1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_46 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
13.1 13.37 11.62 9.44 13.19 13.96 8.11 8.61 9.85 10.18 10.3 8.67 5.31 3.46 5.64 8.85 13.51 8.82 5.99 6.81 2.94 8.6 15.56 12.55 13.73 4.05 8.12 10.41 11.79 14.28 7.61 7.35
0.0 0.0 0.48 0.19 0.37 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.57 2.33 4.71 2.66 4.04 3.68 1.41 0.61 1.29 0.47 0.72 1.26 0.57 0.29 0.3 3.84 2.31 2.03 2.42 0.74 1.44 0.89 1.29 0.69 2.84 1.63 4.55 5.04 1.87 2.5 1.24 1.79
0.62 0.42 1.45 0.66 0.36 0.48 0.37 0.24 0.49 0.63 1.59 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.63 0.04 0.0 0.0 0.0 0.64 0.55 0.0 0.09 0.0 0.0 0.15 0.24 0.35 0.41
0.0 0.05 0.24 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.11 0.08 0.07 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.45 6.59 9.39 0.0 0.0 0.0 1.76 0.0 0.0 0.0 0.0 1.11 1.41 0.0 0.0 0.32 1.4 11.39 1.05 0.0 0.0 0.0 1.01 1.02 2.7 0.0 0.0 0.0 0.89 1.41 2.59 4.1
0.02 0.13 0.45 0.0 0.21 0.05 0.24 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.48 0.63 0.23 0.1 0.24 0.25 0.0 0.0 0.0 0.21 0.36 0.0 0.39 0.15 0.27 0.25 0.21 0.1 0.05
0.0 0.53 2.33 0.0 0.03 0.15 1.61 0.0 0.98 0.51 0.62 0.97 0.0 0.0 0.0 0.17 0.94 1.22 0.41 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 2.0 0.0 0.0 0.0 0.22 1.11 1.09 0.0
0.75 0.54 2.93 1.08 0.1 1.24 0.31 1.34 1.62 0.8 0.29 0.9 0.15 0.2 0.03 0.1 0.05 1.42 0.32 0.0 0.0 0.0 0.1 0.5 0.59 0.1 0.11 0.22 0.42 0.19 0.46 0.22
42.38 66.16 68.53 43.2 40.34 63.45 26.76 14.61 12.45 14.45 19.09 24.3 5.18 0.32 1.49 67.47 35.07 43.34 34.07 26.21 3.77 25.5 52.88 39.89 46.37 5.68 50.88 74.49 27.76 47.36 11.86 5.36
61.2 67.8 57.35 44.83 45.38 46.12 53.65 67.25 57.51 45.02 45.16 39.88 28.63 67.58 53.89 38.16 31.78 44.46 40.98 47.23 15.81 56.34 25.22 17.78 13.88 23.33 46.67 41.94 28.68 31.58 10.05 11.83
0.06 0.07 0.29 0.02 0.03 0.0 0.0 0.04 0.04 0.04 0.02 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.07 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.14 0.11 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.05 0.0
2.59 2.62 5.07 2.48 3.32 1.5 0.94 2.52 4.46 4.4 1.79 5.05 0.42 1.65 2.63 0.46 0.21 0.0 0.61 0.0 1.05 0.0 0.38 0.97 0.0 2.49 3.99 1.03 0.6 0.63 0.29 0.3
0.13 0.0 8.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.83 0.66 5.56 1.43 1.86 0.17 0.0 5.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.5 0.57 0.0 3.26 4.23 10.12 9.0
0.01 0.0 0.39 0.1 0.0 0.16 0.18 0.03 0.04 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.2 0.08 0.08 0.03 0.03 0.05 0.03
0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.04 1.22 0.04 0.44 0.35 0.21 0.12 0.02 0.14 0.0 0.14 0.13 0.02 0.12 0.06 0.09 0.21 0.51 0.02 0.57 0.01 0.05 0.09 0.12 0.46 0.46 1.33 0.07 0.02 0.05 0.03
1.03 0.75 1.33 0.47 0.6 0.47 0.43 0.42 0.64 0.62 0.59 0.79 0.1 0.42 0.34 0.21 0.3 0.36 0.49 0.0 0.05 0.0 0.81 1.2 0.65 0.54 0.49 0.2 0.47 0.53 0.5 0.12
0.15 0.22 0.46 0.32 0.39 0.28 0.34 0.22 0.34 0.18 0.21 0.15 0.0 0.0 0.07 0.04 0.11 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.14 0.32 0.21 0.31 0.05 0.05 0.03 0.05
0.12 0.19 0.47 0.0 0.0 0.08 0.04 0.1 0.04 0.06 0.0 0.07 0.05 0.08 0.37 0.05 0.05 0.09 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.08 0.08 0.04 0.08
0.74 0.22 1.04 0.34 0.11 0.28 0.41 0.14 0.54 0.72 0.9 0.82 1.27 0.15 0.24 0.67 0.2 0.21 0.96 0.26 0.0 0.27 0.2 0.32 0.02 1.69 1.38 2.22 0.07 0.15 0.09 0.13
1.01 1.8 2.42 1.6 2.24 0.82 0.99 2.19 1.53 1.42 1.45 1.7 0.11 0.69 0.45 0.23 0.07 0.52 0.17 0.0 0.0 0.1 0.83 0.99 1.53 1.37 1.14 1.79 0.04 0.11 0.15 0.14
0.01 0.0 0.24 0.15 0.14 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0
0.23 0.0 3.08 0.17 0.09 0.47 0.31 0.38 0.41 0.39 0.12 0.44 0.11 0.0 0.07 0.0 0.43 0.64 0.48 0.7 1.98 0.0 0.09 0.09 5.99 0.77 0.67 0.55 0.81 1.1 0.0 0.0
0.05 0.32 0.81 0.2 0.0 0.0 0.1 0.26 0.0 0.85 0.0 0.1 0.06 0.0 0.0 0.06 0.81 0.0 0.31 0.0 0.13 0.0 0.36 0.82 0.0 0.0 0.56 0.0 0.64 0.67 0.26 0.05
0.03 0.0 0.51 0.06 0.0 0.07 0.17 0.05 0.17 0.0 0.43 0.06 0.0 0.07 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.12 0.0 0.0 0.0 0.23 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0
0.81 1.12 2.3 1.17 1.03 0.88 0.53 1.38 0.98 1.6 1.1 1.05 0.36 0.23 0.67 0.0 0.53 0.2 0.5 0.0 0.0 0.0 0.77 0.5 0.41 1.44 1.99 1.09 0.49 0.68 0.89 1.17
0.61 0.6 2.19 0.56 0.16 1.25 1.87 0.31 1.0 0.53 0.94 0.47 0.12 1.08 2.24 0.11 0.58 0.0 1.42 0.1 2.43 0.0 0.23 0.15 0.62 0.72 0.32 0.72 0.4 0.44 0.71 0.41
0.0 0.06 1.19 0.0 0.06 0.32 0.5 0.2 1.13 0.85 0.51 0.07 0.08 0.0 0.2 0.08 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.62 0.0 1.12 1.44 0.29 0.15 0.14 0.14
1.81 1.12 3.08 0.85 1.24 0.84 0.66 2.37 0.89 1.29 0.28 0.74 0.89 0.31 1.13 1.14 1.95 2.39 3.17 1.34 0.2 0.71 1.2 2.42 0.0 0.69 0.37 1.51 1.67 1.44 0.75 0.58
0.19 0.24 0.75 0.23 0.42 0.51 0.92 0.84 0.66 0.34 0.19 0.18 0.0 0.05 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.93 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.63 0.38 2.6 1.01 0.25 1.09 0.43 0.41 0.63 0.84 0.2 0.89 0.0 0.27 0.02 0.09 0.0 0.5 0.06 0.0 0.0 2.94 0.04 0.12 1.02 0.0 0.49 0.0 0.37 0.0 0.83 0.81
0.15 0.12 0.29 0.09 0.0 0.17 0.21 0.16 0.34 0.11 0.49 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.13 0.0 0.0 0.0 0.13 0.14 0.07 0.18 0.17 0.16 0.02 0.09 0.04 0.02
0.05 0.02 0.14 0.02 0.02 0.04 0.0 0.02 0.05 0.12 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.2 0.05 0.06 0.0 0.03 0.01 0.0 0.03
0.03 0.01 0.21 0.02 0.01 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0 0.08 0.0 0.04 0.01 0.06 0.03 0.03 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.06 0.05 0.03 0.0 0.0
2.22 5.09 5.23 3.97 5.87 5.45 3.35 1.86 1.71 1.64 1.66 2.15 1.6 0.41 1.07 3.68 2.84 1.47 3.59 2.54 1.65 2.77 1.4 0.8 1.28 0.79 3.55 5.79 1.59 1.6 1.62 1.66
5.35 5.71 7.98 3.82 1.92 4.05 5.08 5.74 1.7 3.62 3.11 3.52 1.28 6.43 0.66 2.04 1.77 0.07 0.75 0.0 1.46 1.87 2.61 3.71 2.67 3.8 6.66 3.21 1.07 0.71 1.56 0.75
0.48 1.13 1.32 0.95 1.29 0.3 1.15 0.41 0.7 0.66 0.63 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.1 0.14 0.0 0.0 0.0 0.36 0.24 0.0 0.0 0.48 0.49 0.45 0.29 0.23 0.36
0.71 0.46 1.96 0.61 1.64 0.93 1.28 0.59 0.48 0.75 0.63 0.69 0.65 0.15 0.64 1.0 0.86 2.32 1.47 0.0 0.16 0.1 1.15 1.22 0.0 0.28 0.43 0.0 0.99 0.76 1.2 1.14
0.0 0.79 1.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.2 0.14 0.12 0.18 0.25 0.85 0.0 0.0 0.06 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.06 0.12 0.0
0.0 0.16 0.52 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.18 0.21 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0
0.02 0.07 2.1 0.05 0.0 0.14 0.25 0.04 0.08 0.14 0.0 0.0 0.05 0.12 0.05 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.77 0.62 4.21 1.62 2.22 1.53 1.27 1.54 1.3 1.03 2.58 1.2 0.34 2.5 3.67 0.84 0.33 0.45 0.1 0.0 0.0 0.0 0.23 0.04 0.0 1.98 0.77 0.64 0.13 0.14 0.04 0.1
0.15 0.15 0.18 0.04 0.0 0.39 0.23 0.0 0.27 0.39 0.18 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.04 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.39 0.58 0.05 0.0 0.29 0.22 0.11 0.1 0.25 0.1 0.25 0.49 0.2 0.13 0.44 0.11 0.11 0.45 0.0 0.0 0.0 0.13 0.49 0.14 0.07 0.08 0.0 0.23 0.14 0.17 0.06
0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.33 0.45 1.36 0.75 1.52 0.88 0.66 0.16 0.35 0.83 1.24 0.33 0.93 0.19 0.03 0.4 0.93 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.98 0.73 0.21 0.0 0.68 0.24 0.48 0.5 0.59 0.71
0.02 0.02 0.59 0.02 0.0 0.0 0.08 0.0 0.03 0.09 0.0 0.0 0.23 0.12 0.04 0.11 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.12 0.31 0.0 0.06 0.06 0.06 0.0
0.14 0.21 0.25 0.09 0.0 0.1 0.02 0.11 0.18 0.04 0.0 0.06 0.0 0.3 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.18 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.07 0.73 0.31 0.21 0.39 0.42 0.47 0.39 0.14 0.35 0.38 0.03 0.05 0.12 0.03 0.1 0.18 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.11 0.06 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0
0.13 0.0 5.66 4.08 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 1.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.75 0.0 1.39 0.0 0.0 0.0 5.51 0.37 3.78 0.0 0.25 0.66 0.06 0.0
0.0 0.0 0.59 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.66 1.26 0.0 0.0 0.0 0.0
0.81 0.9 5.15 1.61 2.5 2.19 4.29 1.69 1.87 3.5 3.42 1.75 1.44 1.2 3.23 1.02 0.98 0.99 2.74 2.32 1.17 0.0 2.21 2.69 0.0 5.99 2.14 5.9 2.11 1.73 0.44 1.2
0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.03 0.0
1.9 1.04 2.43 0.92 0.07 0.08 0.42 0.27 0.0 0.0 0.2 0.31 0.63 0.15 0.92 0.14 1.27 0.67 3.94 0.0 0.1 0.0 0.79 0.46 0.8 0.8 0.59 0.55 0.89 1.09 0.11 0.18
2.19 2.16 3.23 0.96 0.36 2.51 1.67 1.88 3.06 1.77 2.01 1.71 0.54 0.08 5.95 1.98 3.56 1.95 7.56 0.0 0.0 0.0 1.53 0.85 0.0 2.88 3.62 3.5 3.41 3.52 2.89 1.23
0.0 0.0 1.91 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.13 0.0 0.1 0.28 0.0 0.24 1.6 0.0 0.0 0.0 0.12 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
38.17 42.59 43.01 42.6 51.94 55.34 33.07 25.07 20.14 23.8 20.73 24.41 37.33 11.14 13.41 27.92 25.13 22.8 25.36 21.35 24.23 20.43 30.52 31.67 23.22 23.29 34.58 43.58 15.01 14.56 14.09 16.64
0.69 0.46 1.45 0.39 0.19 0.93 1.16 0.3 0.49 0.49 0.64 0.73 0.19 0.18 0.87 0.43 0.89 0.6 0.11 0.02 0.0 0.0 0.13 0.3 0.0 0.08 0.48 0.33 0.66 0.58 0.23 0.08
17.33 43.25 36.9 16.73 31.21 26.02 9.24 9.06 22.16 18.72 25.05 17.86 33.06 16.83 10.15 35.91 20.84 26.79 31.4 30.22 1.42 0.0 41.22 34.69 3.96 18.08 14.66 13.61 30.46 30.32 18.97 20.67
0.13 0.23 1.43 0.35 0.04 0.0 0.26 0.12 0.6 0.55 0.28 0.26 0.0 0.06 0.72 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.17 0.39 0.03 0.0 0.08 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)