1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_64 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.02 0.21 0.0 0.09 0.03 0.12 0.09 0.02 0.03 0.04 0.0 0.05 0.04 0.05 0.3 0.13 0.05 0.12 0.13 0.06 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
1.48 2.0 0.79 0.22 0.0 0.19 0.0 0.25 0.14 0.29 0.76 1.82 0.76 0.29 0.03 1.14 0.05 0.22 0.15 0.0 0.0 0.0 0.36 0.85 1.0 1.42 0.73 0.48 0.64 0.3 0.05 0.0
10.74 10.54 10.46 8.77 13.03 13.55 9.1 12.29 9.95 9.78 12.1 6.7 21.8 7.0 12.0 21.04 9.58 15.06 24.09 0.0 0.0 0.0 16.62 20.01 0.41 3.7 9.51 12.12 9.96 10.88 9.89 11.11
0.51 2.22 0.66 0.33 0.54 0.34 0.92 0.0 0.3 0.0 0.66 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.49 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.56 0.14 0.4
0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.18 0.13 0.03 0.0 0.09 0.0 0.01 0.07 0.0 0.06 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.05 0.01
1.73 6.74 0.76 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.75 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 3.02 3.03 1.7 5.35 0.0 0.0 0.0 1.86 2.18 0.0 2.15 0.0 0.0 5.11 3.64 4.01 1.37
0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.08 0.09 0.12 0.0 0.0 0.04 0.0 0.08 0.0 0.15 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04
2.75 6.56 4.67 5.0 4.7 4.18 3.83 3.71 1.9 5.62 2.94 2.57 5.05 5.56 2.85 4.32 3.23 0.22 4.16 0.0 1.3 0.0 2.78 2.02 0.0 2.4 1.77 2.24 2.03 2.02 2.04 2.19
0.06 0.55 0.0 0.13 0.0 0.42 0.15 0.62 0.0 0.71 0.0 0.16 0.37 0.17 0.11 0.65 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.49 0.0 0.36 0.59 0.12 0.0
1.01 2.48 0.14 0.27 1.05 0.09 0.0 0.14 1.18 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.96 8.26 1.85 4.94 5.03 1.92 0.37 3.05 2.52 2.14 1.28 0.76 0.23 1.1 0.5 0.24 0.21 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.87 0.0 3.79 0.0 0.23 0.0 0.0
0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 0.04 0.0
2.2 3.93 3.0 1.25 1.52 2.15 1.49 1.95 1.69 1.99 2.06 2.38 3.0 2.44 3.2 1.82 1.98 0.84 1.61 0.45 0.0 0.0 1.45 1.54 1.31 0.86 1.27 0.9 1.52 1.79 0.68 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.34 0.09 0.13 0.0 0.09 0.06 0.05 0.07 0.09 0.04 0.13 0.29 0.15 0.15 0.3 0.08 0.02 0.28 0.05 0.23 0.0 0.05 0.03 0.29 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.08 0.25 0.11 0.09 0.0 0.04 0.08 0.02 0.0 0.04 0.02 0.06 0.02 0.14 0.14 0.05 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.11 0.1 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.22 0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.58 0.16 0.0 0.07 0.0 0.12 0.0 0.0 0.06 0.0 0.18 0.07 0.0 0.0 0.16 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.12
0.05 0.84 0.17 0.35 0.16 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.13 0.07 0.77 0.28 0.37 1.15 0.0 0.09 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 1.06 0.07 0.0 0.07 0.0
0.54 0.8 0.37 0.21 0.23 0.23 0.38 0.35 0.22 0.16 0.3 0.57 1.01 0.3 0.42 1.04 0.49 0.41 1.07 0.05 0.38 0.0 0.61 0.55 0.57 0.63 0.46 0.13 0.78 0.89 0.46 0.56
0.37 0.69 0.36 0.42 0.31 0.48 0.05 0.56 0.42 0.34 0.39 0.22 0.24 0.09 0.1 0.33 0.02 0.03 0.56 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.19 0.36 0.6 0.47 0.05 0.06 0.01 0.03
0.38 0.55 0.0 0.1 0.04 0.09 0.04 0.16 0.1 0.03 0.15 0.24 0.0 0.0 0.0 0.14 0.08 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.09 0.32 0.0 0.04 0.12 0.0 0.0
0.04 0.14 0.04 0.0 0.02 0.02 0.0 0.06 0.05 0.0 0.1 0.0 0.31 0.0 0.05 0.06 0.02 0.05 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.5 0.93 0.42 0.53 0.5 0.7 0.39 0.52 0.29 0.48 0.37 0.56 0.83 0.21 0.39 0.55 0.13 0.01 0.83 0.14 0.0 0.0 0.07 0.08 0.7 0.88 1.15 0.99 0.03 0.14 0.12 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.06 2.1 0.64 0.36 1.32 1.04 0.04 0.0 0.46 0.6 0.24 0.92 0.12 1.37 0.73 0.06 0.0 0.0 0.23 0.0 0.22 0.65 0.09 0.0 0.0 0.53 0.0 0.93 0.04 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 1.42 0.53 0.1 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.06 0.0 0.0 1.28 0.21 0.0 2.32 0.0 0.2 0.44 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.33 0.16 0.0 0.0 0.36 0.08 0.22 0.07
0.22 0.34 0.02 0.1 0.13 0.0 0.09 0.09 0.05 0.08 0.0 0.14 0.0 0.02 0.19 0.06 0.0 0.16 0.38 0.0 0.0 0.0 0.1 0.15 0.18 0.11 0.06 0.35 0.19 0.13 0.05 0.0
0.03 0.35 0.03 0.0 0.14 0.06 0.0 0.21 0.02 0.06 0.0 0.03 0.08 0.0 0.34 0.16 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.12 0.06 0.26 0.06 0.0 0.03 0.03
0.11 0.52 0.0 0.18 0.0 0.12 0.11 0.09 0.04 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.1 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.12 0.05 0.0 0.15 0.05 0.33 0.12 0.1 0.3 0.16
0.09 0.45 0.18 0.02 0.04 0.1 0.38 0.38 0.16 0.13 0.0 0.05 0.0 0.07 0.09 0.0 0.03 0.0 0.02 0.21 0.0 0.0 0.0 0.03 0.13 0.11 0.06 0.52 0.01 0.0 0.0 0.0
0.04 0.26 0.03 0.23 0.08 0.08 0.14 0.15 0.32 0.03 0.07 0.17 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.15 0.19 0.16 0.15 0.19 0.18 0.23 0.31 0.04 0.04
0.76 1.14 0.44 0.25 0.05 0.63 0.2 0.15 0.38 0.19 0.25 0.66 0.06 0.0 0.0 0.14 0.02 0.0 1.53 0.0 0.0 0.0 1.57 1.16 0.93 0.0 0.08 0.46 0.11 0.05 0.27 0.08
0.09 0.38 0.1 0.31 0.04 0.26 0.18 0.35 0.25 0.23 0.23 0.13 0.26 0.12 0.1 0.16 0.17 0.09 0.18 0.0 0.0 0.0 0.05 0.14 0.06 0.21 0.17 0.32 0.11 0.18 0.1 0.03
0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.54 1.06 0.13 0.37 0.74 0.37 0.45 0.29 0.46 0.89 0.19 0.4 1.17 0.65 0.58 1.41 0.39 0.59 1.81 0.0 0.0 0.0 1.01 0.81 0.0 0.33 0.76 0.82 0.65 0.9 0.81 0.81
0.18 0.79 0.37 0.08 0.3 0.21 0.0 0.34 0.46 0.0 0.46 0.26 0.32 1.31 0.71 0.23 0.18 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.11 0.34 0.81 0.37 0.01 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.27 0.03 0.15 0.04 0.04 0.04 0.03 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.3 0.14 0.04 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.09 0.21 0.38 0.04 0.0 0.0 0.08
0.06 1.26 0.21 1.27 1.25 0.0 0.72 0.24 0.0 0.0 0.54 0.14 0.0 0.14 0.46 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.8 0.17 0.18 0.79 0.14 0.0 0.06 0.0
0.8 2.66 0.64 0.76 3.61 1.28 1.13 0.68 2.68 0.48 0.33 1.02 0.32 0.31 1.49 0.9 0.06 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.29 0.93 0.99 1.56 0.0 0.12 0.0 0.12
0.01 0.09 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.72 1.61 0.51 0.55 2.06 1.03 1.57 1.12 2.81 1.49 1.53 1.59 1.92 0.8 2.55 1.78 1.06 0.52 1.01 0.0 0.71 0.0 1.0 1.17 0.13 0.66 1.29 2.0 1.15 1.3 1.01 1.3
0.84 2.53 1.28 2.28 1.08 1.71 0.94 2.95 0.61 0.4 0.26 0.94 0.2 1.18 0.51 0.2 0.1 1.8 0.91 0.43 0.0 0.0 0.28 0.28 0.0 0.45 1.57 1.47 0.1 0.19 0.47 0.36
0.06 1.33 0.0 0.18 0.03 0.32 0.24 0.0 0.0 0.07 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.61 0.54 0.73 0.24 0.8 0.89 0.17 0.39 0.84 0.25 0.09 0.36 0.7 0.44 0.05 0.15 0.01 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.14 0.48 0.79 0.38 0.03 0.07 0.03 0.01
0.04 1.45 0.56 0.2 0.13 0.13 0.43 0.28 0.11 0.1 0.22 0.0 0.11 0.0 0.15 0.0 0.43 0.88 0.31 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.24 1.53 0.0 0.22 0.53 0.0 0.1
0.03 0.22 0.0 0.0 0.0 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
8.2 5.88 5.69 3.58 3.17 5.87 2.99 5.16 5.36 3.24 4.76 2.92 8.65 2.71 4.3 11.63 5.91 15.04 10.1 0.0 0.0 0.0 7.76 6.68 0.0 2.03 1.94 2.07 6.82 5.34 3.63 5.17
0.03 0.22 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.11 0.08 0.09 0.05 0.02 0.04 0.02
0.09 0.82 0.0 0.05 0.14 0.0 0.18 0.06 0.16 0.08 0.04 0.0 0.24 0.2 0.03 0.0 0.05 0.08 0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.15 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0
0.91 2.59 1.42 0.89 0.53 1.24 0.23 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 1.09 2.3 1.88 2.14 0.36 0.38 1.68 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 1.79 1.1 1.86 1.19 0.73 0.0 0.18 0.17
0.22 0.87 0.0 0.39 0.0 0.27 0.22 0.41 1.09 0.65 0.06 0.16 0.01 0.0 0.18 0.12 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.27 0.19 0.0 0.08 0.0 0.0 0.17 0.6 0.0 0.02
0.21 3.04 1.86 0.0 1.82 0.0 2.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.25 0.0 0.03 0.0 0.28 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 5.65 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0
4.32 5.2 3.63 3.83 3.67 3.08 1.59 3.77 1.79 1.27 3.62 1.43 0.0 0.0 0.0 0.0 4.53 3.52 3.01 0.0 0.0 0.0 3.67 2.48 3.12 1.68 1.7 1.5 2.51 2.24 1.18 0.13
0.11 1.66 0.0 0.0 0.17 0.18 0.28 0.03 0.0 0.18 0.62 0.0 0.0 0.1 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)