Heatmap: Cluster_135 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo105905	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.8	0.47	0.07	1.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.1	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01
Smo107394	0.02	0.01	0.02	0.02	0.0	0.0	0.02	0.04	0.09	0.02	0.03	0.04	0.58	0.34	0.0	1.0	0.01	0.12	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.22	0.06	0.0	0.02	0.04	0.02	0.0
Smo11120	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo112052	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.51	0.04	0.08	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo118867	0.09	0.08	0.04	0.04	0.06	0.05	0.05	0.1	0.1	0.1	0.09	0.12	0.76	0.03	0.8	1.0	0.02	0.02	0.2	0.0	0.39	0.0	0.02	0.04	0.33	0.24	0.2	0.17	0.08	0.09	0.14	0.08
Smo122841	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.0	0.04	0.0	0.02	0.62	0.54	0.01	1.0	0.01	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.05	0.18	0.03	0.03	0.03	0.0	0.01	0.03	0.01	0.01
Smo12696	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.52	0.3	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01
Smo132803	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.3	0.23	0.06	1.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.06	0.07	0.01	0.02	0.0	0.0
Smo133933	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.77	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0
Smo136730	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.19	0.17	0.05	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01
Smo163980	0.47	0.55	0.61	0.48	0.48	0.51	0.61	0.36	0.42	0.48	0.47	0.46	0.2	0.21	0.17	1.0	0.23	0.14	0.23	0.26	0.08	0.08	0.55	0.69	0.34	0.22	0.4	0.54	0.29	0.38	0.24	0.24
Smo173016	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo18538	0.01	0.03	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.69	0.34	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.03	0.23	0.02	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.02	0.02
Smo227648	0.05	0.05	0.04	0.04	0.05	0.03	0.03	0.05	0.05	0.05	0.04	0.04	0.66	0.27	0.05	1.0	0.04	0.02	0.09	0.0	0.04	0.0	0.04	0.09	0.05	0.04	0.03	0.02	0.11	0.12	0.04	0.05
Smo23147	0.72	0.77	0.96	0.77	0.81	0.86	0.49	0.71	0.57	0.75	0.73	0.59	0.61	0.31	0.26	0.74	0.57	0.57	0.91	1.0	0.25	0.4	0.91	0.96	0.47	0.71	0.55	0.74	0.62	0.64	0.59	0.5
Smo35439	0.06	0.08	0.06	0.04	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.41	0.39	0.04	1.0	0.02	0.01	0.07	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04
Smo37169	0.06	0.05	0.04	0.06	0.04	0.05	0.05	0.05	0.04	0.06	0.06	0.04	0.69	0.32	0.27	1.0	0.05	0.06	0.08	0.02	0.02	0.0	0.04	0.05	0.04	0.08	0.05	0.08	0.06	0.06	0.03	0.02
Smo38553	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.06	0.47	0.25	0.02	1.0	0.04	0.04	0.06	0.03	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.05	0.05
Smo402687	0.02	0.04	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.41	0.35	0.03	1.0	0.04	0.14	0.31	0.0	0.03	0.0	0.07	0.06	0.03	0.04	0.04	0.02	0.09	0.07	0.03	0.03
Smo403763	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo403764	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.2	0.07	0.23	1.0	0.0	0.0	0.01	0.1	0.02	0.01	0.0	0.0	0.01	0.03	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo404649	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo408339	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.05	0.03	0.03	0.03	0.09	0.06	0.04	0.16	0.01	0.8	1.0	0.01	0.04	0.05	0.0	0.0	0.02	0.06	0.12	0.02	0.05	0.04	0.08	0.02	0.03	0.03	0.07
Smo410167	0.24	0.11	0.23	0.29	0.18	0.15	0.53	0.04	0.11	0.22	0.1	0.12	1.0	0.07	0.67	0.31	0.0	0.03	0.75	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.89	0.0	0.0	0.14	0.04	0.21	0.04
Smo411037	0.0	0.04	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.21	0.28	1.0	0.04	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.04	0.04	0.0	0.16	0.1	0.0	0.0	0.08	0.08	0.04
Smo411406	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo413285	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.06	0.02	0.02	1.0	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.09	0.06	0.15	0.02	0.01	0.02	0.01
Smo413427	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.07	1.0	0.05	0.03	0.04	0.0	0.0	0.0	0.08	0.05	0.0	0.0	0.1	0.0	0.11	0.04	0.04	0.1
Smo417541	0.13	0.18	0.19	0.19	0.14	0.18	0.17	0.22	0.28	0.29	0.25	0.23	0.36	0.27	0.27	1.0	0.11	0.12	0.2	0.26	0.05	0.03	0.13	0.18	0.15	0.41	0.14	0.17	0.15	0.2	0.12	0.13
Smo419691	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.01	0.0	1.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo419692	0.07	0.04	0.1	0.04	0.05	0.07	0.09	0.08	0.16	0.08	0.18	0.12	0.24	0.0	0.01	1.0	0.01	0.01	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.11	0.04	0.14	0.0	0.01	0.02	0.02
Smo419927	0.11	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.44	0.22	0.0	0.1	1.0	0.0	0.59	0.59	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.06	0.22	0.05	0.0
Smo421373	0.07	0.17	0.12	0.13	0.19	0.14	0.06	0.07	0.06	0.08	0.05	0.07	0.04	0.03	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.03	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo422096	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.0	0.98	0.0	0.0	1.0	0.01	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.09	0.05	0.17	0.05	0.01	0.01	0.0
Smo423095	0.5	0.88	0.83	0.83	0.82	0.98	0.66	0.61	0.61	0.68	0.55	0.6	0.76	0.33	0.22	0.56	0.31	0.5	0.3	0.56	0.06	0.11	1.0	0.83	0.34	0.23	0.71	0.8	0.3	0.35	0.24	0.34
Smo424982	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.02	0.0	1.0	0.06	0.04	0.09	0.0	0.0	0.0	0.38	0.51	0.0	0.0	0.03	0.01	0.09	0.13	0.07	0.08
Smo432099	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo432614	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.64	0.0	0.0	0.04	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.09
Smo67943	0.04	0.04	0.02	0.05	0.05	0.05	0.04	0.05	0.06	0.05	0.07	0.04	0.62	0.03	0.02	1.0	0.06	0.05	0.17	0.01	0.05	0.02	0.06	0.06	0.11	0.07	0.03	0.07	0.05	0.07	0.05	0.05
Smo7202	0.1	0.08	0.03	0.07	0.07	0.03	0.06	0.07	0.04	0.01	0.06	0.04	0.5	0.4	0.04	1.0	0.02	0.09	0.06	0.0	0.21	0.0	0.05	0.03	0.16	0.06	0.05	0.16	0.06	0.08	0.03	0.04
Smo74427	0.19	0.25	0.26	0.22	0.24	0.22	0.15	0.16	0.17	0.16	0.17	0.14	0.37	0.09	0.01	1.0	0.07	0.04	0.09	0.01	0.02	0.01	0.42	0.58	0.16	0.15	0.24	0.28	0.1	0.11	0.07	0.07
Smo75567	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.0	0.02	0.01	0.01	0.54	0.39	0.05	1.0	0.04	0.04	0.24	0.0	0.02	0.0	0.04	0.06	0.03	0.02	0.02	0.0	0.07	0.04	0.02	0.01
Smo77019	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo77290	0.11	0.09	0.08	0.13	0.13	0.09	0.1	0.13	0.1	0.14	0.11	0.11	0.75	0.35	0.27	1.0	0.05	0.06	0.2	0.01	0.0	0.01	0.06	0.04	0.05	0.11	0.11	0.17	0.06	0.06	0.05	0.06
Smo82917	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo84595	0.23	0.17	0.12	0.21	0.19	0.28	0.32	0.33	0.33	0.25	0.19	0.21	0.52	0.17	0.35	1.0	0.26	0.24	0.24	0.03	0.12	0.23	0.25	0.23	0.34	0.36	0.37	0.42	0.28	0.28	0.17	0.14
Smo84634	0.05	0.04	0.04	0.05	0.07	0.06	0.07	0.05	0.05	0.06	0.05	0.04	0.48	0.23	0.07	1.0	0.04	0.05	0.06	0.0	0.01	0.05	0.03	0.05	0.05	0.08	0.14	0.17	0.04	0.04	0.02	0.02
Smo85264	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.01	0.0	0.01
Smo86551	0.22	0.31	0.37	0.31	0.24	0.28	0.36	0.21	0.27	0.22	0.27	0.23	0.15	0.23	0.11	1.0	0.14	0.11	0.15	0.03	0.02	0.02	0.37	0.56	0.11	0.14	0.23	0.34	0.18	0.26	0.15	0.15
Smo92732	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo96541	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.06	0.02	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo97809	0.12	0.11	0.04	0.07	0.12	0.06	0.08	0.11	0.11	0.16	0.06	0.08	0.6	0.21	0.76	1.0	0.22	0.2	0.31	0.18	0.11	0.0	0.11	0.16	0.19	0.32	0.18	0.0	0.1	0.39	0.15	0.06
Smo98138	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
Smo99641	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)