1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_46 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.84 0.86 0.75 0.61 0.85 0.9 0.52 0.55 0.63 0.65 0.66 0.56 0.34 0.22 0.36 0.57 0.87 0.57 0.39 0.44 0.19 0.55 1.0 0.81 0.88 0.26 0.52 0.67 0.76 0.92 0.49 0.47
0.0 0.0 1.0 0.39 0.76 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 0.46 0.93 0.53 0.8 0.73 0.28 0.12 0.26 0.09 0.14 0.25 0.11 0.06 0.06 0.76 0.46 0.4 0.48 0.15 0.29 0.18 0.26 0.14 0.56 0.32 0.9 1.0 0.37 0.5 0.25 0.35
0.39 0.26 0.91 0.41 0.23 0.3 0.23 0.15 0.31 0.4 1.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.39 0.02 0.0 0.0 0.0 0.4 0.34 0.0 0.05 0.0 0.0 0.1 0.15 0.22 0.26
0.0 0.23 1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.46 0.34 0.3 0.14 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12
0.04 0.58 0.82 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.12 0.0 0.0 0.03 0.12 1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.09 0.09 0.24 0.0 0.0 0.0 0.08 0.12 0.23 0.36
0.03 0.21 0.71 0.0 0.33 0.08 0.38 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.76 1.0 0.37 0.16 0.38 0.4 0.0 0.0 0.0 0.33 0.56 0.0 0.61 0.24 0.42 0.39 0.33 0.16 0.08
0.0 0.23 1.0 0.0 0.01 0.07 0.69 0.0 0.42 0.22 0.27 0.42 0.0 0.0 0.0 0.07 0.4 0.52 0.17 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.1 0.48 0.47 0.0
0.26 0.18 1.0 0.37 0.03 0.42 0.1 0.46 0.55 0.27 0.1 0.31 0.05 0.07 0.01 0.04 0.02 0.48 0.11 0.0 0.0 0.0 0.03 0.17 0.2 0.03 0.04 0.08 0.14 0.06 0.16 0.08
0.57 0.89 0.92 0.58 0.54 0.85 0.36 0.2 0.17 0.19 0.26 0.33 0.07 0.0 0.02 0.91 0.47 0.58 0.46 0.35 0.05 0.34 0.71 0.54 0.62 0.08 0.68 1.0 0.37 0.64 0.16 0.07
0.9 1.0 0.85 0.66 0.67 0.68 0.79 0.99 0.85 0.66 0.67 0.59 0.42 1.0 0.79 0.56 0.47 0.66 0.6 0.7 0.23 0.83 0.37 0.26 0.2 0.34 0.69 0.62 0.42 0.47 0.15 0.17
0.2 0.24 1.0 0.09 0.09 0.0 0.0 0.15 0.15 0.14 0.08 0.17 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.24 0.18 0.0 0.0 0.0 0.29 0.47 0.37 0.0 0.0 0.0 0.26 0.27 0.18 0.0
0.51 0.52 1.0 0.49 0.66 0.3 0.19 0.5 0.88 0.87 0.35 1.0 0.08 0.33 0.52 0.09 0.04 0.0 0.12 0.0 0.21 0.0 0.08 0.19 0.0 0.49 0.79 0.2 0.12 0.12 0.06 0.06
0.01 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.55 0.14 0.18 0.02 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.06 0.0 0.32 0.42 1.0 0.89
0.02 0.0 1.0 0.26 0.0 0.4 0.46 0.07 0.11 0.13 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.11 0.04 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.52 0.21 0.2 0.08 0.09 0.13 0.08
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.03 0.92 0.03 0.33 0.27 0.16 0.09 0.02 0.11 0.0 0.11 0.1 0.02 0.09 0.05 0.07 0.16 0.38 0.02 0.43 0.01 0.04 0.07 0.09 0.35 0.34 1.0 0.05 0.01 0.04 0.02
0.77 0.56 1.0 0.36 0.45 0.35 0.33 0.31 0.48 0.46 0.44 0.59 0.08 0.32 0.26 0.16 0.22 0.27 0.37 0.0 0.03 0.0 0.61 0.9 0.49 0.41 0.37 0.15 0.35 0.4 0.38 0.09
0.32 0.48 1.0 0.7 0.85 0.6 0.75 0.47 0.75 0.38 0.44 0.33 0.0 0.0 0.15 0.08 0.24 0.11 0.19 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.3 0.69 0.46 0.68 0.11 0.11 0.07 0.1
0.26 0.4 1.0 0.0 0.0 0.17 0.08 0.22 0.08 0.14 0.0 0.15 0.1 0.16 0.78 0.11 0.1 0.19 0.09 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.16 0.18 0.09 0.17
0.33 0.1 0.47 0.16 0.05 0.13 0.18 0.06 0.24 0.33 0.4 0.37 0.57 0.07 0.11 0.3 0.09 0.09 0.43 0.12 0.0 0.12 0.09 0.14 0.01 0.76 0.62 1.0 0.03 0.07 0.04 0.06
0.42 0.74 1.0 0.66 0.93 0.34 0.41 0.91 0.63 0.59 0.6 0.7 0.05 0.28 0.19 0.1 0.03 0.21 0.07 0.0 0.0 0.04 0.34 0.41 0.63 0.57 0.47 0.74 0.01 0.04 0.06 0.06
0.02 0.0 0.69 0.44 0.39 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.07 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0
0.04 0.0 0.51 0.03 0.02 0.08 0.05 0.06 0.07 0.06 0.02 0.07 0.02 0.0 0.01 0.0 0.07 0.11 0.08 0.12 0.33 0.0 0.02 0.02 1.0 0.13 0.11 0.09 0.13 0.18 0.0 0.0
0.06 0.37 0.95 0.23 0.0 0.0 0.12 0.31 0.0 1.0 0.0 0.11 0.07 0.0 0.0 0.07 0.95 0.0 0.36 0.0 0.16 0.0 0.42 0.96 0.0 0.0 0.66 0.0 0.76 0.79 0.3 0.06
0.05 0.0 0.79 0.1 0.0 0.11 0.27 0.08 0.27 0.0 0.66 0.09 0.0 0.12 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.18 0.0 0.0 0.0 0.36 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 0.48 1.0 0.51 0.45 0.38 0.23 0.6 0.43 0.69 0.48 0.45 0.16 0.1 0.29 0.0 0.23 0.09 0.22 0.0 0.0 0.0 0.33 0.22 0.18 0.62 0.86 0.47 0.21 0.29 0.39 0.51
0.25 0.25 0.9 0.23 0.07 0.51 0.77 0.13 0.41 0.22 0.39 0.19 0.05 0.44 0.92 0.04 0.24 0.0 0.58 0.04 1.0 0.0 0.1 0.06 0.25 0.3 0.13 0.3 0.17 0.18 0.29 0.17
0.0 0.04 0.74 0.0 0.04 0.2 0.31 0.13 0.7 0.52 0.32 0.04 0.05 0.0 0.12 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.69 0.89 0.18 0.09 0.09 0.08
0.57 0.35 0.97 0.27 0.39 0.27 0.21 0.75 0.28 0.41 0.09 0.23 0.28 0.1 0.36 0.36 0.61 0.75 1.0 0.42 0.06 0.22 0.38 0.76 0.0 0.22 0.12 0.48 0.53 0.45 0.24 0.18
0.21 0.26 0.81 0.25 0.45 0.55 0.98 0.9 0.7 0.36 0.21 0.19 0.0 0.06 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 1.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.22 0.13 0.89 0.35 0.08 0.37 0.15 0.14 0.22 0.29 0.07 0.3 0.0 0.09 0.01 0.03 0.0 0.17 0.02 0.0 0.0 1.0 0.01 0.04 0.35 0.0 0.17 0.0 0.13 0.0 0.28 0.27
0.31 0.25 0.59 0.19 0.0 0.35 0.43 0.34 0.7 0.22 1.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.11 0.26 0.0 0.0 0.0 0.27 0.29 0.15 0.37 0.36 0.34 0.04 0.19 0.07 0.03
0.25 0.1 0.7 0.11 0.12 0.18 0.0 0.12 0.24 0.61 0.27 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 1.0 0.26 0.32 0.0 0.17 0.06 0.0 0.17
0.14 0.05 1.0 0.1 0.06 0.0 0.11 0.05 0.14 0.0 0.37 0.0 0.17 0.06 0.28 0.14 0.13 0.29 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.16 0.28 0.24 0.12 0.0 0.0
0.38 0.87 0.89 0.68 1.0 0.93 0.57 0.32 0.29 0.28 0.28 0.37 0.27 0.07 0.18 0.63 0.48 0.25 0.61 0.43 0.28 0.47 0.24 0.14 0.22 0.13 0.61 0.99 0.27 0.27 0.28 0.28
0.67 0.72 1.0 0.48 0.24 0.51 0.64 0.72 0.21 0.45 0.39 0.44 0.16 0.81 0.08 0.26 0.22 0.01 0.09 0.0 0.18 0.23 0.33 0.46 0.33 0.48 0.84 0.4 0.13 0.09 0.2 0.09
0.36 0.86 1.0 0.72 0.98 0.23 0.87 0.31 0.53 0.5 0.48 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.07 0.11 0.0 0.0 0.0 0.27 0.18 0.0 0.0 0.36 0.37 0.34 0.22 0.18 0.27
0.31 0.2 0.85 0.26 0.71 0.4 0.55 0.26 0.21 0.32 0.27 0.3 0.28 0.06 0.28 0.43 0.37 1.0 0.64 0.0 0.07 0.04 0.5 0.53 0.0 0.12 0.18 0.0 0.43 0.33 0.52 0.49
0.0 0.77 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.19 0.13 0.12 0.17 0.24 0.83 0.0 0.0 0.06 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.06 0.12 0.0
0.0 0.3 1.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.34 0.4 0.0 0.07 0.1 0.0 0.0
0.01 0.04 1.0 0.03 0.0 0.07 0.12 0.02 0.04 0.07 0.0 0.0 0.02 0.05 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.15 1.0 0.39 0.53 0.36 0.3 0.37 0.31 0.24 0.61 0.29 0.08 0.59 0.87 0.2 0.08 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.47 0.18 0.15 0.03 0.03 0.01 0.02
0.39 0.39 0.46 0.09 0.0 1.0 0.59 0.0 0.69 0.99 0.46 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.0 0.08 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.67 1.0 0.08 0.0 0.5 0.37 0.19 0.17 0.44 0.18 0.43 0.85 0.34 0.22 0.76 0.18 0.19 0.77 0.0 0.0 0.0 0.23 0.84 0.25 0.12 0.14 0.0 0.4 0.24 0.29 0.11
0.2 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.26 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 1.0 0.0 0.75 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0
0.22 0.3 0.9 0.49 1.0 0.58 0.43 0.1 0.23 0.55 0.82 0.21 0.61 0.13 0.02 0.27 0.62 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.65 0.48 0.14 0.0 0.45 0.16 0.32 0.33 0.39 0.47
0.03 0.04 1.0 0.03 0.0 0.0 0.14 0.0 0.05 0.16 0.0 0.0 0.39 0.2 0.06 0.18 0.0 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 0.05 0.1 0.0 0.21 0.53 0.0 0.1 0.1 0.1 0.0
0.48 0.69 0.86 0.3 0.0 0.33 0.07 0.38 0.6 0.14 0.0 0.21 0.0 1.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.16 0.6 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.1 1.0 0.42 0.28 0.53 0.57 0.64 0.53 0.19 0.48 0.51 0.04 0.07 0.17 0.04 0.14 0.25 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.15 0.08 0.0 0.07 0.07 0.0 0.0
0.02 0.0 1.0 0.72 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.13 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.97 0.07 0.67 0.0 0.04 0.12 0.01 0.0
0.0 0.0 0.47 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.52 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.15 0.86 0.27 0.42 0.37 0.72 0.28 0.31 0.59 0.57 0.29 0.24 0.2 0.54 0.17 0.16 0.17 0.46 0.39 0.2 0.0 0.37 0.45 0.0 1.0 0.36 0.99 0.35 0.29 0.07 0.2
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.04 0.0
0.48 0.26 0.62 0.23 0.02 0.02 0.11 0.07 0.0 0.0 0.05 0.08 0.16 0.04 0.23 0.04 0.32 0.17 1.0 0.0 0.03 0.0 0.2 0.12 0.2 0.2 0.15 0.14 0.23 0.28 0.03 0.04
0.29 0.29 0.43 0.13 0.05 0.33 0.22 0.25 0.41 0.23 0.27 0.23 0.07 0.01 0.79 0.26 0.47 0.26 1.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.11 0.0 0.38 0.48 0.46 0.45 0.47 0.38 0.16
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.14 0.0 0.12 0.84 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.69 0.77 0.78 0.77 0.94 1.0 0.6 0.45 0.36 0.43 0.37 0.44 0.67 0.2 0.24 0.5 0.45 0.41 0.46 0.39 0.44 0.37 0.55 0.57 0.42 0.42 0.62 0.79 0.27 0.26 0.25 0.3
0.47 0.32 1.0 0.27 0.13 0.64 0.8 0.2 0.34 0.34 0.44 0.5 0.13 0.12 0.6 0.29 0.61 0.41 0.07 0.02 0.0 0.0 0.09 0.21 0.0 0.05 0.33 0.23 0.45 0.4 0.16 0.05
0.4 1.0 0.85 0.39 0.72 0.6 0.21 0.21 0.51 0.43 0.58 0.41 0.76 0.39 0.23 0.83 0.48 0.62 0.73 0.7 0.03 0.0 0.95 0.8 0.09 0.42 0.34 0.31 0.7 0.7 0.44 0.48
0.09 0.16 1.0 0.25 0.03 0.0 0.18 0.08 0.42 0.39 0.2 0.18 0.0 0.04 0.5 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.12 0.27 0.02 0.0 0.06 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)