1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_117 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.76 0.78 0.51 0.4 0.53 0.3 1.06 0.0 0.0 0.0 0.34 3.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.56 0.19 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
8.55 3.46 2.7 5.32 7.82 9.1 14.2 11.13 12.06 9.59 12.95 6.21 9.66 16.95 32.99 21.93 1.61 3.12 5.65 10.45 0.12 3.5 5.34 11.27 13.14 1.67 10.34 9.33 5.12 5.42 3.3 2.92
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.05 0.44 1.07 0.27 0.05 0.04 0.49 0.0 0.0 0.0 0.24 0.96 0.0 0.0 0.06 0.0 0.07 0.05 0.05 0.07
0.75 0.69 0.22 0.87 2.7 1.25 0.45 1.0 1.38 0.35 0.72 0.72 7.56 6.67 18.29 19.81 1.82 0.47 1.76 0.0 0.0 0.0 1.24 1.95 4.17 3.46 2.93 3.76 2.44 3.74 1.03 1.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.71 0.69 0.51 0.85 0.52 0.75 0.31 0.29 0.2 0.16 0.33 0.5 0.23 9.07 0.9 0.49 0.53 4.53 1.44 0.0 0.2 0.01 0.35 0.93 0.23 0.23 0.38 0.39 0.27 0.14 0.07
0.0 0.0 0.0 0.03 0.14 0.24 0.0 0.03 0.03 0.03 0.1 0.04 0.42 0.5 0.6 0.13 0.0 0.49 0.49 0.0 0.0 0.34 0.08 0.08 0.0 0.0 0.19 0.18 0.07 0.0 0.0 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.29 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.05 0.0 0.0 0.04 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.04 0.01 0.07 0.08 0.1 0.18 0.23 0.2 0.06 0.06 0.07 0.02 0.12 0.94 0.2 0.14 0.23 1.15 0.05 0.0 0.29 0.09 0.02 0.19 0.15 0.22 0.23 0.05 0.09 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.26 0.22 0.34 0.27 0.08 0.12 0.28 0.15 0.32 0.29 0.13 0.42 0.43 1.5 0.41 0.12 0.16 0.75 0.18 0.0 0.0 0.15 0.27 0.07 0.2 0.4 0.23 0.09 0.12 0.13 0.11
1.1 1.36 1.65 2.91 2.77 3.39 2.98 2.07 1.59 0.98 1.28 1.35 2.14 2.66 41.36 3.72 2.29 2.67 8.06 5.38 1.1 9.91 0.9 1.74 2.39 3.34 5.89 7.17 1.85 1.98 1.03 0.34
0.01 0.05 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.38 0.03 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.13 0.14 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.06 0.02 0.09 0.03 0.08 0.18 0.18 0.29 0.15 0.04 0.03 0.21 0.1 2.98 0.27 0.0 0.06 1.76 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.12 0.06 0.04 0.03 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.25 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.15 0.1 0.28 0.21 0.28 0.36 0.29 0.21 0.18 0.27 0.29 1.48 1.35 2.76 0.8 0.12 0.53 1.92 0.22 0.0 0.0 0.19 0.14 0.27 0.16 0.37 0.34 0.12 0.15 0.08 0.07
0.07 0.11 0.04 0.13 0.1 0.14 0.17 0.16 0.08 0.16 0.2 0.11 0.1 0.45 2.09 0.12 0.06 0.23 1.48 0.0 0.0 0.0 0.13 0.15 0.07 0.14 0.35 0.24 0.01 0.06 0.03 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.03 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.13 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.16 0.2 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.15 0.04 1.27 0.21 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.13 1.13 0.79 1.09 1.09 1.06 1.11 0.85 1.5 0.77 1.01 0.77 2.66 4.64 7.35 2.94 0.89 3.37 1.77 1.79 1.05 0.0 1.26 2.12 2.94 1.1 1.78 1.55 0.7 0.86 0.84 0.91
0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 0.04 0.04 0.03 0.02 0.0 0.0 0.02 0.1 0.11 0.26 0.03 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.11 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.21 0.0 0.11 0.0 0.08 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.34 0.0 1.87 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.91 0.54 1.01 0.94 1.91 1.43 1.45 0.78 0.93 2.21 0.92 1.02 2.23 2.21 4.99 2.32 0.67 1.38 0.66 0.0 0.0 0.0 1.06 0.89 0.0 2.0 1.64 2.5 0.85 0.82 0.5 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.22 0.01 0.64 0.04 0.0 0.02 0.08 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.04 0.0 0.0 0.04 0.04 0.05 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.28 0.02 0.09 0.03 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.12 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.16 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
0.02 0.04 0.0 0.04 0.0 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.61 0.08 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.48 0.62 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0
0.09 0.11 0.1 0.14 0.07 0.13 0.06 0.1 0.0 0.1 0.0 0.06 0.8 1.07 3.58 0.64 0.13 0.5 0.3 0.0 0.0 0.0 0.23 0.18 0.45 0.26 0.17 0.0 0.18 0.06 0.06 0.29
0.03 0.0 0.07 0.02 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.04 0.04 0.8 0.02 0.08 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.13 0.0 0.1 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0
353.01 326.62 307.9 384.96 340.81 306.46 223.91 190.07 280.71 387.16 407.36 366.73 2007.61 1263.96 4082.24 910.26 143.53 90.26 85.48 112.64 30.51 158.44 85.98 223.17 194.62 571.37 122.75 171.95 107.18 296.83 101.88 157.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.13 0.27 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.45 0.15 0.45 0.87 0.47 0.2 0.19 0.23 0.61 0.77 0.33 0.97 0.75 4.43 1.25 0.23 0.5 3.2 0.0 0.0 0.07 0.31 0.58 0.28 0.41 0.37 0.35 0.36 0.43 0.27 0.91
0.0 0.0 0.09 0.02 0.12 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 1.82 0.29 0.0 0.24 0.86 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0
0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 1.59 0.0 0.12 0.17 0.43 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.36 0.36 0.0 0.07 0.11 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)