1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_117 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.23 0.24 0.15 0.12 0.16 0.09 0.32 0.0 0.0 0.0 0.1 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.17 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.1 0.08 0.16 0.24 0.28 0.43 0.34 0.37 0.29 0.39 0.19 0.29 0.51 1.0 0.66 0.05 0.09 0.17 0.32 0.0 0.11 0.16 0.34 0.4 0.05 0.31 0.28 0.16 0.16 0.1 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.05 0.41 1.0 0.25 0.04 0.03 0.46 0.0 0.0 0.0 0.22 0.9 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.04 0.04 0.06
0.04 0.03 0.01 0.04 0.14 0.06 0.02 0.05 0.07 0.02 0.04 0.04 0.38 0.34 0.92 1.0 0.09 0.02 0.09 0.0 0.0 0.0 0.06 0.1 0.21 0.17 0.15 0.19 0.12 0.19 0.05 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.08 0.08 0.06 0.09 0.06 0.08 0.03 0.03 0.02 0.02 0.04 0.06 0.03 1.0 0.1 0.05 0.06 0.5 0.16 0.0 0.02 0.0 0.04 0.1 0.03 0.03 0.04 0.04 0.03 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.04 0.24 0.4 0.0 0.05 0.05 0.05 0.17 0.06 0.7 0.83 1.0 0.22 0.0 0.81 0.82 0.0 0.0 0.56 0.14 0.13 0.0 0.0 0.32 0.3 0.12 0.0 0.0 0.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 1.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.12 0.0 0.0 0.09 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.03 0.01 0.06 0.07 0.09 0.16 0.2 0.17 0.06 0.05 0.06 0.02 0.11 0.82 0.17 0.12 0.2 1.0 0.05 0.0 0.26 0.08 0.01 0.16 0.13 0.19 0.2 0.04 0.07 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.17 0.14 0.23 0.18 0.05 0.08 0.19 0.1 0.21 0.19 0.09 0.28 0.29 1.0 0.27 0.08 0.11 0.5 0.12 0.0 0.0 0.1 0.18 0.04 0.14 0.27 0.15 0.06 0.08 0.09 0.07
0.03 0.03 0.04 0.07 0.07 0.08 0.07 0.05 0.04 0.02 0.03 0.03 0.05 0.06 1.0 0.09 0.06 0.06 0.19 0.13 0.03 0.24 0.02 0.04 0.06 0.08 0.14 0.17 0.04 0.05 0.02 0.01
0.02 0.13 0.0 0.05 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.07 1.0 0.08 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.87 1.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.01 0.03 0.01 0.03 0.06 0.06 0.1 0.05 0.01 0.01 0.07 0.03 1.0 0.09 0.0 0.02 0.59 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 1.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.05 0.04 0.1 0.08 0.1 0.13 0.1 0.08 0.07 0.1 0.11 0.54 0.49 1.0 0.29 0.04 0.19 0.7 0.08 0.0 0.0 0.07 0.05 0.1 0.06 0.14 0.12 0.04 0.05 0.03 0.03
0.03 0.05 0.02 0.06 0.05 0.07 0.08 0.08 0.04 0.08 0.09 0.05 0.05 0.22 1.0 0.06 0.03 0.11 0.71 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.03 0.07 0.17 0.11 0.01 0.03 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.37 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.4 0.0 0.0 0.4 0.0 0.39 1.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.26 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.13 0.16 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.12 0.03 1.0 0.17 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.15 0.11 0.15 0.15 0.14 0.15 0.12 0.2 0.1 0.14 0.1 0.36 0.63 1.0 0.4 0.12 0.46 0.24 0.24 0.14 0.0 0.17 0.29 0.4 0.15 0.24 0.21 0.1 0.12 0.11 0.12
0.04 0.0 0.0 0.31 0.0 0.15 0.15 0.12 0.08 0.0 0.0 0.07 0.4 0.45 1.0 0.12 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.16 0.44 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.0 0.06 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.11 0.2 0.19 0.38 0.29 0.29 0.16 0.19 0.44 0.18 0.21 0.45 0.44 1.0 0.46 0.13 0.28 0.13 0.0 0.0 0.0 0.21 0.18 0.0 0.4 0.33 0.5 0.17 0.16 0.1 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.34 0.02 1.0 0.06 0.0 0.03 0.13 0.0 0.06 0.0 0.01 0.02 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.13 0.0 0.0 0.14 0.12 0.19 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 1.0 0.07 0.33 0.12 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.42 0.0 0.06 0.0 0.0 0.12
0.02 0.03 0.0 0.02 0.09 0.0 0.03 0.0 0.05 0.0 0.03 0.09 0.16 0.12 1.0 0.0 0.04 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.07 0.09 0.0 0.04 0.0 0.03 0.03
0.01 0.02 0.0 0.03 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.39 0.05 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 1.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.76 1.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
0.03 0.03 0.03 0.04 0.02 0.04 0.02 0.03 0.0 0.03 0.0 0.02 0.22 0.3 1.0 0.18 0.04 0.14 0.08 0.0 0.0 0.0 0.07 0.05 0.13 0.07 0.05 0.0 0.05 0.02 0.02 0.08
0.04 0.0 0.09 0.03 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.06 0.08 0.0 0.05 0.05 1.0 0.03 0.1 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.17 0.0 0.13 0.11 0.0 0.07 0.0 0.0
0.09 0.08 0.08 0.09 0.08 0.08 0.05 0.05 0.07 0.09 0.1 0.09 0.49 0.31 1.0 0.22 0.04 0.02 0.02 0.03 0.01 0.04 0.02 0.05 0.05 0.14 0.03 0.04 0.03 0.07 0.02 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.48 1.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.1 0.03 0.1 0.2 0.11 0.05 0.04 0.05 0.14 0.17 0.08 0.22 0.17 1.0 0.28 0.05 0.11 0.72 0.0 0.0 0.02 0.07 0.13 0.06 0.09 0.08 0.08 0.08 0.1 0.06 0.21
0.01 0.0 0.37 0.07 0.48 0.03 0.06 0.0 0.05 0.0 0.27 0.06 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.16 0.0 0.13 0.47 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0
0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 1.0 0.0 0.07 0.11 0.27 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.23 0.23 0.0 0.05 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 1.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)