Heatmap: Cluster_76 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.18 0.29 0.29 0.29 0.25 0.27 0.18 0.15 0.25 0.23 0.2 0.16 0.24 0.45 1.0 0.27 0.29 0.23 0.06 0.01 0.04 0.08 0.16 0.11 0.11 0.07 0.1 0.12 0.15 0.21 0.12 0.08
0.34 0.32 0.36 0.37 0.45 0.4 0.41 0.25 0.4 0.37 0.33 0.32 0.13 0.04 1.0 0.15 0.36 0.27 0.19 0.04 0.03 0.16 0.17 0.1 0.0 0.07 0.07 0.1 0.2 0.21 0.15 0.13
0.23 0.22 0.29 0.28 0.52 0.48 0.44 0.4 0.42 0.39 0.36 0.27 0.14 0.1 1.0 0.23 0.4 0.45 0.16 0.05 0.01 0.33 0.17 0.07 0.0 0.08 0.23 0.13 0.33 0.29 0.19 0.14
0.4 0.44 0.43 0.41 0.41 0.42 0.47 0.46 0.5 0.57 0.51 0.51 0.48 0.91 1.0 0.5 0.32 0.31 0.34 0.38 0.33 0.16 0.37 0.38 0.15 0.23 0.16 0.15 0.33 0.34 0.35 0.4
0.21 0.27 0.31 0.29 0.26 0.33 0.32 0.22 0.34 0.3 0.28 0.21 0.31 0.42 1.0 0.19 0.33 0.23 0.14 0.39 0.13 0.36 0.03 0.03 0.01 0.08 0.07 0.13 0.2 0.32 0.12 0.13
0.27 0.25 0.26 0.23 0.29 0.25 0.21 0.2 0.27 0.29 0.29 0.23 0.26 0.11 1.0 0.37 0.12 0.13 0.1 0.16 0.06 0.04 0.07 0.11 0.01 0.11 0.08 0.1 0.07 0.1 0.06 0.05
0.41 0.43 0.5 0.48 0.5 0.49 0.47 0.32 0.45 0.4 0.42 0.35 0.1 0.14 1.0 0.19 0.55 0.34 0.14 0.14 0.09 0.33 0.11 0.09 0.02 0.13 0.12 0.17 0.33 0.4 0.3 0.28
0.48 0.5 0.48 0.5 0.49 0.54 0.51 0.38 0.43 0.43 0.48 0.41 0.22 0.36 1.0 0.29 0.61 0.39 0.25 0.49 0.4 0.25 0.27 0.28 0.35 0.18 0.22 0.26 0.38 0.47 0.27 0.18
0.61 0.59 0.59 0.63 0.59 0.6 0.53 0.55 0.59 0.6 0.5 0.54 0.85 0.79 1.0 0.74 0.47 0.39 0.76 0.42 0.29 0.55 0.62 0.7 0.26 0.58 0.47 0.41 0.48 0.45 0.59 0.69
0.38 0.44 0.48 0.48 0.45 0.44 0.47 0.37 0.41 0.4 0.38 0.35 0.43 0.72 1.0 0.48 0.42 0.3 0.37 0.39 0.1 0.1 0.38 0.38 0.11 0.29 0.3 0.38 0.32 0.37 0.28 0.27
0.34 0.35 0.38 0.37 0.34 0.32 0.38 0.31 0.46 0.47 0.45 0.41 0.18 0.37 1.0 0.2 0.36 0.37 0.09 0.13 0.08 0.26 0.11 0.15 0.03 0.14 0.07 0.09 0.23 0.28 0.29 0.24
0.41 0.39 0.4 0.41 0.54 0.43 0.41 0.44 0.55 0.61 0.5 0.42 0.21 0.31 1.0 0.26 0.35 0.3 0.24 0.02 0.02 0.06 0.34 0.24 0.0 0.2 0.15 0.11 0.3 0.34 0.2 0.32
0.27 0.33 0.38 0.31 0.36 0.29 0.33 0.26 0.27 0.27 0.27 0.26 0.13 0.33 1.0 0.26 0.36 0.04 0.11 0.27 0.01 0.01 0.14 0.13 0.02 0.2 0.12 0.16 0.22 0.25 0.09 0.08
0.41 0.41 0.46 0.42 0.45 0.44 0.46 0.38 0.49 0.44 0.45 0.39 0.25 0.59 1.0 0.36 0.39 0.31 0.32 0.28 0.19 0.24 0.33 0.28 0.07 0.21 0.31 0.29 0.26 0.28 0.44 0.47
0.22 0.22 0.2 0.24 0.27 0.3 0.21 0.2 0.28 0.28 0.29 0.24 0.15 0.24 1.0 0.2 0.09 0.05 0.04 0.27 0.16 0.59 0.02 0.06 0.14 0.11 0.06 0.07 0.06 0.09 0.05 0.04
0.44 0.54 0.58 0.55 0.54 0.58 0.57 0.34 0.5 0.43 0.5 0.44 0.27 0.65 1.0 0.37 0.41 0.42 0.16 0.37 0.08 0.01 0.34 0.34 0.2 0.15 0.15 0.13 0.26 0.28 0.24 0.2
0.29 0.39 0.4 0.36 0.35 0.3 0.39 0.38 0.41 0.47 0.41 0.34 0.42 0.85 1.0 0.47 0.29 0.26 0.41 0.37 0.02 0.16 0.22 0.32 0.06 0.23 0.14 0.13 0.21 0.24 0.15 0.2
0.56 0.44 0.43 0.47 0.41 0.47 0.4 0.55 0.49 0.54 0.56 0.51 0.65 0.88 1.0 0.64 0.37 0.46 0.58 0.44 0.19 0.45 0.5 0.55 0.09 0.51 0.38 0.32 0.39 0.37 0.49 0.65
0.36 0.49 0.54 0.62 0.59 0.64 0.68 0.57 0.65 0.57 0.57 0.47 0.29 0.79 1.0 0.46 0.61 0.42 0.4 0.44 0.25 0.52 0.59 0.67 0.25 0.19 0.32 0.41 0.5 0.57 0.41 0.35
0.23 0.3 0.26 0.36 0.33 0.33 0.33 0.28 0.28 0.32 0.37 0.26 0.36 0.22 1.0 0.35 0.36 0.63 0.14 0.16 0.05 0.49 0.31 0.3 0.01 0.02 0.02 0.04 0.24 0.26 0.21 0.15
0.25 0.26 0.31 0.3 0.3 0.38 0.34 0.37 0.37 0.38 0.45 0.37 0.09 0.05 1.0 0.21 0.34 0.18 0.3 0.01 0.1 0.0 0.1 0.05 0.07 0.14 0.11 0.16 0.28 0.34 0.19 0.19
0.13 0.15 0.15 0.19 0.15 0.13 0.23 0.17 0.29 0.22 0.21 0.18 0.02 0.41 1.0 0.04 0.12 0.1 0.02 0.01 0.03 0.01 0.05 0.06 0.1 0.05 0.04 0.07 0.09 0.11 0.06 0.02
0.27 0.27 0.31 0.3 0.31 0.3 0.38 0.34 0.4 0.39 0.4 0.31 0.09 0.07 1.0 0.19 0.33 0.19 0.19 0.06 0.02 0.23 0.16 0.15 0.06 0.4 0.25 0.35 0.27 0.29 0.24 0.28
0.35 0.33 0.33 0.37 0.41 0.48 0.5 0.6 0.59 0.49 0.51 0.39 0.09 0.24 1.0 0.16 0.4 0.37 0.37 0.12 0.38 0.14 0.2 0.14 0.19 0.4 0.47 0.47 0.42 0.4 0.24 0.25
0.45 0.46 0.51 0.44 0.59 0.46 0.43 0.36 0.49 0.5 0.51 0.4 0.1 0.03 1.0 0.18 0.3 0.26 0.07 0.13 0.04 0.24 0.02 0.03 0.01 0.22 0.17 0.22 0.16 0.2 0.23 0.25
0.12 0.26 0.27 0.16 0.11 0.11 0.22 0.16 0.16 0.19 0.16 0.18 0.02 0.6 1.0 0.05 0.06 0.04 0.06 0.01 0.01 0.02 0.04 0.02 0.01 0.05 0.08 0.12 0.05 0.1 0.01 0.02
0.29 0.31 0.31 0.28 0.34 0.36 0.43 0.21 0.35 0.24 0.27 0.27 0.37 0.5 1.0 0.22 0.3 0.09 0.14 0.0 0.35 0.26 0.02 0.03 0.01 0.08 0.1 0.08 0.21 0.29 0.11 0.11
0.21 0.28 0.28 0.33 0.38 0.39 0.42 0.34 0.35 0.33 0.29 0.24 0.16 0.14 1.0 0.14 0.38 0.27 0.12 0.21 0.13 0.37 0.18 0.15 0.08 0.12 0.18 0.23 0.24 0.31 0.15 0.13
0.3 0.33 0.39 0.36 0.41 0.42 0.44 0.37 0.5 0.46 0.48 0.37 0.1 0.05 1.0 0.3 0.37 0.29 0.12 0.18 0.1 0.26 0.15 0.14 0.03 0.36 0.16 0.16 0.25 0.31 0.43 0.35
0.24 0.24 0.26 0.3 0.27 0.32 0.3 0.27 0.38 0.4 0.38 0.29 0.2 0.14 1.0 0.27 0.33 0.28 0.24 0.1 0.02 0.11 0.15 0.23 0.0 0.14 0.1 0.14 0.24 0.28 0.36 0.36
0.23 0.21 0.27 0.35 0.29 0.3 0.32 0.21 0.22 0.28 0.25 0.27 0.06 0.06 1.0 0.1 0.42 0.16 0.27 0.08 0.01 0.11 0.14 0.08 0.1 0.18 0.26 0.33 0.23 0.28 0.14 0.1
0.39 0.41 0.49 0.43 0.37 0.4 0.41 0.38 0.47 0.44 0.5 0.39 0.1 0.18 1.0 0.16 0.29 0.12 0.3 0.31 0.15 0.44 0.15 0.14 0.1 0.21 0.21 0.25 0.31 0.31 0.16 0.17
0.27 0.28 0.31 0.28 0.29 0.28 0.33 0.27 0.29 0.28 0.28 0.25 0.21 0.38 1.0 0.21 0.23 0.14 0.08 0.03 0.01 0.05 0.11 0.15 0.03 0.1 0.11 0.14 0.15 0.18 0.25 0.18
0.35 0.35 0.28 0.4 0.41 0.3 0.32 0.26 0.35 0.26 0.26 0.21 0.11 0.49 1.0 0.22 0.33 0.3 0.4 0.71 0.02 0.14 0.1 0.18 0.13 0.45 0.24 0.39 0.2 0.32 0.34 0.26
0.26 0.3 0.18 0.25 0.18 0.25 0.23 0.18 0.18 0.18 0.13 0.21 0.09 0.43 1.0 0.16 0.31 0.53 0.49 0.57 0.08 0.03 0.17 0.14 0.14 0.56 0.4 0.48 0.25 0.25 0.07 0.12
0.22 0.24 0.25 0.27 0.27 0.28 0.2 0.21 0.25 0.28 0.23 0.25 0.12 0.43 1.0 0.21 0.14 0.12 0.05 0.22 0.01 0.1 0.06 0.07 0.05 0.06 0.12 0.09 0.11 0.13 0.1 0.08
0.39 0.41 0.42 0.37 0.4 0.41 0.54 0.26 0.42 0.29 0.39 0.43 0.16 0.21 1.0 0.23 0.33 0.26 0.2 0.53 0.05 0.23 0.19 0.14 0.09 0.28 0.2 0.27 0.24 0.31 0.19 0.19
0.25 0.3 0.35 0.31 0.33 0.33 0.42 0.34 0.37 0.36 0.37 0.28 0.15 0.34 1.0 0.23 0.31 0.13 0.11 0.33 0.13 0.23 0.11 0.11 0.03 0.24 0.14 0.16 0.22 0.22 0.14 0.16
0.24 0.3 0.36 0.35 0.4 0.43 0.44 0.36 0.39 0.4 0.42 0.35 0.12 0.17 1.0 0.2 0.29 0.19 0.38 0.38 0.16 0.38 0.08 0.06 0.1 0.36 0.41 0.4 0.2 0.22 0.2 0.27
0.28 0.37 0.39 0.36 0.38 0.37 0.51 0.32 0.38 0.35 0.35 0.3 0.13 0.38 1.0 0.23 0.42 0.29 0.16 0.46 0.15 0.34 0.13 0.17 0.05 0.22 0.21 0.3 0.25 0.32 0.22 0.17
0.63 0.59 0.59 0.56 0.54 0.62 0.72 0.41 0.53 0.54 0.6 0.53 0.29 0.2 1.0 0.35 0.53 0.44 0.23 0.62 0.19 0.59 0.24 0.23 0.17 0.15 0.27 0.3 0.35 0.43 0.2 0.19
0.34 0.46 0.38 0.43 0.33 0.4 0.34 0.21 0.27 0.23 0.25 0.24 0.26 0.44 1.0 0.37 0.35 0.28 0.22 0.15 0.19 0.51 0.26 0.27 0.2 0.12 0.15 0.16 0.23 0.3 0.15 0.15
0.5 0.47 0.5 0.37 0.46 0.4 0.45 0.29 0.49 0.42 0.51 0.4 0.07 0.02 1.0 0.09 0.66 0.34 0.1 0.7 0.18 0.71 0.02 0.01 0.08 0.08 0.13 0.19 0.39 0.45 0.19 0.1
0.23 0.3 0.31 0.29 0.27 0.29 0.24 0.18 0.22 0.17 0.21 0.19 0.18 0.48 1.0 0.22 0.25 0.14 0.08 0.0 0.0 0.04 0.19 0.11 0.05 0.02 0.07 0.11 0.15 0.17 0.05 0.03
0.35 0.32 0.39 0.36 0.46 0.36 0.41 0.27 0.35 0.37 0.42 0.28 0.11 0.25 1.0 0.18 0.38 0.42 0.21 0.01 0.01 0.16 0.16 0.11 0.01 0.27 0.22 0.23 0.24 0.27 0.23 0.22
0.4 0.34 0.36 0.38 0.37 0.37 0.41 0.27 0.29 0.35 0.31 0.28 0.33 1.0 0.85 0.53 0.51 0.49 0.25 0.4 0.06 0.0 0.33 0.45 0.02 0.04 0.07 0.09 0.21 0.24 0.25 0.14
0.29 0.31 0.36 0.33 0.41 0.35 0.35 0.3 0.4 0.35 0.42 0.28 0.13 0.18 1.0 0.21 0.37 0.4 0.11 0.0 0.0 0.0 0.09 0.07 0.0 0.14 0.15 0.17 0.25 0.31 0.2 0.2
0.36 0.35 0.38 0.41 0.42 0.48 0.32 0.41 0.37 0.37 0.36 0.31 0.37 0.62 1.0 0.36 0.37 0.43 0.33 0.28 0.05 0.1 0.35 0.31 0.16 0.18 0.36 0.38 0.21 0.28 0.22 0.2
0.16 0.22 0.21 0.23 0.21 0.21 0.25 0.34 0.36 0.4 0.37 0.26 0.13 0.12 1.0 0.29 0.21 0.16 0.17 0.04 0.01 0.17 0.18 0.07 0.05 0.2 0.12 0.15 0.18 0.2 0.17 0.12
0.27 0.27 0.29 0.37 0.36 0.37 0.36 0.34 0.43 0.34 0.43 0.3 0.15 0.37 1.0 0.19 0.21 0.07 0.04 0.57 0.08 0.51 0.04 0.04 0.0 0.24 0.16 0.17 0.12 0.12 0.12 0.13
0.61 0.5 0.37 0.41 0.38 0.37 0.38 0.37 0.56 0.49 0.54 0.52 0.1 0.16 1.0 0.17 0.41 0.28 0.26 0.47 0.11 0.09 0.21 0.16 0.29 0.18 0.19 0.28 0.33 0.35 0.16 0.13
0.5 0.39 0.39 0.37 0.39 0.37 0.43 0.45 0.56 0.61 0.62 0.58 0.24 0.31 1.0 0.28 0.41 0.25 0.25 0.4 0.13 0.27 0.08 0.1 0.21 0.3 0.32 0.37 0.31 0.36 0.22 0.19
0.52 0.48 0.56 0.56 0.56 0.71 0.67 0.59 0.72 0.77 0.55 0.51 0.44 0.46 1.0 0.48 0.44 0.38 0.43 0.33 0.38 0.46 0.52 0.52 0.39 0.53 0.66 0.65 0.42 0.44 0.38 0.38
0.2 0.21 0.22 0.23 0.25 0.22 0.33 0.34 0.38 0.38 0.37 0.35 0.17 0.19 1.0 0.23 0.21 0.21 0.26 0.1 0.02 0.01 0.13 0.13 0.04 0.4 0.32 0.34 0.27 0.25 0.22 0.25
0.29 0.39 0.48 0.43 0.43 0.53 0.59 0.36 0.47 0.43 0.38 0.35 0.13 0.5 1.0 0.28 0.35 0.33 0.13 0.46 0.1 0.23 0.37 0.49 0.03 0.11 0.08 0.12 0.32 0.42 0.26 0.22
0.13 0.17 0.24 0.29 0.31 0.32 0.45 0.19 0.22 0.19 0.18 0.15 0.08 0.23 1.0 0.16 0.26 0.13 0.13 0.22 0.07 0.28 0.22 0.27 0.07 0.06 0.1 0.1 0.2 0.18 0.08 0.07
0.38 0.52 0.45 0.44 0.43 0.47 0.33 0.21 0.31 0.26 0.28 0.28 0.39 0.18 1.0 0.26 0.54 0.36 0.13 0.43 0.29 0.06 0.24 0.15 0.23 0.03 0.12 0.19 0.25 0.35 0.14 0.12
0.43 0.33 0.28 0.33 0.38 0.35 0.38 0.39 0.53 0.46 0.52 0.47 0.1 0.16 1.0 0.14 0.34 0.24 0.12 0.17 0.1 0.31 0.15 0.13 0.13 0.35 0.42 0.36 0.26 0.28 0.34 0.46
0.33 0.32 0.39 0.37 0.38 0.41 0.41 0.34 0.47 0.45 0.42 0.35 0.1 0.29 1.0 0.15 0.29 0.17 0.14 0.06 0.01 0.07 0.07 0.07 0.01 0.09 0.15 0.18 0.22 0.27 0.32 0.3
0.53 0.54 0.58 0.59 0.6 0.55 0.68 0.42 0.62 0.58 0.56 0.55 0.25 0.15 1.0 0.27 0.84 0.67 0.22 0.78 0.48 0.35 0.2 0.14 0.48 0.28 0.24 0.3 0.62 0.57 0.32 0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)