.12	0.36	0.22	0.5	0.51	0.65	1.0	0.88	0.84	0.42	0.42	0.36	0.45
Smo75959	0.59	0.67	0.66	0.73	0.67	0.7	0.82	0.79	0.74	0.77	0.7	0.67	0.68	0.65	1.0	0.91	0.56	0.33	0.84	0.48	0.87	0.51	0.53	0.57	0.43	0.98	0.83	0.78	0.6	0.62	0.43	0.39
Smo76516	0.31	0.23	0.28	0.35	0.35	0.3	0.35	0.64	0.59	0.68	0.58	0.44	0.32	0.24	0.5	0.32	0.16	0.06	0.25	0.11	0.01	0.04	0.22	0.22	0.18	1.0	0.45	0.46	0.18	0.2	0.23	0.26
Smo79429	0.41	0.39	0.45	0.5	0.67	0.68	0.62	0.76	0.66	0.65	0.54	0.51	0.67	0.32	0.79	0.72	0.32	0.28	0.66	0.16	0.41	0.42	0.53	0.64	0.91	1.0	0.51	0.57	0.55	0.6	0.2	0.19
Smo80824	0.57	0.46	0.53	0.53	0.59	0.77	0.7	0.77	0.77	0.69	0.6	0.59	0.56	0.3	1.0	0.66	0.48	0.48	0.69	0.09	0.17	0.03	0.66	0.73	0.87	0.64	0.68	0.78	0.5	0.56	0.34	0.35
Smo83558	0.28	0.26	0.29	0.3	0.27	0.23	0.36	0.52	0.67	0.76	0.78	0.56	0.54	0.86	1.0	0.37	0.1	0.08	0.05	0.01	0.0	0.0	0.11	0.21	0.07	0.7	0.32	0.3	0.08	0.12	0.13	0.14
Smo93468	0.54	0.55	0.51	0.63	0.67	0.56	0.57	0.61	0.62	0.62	0.63	0.61	0.48	0.45	1.0	0.53	0.47	0.33	0.53	0.33	0.3	0.41	0.45	0.47	0.48	0.61	0.67	0.67	0.41	0.43	0.52	0.49
Smo93560	0.7	0.62	0.75	0.68	0.65	0.6	0.59	0.81	0.72	0.72	0.71	0.65	0.5	0.85	0.66	0.7	0.31	0.15	0.6	0.04	0.33	0.1	0.4	0.48	0.77	1.0	0.68	0.77	0.39	0.34	0.3	0.32
Smo94941	0.43	0.43	0.6	0.41	0.46	0.45	0.26	0.44	0.53	0.41	0.47	0.32	0.23	0.53	0.69	0.3	0.17	0.01	0.25	0.08	1.0	0.05	0.21	0.26	0.99	0.62	0.61	0.9	0.19	0.2	0.14	0.18
Smo98967	0.4	0.4	0.45	0.49	0.52	0.53	0.63	0.67	0.69	0.73	0.66	0.61	0.56	0.71	1.0	0.44	0.3	0.15	0.32	0.12	0.22	0.11	0.29	0.32	0.16	0.5	0.48	0.39	0.24	0.28	0.35	0.39

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)