1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_110 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.92 0.83 0.77 0.76 0.8 0.91 0.95 0.97 0.92 0.96 1.0 0.91 0.84 0.91 0.86 0.96 0.54 0.51 0.82 0.86 0.9 0.53 0.69 0.83 0.96 0.72 0.67 0.66 0.58 0.63 0.54 0.53
0.29 0.28 0.24 0.28 0.28 0.35 0.26 0.26 0.25 0.24 0.22 0.2 0.2 0.15 0.26 0.23 0.18 0.15 0.22 0.42 1.0 0.05 0.18 0.17 0.14 0.12 0.21 0.2 0.19 0.21 0.12 0.13
0.12 0.23 0.13 0.27 0.0 0.18 0.24 0.13 0.6 0.13 0.17 0.07 1.0 0.23 0.04 0.55 0.0 0.14 0.12 0.0 0.24 0.92 0.11 0.25 0.51 0.1 0.18 0.23 0.11 0.15 0.05 0.02
0.31 0.3 0.24 0.28 0.29 0.28 0.3 0.31 0.39 0.36 0.37 0.3 0.49 0.56 0.23 0.55 0.26 0.28 0.65 0.4 0.52 1.0 0.31 0.39 0.43 0.53 0.33 0.29 0.28 0.28 0.42 0.46
0.4 0.43 0.42 0.44 0.39 0.45 0.45 0.66 0.67 0.69 0.74 0.61 1.0 0.88 0.83 0.72 0.33 0.38 0.51 0.44 0.36 0.64 0.46 0.54 0.45 0.84 0.38 0.41 0.39 0.36 0.5 0.72
0.39 0.34 0.35 0.37 0.35 0.43 0.46 0.56 0.64 0.59 0.7 0.57 0.82 0.38 0.43 0.7 0.36 0.57 0.51 0.65 0.82 0.53 0.46 0.54 1.0 0.65 0.39 0.35 0.5 0.46 0.51 0.54
0.38 0.29 0.29 0.27 0.28 0.29 0.25 0.28 0.35 0.36 0.37 0.37 0.36 0.49 0.26 0.32 0.21 0.33 0.43 1.0 0.8 0.24 0.25 0.27 0.65 0.31 0.23 0.19 0.25 0.23 0.33 0.43
0.42 0.4 0.42 0.45 0.43 0.43 0.52 0.55 0.55 0.58 0.56 0.52 0.46 0.53 0.35 0.55 0.29 0.23 0.46 0.42 0.54 0.12 0.81 1.0 0.88 0.69 0.33 0.29 0.43 0.39 0.55 0.47
0.37 0.41 0.4 0.47 0.48 0.45 0.48 0.49 0.52 0.58 0.55 0.58 0.62 0.58 0.34 0.75 0.33 0.47 0.61 0.76 0.51 0.16 0.53 0.49 1.0 0.53 0.5 0.45 0.47 0.43 0.51 0.63
0.58 0.66 0.62 0.63 0.66 0.67 0.72 0.86 0.87 0.91 0.91 0.74 0.85 1.0 0.85 0.91 0.47 0.5 0.71 0.67 0.6 0.48 0.78 0.87 0.46 0.77 0.55 0.59 0.54 0.56 0.49 0.52
0.11 0.05 0.05 0.1 0.09 0.15 0.12 0.11 0.08 0.08 0.06 0.08 0.04 0.08 0.45 0.05 0.11 0.02 0.16 0.32 1.0 0.13 0.08 0.1 0.17 0.12 0.12 0.24 0.09 0.11 0.06 0.06
0.4 0.3 0.18 0.32 0.29 0.22 0.24 0.54 0.42 0.6 0.46 0.48 1.0 0.82 0.13 0.82 0.02 0.09 0.41 0.59 0.55 0.0 0.14 0.29 0.55 0.89 0.14 0.1 0.09 0.09 0.15 0.05
0.44 0.49 0.55 0.55 0.5 0.47 0.72 0.82 0.92 0.89 0.93 0.77 0.73 0.43 0.17 0.65 0.5 0.63 0.77 1.0 0.89 0.62 0.9 1.0 0.56 0.81 0.38 0.42 0.66 0.6 0.7 0.77
0.53 0.44 0.44 0.49 0.55 0.43 0.42 0.56 0.63 0.61 0.74 0.64 0.49 0.42 0.31 0.57 0.22 0.22 0.36 0.51 0.43 1.0 0.25 0.26 0.27 0.74 0.54 0.51 0.3 0.31 0.46 0.73
0.54 0.46 0.5 0.49 0.58 0.63 0.55 0.66 0.71 0.7 0.73 0.54 0.79 0.56 0.9 0.82 0.34 0.34 0.55 0.81 1.0 0.74 0.49 0.58 0.63 0.78 0.57 0.49 0.34 0.3 0.36 0.39
0.61 0.61 0.66 0.66 0.87 0.87 0.67 0.55 0.45 0.48 0.39 0.37 0.72 0.77 0.42 1.0 0.54 0.52 0.63 0.57 0.55 0.55 0.4 0.36 0.35 0.69 0.58 0.72 0.44 0.44 0.3 0.29
0.6 0.43 0.37 0.41 0.44 0.48 0.51 0.46 0.53 0.54 0.58 0.5 0.57 0.67 0.28 0.97 0.35 0.77 0.61 0.62 1.0 0.92 0.36 0.42 0.58 0.27 0.43 0.38 0.4 0.43 0.93 0.89
0.5 0.54 0.63 0.55 0.57 0.61 0.61 0.72 0.74 0.7 0.68 0.64 0.91 0.6 0.68 0.84 0.61 0.45 0.8 0.73 0.54 0.98 0.78 0.78 0.25 1.0 0.59 0.51 0.73 0.73 0.62 0.54
0.57 0.43 0.5 0.53 0.57 0.6 0.55 0.84 0.94 1.0 0.95 0.78 0.7 0.93 0.51 0.99 0.26 0.42 0.58 0.74 0.49 0.43 0.47 0.55 0.3 0.91 0.48 0.46 0.47 0.42 0.43 0.39
0.44 0.47 0.41 0.44 0.49 0.45 0.5 0.64 0.64 0.7 0.73 0.6 0.76 0.51 0.59 0.67 0.26 0.26 0.65 0.55 0.52 1.0 0.46 0.55 0.43 0.76 0.28 0.28 0.38 0.35 0.46 0.53
0.6 0.52 0.47 0.45 0.51 0.51 0.51 0.46 0.53 0.55 0.51 0.45 0.92 0.79 0.82 1.0 0.4 0.46 0.67 0.61 0.69 0.93 0.36 0.43 0.43 0.58 0.4 0.55 0.51 0.63 0.61 0.52
0.35 0.11 0.12 0.19 0.58 0.07 0.53 0.12 0.22 0.92 0.23 0.32 0.84 0.33 1.0 0.84 0.06 0.18 0.49 0.04 0.2 0.79 0.18 0.31 0.47 0.63 0.5 0.62 0.09 0.05 0.11 0.05
0.27 0.3 0.29 0.33 0.32 0.35 0.33 0.41 0.37 0.36 0.42 0.41 0.35 0.33 0.42 0.4 0.26 0.26 0.33 0.42 1.0 0.54 0.3 0.35 0.42 0.22 0.19 0.21 0.25 0.28 0.24 0.25
0.4 0.33 0.3 0.35 0.33 0.34 0.28 0.33 0.34 0.33 0.31 0.26 0.59 0.63 0.68 0.87 0.35 0.28 0.63 0.57 0.72 0.24 0.44 0.59 0.82 0.68 0.52 0.39 0.39 0.37 1.0 0.56
0.42 0.31 0.28 0.34 0.47 0.23 0.37 0.38 0.41 0.49 0.35 0.4 0.3 0.16 0.28 0.47 0.35 0.37 0.8 0.0 0.11 0.63 0.32 0.45 1.0 0.53 0.44 0.58 0.34 0.34 0.47 0.63
0.66 0.57 0.62 0.63 0.67 0.62 0.78 0.71 0.68 0.77 0.71 0.64 0.73 0.76 0.78 0.82 0.54 0.55 0.89 0.63 0.63 0.84 0.66 0.69 0.81 1.0 0.91 0.86 0.6 0.61 0.75 0.75
0.48 0.53 0.49 0.53 0.45 0.55 0.53 0.56 0.63 0.66 0.64 0.6 0.59 0.66 0.35 0.8 0.39 0.4 0.75 0.81 0.73 0.47 0.73 0.78 1.0 0.72 0.69 0.62 0.5 0.51 0.69 0.89
0.71 0.63 0.76 0.59 0.51 0.66 0.64 0.72 0.88 1.0 0.98 0.83 0.77 0.51 0.43 0.8 0.51 0.78 0.42 0.63 0.6 0.88 0.38 0.4 0.38 0.8 0.51 0.7 0.7 0.68 0.54 0.6
0.09 0.05 0.08 0.04 0.02 0.1 0.02 0.15 0.11 0.12 0.09 0.07 0.11 0.26 0.22 0.07 0.06 0.0 0.07 0.71 1.0 0.13 0.05 0.03 0.21 0.05 0.13 0.21 0.04 0.04 0.03 0.04
0.22 0.25 0.15 0.18 0.16 0.2 0.21 0.25 0.31 0.34 0.44 0.35 0.38 0.12 0.09 0.23 0.09 0.1 0.15 0.4 1.0 0.15 0.15 0.17 0.48 0.08 0.05 0.06 0.12 0.12 0.21 0.26
0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.25 0.64 0.15 0.35 0.0 0.0 1.0 0.0 0.18 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 0.32 0.47 0.42 0.46 0.44 0.51 0.69 0.72 0.72 0.7 0.54 0.65 0.38 0.34 0.73 0.42 0.53 0.51 0.48 0.61 1.0 0.67 0.62 0.31 0.91 0.26 0.31 0.52 0.5 0.3 0.32
0.22 0.19 0.15 0.17 0.15 0.15 0.24 0.23 0.23 0.2 0.21 0.28 0.02 0.03 0.05 0.05 0.13 0.57 0.22 1.0 0.44 0.28 0.09 0.06 0.53 0.22 0.27 0.25 0.19 0.16 0.14 0.11
0.67 0.65 0.64 0.61 0.67 0.63 0.68 0.71 0.72 0.79 0.76 0.72 0.68 0.53 0.63 0.84 0.42 0.39 0.69 0.63 0.65 1.0 0.51 0.55 0.37 0.78 0.64 0.61 0.5 0.57 0.64 0.65
0.18 0.18 0.21 0.2 0.28 0.26 0.25 0.27 0.29 0.26 0.27 0.22 0.28 0.19 0.3 0.27 0.13 0.21 0.21 0.6 1.0 0.4 0.18 0.2 0.66 0.39 0.37 0.38 0.15 0.14 0.15 0.15
0.66 0.56 0.46 0.52 0.49 0.47 0.47 0.52 0.64 0.69 0.72 0.75 0.93 0.86 0.76 0.98 0.42 0.27 0.65 0.85 0.53 0.39 0.68 0.74 0.75 1.0 0.39 0.38 0.47 0.49 0.49 0.55
0.44 0.31 0.26 0.21 0.28 0.29 0.22 0.35 0.28 0.31 0.28 0.3 0.2 0.74 0.23 0.52 0.14 0.24 0.36 0.27 0.79 1.0 0.05 0.14 0.24 0.97 0.52 0.22 0.23 0.19 0.71 0.26
0.16 0.1 0.14 0.15 0.1 0.16 0.18 0.21 0.22 0.45 0.39 0.26 0.8 0.17 0.27 0.44 0.13 0.11 0.45 1.0 0.96 0.71 0.17 0.18 0.5 0.38 0.27 0.32 0.14 0.16 0.1 0.12
0.6 0.56 0.41 0.59 0.62 0.7 0.66 0.42 0.72 0.68 0.53 0.6 1.0 0.34 0.36 1.0 0.54 0.26 0.86 0.73 0.55 0.48 0.48 0.56 0.94 0.45 0.31 0.29 0.56 0.42 0.69 0.76
0.45 0.59 0.86 0.76 0.77 0.74 0.89 0.99 0.82 0.86 0.83 0.59 0.91 0.34 0.86 0.34 0.88 0.69 0.21 0.87 1.0 0.89 0.12 0.13 0.22 0.31 0.23 0.16 0.51 0.45 0.49 0.42
0.2 0.29 0.22 0.3 0.23 0.25 0.28 0.35 0.31 0.35 0.33 0.29 0.12 0.1 0.27 0.13 0.1 0.07 0.19 0.59 1.0 0.29 0.12 0.14 0.57 0.08 0.17 0.15 0.1 0.1 0.15 0.15
0.36 0.38 0.44 0.4 0.31 0.38 0.43 0.42 0.67 0.55 0.49 0.52 0.29 0.73 0.65 0.34 0.11 0.28 0.27 0.73 1.0 0.12 0.48 0.7 0.65 0.45 0.32 0.28 0.14 0.2 0.1 0.16
0.46 0.28 0.22 0.23 0.24 0.2 0.24 0.23 0.32 0.37 0.35 0.33 0.57 1.0 0.43 0.74 0.15 0.27 0.45 0.7 0.8 0.38 0.18 0.19 0.61 0.6 0.28 0.21 0.32 0.26 0.42 0.4
0.33 0.37 0.33 0.33 0.35 0.33 0.4 0.38 0.58 0.41 0.4 0.34 1.0 0.3 0.24 0.69 0.21 0.16 0.46 0.43 0.04 0.68 0.37 0.39 0.52 0.34 0.21 0.25 0.23 0.29 0.23 0.33
0.57 0.43 0.48 0.52 0.64 0.65 0.65 0.61 0.67 0.7 0.69 0.59 1.0 0.63 0.76 0.88 0.45 0.17 0.67 0.62 0.54 0.3 0.57 0.65 0.77 0.99 0.88 0.69 0.46 0.53 0.55 0.59
0.55 0.57 0.22 0.38 0.47 0.46 0.36 0.57 0.58 0.54 0.6 0.46 0.02 0.0 0.08 0.13 0.13 0.0 0.52 0.81 0.84 1.0 0.2 0.4 0.06 0.43 0.15 0.15 0.12 0.18 0.2 0.14
0.28 0.18 0.27 0.38 0.36 0.35 0.29 0.35 0.2 0.38 0.61 0.28 0.35 0.13 0.14 0.33 0.2 0.05 0.44 0.28 0.13 0.61 0.56 0.85 0.22 1.0 0.21 0.28 0.26 0.22 0.21 0.13
0.1 0.11 0.19 0.16 0.22 0.22 0.27 0.11 0.26 0.29 0.15 0.12 0.03 0.08 0.1 0.06 0.14 0.31 0.04 0.35 1.0 0.0 0.06 0.07 0.0 0.13 0.0 0.02 0.08 0.11 0.09 0.08
0.1 0.2 0.09 0.13 0.01 0.02 0.02 0.04 0.03 0.08 0.21 0.1 0.02 0.07 0.15 0.07 0.22 0.03 0.05 0.18 1.0 0.43 0.1 0.06 0.17 0.03 0.08 0.17 0.14 0.15 0.06 0.08
0.35 0.36 0.42 0.5 0.28 0.33 0.43 0.41 0.41 0.32 0.34 0.43 0.86 0.2 0.13 0.7 0.4 0.16 0.41 0.77 0.97 0.56 0.43 0.51 1.0 0.59 0.55 0.42 0.44 0.4 0.4 0.5
0.31 0.2 0.18 0.2 0.15 0.17 0.18 0.37 0.38 0.48 0.4 0.4 0.69 0.35 0.16 0.58 0.16 0.15 0.38 0.61 1.0 0.18 0.21 0.35 0.38 0.5 0.08 0.07 0.32 0.3 0.21 0.21
0.69 0.6 0.64 0.68 0.67 0.61 0.71 0.76 0.9 0.82 0.85 0.7 0.91 0.71 0.52 0.93 0.79 0.54 0.93 0.67 0.81 0.82 0.97 1.0 0.71 0.98 0.6 0.65 0.83 0.86 0.58 0.53
0.51 0.51 0.53 0.46 0.52 0.61 0.64 0.57 0.6 0.7 0.53 0.53 0.56 0.7 0.4 0.91 0.45 0.45 0.61 0.83 1.0 0.18 0.39 0.33 0.5 0.28 0.31 0.22 0.6 0.59 0.79 0.67
0.25 0.2 0.18 0.18 0.12 0.24 0.2 0.22 0.26 0.25 0.17 0.24 0.15 0.56 0.6 0.32 0.17 0.25 0.33 1.0 0.9 0.2 0.12 0.15 0.29 0.06 0.09 0.08 0.25 0.27 0.4 0.34
0.69 0.74 0.56 0.48 0.54 0.5 0.58 0.56 0.57 0.63 0.47 0.35 1.0 0.99 0.51 0.94 0.41 0.39 0.67 0.92 0.46 0.7 0.32 0.27 0.52 0.71 0.55 0.48 0.56 0.41 0.78 0.52
0.57 0.46 0.42 0.54 0.44 0.48 0.46 0.51 0.51 0.56 0.59 0.59 0.57 0.69 0.58 0.61 0.29 0.25 0.64 0.72 0.43 0.11 0.37 0.38 0.94 1.0 0.6 0.55 0.35 0.36 0.42 0.47
0.3 0.29 0.07 0.1 0.05 0.16 0.11 0.13 0.09 0.1 0.06 0.11 0.2 0.36 0.1 0.63 0.11 0.04 0.38 0.47 0.5 0.17 0.33 0.4 1.0 0.19 0.26 0.08 0.15 0.13 0.5 0.19
0.07 0.04 0.06 0.05 0.1 0.12 0.16 0.12 0.16 0.11 0.08 0.08 0.04 0.02 0.11 0.05 0.06 0.07 0.05 0.46 1.0 0.29 0.04 0.03 0.47 0.09 0.25 0.25 0.06 0.07 0.07 0.05
0.48 0.51 0.56 0.52 0.58 0.47 0.41 0.56 0.5 0.53 0.49 0.47 0.5 0.23 0.2 0.77 0.61 0.57 0.67 0.45 1.0 0.59 0.65 0.63 0.67 0.92 0.55 0.64 0.76 0.75 0.4 0.37
0.19 0.27 0.13 0.16 0.14 0.47 0.2 0.08 0.1 0.14 0.13 0.11 0.17 0.16 0.29 0.21 0.27 0.13 0.32 0.45 1.0 0.57 0.22 0.16 0.41 0.29 0.3 0.42 0.19 0.14 0.11 0.1
0.28 0.18 0.27 0.38 0.36 0.35 0.29 0.35 0.2 0.38 0.61 0.28 0.35 0.13 0.14 0.33 0.2 0.05 0.44 0.28 0.13 0.61 0.56 0.85 0.22 1.0 0.21 0.28 0.26 0.22 0.21 0.13
0.53 0.59 0.56 0.53 0.23 0.35 0.4 0.6 0.58 0.7 0.62 0.55 0.81 0.62 0.32 0.89 0.51 0.4 0.95 0.0 0.37 0.79 0.61 0.76 0.67 0.99 0.47 0.8 0.62 0.58 0.81 1.0
0.46 0.58 0.61 0.41 0.4 0.55 0.64 0.7 0.65 0.63 0.72 0.61 0.91 0.43 0.38 0.72 0.21 0.17 0.62 0.48 1.0 0.0 0.32 0.45 0.45 0.26 0.18 0.09 0.35 0.38 0.61 0.55
0.3 0.29 0.32 0.3 0.34 0.37 0.42 0.46 0.61 0.61 0.63 0.51 0.72 0.35 0.4 0.61 0.35 0.43 0.53 0.58 0.57 0.46 0.46 0.54 1.0 0.41 0.15 0.16 0.52 0.46 0.45 0.49
0.26 0.28 0.12 0.16 0.12 0.21 0.13 0.25 0.22 0.21 0.29 0.22 0.14 0.19 0.32 0.18 0.18 0.19 0.16 0.45 1.0 0.2 0.21 0.24 0.98 0.19 0.26 0.27 0.21 0.18 0.11 0.14
0.19 0.13 0.05 0.06 0.01 0.09 0.05 0.12 0.18 0.1 0.06 0.1 0.36 0.23 0.24 0.44 0.19 0.39 0.41 0.75 1.0 0.25 0.2 0.17 0.28 0.07 0.23 0.06 0.23 0.2 0.2 0.1
0.73 0.68 0.59 0.67 0.7 0.66 0.63 0.74 0.78 0.78 0.83 0.77 0.84 0.81 0.58 1.0 0.4 0.35 0.73 0.87 0.64 0.54 0.67 0.73 0.73 0.82 0.41 0.41 0.5 0.52 0.55 0.45
0.23 0.23 0.16 0.23 0.18 0.24 0.16 0.22 0.24 0.27 0.25 0.28 0.22 0.93 0.92 0.46 0.13 0.22 0.24 0.8 1.0 0.09 0.11 0.14 0.28 0.2 0.15 0.15 0.19 0.16 0.28 0.3
0.3 0.28 0.33 0.32 0.34 0.36 0.38 0.55 0.65 0.76 0.73 0.58 0.82 0.3 0.26 0.76 0.35 0.57 0.76 0.53 0.59 1.0 0.72 0.92 0.53 0.42 0.34 0.25 0.54 0.55 0.71 0.88
0.34 0.43 0.38 0.43 0.42 0.35 0.33 0.43 0.44 0.5 0.46 0.44 0.75 0.29 0.19 0.84 0.35 0.38 0.65 0.66 0.41 1.0 0.42 0.48 0.3 0.48 0.15 0.19 0.41 0.37 0.35 0.39
0.51 0.48 0.75 0.44 0.6 0.41 0.38 0.34 0.44 0.77 0.53 0.36 0.51 0.28 0.52 0.84 0.63 0.35 0.88 0.13 0.4 0.45 0.63 0.45 0.55 1.0 0.48 0.5 0.65 0.69 0.3 0.34
0.05 0.01 0.12 0.01 0.02 0.09 0.06 0.03 0.15 0.07 0.01 0.01 0.15 0.1 0.02 0.21 0.26 0.54 0.14 0.3 1.0 0.0 0.36 0.4 0.19 0.08 0.1 0.11 0.23 0.26 0.16 0.2
0.42 0.42 0.27 0.38 0.31 0.35 0.37 0.39 0.45 0.47 0.39 0.47 0.46 0.37 0.33 0.47 0.23 0.24 0.39 0.8 1.0 0.46 0.42 0.49 0.83 0.51 0.31 0.25 0.28 0.27 0.28 0.28
0.06 0.05 0.07 0.06 0.1 0.07 0.07 0.05 0.06 0.08 0.07 0.05 0.14 0.07 0.11 0.15 0.08 0.07 0.16 0.5 1.0 0.27 0.09 0.08 0.49 0.12 0.08 0.07 0.08 0.1 0.08 0.09

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)