Heatmap: Cluster_202 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo143272	0.09	0.13	0.15	0.25	0.34	0.37	0.28	0.22	0.16	0.14	0.11	0.09	0.25	0.47	0.26	0.32	0.21	0.15	0.39	0.1	0.33	0.03	0.25	0.23	1.0	0.25	0.34	0.35	0.15	0.17	0.15	0.16
Smo143934	0.43	0.56	0.55	0.59	0.61	0.57	0.55	0.55	0.59	0.47	0.46	0.45	0.69	0.56	0.63	0.78	0.67	0.57	0.68	0.31	0.22	0.1	0.7	0.74	0.35	0.82	0.89	1.0	0.56	0.6	0.33	0.29
Smo149735	0.36	0.38	0.42	0.41	0.51	0.62	0.48	0.48	0.36	0.34	0.3	0.29	0.89	0.59	0.62	0.9	0.32	0.43	1.0	0.1	0.14	0.34	0.45	0.54	0.54	0.58	0.81	0.77	0.36	0.41	0.39	0.49
Smo163708	0.27	0.36	0.32	0.48	0.54	0.49	0.34	0.28	0.24	0.23	0.2	0.2	0.35	0.51	0.39	0.63	0.44	0.18	1.0	0.09	0.21	0.06	0.55	0.51	0.85	0.36	0.44	0.43	0.33	0.36	0.62	0.56
Smo166276	0.29	0.27	0.28	0.27	0.32	0.3	0.32	0.35	0.31	0.3	0.25	0.27	0.36	0.56	0.42	0.42	0.23	0.19	0.63	0.17	0.56	0.17	0.29	0.34	1.0	0.36	0.45	0.47	0.24	0.25	0.2	0.23
Smo170659	0.33	0.29	0.19	0.21	0.19	0.18	0.13	0.1	0.13	0.12	0.15	0.14	0.15	0.61	0.09	0.25	0.3	0.32	1.0	0.02	0.45	0.01	0.26	0.27	0.97	0.25	0.27	0.22	0.34	0.33	0.38	0.26
Smo171056	0.27	0.34	0.36	0.37	0.42	0.42	0.37	0.41	0.32	0.34	0.27	0.27	0.53	0.76	0.42	0.37	0.21	0.19	1.0	0.18	0.29	0.14	0.25	0.31	0.94	0.47	0.51	0.55	0.22	0.23	0.17	0.17
Smo173107	0.44	0.44	0.42	0.47	0.44	0.43	0.39	0.44	0.41	0.39	0.37	0.37	0.77	0.88	0.48	0.83	0.36	0.29	0.67	0.11	0.8	0.24	0.49	0.53	1.0	0.29	0.25	0.24	0.45	0.44	0.37	0.37
Smo228108	0.46	0.56	0.54	0.59	0.56	0.57	0.59	0.64	0.63	0.62	0.52	0.51	0.71	0.96	0.67	0.88	0.45	0.4	0.76	0.37	0.63	0.32	0.52	0.57	1.0	0.5	0.45	0.5	0.45	0.5	0.36	0.48
Smo231443	0.24	0.26	0.32	0.32	0.33	0.36	0.37	0.29	0.37	0.27	0.19	0.18	0.56	0.37	0.1	0.4	0.37	0.19	1.0	0.04	0.5	0.08	0.22	0.17	0.74	0.24	0.4	0.39	0.33	0.35	0.39	0.28
Smo235874	0.19	0.25	0.21	0.32	0.27	0.35	0.22	0.19	0.19	0.1	0.2	0.1	0.18	1.0	0.2	0.4	0.08	0.1	0.92	0.25	0.14	0.0	0.35	0.55	0.53	0.37	0.51	0.63	0.06	0.08	0.04	0.08
Smo266998	0.43	0.57	0.53	0.61	0.57	0.49	0.42	0.35	0.35	0.33	0.36	0.35	0.45	0.62	0.45	0.71	0.44	0.34	0.81	0.06	0.07	0.12	0.53	0.58	0.7	0.72	0.87	1.0	0.41	0.48	0.82	0.69
Smo270443	0.23	0.42	0.43	0.46	0.55	0.45	0.25	0.23	0.18	0.17	0.16	0.13	0.8	0.18	0.09	0.52	0.4	0.24	0.75	0.0	0.02	0.01	0.62	0.51	0.1	0.45	1.0	0.92	0.29	0.3	0.4	0.36
Smo402577	0.25	0.31	0.24	0.26	0.29	0.41	0.31	0.29	0.31	0.34	0.19	0.29	0.75	0.42	0.61	0.77	0.24	0.66	1.0	0.0	0.15	0.11	0.35	0.46	0.53	0.28	0.51	0.38	0.3	0.3	0.21	0.21
Smo403072	0.52	0.55	0.46	0.59	0.66	0.55	0.55	0.5	0.56	0.56	0.6	0.54	0.87	0.54	0.59	0.97	0.58	0.7	0.77	0.41	0.32	0.02	0.93	1.0	0.56	1.0	0.87	0.72	0.67	0.7	0.53	0.54
Smo403730	0.23	0.21	0.34	0.28	0.23	0.36	0.21	0.26	0.13	0.08	0.08	0.22	0.2	0.22	0.29	0.38	0.11	0.23	1.0	0.0	0.34	0.0	0.21	0.27	0.95	0.09	0.27	0.21	0.14	0.11	0.09	0.06
Smo404968	0.45	0.53	0.61	0.65	0.69	0.61	0.57	0.59	0.58	0.48	0.47	0.39	0.68	0.62	0.6	0.78	0.68	0.38	0.96	0.65	0.33	0.41	0.64	0.55	0.59	0.99	0.88	1.0	0.49	0.51	0.43	0.52
Smo405409	0.3	0.32	0.44	0.39	0.48	0.46	0.37	0.42	0.49	0.33	0.35	0.36	0.47	0.22	0.53	0.88	0.4	0.09	0.65	0.01	0.11	0.0	0.59	0.61	0.35	0.66	0.72	1.0	0.58	0.58	0.13	0.15
Smo405842	0.36	0.35	0.29	0.37	0.41	0.4	0.38	0.38	0.32	0.35	0.32	0.31	0.64	0.6	0.42	0.68	0.31	0.32	0.65	0.08	0.33	0.17	0.42	0.46	1.0	0.36	0.46	0.45	0.37	0.37	0.53	0.47
Smo407018	0.32	0.3	0.18	0.11	0.09	0.23	0.16	0.32	0.26	0.46	0.25	0.18	0.56	0.33	0.13	0.45	0.05	0.21	1.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.84	0.82	0.47	0.73	0.35	0.09	0.08	0.24	0.24
Smo408914	0.23	0.22	0.26	0.31	0.37	0.41	0.48	0.36	0.37	0.34	0.32	0.26	0.7	0.39	0.19	1.0	0.45	0.5	0.86	0.11	0.93	0.35	0.51	0.48	0.96	0.51	0.78	0.86	0.58	0.56	0.4	0.39
Smo413146	0.14	0.18	0.05	0.2	0.45	0.17	0.08	0.21	0.2	0.06	0.11	0.07	0.49	0.55	0.33	0.94	0.16	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.33	0.68	0.4	0.84	0.53	0.19	0.21	0.14	0.15
Smo413178	0.18	0.08	0.22	0.26	0.06	0.1	0.27	0.21	0.04	0.01	0.06	0.2	0.44	1.0	0.08	0.31	0.08	0.28	0.66	0.0	0.42	0.18	0.15	0.08	0.73	0.66	0.73	0.64	0.06	0.08	0.04	0.04
Smo413502	0.16	0.19	0.25	0.29	0.34	0.43	0.23	0.18	0.21	0.13	0.12	0.13	0.22	0.2	0.39	0.24	0.23	0.55	0.62	0.0	0.0	0.0	0.28	0.24	1.0	0.28	0.52	0.43	0.15	0.11	0.27	0.13
Smo420341	0.28	0.3	0.4	0.39	0.47	0.56	0.48	0.58	0.58	0.54	0.42	0.37	0.42	0.46	0.65	0.45	0.44	0.34	0.5	0.02	0.24	0.25	0.46	0.55	1.0	0.51	0.89	0.59	0.37	0.38	0.57	0.7
Smo426141	0.64	0.64	0.55	0.53	0.64	0.62	0.43	0.62	0.47	0.46	0.47	0.5	0.66	0.81	0.58	0.76	0.39	0.49	0.63	0.17	0.23	0.06	0.55	0.55	1.0	0.48	0.62	0.58	0.41	0.43	0.4	0.51
Smo426703	0.09	0.07	0.1	0.0	0.09	0.16	0.28	0.14	0.13	0.08	0.0	0.0	0.07	0.56	0.24	0.13	0.0	0.12	1.0	0.0	0.15	0.0	0.04	0.03	0.82	0.56	0.17	0.38	0.15	0.12	0.0	0.0
Smo428672	0.23	0.42	0.54	0.42	0.29	0.47	0.43	0.35	0.37	0.24	0.24	0.18	0.44	0.16	0.46	1.0	0.34	0.22	0.88	0.05	0.01	0.28	0.63	0.5	0.15	0.78	0.64	1.0	0.48	0.57	0.11	0.07
Smo438595	0.31	0.21	0.26	0.27	0.43	0.27	0.32	0.27	0.26	0.25	0.21	0.25	0.48	0.46	0.51	0.53	0.29	0.24	1.0	0.19	0.48	0.39	0.38	0.39	0.63	0.29	0.45	0.42	0.36	0.36	0.5	0.52
Smo438801	0.41	0.42	0.37	0.44	0.48	0.41	0.46	0.42	0.42	0.39	0.37	0.37	0.44	0.47	0.55	0.51	0.31	0.27	0.56	0.2	0.08	0.2	0.6	0.7	1.0	0.6	0.6	0.62	0.35	0.39	0.83	0.86
Smo439296	0.26	0.29	0.37	0.4	0.58	0.48	0.32	0.34	0.43	0.28	0.3	0.25	0.86	0.54	0.23	0.77	0.47	0.33	1.0	0.0	0.27	0.04	0.71	0.95	0.49	0.59	0.75	0.76	0.47	0.46	0.27	0.28
Smo442089	0.34	0.41	0.34	0.34	0.41	0.27	0.18	0.2	0.21	0.17	0.22	0.18	0.72	0.49	0.07	0.89	0.19	0.25	1.0	0.11	0.18	0.0	0.49	0.79	0.76	0.52	0.45	0.51	0.21	0.24	0.17	0.24
Smo446892	0.34	0.5	0.54	0.64	0.66	0.65	0.46	0.42	0.35	0.35	0.29	0.3	0.7	1.0	0.94	0.71	0.42	0.22	0.58	0.14	0.32	0.22	0.46	0.43	0.83	0.37	0.65	0.63	0.26	0.32	0.32	0.35
Smo65497	0.35	0.35	0.29	0.34	0.32	0.38	0.32	0.39	0.37	0.38	0.35	0.31	0.9	0.64	0.14	0.91	0.5	0.61	0.56	0.05	0.61	0.02	0.93	0.95	1.0	0.59	0.54	0.55	0.65	0.67	0.56	0.55
Smo74468	0.36	0.31	0.26	0.39	0.43	0.39	0.25	0.35	0.39	0.29	0.34	0.37	0.43	0.34	0.58	0.71	0.34	0.33	1.0	0.01	0.23	0.01	0.46	0.4	0.6	0.76	0.61	0.5	0.44	0.38	0.18	0.27
Smo76799	0.31	0.31	0.2	0.25	0.27	0.24	0.17	0.31	0.17	0.2	0.21	0.17	0.79	0.39	0.34	0.68	0.25	0.1	1.0	0.01	0.01	0.0	0.39	0.31	0.52	0.35	0.72	0.63	0.24	0.26	0.08	0.08
Smo77309	0.31	0.46	0.4	0.41	0.42	0.45	0.38	0.36	0.35	0.3	0.32	0.25	0.42	0.53	0.25	0.68	0.32	0.47	0.76	0.02	0.26	0.03	0.78	0.79	0.42	0.69	1.0	0.94	0.37	0.39	0.24	0.24
Smo78585	0.29	0.35	0.34	0.51	0.5	0.45	0.48	0.39	0.37	0.33	0.31	0.24	0.44	0.58	0.41	0.54	0.4	0.31	0.79	0.26	0.26	0.22	0.33	0.28	0.76	0.6	1.0	0.81	0.32	0.32	0.34	0.43
Smo79308	0.44	0.38	0.43	0.39	0.44	0.48	0.36	0.46	0.31	0.39	0.34	0.31	0.55	0.44	0.79	0.77	0.47	0.31	0.78	0.41	0.06	0.11	0.5	0.55	0.41	1.0	0.89	0.91	0.55	0.62	0.37	0.37
Smo79774	0.37	0.52	0.18	0.4	0.42	0.43	0.4	0.47	0.41	0.35	0.36	0.38	0.83	0.38	0.71	1.0	0.49	0.55	0.67	0.0	0.02	0.0	0.58	0.66	0.22	0.83	0.72	0.94	0.58	0.62	0.31	0.28
Smo81258	0.33	0.29	0.3	0.24	0.27	0.3	0.31	0.33	0.31	0.35	0.31	0.31	0.3	0.76	0.43	0.57	0.3	0.52	1.0	0.36	0.68	0.08	0.38	0.36	0.34	0.38	0.32	0.22	0.5	0.49	0.45	0.45
Smo84501	0.42	0.38	0.26	0.49	0.37	0.46	0.46	0.38	0.37	0.56	0.46	0.58	0.65	0.29	0.28	0.79	0.57	0.5	0.7	0.07	0.52	0.04	0.61	0.64	1.0	0.77	0.65	0.61	0.69	0.63	0.56	0.56
Smo86039	0.57	0.53	0.46	0.56	0.53	0.57	0.44	0.58	0.5	0.55	0.55	0.61	0.89	0.61	0.15	0.94	0.65	0.48	0.81	0.18	0.52	0.04	0.85	1.0	0.56	0.97	0.7	0.72	0.8	0.79	0.72	0.58
Smo89723	0.41	0.43	0.43	0.54	0.51	0.54	0.5	0.52	0.45	0.4	0.35	0.39	0.62	0.95	0.71	0.69	0.47	0.45	0.64	0.23	0.36	0.13	0.5	0.53	1.0	0.38	0.62	0.54	0.48	0.51	0.39	0.41
Smo90245	0.59	0.54	0.46	0.46	0.37	0.39	0.35	0.45	0.44	0.38	0.45	0.48	0.77	0.4	0.17	0.66	0.46	0.46	0.64	0.08	0.26	0.06	0.68	0.85	1.0	0.53	0.54	0.54	0.53	0.56	0.42	0.45
Smo91328	0.36	0.32	0.39	0.37	0.43	0.49	0.49	0.55	0.51	0.44	0.42	0.4	0.87	0.46	0.5	1.0	0.42	0.28	0.96	0.25	0.21	0.13	0.71	0.74	0.41	0.79	0.79	0.94	0.58	0.6	0.32	0.27
Smo96034	0.16	0.2	0.36	0.34	0.44	0.37	0.36	0.26	0.34	0.25	0.2	0.21	0.28	0.2	0.63	0.5	0.43	0.23	0.82	0.2	0.01	0.02	0.47	0.33	0.14	0.53	0.56	1.0	0.41	0.5	0.26	0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)